国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株絲氨酸蛋白酶全長(zhǎng)基因的克隆及生物信息學(xué)分析

2011-01-08 08:46王俊偉孟慶玲喬軍王為升羅建勛才學(xué)鵬趙春光
關(guān)鍵詞:絲氨酸孢菌線蟲

王俊偉,孟慶玲,喬軍,王為升,羅建勛,才學(xué)鵬,趙春光

(1石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,石河子832003;2中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所,蘭州730046)

少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株絲氨酸蛋白酶全長(zhǎng)基因的克隆及生物信息學(xué)分析

王俊偉1,孟慶玲1,喬軍1,王為升1,羅建勛2,才學(xué)鵬2,趙春光1

(1石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,石河子832003;2中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所,蘭州730046)

根據(jù)已經(jīng)報(bào)道的少孢節(jié)叢孢菌絲氨酸蛋白酶基因序列,設(shè)計(jì)特異性引物,通過(guò)PCR技術(shù)對(duì)少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株(XJ-XA)絲氨酸蛋白酶(命名為Aoz1)基因序列進(jìn)行了擴(kuò)增,并與國(guó)內(nèi)外少孢節(jié)叢孢菌不同地域分離株相應(yīng)序列進(jìn)行了同源性分析,構(gòu)建該基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果顯示,XJ-XA Aoz1基因全長(zhǎng)為1344bp,包含2個(gè)外顯子和1個(gè)63bp的內(nèi)含子(第517~579位核苷酸),編碼426個(gè)氨基酸。Aoz1的信號(hào)肽位于氨基酸序列的第1~21位氨基酸;氨基酸序列的第160~171位、200~210位和351~361位分別是天冬氨酸(D)、組氨酸(H)和絲氨酸(S)活性位點(diǎn)所在區(qū)域,表明該酶屬于Subtilase家族;該酶還含有2個(gè)潛在的N末端糖基化位點(diǎn)及2個(gè)與底物結(jié)合的S1區(qū)。系統(tǒng)發(fā)生分析發(fā)現(xiàn),少孢節(jié)叢孢菌不同地域分離株Aoz1基因序列具有較高的親緣性,與其他捕食線蟲性真菌Aoz1基因親緣性較遠(yuǎn)。本研究為研發(fā)家畜線蟲病生物防控制劑奠定了前期基礎(chǔ)。

少孢節(jié)叢孢菌;絲氨酸蛋白酶;基因克??;生物信息學(xué)

捕食線蟲性真菌是殺線蟲性真菌中的一類以營(yíng)養(yǎng)菌絲特化形成的捕食器(黏性菌絲、粘性菌網(wǎng)、黏性分枝、黏性球、收縮環(huán)、非收縮環(huán)和冠囊體等)捕捉線蟲的真菌[1-2],主要包括節(jié)叢孢屬(Arthrobotrys Corda)、隔指孢屬(Dactylella Grove)和單頂孢屬(MonacrosporiumOudermans)等種類。近幾十年來(lái),丹麥等國(guó)開(kāi)展用捕食線蟲性真菌對(duì)動(dòng)物寄生蟲病進(jìn)行生物防控的研究,篩選出了適合本國(guó)實(shí)際作用良好的菌株,并在生產(chǎn)實(shí)踐中進(jìn)行了殺滅寄生性線蟲的試驗(yàn),取得了理想的效果。其中,丹麥已申報(bào)了國(guó)際專利,并進(jìn)行了商品化開(kāi)發(fā)與推廣試驗(yàn)研究。

近年來(lái),人們對(duì)真菌捕食線蟲的分子機(jī)制有了較深入研究,先后發(fā)現(xiàn)并克隆了一些真菌侵染線蟲的相關(guān)基因[3-6],這為研發(fā)預(yù)防動(dòng)物消化道線蟲的生物防控制劑奠定了一定的基礎(chǔ)[7-9]。新疆的微生物資源豐富,某特有的生態(tài)環(huán)境使得一些微生物具有獨(dú)特的生物學(xué)特性。本研究在分離多株具有強(qiáng)捕食線蟲活性真菌的研究基礎(chǔ)上,利用PCR技術(shù)對(duì)少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株絲氨酸蛋白酶(Aoz1)的編碼基因進(jìn)行擴(kuò)增、克隆和測(cè)序,通過(guò)分子生物學(xué)軟件對(duì)不同種類真菌的Aoz1基因序列進(jìn)行比較分析,了解該基因在不同種屬菌株間的同源性和相關(guān)分子信息,旨在為下一步進(jìn)行該功能性基因的異種表達(dá)和對(duì)少孢節(jié)叢孢菌重組菌構(gòu)建奠定理論基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

