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宮頸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的表達(dá)譜研究

2009-04-29 00:44:03朱秀蘭馬文麗陰常欣鄭文嶺
生命科學(xué)研究 2009年4期
關(guān)鍵詞:基因芯片宮頸癌

朱秀蘭 馬文麗 陰常欣 鄭文嶺

摘要:淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是影響宮頸癌預(yù)后因素的首要因素,但分子機(jī)理尚不清楚,探討宮頸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,篩選可能用于臨床診斷和治療的新的分子靶標(biāo)尤其重要,BRB-Array Tools軟件對基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Ominibus,GEO)中有/無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移早期宮頸癌的基因芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,找出二者的差異基因,利用GenCLip軟件進(jìn)行文獻(xiàn)挖掘研究這些差異表達(dá)基因的功能關(guān)系,篩選出71個(gè)差異表達(dá)基因。其中35個(gè)在有淋巴轉(zhuǎn)移的宮頸癌中表達(dá)上調(diào),36個(gè)下調(diào),文獻(xiàn)挖掘發(fā)現(xiàn)FZD10、PDZKIIIPI、SERPINB9、COMP、MAGEA1等幾個(gè)新的宮頸癌淋巴轉(zhuǎn)移相關(guān)基因,結(jié)果表明生物信息學(xué)方法能有效地分析基因芯片數(shù)據(jù)并獲取生物內(nèi)在信息,為宮頸癌淋巴轉(zhuǎn)移發(fā)生機(jī)制及治療靶位開辟新思路。

關(guān)鍵詞:宮頸癌;淋巴轉(zhuǎn)移;基因芯片;差異表達(dá)

中圖分類號:R737文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A文章編號1007-7847(2009)04-0337-06

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