張小飛,葉華虎,趙彥斌,王冬平,趙洪衛(wèi),白杰英
(軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心,北京 100071)
猴B病毒囊膜蛋白gB特異性抗原表位的篩選與表達(dá)鑒定
張小飛,葉華虎,趙彥斌,王冬平,趙洪衛(wèi),白杰英
(軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心,北京 100071)
目的 篩選和鑒定猴B病毒囊膜蛋白gB的特異性抗原表位,將其應(yīng)用于B病毒的檢測(cè)。方法 利用蛋白序列比較和表位預(yù)測(cè)技術(shù)篩選猴B病毒囊膜蛋白gB的特異性抗原表位,經(jīng)PCR擴(kuò)增后原核表達(dá),純化,Western-blot鑒定融合蛋白,建立特異性表位的ELISA檢測(cè)方法,并對(duì)其效果進(jìn)行評(píng)估。結(jié)果 瓊脂糖凝膠電泳和測(cè)序結(jié)果顯示出目的表位基因完全正確,并且重組蛋白經(jīng)過(guò)SDS-PAGE、Western-blot鑒定,其相對(duì)分子質(zhì)量約為27×103,與預(yù)期值相符。篩選出的gB-26肽表位檢測(cè)結(jié)果與文獻(xiàn)相符,特異性較好,敏感性稍低。結(jié)論 建立了猴B病毒囊膜蛋白gB特異性抗原表位篩選和鑒定的實(shí)驗(yàn)方法,為進(jìn)一步研制猴B病毒快速診斷試劑盒和猴B病毒亞單位疫苗奠定了基礎(chǔ)。
B病毒;囊膜蛋白gB;抗原表位;篩選;表達(dá)
猴B病毒屬于皰疹病毒科,主要存在于亞洲尤其是印度系獼猴屬(恒河猴、食蟹猴、豚尾猴等)動(dòng)物中[1]。B病毒屬于生物安全4級(jí)病原,既是潛在的生物戰(zhàn)劑,又是影響實(shí)驗(yàn)獼猴質(zhì)量及出口的主要疾病,還是獼猴從業(yè)人員以及實(shí)驗(yàn)科技人員安全健康的重要威脅。猴是B病毒的自然宿主,感染率可達(dá)10%~60%,多數(shù)情況下呈良性經(jīng)過(guò),僅在口腔黏膜和生殖器黏膜出現(xiàn)皰疹和潰瘍,之后病毒可長(zhǎng)期潛伏在三叉神經(jīng)節(jié)和腰骶神經(jīng)節(jié)[2]。人類感染主要表現(xiàn)為腦脊髓炎癥狀,多數(shù)病人死亡。
當(dāng)前,診斷B病毒感染主要依賴于以全病毒作為抗原的血清學(xué)方法,但是,由于B病毒與人單純性皰疹病毒(herpes simple virus,HSV)、猴因子8(simian agent 8 virus,SA8)[3]和狒狒皰疹病毒 4(herpes virus papio 2,HVP-2)具有高度的同源性。以全病毒作檢測(cè)抗原,采用快速檢測(cè)方法(ELISA、IEA和Dot blot雜交等)[4],較強(qiáng)的交叉反應(yīng)難以保證準(zhǔn)確性。同源病毒,如HSV-1(國(guó)內(nèi)目前使用的抗原)、HSV-2、SA8和HVP-2等,雖不存在嚴(yán)重安全隱憂,但假陽(yáng)性和假陰性已使我國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物業(yè)界蒙受了巨大損失。較強(qiáng)的交叉反應(yīng)難以保證準(zhǔn)確性,因而特異性檢測(cè)抗原是當(dāng)前困擾B病毒快速診斷和有效防治的主要“瓶頸”,無(wú)論是B病毒的準(zhǔn)確診斷還是有效防治,有效抗原的獲得都是其中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。
本研究利用蛋白序列比較和表位預(yù)測(cè)技術(shù)篩選B病毒囊膜蛋白gB的特異性抗原表位,經(jīng)PCR擴(kuò)增后在大腸桿菌中進(jìn)行原核表達(dá),表位融合蛋白經(jīng)Ni柱純化和Western-blot鑒定。然后建立該表位的ELISA檢測(cè)方法,并對(duì)其檢測(cè)效果進(jìn)行評(píng)估,為進(jìn)一步研制B病毒快速診斷試劑盒和B病毒亞單位疫苗奠定了基礎(chǔ)。
DNAMAN生物學(xué)分析軟件、DNASTAR生物學(xué)分析軟件。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/,http://www.cbs.dtu.dk/,http://www.immuneepitope.org/。
