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PCR-RFLP法快速測(cè)定種豬氟烷基因型及其使用優(yōu)點(diǎn)

2011-05-03 10:15:46祁永旺王昕陟王金旭
飼料博覽 2011年2期
關(guān)鍵詞:杜洛克氟烷種豬

祁永旺,王昕陟*,侯 華,張 翠,王金旭

(1.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)畜牧獸醫(yī)學(xué)院,沈陽(yáng) 110161;2.沈陽(yáng)市畜牧獸醫(yī)研究所,沈陽(yáng) 110034)

近年來(lái),我國(guó)各大種豬場(chǎng)在對(duì)現(xiàn)有種豬選育的基礎(chǔ)上,相繼從國(guó)外引進(jìn)大批長(zhǎng)白、大約克和杜洛克等優(yōu)良種豬。為了檢驗(yàn)評(píng)定種豬的性能水平,促進(jìn)各場(chǎng)加強(qiáng)種豬選育工作,開(kāi)展了大量的種豬性能測(cè)定工作。測(cè)定性狀主要為胴體品質(zhì)和飼料效率,尚未見(jiàn)將豬的氟烷應(yīng)激敏感基因的檢測(cè)納入種豬性能測(cè)定的常規(guī)指標(biāo)中。豬的氟烷基因是一種應(yīng)激基因,攜帶該基因的豬易發(fā)生應(yīng)激綜合征。豬應(yīng)激綜合征是指豬在應(yīng)激因子(如驅(qū)趕、運(yùn)輸、防疫注射、配種、受驚嚇等)的應(yīng)激下,發(fā)生惡性、高熱綜合征,表現(xiàn)為呼吸急促、心跳加快、肌肉僵直、后肢呈現(xiàn)痙攣性收縮等,甚至突然死亡,產(chǎn)生PSE,其是由氟烷基因變異引起的。研究發(fā)現(xiàn)正常豬與應(yīng)激豬骨骼肌的蘭尼定受體(RYR1)經(jīng)胰蛋白酶消化后的帶型不同,表明正常豬與應(yīng)激敏感豬之間的氨基酸發(fā)生了置換[1-4]。當(dāng)應(yīng)激因子作用時(shí),Ca2+大量非正式釋放,電解質(zhì)代謝紊亂引起肌肉持續(xù)收縮,使豬產(chǎn)生惡性高熱,大量析出的Ca2+激活過(guò)量的糖元酵解,引起肌肉pH的異常變化,導(dǎo)致劣質(zhì)豬肉(PSE肉)產(chǎn)生,氟烷基因是由常染色體上的單隱形基因控制的一種遺傳疾病,存在于外來(lái)種豬和外來(lái)種豬與地方豬雜交而育成的品種品系中[5-10]。其中高瘦肉率的種豬,皮特蘭的氟烷基因陽(yáng)性純合子頻率較高,易造成皮質(zhì)下降,產(chǎn)生PSE肉,給世界各地的養(yǎng)豬生產(chǎn)、豬肉加工和銷(xiāo)售造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失,是制約現(xiàn)代養(yǎng)豬業(yè)經(jīng)濟(jì)發(fā)展的一個(gè)重要因素。及早準(zhǔn)確地對(duì)豬群進(jìn)行氟烷基因檢測(cè)具有重要作用,因此,本試驗(yàn)從豬主中提取DNA,用特異引物進(jìn)行PCRRFLP擴(kuò)增法對(duì)種豬進(jìn)行氟烷基因檢測(cè)。

1 試驗(yàn)材料

1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及毛樣的采集

長(zhǎng)白、大約克及杜洛克種豬購(gòu)自沈陽(yáng)市畜牧獸醫(yī)研究所種豬場(chǎng)。自豬只背部逆毛向采集帶毛囊豬毛10~15根,置于裝有滅菌生理鹽水的離心管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2 試驗(yàn)儀器及試劑