捕食線蟲性真菌-少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株(Arthrobotrys oligospora XJ-XA)由石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院寄生蟲學(xué)實(shí)驗(yàn)室提供。GPYA培養(yǎng)基由本研究室自配(15g葡萄糖,2g蛋白胨,5g酵母提取物,加蒸餾水定容至1L)。Taq plus DNA聚合酶、dNTPs、瓊脂糖凝膠電泳回收試劑盒購(gòu)自上海生物工程公司,pMD18-T載體和200bp DNA Ladder Marker均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司。

1.2 方法

1.2.1 目的基因的提取

將少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株(Arthrobotrys oligospora XJ-XA)接種于GPYA培養(yǎng)基中,在20±1℃霉菌培養(yǎng)箱中培養(yǎng)1周。取適量的菌絲,然后按照Biospin真菌基因組DNA提取試劑盒的說(shuō)明書進(jìn)行提取少孢節(jié)叢孢菌的DNA。

1.2.2 引物設(shè)計(jì)與合成

根據(jù)GenBank中發(fā)表的相關(guān)基因序列,采用Premier 5.0引物軟件設(shè)計(jì)少孢節(jié)叢孢菌絲氨酸蛋白酶編碼序列的特異性引物:

上游引物 Aoz1-f:5′-ATGCTTACGAACGGCCTCATCTC-3′;

下 游 引 物 Aoz1-r:5′-CTAGCTAGCAACAATCGCGACTTGGTG-3′。

引物由生工生物工程(上海)有限公司合成。將合成的引物進(jìn)行低溫瞬時(shí)離心,加入滅菌三蒸水配成100 μm儲(chǔ)備液,于-20℃保存,使用時(shí)稀釋為25μm。

1.2.3 PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系的建立及反應(yīng)條件

總反應(yīng)體系為50μL,體系成分:取提取的DNA模板 2μL,10×PCR Buffer 5μL,2.5mmol/L dNTPs 4μL,Aoz1-f(25μm/L)、Aoz1-r(25μm/L)各1μL,d3H2O 36.8μL,Taq DNA聚合酶(5U/μL)0.2 μL混勻。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3min;94℃變性40 s,54℃退火40s,72℃延伸150s,36個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。最后降溫至4℃保存。

1.2.4 Aoz1基因的克隆

將PCR產(chǎn)物在1.0%瓊脂糖凝膠上電泳,并設(shè)Marker和陰性對(duì)照,以檢測(cè)其純度及堿基序列長(zhǎng)度。電泳完成后,小心取出膠板,置于電泳凝膠紫外成像儀中,觀察拍照。對(duì)擴(kuò)增得到的PCR粗產(chǎn)物再用回收試劑盒進(jìn)行純化回收。將純化回收片段和載體pMDl8-T連接過(guò)夜,次日轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞E.coli DH5α,在氨芐青霉素平板上進(jìn)行篩選,然后做菌落PCR反應(yīng)進(jìn)一步篩選驗(yàn)證。

1.2.5 序列測(cè)定與分析

將驗(yàn)證正確的重組載體產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)有限公司直接測(cè)定核苷酸序列。利用生物在線分析軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/,http://www.expasy.org/tools/)對(duì)絲氨酸蛋白酶Aoz1中存在的信號(hào)肽、結(jié)構(gòu)域、氨基酸活性位點(diǎn)等進(jìn)行分析,并應(yīng)用MEGA5.0等軟件對(duì)新疆分離株和GenBank中發(fā)表的捕食線蟲性真菌及相關(guān)菌株的絲氨酸蛋白酶基因序列進(jìn)行分析,并采用NJ法(Neighbor-Joining Method)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

2 結(jié)果與分析

2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果

利用特異性引物擴(kuò)增出Aoz1基因序列,再經(jīng)1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),所擴(kuò)增的目的PCR產(chǎn)物的分子量約1344bp(圖1)??寺∞D(zhuǎn)化后,隨機(jī)挑取單菌落,做菌液PCR篩選驗(yàn)證,成功得到陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子(圖2)。

圖1 絲氨酸蛋白酶Aoz1基因PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1Amplification product test results of serine protease Aoz1gene by PCR

圖2 絲氨酸蛋白酶Aoz1基因陽(yáng)性克隆菌落PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.2Amplification product test results of positive transformants of serine protease Aoz1gene of Arthrobotrys oligospora XJ-XA by colony PCR