質(zhì)粒pET32-gB為研究室保存。E.coli DH5α、BL21(DE3)為研究室保存。
質(zhì)粒提取試劑盒購(gòu)自TIANGEN(天根)生物技術(shù)有限公司,膠回收試劑盒購(gòu)自WATSON(華舜)生物技術(shù)有限公司。耐熱性DNA聚合酶、限制性核酸內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶均是TaKaRa(大連寶生物)工程有限公司的產(chǎn)品。
96孔ImmobilizerTM-氨基酶標(biāo)板(Nunc)購(gòu)自華美生物技術(shù)有限公司。PCR儀(BIO-RAD公司)、水平電泳槽(BIO-RAD公司)、立式電泳槽(BIO-RAD公司)、UVP凝膠成像系統(tǒng)、恒溫?fù)u床(37℃)、培養(yǎng)箱(37℃)、冰箱(4℃、16℃、-20℃、-70℃)、水浴鍋、超凈工作臺(tái)等。
BVgD蛋白C端9個(gè)氨基酸的多肽GPARRGAPY由上海生工合成,作為陽(yáng)性對(duì)照。BV-gB篩選26個(gè)氨基酸的多肽由上海生工合成。
1.7.1.1 查找猴B病毒囊膜蛋白gB、HSV-1、HSV-2的氨基酸序列:登陸國(guó)家生物技術(shù)信息中心NCBI(National Center for Biotechnology Information),查找B virus gB、HSV-1、HSV-2、SA8、HVP-2 等病毒蛋白的氨基酸序列。
1.7.1.2 預(yù)測(cè)猴B病毒囊膜蛋白gB的信號(hào)肽序列:登陸生物序列分析中心 CBS(Center for Biological Sequence Analysis),分析猴B病毒囊膜蛋白gB的氨基酸序列,預(yù)測(cè)其信號(hào)肽序列的位置。首先,登陸 http://www.cbs.dtu.dk/網(wǎng)站的主頁(yè)。然后,打開CBS predication services并且選擇SignalP從而運(yùn)行SignalP 3.0 Server程序。最后,輸入猴B病毒囊膜蛋白gB的氨基酸序列后點(diǎn)擊運(yùn)行即可。
1.7.1.3 預(yù)測(cè)猴B病毒囊膜蛋白gB的胞外區(qū):登陸生物序列分析中心CBS(Center for Biological Sequence Analysis),分析猴B病毒囊膜蛋白gB的氨基酸序列,預(yù)測(cè)其胞外區(qū)、跨膜區(qū)、胞內(nèi)區(qū)的位置。首先,登陸http://www.cbs.dtu.dk/網(wǎng)站的主頁(yè)。然后,打開CBS predication services并且選擇TMHMM從而運(yùn)行TMHMM Server v.2.0程序。最后,輸入猴B病毒囊膜蛋白gB的氨基酸序列后點(diǎn)擊運(yùn)行即可。
1.7.1.4 比較猴B病毒囊膜蛋白gB與HSV-1、HSV-2的特異性:利用DNAMAN生物學(xué)分析軟件(也可利用DNASTAR生物學(xué)分析軟件),比較猴B病毒囊膜蛋白 gB與 HSV-1、HCV-2、SA8、HVP-2等的氨基酸同源性。首先,打開DNAMAN生物學(xué)分析軟件。然后,運(yùn)行多重序列比較程序。最后,輸入所要對(duì)比的氨基酸序列(如比較猴B病毒囊膜蛋白gB與HSV-1、HCV-2),點(diǎn)擊運(yùn)行即可得出氨基酸序列間的相同序列及不相同序列。
1.7.1.5 預(yù)測(cè)猴B病毒囊膜蛋白gB的抗原表位:登陸抗原表位數(shù)據(jù)庫(kù)和分析資源站IEDB(Immune Epitope Database and Analysis Resource)的網(wǎng)站http://www.immuneepitope.org/,利 用 Epitope Prediction and Analysis Tools對(duì)猴B病毒囊膜蛋白gB的氨基酸序列進(jìn)行抗原表位的預(yù)測(cè)。也可以利用生物序列分析中心CBS的BepiPred 1.0 Server程序或者DNASTAR軟件中的Protean Program來(lái)完成抗原表位的預(yù)測(cè)。
