區(qū)偉佳,王 榮,李敏清,袁英英,李華興
(華南農(nóng)業(yè)大學(xué)資源環(huán)境學(xué)院,廣州 510642)
華南地區(qū)大豆根內(nèi)拮抗菌AF-67篩選與鑒定*
區(qū)偉佳,王 榮,李敏清,袁英英,李華興**
(華南農(nóng)業(yè)大學(xué)資源環(huán)境學(xué)院,廣州 510642)
篩選生防菌共436株,有生防性能71株,占16.3%,抑菌效果較好8株,占1.8%,能快速高命中率的獲得具有防病效果好、抑菌譜廣的生防菌株。內(nèi)生菌AF-67與Fusarium oxysporum共培養(yǎng)時(shí),能使其菌絲體及其分生孢子生長(zhǎng)明顯畸變。經(jīng)16S rDNA基因序列分析,AF-67被初步鑒定為Bacillus amyloliquefaciens。
大豆根腐??;根內(nèi)拮抗菌;篩選;鑒定;16S rDNA
大豆根腐病(Soybean root rot)在國(guó)內(nèi)外大豆產(chǎn)區(qū)均有發(fā)生,是土傳病害,危害較重[1]。該病對(duì)產(chǎn)量影響大,感病品種產(chǎn)量損失一般為5%~10%,嚴(yán)重的可達(dá)90%以上,甚至絕產(chǎn)。每年給國(guó)家造成巨額經(jīng)濟(jì)損失[2,3]。華南大豆產(chǎn)區(qū)高溫多雨的氣候環(huán)境,土壤緊實(shí)粘重、偏酸等均有利于根腐病的發(fā)生[4],關(guān)于解決華南產(chǎn)區(qū)大豆根腐病的研究越來越受科研工作者的關(guān)注。
生物防治手段普遍應(yīng)用于植物病害防治。許多根際或根內(nèi)微生物同時(shí)具有防病、促生作用。土壤施用含有該生防菌株的生物肥料能減少農(nóng)藥的用量,降低成本,同時(shí)還能改善土壤條件及農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)[5]。在生防菌株的篩選源上,考慮生防菌在植株根部的定殖效果,著重研究從植株根際或根內(nèi)中篩選。有研究表明,從根際或根內(nèi)分離篩選出的拮抗菌能更好的定殖在植株根系[6,7]。
芽孢桿菌作為目標(biāo)菌群,更能適合于生物肥料工業(yè)生產(chǎn)的要求。研究通過對(duì)有效生防菌的16S rDNA序列分析,確定生防菌的種類和來源。旨在提供一種快速、準(zhǔn)確的生防菌選鑒方法。
采自華南農(nóng)業(yè)大學(xué)博羅、寧西大豆試驗(yàn)田的大豆植株。
尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum) 3個(gè)高致病性菌株 F1、F2、F5;
絲核菌(Rhizoctoniasp);
小核菌(Sclerotium rolfssii);
以上供試菌種由華南農(nóng)業(yè)大學(xué)資源環(huán)境學(xué)院根系中心分離與提供。
選取健康強(qiáng)壯大豆植株根系,表面消毒后,無(wú)菌狀態(tài)置于滅菌研缽,加入適量LB培養(yǎng)基和滅菌石英砂,充分研磨后轉(zhuǎn)入含50mL LB液體培養(yǎng)基中,150rpm富集培養(yǎng)30min。取出,置于80℃恒溫水浴10min。培養(yǎng)液稀釋后,取適當(dāng)濃度涂布LB平板,36℃培養(yǎng)48h后挑取形態(tài)不同、長(zhǎng)勢(shì)較好的菌落,劃線純化。
距PDA平板中心3cm處互相垂直四個(gè)方向點(diǎn)接拮抗細(xì)菌,平板的中央接種經(jīng)過活化的尖孢鐮刀菌菌塊(直徑5mm),28℃黑暗培養(yǎng)12d后記錄菌圈直徑,設(shè)5個(gè)重復(fù)。公式如下:
同時(shí)按上述的方法對(duì)絲核菌、小核菌進(jìn)行拮抗性測(cè)定。
菌間相容性采用交叉劃線法:取待檢拮抗菌液依次兩兩交叉劃線,在劃線的交叉處出現(xiàn)透明不生長(zhǎng),為菌間不相容;無(wú)出現(xiàn)透明點(diǎn),能正常生長(zhǎng)為菌間相容[8,9]。
形態(tài)鑒定參照《伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》[10];AF-67鑒定方法采用分子生物學(xué)16S rDNA序列分析:取培養(yǎng)至對(duì)數(shù)期菌液,用細(xì)菌DNA提取試劑盒提取AF-67的總DNA。配制擴(kuò)增體系50uL,其中,正向引物K01(FC27):5’AGAGTTTGATCCTGGCTCA G 3’;反向引物K02(RC1492):5’TACGGCTACCTT GTTACGACTT 3’。PCR產(chǎn)物由北京奧科生物技術(shù)有限責(zé)任公司測(cè)序。序列結(jié)果通過BLASTN程序在GenBank核酸數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行分析,確定其分類地位。
將尖孢鐮刀菌(F5) 菌塊(直徑5mm)與AF-67菌懸液3mL加入50mLKB培養(yǎng)液中,28℃,150rpm培養(yǎng)3d。吸取少量培養(yǎng)液,顯微鏡下觀察真菌菌絲的生長(zhǎng)情況。對(duì)照接病原菌塊的KB培養(yǎng)液。
從大豆根內(nèi)篩選出候選生防菌共436株,其中具有生防性能71株,占16.3%,其中對(duì)大豆根腐病原菌具明顯抑制作用8株,占1.8%,抑菌效果見表1。
試驗(yàn)證明該法能高命中率的獲得具有防病效果好、抑菌譜廣的生防菌株。由表1可知,所得菌株對(duì)峙試驗(yàn)后15d仍保持高抑菌效果性能。