2.2 絲氨酸蛋白酶基因核苷酸及氨基酸序列生物信息學(xué)分析

經(jīng)測(cè)序,Aoz1基因全長(zhǎng)1344bp(此序列已經(jīng)提交GenBank,登錄號(hào)為JF747254),該序列由1個(gè)開(kāi)放閱讀框(ORF)組成,含有2個(gè)外顯子和1個(gè)內(nèi)含子。內(nèi)含子位于Aoz1基因的第517~579位核苷酸,大小為63bp,以GT開(kāi)頭,AG結(jié)尾,具有真菌內(nèi)含子的共同特征。用DNAMAN軟件翻譯所得序列編碼區(qū)得到蛋白質(zhì)氨基酸序列(圖3)。

圖3 少孢節(jié)叢孢菌絲氨酸蛋白酶基因和氨基酸序列Fig.3Nucleotide sequence and amino acids sequence of serine protease of Arthrobotrys oligospora

由圖3可知,序列中含有426個(gè)氨基酸;進(jìn)一步經(jīng)同源性分析得知:翻譯后氨基酸序列與GenBank中發(fā)表的少孢節(jié)叢孢菌的PII蛋白酶的氨基酸序列同源性為97.67%,與少孢節(jié)叢孢菌中性絲氨酸蛋白酶氨基酸序列的同源性為97.89%。與其他蛋白酶同源性比對(duì)顯示,Aoz1為典型的絲氨酸蛋白酶。Aoz1絲氨酸蛋白酶含有的信號(hào)肽位于序列的第1~21位,包含起始密碼子甲硫氨酸(M)、1個(gè)由8個(gè)氨基酸殘基(Leu-Leu-Ala-Ile-Ala-Gly-Leu-Ala)組成的疏水中心以及在信號(hào)肽酶酶切位點(diǎn)之前的3個(gè)疏水殘基(Ala-Phe-Ala)。Aoz1前肽切割位點(diǎn)在分泌性蛋白的N末端之前,且前肽的最后1個(gè)氨基酸殘基是位于序列第123位的酪氨酸(Y);氨基酸序列的第160~171位、200~210位、351~361位分別是天冬氨酸(D)、組氨酸(H)、絲氨酸(S)活性位點(diǎn)所在區(qū)域,表明該酶屬于Subtilase家族。成熟的Aoz1絲氨酸蛋白酶序列包括303個(gè)氨基酸,分子量為31.4kDa,分子式為C1364H2129N389O454S6,等電點(diǎn)理論值為5.97;它還包括2個(gè)潛在的N末端糖基化位點(diǎn)(Asn178、Asn252)及與底物結(jié)合的S1區(qū)(SBP)Ser259Leu260Gly261和 Ala285Ala286Gly287(圖4);而且高度保守的Asn288在維持反應(yīng)中間物的穩(wěn)定性方面起著關(guān)鍵性作用。

圖4 Aoz1基因的內(nèi)含子/外顯子和基本特征的模式圖Fig.4Diagram of Aoz1gene showing the presence of intron/exons and basic features

2.3 少孢節(jié)叢孢菌XJ-XA株絲氨酸蛋白酶Aoz1的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

利用SOPMA在線軟件對(duì)少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株XJ-XA的絲氨酸蛋白酶Aoz1進(jìn)行蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(圖5)。預(yù)測(cè)Aoz1蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)包括426個(gè)氨基酸,其中115個(gè)氨基酸(占27.00%)可能形成α-螺旋(h),95個(gè)氨基酸(占22.3%)可能形成延伸鏈(e),189個(gè)氨基酸(占44.37%)可能形成無(wú)規(guī)卷曲(c),27個(gè)氨基酸(占6.34%)可能形成β-轉(zhuǎn)角(t),但沒(méi)有形成β-折疊片。由此可知該蛋白質(zhì)主要以α-螺旋、延伸鏈及無(wú)規(guī)卷曲為主。

圖5 利用SOPMA在線軟件預(yù)測(cè)的少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株XJ-XA絲氨酸蛋白酶的二級(jí)結(jié)構(gòu)Fig.5Predicted secondery structure of serine protease Aoz1of A.oligospora XJ-XA by using SOPMA secondary structure prediction method