1.7.1.6 篩選猴B病毒囊膜蛋白gB的特異性抗原表位:基于以上氨基酸序列信號(hào)肽、跨膜區(qū)的分析結(jié)果,同源性的比較結(jié)果以及抗原表位的預(yù)測(cè)結(jié)果,從而篩選出猴B病毒囊膜蛋白gB的特異性抗原表位。符合實(shí)驗(yàn)要求的猴B病毒囊膜蛋白gB的特異性抗原表位應(yīng)滿足以下條件:篩選出的氨基酸序列應(yīng)該盡量避開信號(hào)肽區(qū)域、跨膜區(qū)以及胞內(nèi)區(qū),并且是不具有同源性的序列,當(dāng)然更為重要的是經(jīng)抗原表位預(yù)測(cè)顯示其具有抗原表位。
1.7.2.1 gB上篩選表位的原核表達(dá):分別根據(jù)目的表位序列設(shè)計(jì)引物,以陽(yáng)性質(zhì)粒pET32-gB為模板擴(kuò)增多個(gè)表位序列,經(jīng)酶切、連接、轉(zhuǎn)化后送至英駿生物公司測(cè)序,結(jié)果正確后將其插入表達(dá)載體pET32b(+),在 BL21(DE3)內(nèi)原核表達(dá),SDSPAGE檢測(cè)蛋白表達(dá)水平。
1.7.2.2 Ni柱純化:將以包涵體形式表達(dá)的菌體蛋白收集后超生破碎,離心后取菌體沉淀用含2 mol/L尿素的變性液重懸,攪拌溶解2 h;12000 r/min離心20 min;將沉淀用含6 mol/L尿素的變性液重懸,攪拌至溶解;將Ni柱用平衡液平衡,加入變性蛋白液使目的蛋白與Ni柱結(jié)合,然后用含咪唑的洗脫液將目的蛋白從柱上洗脫,同時(shí)復(fù)性蛋白,收集蛋白峰4℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.7.2.3 用Western-blot對(duì)gB表位的特異性進(jìn)行鑒定:經(jīng)SDS-PAGE電泳后,將凝膠上的蛋白轉(zhuǎn)印至PVDF膜上,放入含有封閉液的平皿中,封口后4℃封閉過(guò)夜。然后用0.1 mol/L的PBS洗滌三次,加入用封閉液配制的1∶1000倍稀釋的His·Tag多克隆抗體,37℃作用1 h,PBS漂洗三次。加入1∶500倍稀釋的辣根酶標(biāo)記的山羊抗小鼠IgG作為二抗,37℃作用1 h。用PBS漂洗三次。加入DAB顯色液,室溫顯色待觀察到明顯條帶時(shí)用純水終止反應(yīng)。拍攝照片后干燥保存反應(yīng)膜。
1.7.2.4 gB-26肽表位ELISA方法的建立:96孔ImmobilizerTM-氨基酶標(biāo)板(Nunc)每孔分別包被100~500 ng gB-26肽和gD-9肽表位合成肽,不蓋蓋,37℃過(guò)夜;用100%甲醇室溫固定15 min,每孔100 μL;扣干后用洗滌液洗滌,3×5min;加入封閉液(含3%BSA)室溫封閉 1 h,每孔200 μL;扣干后用洗滌液洗滌,3×5 min;加入稀釋液(含1%BSA)1∶50倍稀釋的待檢血清,每孔 100 μL,37℃ 孵育 90 min;扣干后用洗滌液洗滌,3×5 min;加入稀釋液(含0.02%Tween-20)1∶(4000~12000)倍稀釋的SPA,每孔 100 μL,37℃孵育 40 min;扣干后用洗滌液洗滌,3×5 min;用 OPD顯色,37℃ 15 min;終止液終止反應(yīng),酶標(biāo)儀450 nm讀數(shù)。
1.7.2.5 gB-26肽表位ELISA方法的評(píng)估:將人工合成的gB-26肽與gD-9肽分別包被于酶標(biāo)板上,對(duì)相同42份血清進(jìn)行ELISA檢測(cè),比較其檢測(cè)結(jié)果1~6列為9肽包被;7~12列為26肽包被(圖1)。A~G排分別加入陽(yáng)性血清和陰性血清,H排分別加入4份小鼠血清和2份空白對(duì)照。
圖1 gB-26肽與gD-9肽ELISA 96孔板加樣示意圖Fig.1 The ELISA microplate delineation of gB-26 peptide and gD-9 peptide
利用生物序列分析中心CBS(Center for Biological Sequence Analysis)的SignalP 3.0 Server程序分析猴B病毒囊膜蛋白gB的氨基酸序列,預(yù)測(cè)得出其信號(hào)肽序列第34和35位氨基酸處。
