倪青山　王正志　趙英杰等

摘要：蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測是生物信息學(xué)研究的重要問題之一，提出了一種基于物理化學(xué)性質(zhì)優(yōu)化的蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測方法，與現(xiàn)有方法的顯著不同就是，并未使用已知的氨基酸殘基的物理化學(xué)性質(zhì)，而是通過粒子群算法優(yōu)化得到有益于相互作用預(yù)測的物理化學(xué)性質(zhì)數(shù)值，對真實的數(shù)據(jù)集測試表明，優(yōu)化得到的物理化學(xué)性質(zhì)比現(xiàn)有的物理化學(xué)性質(zhì)更有益于提高蛋白質(zhì)相互作用的預(yù)測性能，與其它方法相比，也具有一定的優(yōu)勢，說明該方法是一種有效的蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測方法。

關(guān)鍵詞：蛋白質(zhì)相互作用；物理化學(xué)性質(zhì)；局部超平面分類算法；粒子群優(yōu)化算法

中圖分類號：Q332

文獻標識碼：A

文章編號：1007－7847(2009)03－0204－05