2.4 少孢節(jié)叢孢菌XJ-XA株與世界不同地域分離株同源性比較

用DNAStar中的Clustal V軟件對(duì)測(cè)序所得的少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株XJ-XA絲氨酸蛋白酶基因序列與GenBank中發(fā)表的絲氨酸蛋白酶基因編碼序列進(jìn)行分析,少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株(A.oligospora XJ-XA)絲氨酸蛋白酶基因序列與A.oligospora國(guó)外株絲氨酸蛋白酶基因、A.oligospora中性絲氨酸蛋白酶基因、A.multisecundaria絲氨酸蛋白酶基因、彎孢節(jié)叢孢菌(A.musiformis)絲氨酸蛋白酶基因、云南節(jié)叢孢菌(A.yunnanensis)絲氨酸蛋白酶基因的相似性分別為97.5%、98.3%、76.8%、81.9%和74.6%;同時(shí)發(fā)現(xiàn)屬內(nèi)種間和種內(nèi)株間相似性相差較大。

2.5 少孢節(jié)叢孢菌絲氨酸蛋白酶基因的遺傳進(jìn)化分析

借助MEGA5.0軟件包對(duì)新疆分離株(XJ-XA)和GenBank中發(fā)表的其他捕食線蟲性真菌及相關(guān)菌株的絲氨酸蛋白酶基因序列繪制了進(jìn)化樹(shù)(圖6)。從進(jìn)化樹(shù)圖上可以看出:來(lái)源于食線蟲性真菌和昆蟲病原真菌的絲氨酸蛋白酶聚成2個(gè)分枝,由共同祖先進(jìn)化而來(lái)。來(lái)自捕食線蟲性真菌的絲氨酸蛋白酶(XJ-XA Aoz1、Mc1、Aoz1、Ac1、Dv1、Ds1、Mlx、PII和SPR1等)較有規(guī)律的按捕食結(jié)構(gòu)的不同排列于進(jìn)化樹(shù)上并形成第一個(gè)分枝;來(lái)自內(nèi)寄生性真菌和昆蟲病原性真菌的絲氨酸蛋白酶(Pr1、PrA、PrK、Psp-3、VCP1和 Ver112)也依次分別較早地聚于一起并形成第二個(gè)分枝。但值得注意的是,Monacrosporium haptotylumSPR2經(jīng)核苷酸序列比對(duì)存在幾個(gè)較大堿基變異區(qū),變異程度較大,在進(jìn)化樹(shù)上單獨(dú)形成第三個(gè)分枝,其分類還有待商榷。在進(jìn)化樹(shù)圖上,XJ-XA與A.oligospora國(guó)外株、A.oligospora云南分離株較早地聚為一枝,親緣關(guān)系最近,而與隔指孢屬和單頂孢屬在遺傳距離上相對(duì)較遠(yuǎn),符合根據(jù)捕食器結(jié)構(gòu)和分生孢子等形態(tài)特征進(jìn)行分類的結(jié)果,也說(shuō)明基于功能性基因的分子生物學(xué)信息可以在一定程度上反映捕食線蟲性真菌的分類關(guān)系,但功能性基因能否作為分類的依據(jù)還有待商榷。

圖6 采用NJ法基于Aoz1基因所做的捕食線蟲性真菌的系統(tǒng)發(fā)生分析Fig.6Phylogenetic analysis of nematode-trapping fungi based on Aoz1gene with Neighbor-Joining(NJ)Method

3 討論

根據(jù)捕食器類型,捕食線蟲性真菌分成兩種,一種是套捕型捕食線蟲性真菌,代表種為少孢節(jié)叢孢菌(Arthrobotrys oligospora),可產(chǎn)生菌環(huán)、粘性菌網(wǎng)等捕食器,以套捕方式捕食線蟲幼蟲。另一種是粘捕型捕食線蟲性真菌,代表種為紡錘隔指孢菌(Dactylella ellipsospora),可形成菌結(jié)等捕食器,以粘捕的方式捕食線蟲幼蟲[10-11]。捕食線蟲性真菌的捕食過(guò)程可分為吸引、識(shí)別和黏附、侵染、消解幾個(gè)過(guò)程[11-12]。捕食線蟲性真菌在捕食線蟲時(shí),首先在線蟲誘導(dǎo)下形成捕食器,捕食器再吸引寄主線蟲并與線蟲發(fā)生特異性識(shí)別,進(jìn)而將線蟲粘著,然后在較短時(shí)間內(nèi)侵入線蟲,并于侵入后萌發(fā)產(chǎn)生普通營(yíng)養(yǎng)菌絲,同時(shí)分泌一些水解酶--胞外酶,尤其枯草桿菌蛋白酶(Subtilisin)樣絲氨酸蛋白酶,最終將線蟲消解。在侵染線蟲過(guò)程中,捕食線蟲性真菌借助機(jī)械壓力和分泌的胞外酶的聯(lián)合作用[13],促進(jìn)菌絲對(duì)線蟲體壁的直接穿透,而其中胞外酶起主導(dǎo)作用。在胞外酶中,Subtilisin樣絲氨酸蛋白酶是一種作為毒力因子的酶類,以具有天冬氨酸(D)-組氨酸(H)-絲氨酸(S)催化三聯(lián)體為特征,是許多真菌侵染線蟲的一種關(guān)鍵酶[12-13]。