利用生物序列分析中心CBS(center for biological sequence analysis)的TMHMM Server v.2.0程序,分析猴B病毒囊膜蛋白gB的氨基酸序列,預(yù)測(cè)得出其胞外區(qū)是第1個(gè)氨基酸至第762個(gè)氨基酸,跨膜區(qū)是第763個(gè)氨基酸至第785個(gè)氨基酸、胞內(nèi)區(qū)是第786個(gè)氨基酸至第892個(gè)氨基酸。
利用IEDB網(wǎng)站的Epitope Prediction andAnalysis Tools、DNASTAR軟件中的 Protean Program程序,分別對(duì)猴B病毒囊膜蛋白gB的氨基酸序列進(jìn)行抗原表位的預(yù)測(cè)。鑒于抗原表位預(yù)測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確率在15%~75%之間,因而不同工具的抗原表位預(yù)測(cè)結(jié)果有少許的不同(圖2a,2b,見(jiàn)彩插Ⅲ)。圖2a中橫線上方黃色區(qū)域表示表位可能分布區(qū)域,圖2b中黑線上方紅色區(qū)域表示表位可能分布區(qū)域。
根據(jù)表位預(yù)測(cè)和猴B病毒囊膜蛋白gB特異性序列分析,從gB蛋白上篩選出gB-24、gB-25、gB-26、gB-284個(gè)抗原表位,其氨基酸序列如下:gB 24肽(32-55)aaatpvvsp raspappvpa atptf;25肽(56-80)pdddn dgeagaapga pgtnasveag;26肽(43-68)spappvpa atptfpdddndgeagaap;28肽(453-480)rellreqe rrpgdaaatp kpsadppdve。
以陽(yáng)性質(zhì)粒pET32-gB為模板,經(jīng)PCR擴(kuò)增后,在用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),出現(xiàn)DNA條帶,約為100 bp,與預(yù)期結(jié)果相一致(圖3)。
圖3 gB四表位基因片段PCR擴(kuò)增電泳圖Fig.3 The PCR product of four eiptope of gB
將這4個(gè)表位核酸片段分別插入原核表達(dá)載體pET32b(+)中進(jìn)行原核表達(dá)。轉(zhuǎn)化BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng),菌液中加入IPTG至終濃度1mmol/L進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),分別于誘導(dǎo)前后進(jìn)行采樣,最后對(duì)處理后的樣品進(jìn)行SDS-PAGE鑒定,在27×103處出現(xiàn)融合蛋白(圖4),圖中可見(jiàn)3泳道的gB-26肽表位蛋白量高。
大量培養(yǎng)表達(dá)gB-26融合蛋白克隆菌,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后,用Ni柱純化gB-26蛋白變性液,洗脫曲線中有兩個(gè)峰,為峰1和峰2,用SDS-PAGE檢測(cè),洗脫液峰2中含有帶His標(biāo)簽的gB-26融合蛋白 (圖5a)。
圖4 gB四表位SDS-PAGE電泳圖Fig.4 The SDS-PAGE electropherogram of gB four eipitopes
將gB-26表位純化后融合蛋白SDS-PAGE電泳后,轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,加上His抗體后又棕色條帶出現(xiàn)(圖5b),表明純化蛋白為目的表位蛋白。
圖5 gB-26表位融合蛋白SDS-PAGE電泳圖(5a)和Western-blot分析(5b)Fig.5 The SDS-PAGE electropherogram(5a)and Western-blot analyses(5b)of gB-26 epitope fusion protein
用梯度稀釋法,確定了gB-26肽和gD-9肽兩種抗原系統(tǒng)的ELISA方法,最佳工作條件如下:(1)gB-26肽:每孔包被200 ng;酶標(biāo)抗體1∶10000。(2)gD-9肽:每孔包被100 ng;酶標(biāo)抗體1∶10000。