表1 生防菌對(duì)大豆根腐病菌抑菌效果 %
生防菌間相容性測(cè)試結(jié)果顯示(見表2),菌株AF8與其他大部分生防菌顯示不相容性,其他菌株均顯示可以共存。
表2 生防菌間相容性測(cè)試結(jié)果
圖1 拮抗菌AF-67的16S rDNA電泳條帶及其測(cè)序峰圖片段
優(yōu)選有代表性,編號(hào)為AF-67拮抗細(xì)菌,16S rDNA序列比對(duì)結(jié)果經(jīng)GenBank(NCBI)比對(duì),登記號(hào)為lcl58891。根據(jù)同源性比較(見表3),與解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis subsp) 同源性最高,達(dá)99%,與地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)、短小芽孢桿菌 (Bacillus pumilus) 同源性也達(dá)97%。
表3 AF-67 16S rDNA在GenBank(NCBI)比對(duì)結(jié)果
拮抗菌16S rDNA的PCR擴(kuò)增條帶單一、清晰,位于約1.5kb處。其序列峰圖效果理想,無(wú)出現(xiàn)錯(cuò)峰套峰,測(cè)序結(jié)果可靠性高(見圖1)。
測(cè)序結(jié)果在GenBank核酸數(shù)據(jù)庫(kù)中分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(見圖2),分析遺傳距離,其種間親緣關(guān)系表明AF-67與B.Amyloliquefaciens的親緣關(guān)系最近,且在同一個(gè)分支中,這再次驗(yàn)證了AF-67最可能為解淀粉芽孢桿菌。
拮抗菌AF-67與鐮刀菌共培養(yǎng)后發(fā)現(xiàn),能明顯抑制病菌菌絲的生長(zhǎng)(見圖3)。菌絲體局部明顯膨大、腫脹,菌絲不發(fā)育,同時(shí)有畸形、斷裂現(xiàn)象,菌絲體分隔數(shù)顯著增多。細(xì)胞內(nèi)含物大量凝聚,部分形成大且透明的空泡。與對(duì)照相比,經(jīng)共培養(yǎng)的鐮刀菌產(chǎn)孢量明顯減少。
圖2 AF-67的系統(tǒng)發(fā)育樹
圖3 AF-67對(duì)尖孢鐮刀菌菌絲發(fā)育影響
鑒于芽孢桿菌屬的生物安全性、耐熱特性和生產(chǎn)上的可操作性,試驗(yàn)?zāi)芸焖僦苯雍Y選出目標(biāo)生防菌。結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù),對(duì)于難于培養(yǎng)、生化反應(yīng)不明顯及遺傳表型等手段不能鑒定的細(xì)菌,采用此法提供快捷可行的解決方案。
造成大豆根腐的致病菌種類繁多雜亂,地域差異性大[11]。篩選的8株生防菌對(duì)幾種華南地區(qū)的常見致病菌均顯示較好抑菌效果。靶標(biāo)菌中,國(guó)內(nèi)以Fusarium oxysporum的出現(xiàn)頻率最多[12,13],大豆項(xiàng)目科研基地的感病植株,其5號(hào)高致病性菌株的分離率最高。篩選的AF-67對(duì)Fusarium oxysporum菌絲生長(zhǎng)有一定的抑制作用,具開發(fā)利用潛力。
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In this study,the improved traditional screening methods could quickly obtain strains which showed antagonistic activity against soybean root rot and broad antagonistic spectrum.The activity of 436 strains assayed,16.3%of them showed antagonistic activity againstF.oxysporumf.sp.soybean and one of them,strain AF67 isolated from soybean roots was the best.Co-culture with Fusarium oxysporum,mycelium and conidia were evident distortion.Based on the sequence of 16S rDNA,strain AF67 was identified asBacillusamyloliquefaciens.
Soybean root rot;Antifungal Entophytic Bacteria;Isolation;Characterization;16S rDNA
S432.4+4
B
1674-3547(2010)02-0018-04
2009-12-22;修回日期:2010-01-12
國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(40971155);廣東省“十一五”攻關(guān)項(xiàng)目(2006B20301050),廣東省教育部產(chǎn)學(xué)研結(jié)合項(xiàng)目(2009B090300330),廣東省農(nóng)業(yè)廳科技項(xiàng)目(粵農(nóng)土肥(2004)28號(hào))。
李華興,男,教授,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)資源環(huán)境學(xué)院,E-mail:huaxli@scau.edu.cn