在本研究中,少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株絲氨酸蛋白酶核苷酸序列推導(dǎo)的氨基酸序列與同種國(guó)外株和云南分離株的相似性分別為97.67%和97.89%,證實(shí)我們的分離株確實(shí)屬于少孢節(jié)叢孢菌(A.oligospora),擴(kuò)增所得的核苷酸序列為少孢節(jié)叢孢菌絲氨酸蛋白酶的基因序列。本次試驗(yàn)擴(kuò)增所得的少孢節(jié)叢孢菌XJ-XA株絲氨酸蛋白酶基因序列為1344bp,與同種國(guó)外分離株和云南分離株的同源性分別為97.5%和98.3%。系統(tǒng)發(fā)生分析發(fā)現(xiàn),少孢節(jié)叢孢菌(A.oligospora)新疆分離株 XJ-XA絲氨酸蛋白酶基因和瑞典株及云南分離株3株菌聚為一枝,與隔指孢屬和單頂孢屬在遺傳距離上相對(duì)較遠(yuǎn),這與基于捕食器結(jié)構(gòu)和分生孢子等形態(tài)特征進(jìn)行分類的結(jié)果相一致。研究還發(fā)現(xiàn),少孢節(jié)叢孢菌不同分離株絲氨酸蛋白酶之間存在差異,說(shuō)明少孢節(jié)叢孢菌在不同國(guó)家和地區(qū)存在不同的株,其生物學(xué)特性可能也存在差異。

動(dòng)物線蟲病是嚴(yán)重危害畜牧業(yè)發(fā)展的大敵,不僅造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,而且應(yīng)用化學(xué)驅(qū)蟲藥物已產(chǎn)生抗藥性、藥物殘留對(duì)人體的危害和生態(tài)環(huán)境污染等應(yīng)給予高度重視的問(wèn)題。因此,研發(fā)捕食線蟲性真菌及其侵染線蟲的生物制劑來(lái)控制家畜的線蟲病具有重要的意義[14-15]。

[1]Pfister D H.Castor,polluxans life histories of fungi[J].Mycologia,1997,89:1-23.

[2]Scholler M,Hagedorn G,Rubner A.A revaluation of predatory orbiliaceous fungi II.A new generic concept[J].Sydowia,1999,51:89-113.

[3]Zhao M I,Mo M H,Zhang K Q.Characterization of a neutral serine protease and its full-length cDNA from the nematode-trapping fungus Athrobotrys oligospora[J].Mycologia,2004,96(1):16-22.

[4]Ahman J,Ek B,Rask L,et al.Sequence analysis and regulation of a gene encoding a cuticle-degrading serine protease from the nematophagous fungus Arthzobotrys oli-gospora[J].Microbiology,1996,142(7):1605-1616.

[5]Ahren D,Tholander M,F(xiàn)ekete C,et al.Comparison of gene expression in trap cells and vegetative hyphae of the nematophagous fungus Monacrosporium haptotylum[J].Microbiology,2005,151:789-803.

[6]Iijima N,Yoshino H,Ten L C,et al.Two genes encoding fruit body lectins of pleurotus cornucopiae:sequence similarity with the lectin of a nematode-trapping fungus[J].Bioscience,Biotechnology and Biochemistry,2002,66(10):2083-2089.

[7]Tunlid A,Ahman J,Oliver R P.Transformation of the nematode-trapping fungus Arthrobotrys oligospora[J].FEMS Microbiology Letters,1999,173(1):111-116.

[8]Ahman J,Johansson T,Olsson M,et al.Improving the pathogenicity of a nematode-trapping fungus by genetic engineering of a subtilisin with nematotoxic activity[J].Applied and Enviromental Microbiology,2002,68:3408-3415.

[9]Xu J,Mo M H,Huang X W,et al.Improvment on genetic transformation in the nematode-trapping fungus Arthrobotrys oligospora and its quantification on dung samples[J].Mycopathologia,2005,159:533-538.