分別以gB-26肽和gD-9肽為包被抗原,檢測(cè)猴B病毒抗原片檢測(cè)陽(yáng)性血清和陰性血清各21份,gD-9肽的陽(yáng)性率為76.2%,陰性率100%;gB-26肽的陽(yáng)性率為42.9%,陰性率100%。結(jié)果表明篩選的gB-26肽表位與文獻(xiàn)報(bào)道gD-9肽的陰性檢測(cè)結(jié)果完全符合,陽(yáng)性檢測(cè)率稍低。
近年來(lái),隨著生物信息學(xué)的快速發(fā)展,其在表位預(yù)測(cè)和輔助鑒定方面的作用得到研究者的高度關(guān)注和認(rèn)可,并已獲得一定的發(fā)展和應(yīng)用。Cha等[5]構(gòu)建了腫瘤細(xì)胞NPLs,通過(guò)患者血清中的抗體篩選得到了腫瘤相關(guān)抗原表位。篩選自NPLs的表位引起的免疫應(yīng)答更加接近于蛋白抗原激起的反應(yīng)[6]。綜合利用分子生物學(xué)、生物信息學(xué)和免疫學(xué)手段篩選出猴B病毒囊膜蛋白gB的抗原表位,對(duì)于B病毒診斷和多表位疫苗的研制具有重要意義。猴B病毒囊膜蛋白gB的胞外區(qū)部分是刺激機(jī)體產(chǎn)生抗體的有效抗原成分,當(dāng)然,并不排除抗原的跨膜區(qū)和胞內(nèi)區(qū)部分在刺激機(jī)體產(chǎn)生抗體的過(guò)程中也發(fā)揮著一定的作用,但有一點(diǎn)可以肯定的是抗原的胞外區(qū)部分較跨膜區(qū)和胞內(nèi)區(qū)部分有更好的免疫原性和反應(yīng)原性,因而我們偏向于在猴B病毒囊膜蛋白gB的胞外區(qū)部分尋找特異性的抗原表位。
表位預(yù)測(cè)主要依據(jù)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)、親水性、表面可及性、抗原性指數(shù)以及柔韌性等參數(shù),預(yù)測(cè)抗原的表位序列。目前開發(fā)的分析軟件正是基于不同參數(shù)組合形成的數(shù)據(jù)庫(kù),因而預(yù)測(cè)的結(jié)果可能有較大差異。對(duì)比不同分析軟件(準(zhǔn)確性為15%~75%)的預(yù)測(cè)結(jié)果,既能提高預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性,又盡可能覆蓋所有表位。因此,我們綜合多種分析軟件的預(yù)測(cè)結(jié)果,并結(jié)合gB蛋白與其它病毒比較的特異區(qū)域,從而盡可能的提高抗原表位預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。
在對(duì)猴群B病毒抗體檢測(cè)中,目前我國(guó)使用HSV-1作為BV的替代抗原,廣泛應(yīng)用于對(duì)于實(shí)驗(yàn)猴群B病毒抗體的常規(guī)檢測(cè)。雖然B病毒與HSV-1具有共同抗原,B病毒免疫血清可以完全中和HSV-1抗原,但HSV-1免疫血清不能完全中和B病毒[7]。Perelygina以gD的特異性表位(氨基酸序列為GPARRGAPY,位于蛋白序列的362~370氨基酸殘基)合成肽和重組蛋白作為ELISA或dot blot的檢測(cè)抗原,特異性為100%,敏感性為67%[8]。肖鏡等[9]進(jìn)一步對(duì)該表位的特異性進(jìn)行研究,檢測(cè)結(jié)果與美國(guó)實(shí)驗(yàn)室BV抗體檢測(cè)結(jié)果的符合率達(dá)85%。本文中用篩選出的gB-26肽表位作為檢測(cè)抗原,與文獻(xiàn)報(bào)道gD-9肽表位相比,特異性較強(qiáng),但陽(yáng)性檢出率稍低。這提示我們單個(gè)表位的抗原性有較大差異,而且表位氨基酸片段大小可能對(duì)表位特異性也有關(guān)系。在感染動(dòng)物體內(nèi),B病毒11種囊膜蛋白(分別為gB~gM)都能檢測(cè)到相應(yīng)的抗體,其中g(shù)B、gC、gD和gG的抗體滴度最高、出現(xiàn)時(shí)間最早(感染后7 d產(chǎn)生),在體內(nèi)駐留時(shí)間也最長(zhǎng)(2年以上)。這提示我們可以進(jìn)一步篩選特異性表位,并考慮多表位的串聯(lián)來(lái)增強(qiáng)其特異性和敏感性。
[1]郭秀嬋.B病毒感染及防治[J].病毒學(xué)報(bào),2005,21(6):481-484.
[2]Cohen JI,Davenport DS,Stewart JA,et al.Recommendations for prevention of and therapy for exposure to B virus[J].MAJOR ARTICLE,2002,35:1191-1203.
[3]Tyler SD,Peters GA,Severini A.Complete genome sequence of cercopithecine herpesvirus 2(SA8)and comparison with other simplex viruses[J].Virology,2005,331:429-440.
[4]李曉波,賀爭(zhēng)鳴.猴B病毒檢測(cè)技術(shù)研究與應(yīng)用進(jìn)展[J].實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué),2007,24(4):59-62.
[5]Cha SC,Kwak LW,Ruffini PA,et al.Cloning of B cell lymphoma-associated antigens using modified phage-displayed expression cDNA library and immunized patient sera[J].J Immunol Methods,2006,312:79-93.
[6]Matthewsl J,Davis R,Smith GP.Immunogenically fit subunit vaccine components via epitope discovery from natural peptide librarie[J].J Immunol,2002,169:837-846.
[7]周亞敏,李紹東,楊森富,等.猴皰疹病毒(B病毒)抗體檢測(cè)方法的比較研究[J].中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志,2005,15(4):237-239.
[8]Perelygina L,Zurkuhlen H,Patrusheva I,et al.Identification of a herpes B virus-specific glycoprotein D immunodominant epitope recognized by natural and foreign hosts[J].J Infect Dis,2002,186:453-461.
[9]肖鏡,付瑞,賀爭(zhēng)鳴,等.猴B病毒BVgD多肽ELISA檢測(cè)方法的建立[J].實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué),2008 25(2):20-24.
Selection and Identification of Specific Antigen Epitope in Monkey B Virus Envelop Protein gB
ZHANG Xiao-fei,YE Hua-hu,ZHAO Yan-bin,WANG Dong-ping,ZHAO Hong-wei,BAI Jie-ying
(Laboratory Animal Center,Academy of Military Medical Science,Beijing 100071,China)
Objective To select and identify B virus envelop protein gB specific antigen epitope and to apply to the detection of B virus.Methods Using protein sequence comparison and epitope prediction to select the gB specific antigen eitope.Then obtaining the fusion protein by prokaryon expression and Western-blot assessment,building the ELISA method to detect epitope and evaluating the effects.Results The gene sequence of epitopewas completely correct,the molecular weight of recombination protein identifying by Western-blot was about 27×103.The gB-26 epitide was better in specificity and lower in sensitivity.Conclusion Building up methods to selecet and identify specific antigen eitope.
B virus;Envelop protein gB;Antigen epitope;Selection;Identification
512.92
A
1671-7856(2010)10-0010-05
10.3969/j.issn.1671.7856.2010.10.004
2010-06-25
圖2 Epitope prediction and analysis tools(a)和protean program程序(b)的抗原表位預(yù)測(cè)結(jié)果
Fig.2 The prediction of antigen epitope using epitope prediction and analysis tools(a)and protean program (b)
注:橫軸表示氨基酸數(shù);a中橫線上方黃色區(qū)域表示表位可能分布區(qū)域,b中黑線上方紅色區(qū)域表示表位可能分布區(qū)域。
Note: horizontal axis means number of animo acids; yelloW area means prediction epitope in a, red area above the black line means prediction epitope in b.
軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院科研創(chuàng)新基金資助。
張小飛(1979-),女,博士,主要從事實(shí)驗(yàn)動(dòng)物微生物學(xué)研究。E-mail:wangyizxf@163.com
白杰英(1977-),男,博士,副主任,主要從事實(shí)驗(yàn)動(dòng)物免疫與生物化學(xué)研究。E-mail:baijieying@126.com