[10]李天飛,張克勤.食線蟲菌物分類學(xué)[M].北京:中國(guó)科學(xué)技術(shù)出版社,2000.

[11]張克勤,劉杏忠,李天飛.食線蟲菌物生物學(xué)[M].北京:中國(guó)科學(xué)技術(shù)出版社,2001.

[12]Huang X W,Zhao N H,Zhang K Q.Extracellular enzymes serving as virulence factors in nematophagous fungi involved in infection of the host[J].Research in Microbiology,2004,155:811-816.

[13]Yang J K,Tian B Y,Liang L M,et al.Extracellular enzymes and the pathogenesis of nematophagous fungi[J].Appl Microbiol Biotechnol,2007,75:21-31.

[14]Knox M R,F(xiàn)aedo M.Biological control of field infections of nematode parasites of young sheep with Duddiagtonia flagrans and effects of spore intake on efficacy[J].Veterinary Parasitology,2001,101(2):155-160.

[15]Dijksterhuis J,Veenhuis M,Harder W,et al.Nematophagous fungi:Physiological aspects and structurefunction relationships[J].London:Academic Press,Advance in Microbial Physiology,1994,36:111-143.

Cloning and Bioinformatics Analysis of Full-Length Gene of Serine Protease of Arthrobotrys oligospora Xinjiang Isolate

WANG Junwei1,MENG Qingling1,QIAO Jun1,WANG Weisheng1,LUO Jianxun2,CAI Xuepeng2,ZHAO Chunguang1
(1Department of Animal Science and Technology,Shihezi University,Shihezi 832003,China;2Lanzhou Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730046,China)

According to the previously reported sequences of serine protease of Arthrobotrys oligospora,the serine protease(designated Aoz1)sequence of A.oligospora Xinjiang isolate(XJ-XA)was amplified with designed specific primers by PCR and a phylogenetic tree was constructed corresponding to sequence identity analyses of domestic and overseas isolates of Arthrobotrys oligosporafrom different geographic regions.The results showed that the Aoz1gene of XJ-XA strain contains 1344base pairs with one intron of 63-bp and two exons encoding apolypeptide of 426amino acid residues.Aoz1has a signal peptide of 21-amino acid consisting of the initial methionine,position 1~21in Aoz1,and the protease had the aspartic acid (Asp164)-h(huán)istidine(His203)-serine(Ser353)(in Aoz1)catalytic triad as active sites,which confirmed that Aoz1belongs to the subtilisin-like serine protease family.Moreover,Aoz1contains two potential N-linked glycosylation sites and two substrate-binding S1pockets.Phylogenetic analyses revealed that the sequences of A.oligosporaisolates from different geographic regions had a high degree of sequence identities and diverged from sequences of the proteases isolated from other nematode-trapping fungi.The present study can lay agood foundation for the preparation of biological agents in the control of gastrointestinal nematodes of domestic.

Arthrobotrys oligospora;serine protease;gene cloning;bioinformatics

S852.659.5

A

1007-7383(2011)06-0700-06

2011-09-13

新疆兵團(tuán)博士資金項(xiàng)目(2009JC09),石河子大學(xué)高層次人才專項(xiàng)(RCZX200901)

王俊偉(1985-),男,碩士研究生,專業(yè)方向?yàn)榉肿蛹纳x學(xué);e-mail:13649996897@163.com。

孟慶玲(1969-),女,副教授,博士,從事寄生蟲分子生物學(xué)研究;e-mail:xjmqlqj@163.com。

猜你喜歡
絲氨酸孢菌線蟲
D-絲氨酸與學(xué)習(xí)記憶關(guān)系的研究進(jìn)展
夏季蔬菜換茬期線蟲防治要注意
D-絲氨酸在抑郁癥中的作用研究進(jìn)展
富硒酵母對(duì)長(zhǎng)期缺硒和正常大鼠體內(nèi)D-絲氨酸和L-絲氨酸水平的影響
鐮孢菌與大豆根腐病研究進(jìn)展
湖北省蔬菜根際土壤中的鐮孢菌分布特征
四川省套作玉米莖腐病致病鐮孢菌的分離與鑒定
地黃花對(duì)秀麗線蟲壽命的影響
朝鮮孢囊線蟲——浙江省孢囊線蟲新記錄種
線蟲共生菌Xenorhabdus budapestensis SN19次生代謝產(chǎn)物的分離純化與結(jié)構(gòu)鑒定