低溫冰箱為中科美菱生產(chǎn),高速冷凍離心機(jī)為KOKUSAN生產(chǎn),微量移液器、電泳槽、電泳儀均購(gòu)自北京市六一儀器廠,PCR儀為北京東迅天地醫(yī)療儀器有限公司生產(chǎn),紫外透射儀為上海精科生產(chǎn),WFH-202紫外透射儀、成像儀均由上海精科生產(chǎn)。PCR擴(kuò)增試劑盒、Taq聚合酶、限制性?xún)?nèi)切酶HhaⅠ、蛋白酶K均購(gòu)自大連寶生物公司,引物由大連寶生物公司合成,瓊脂糖凝膠購(gòu)自美國(guó)生命技術(shù)公司,TE溶液、10%SDS(十二烷基硫酸鈉)、飽和酚、氯仿、異戊醇、三蒸水為國(guó)產(chǎn)試劑等。

2 試驗(yàn)方法

2.1 DNA提取

2.1.1 樣品處理

將樣品用三蒸水將表面洗凈,選擇5根毛囊完整的豬毛從根部剪取0.3~0.5 cm置于1.5mL EP管內(nèi),向EP管內(nèi)加三蒸水500μL。12 000 rpm離心10min,棄上層水,將殘余的水吸凈后開(kāi)始消化。

2.1.2 消化

加入裂解液400μL將離心后的組織懸浮,再加入10%SDS 200μL和蛋白酶K 10μL,56℃水浴消化過(guò)夜(12~14 h)。取出水浴混合液,12 000 rpm離心4min,取上層至1.5mLEP管內(nèi)。

2.1.3 提取

分別加入等體積的飽和酚、氯仿和異戊醇(25∶24∶1),混勻 10min。4 ℃ 12 000 rpm 離心 10min。取上層移至另一EP管,重復(fù)2次。

2.1.4 棄上清

DNA沉淀用75%的乙醇(-20℃預(yù)冷)漂洗,12 000 rpm 4℃離心10min,重復(fù)2次。棄上清,自然干燥(或者超凈臺(tái)內(nèi)風(fēng)干)后用50~100μL超純水(或TE緩沖液)溶解,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

2.1.5 DNA模板的檢測(cè)

取DNA溶液5μL,加1μL的DL 2000 Marker,用1%瓊脂糖凝膠電泳(130 V)約40min,染色10min,在凝膠成像系統(tǒng)中掃描成像。

2.2 PCR擴(kuò)增

2.2.1 引物設(shè)計(jì)

引物A、B序列:引物A 5′ TCCAGTTTGCCACAGGTCCTACCA 3′;引物B 5′ ATTCACCGGAGTGGAGTCTCTGAG 3′[5]。

2.2.2 PCR反應(yīng)體系

PCR反應(yīng)體系見(jiàn)表1。

表1 豬氟烷基因PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系

PCR反應(yīng)條件為35個(gè)循環(huán),預(yù)變性94℃5min,進(jìn)入循環(huán)94℃45 s,56℃50 s,72℃50 s,72℃延伸10min。

2.2.3 PCR產(chǎn)物檢測(cè)及酶切

取PCR產(chǎn)物5μL加DL 2 000Marker 1μL進(jìn)行點(diǎn)樣。1%瓊脂糖凝膠電泳(130 v)40min后,將凝膠取出,EB染色后,在紫外燈下觀察結(jié)果,并在凝膠成像系統(tǒng)上照相,保存電泳圖譜。

取PCR產(chǎn)物10μL,加入Hha I內(nèi)切酶(10 U·μL-1)0.4 μL 和 10×Buffer 2 μL,加超純水至 20 μL,37℃恒溫4 h,全部產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳(130 v)40min,EB染色10min,在凝膠成像系統(tǒng)儀上觀察結(jié)果。

3 試驗(yàn)結(jié)果

3.1 氟烷基因型檢測(cè)結(jié)果

沈陽(yáng)畜牧獸醫(yī)研究所種豬場(chǎng)種豬的氟烷基因型檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)表2。

表2 不同種豬的氟烷基因型檢測(cè)結(jié)果

由表2可見(jiàn),在各品種中均沒(méi)有發(fā)現(xiàn)氟烷基因陽(yáng)性純合子(HaLnn);而雜合子(HaLNn)在長(zhǎng)白豬中有6頭,HaLn基因頻率為7.5%,在大約克夏豬中有2頭,HaLn基因頻率為2.1%,杜洛克豬中有1頭,HaLn基因頻率為2.0%,3個(gè)品種中杜洛克豬HaLn基因頻率最低。

3.2 氟烷基因PCR產(chǎn)物HhaI酶切結(jié)果

氟烷基因PCR產(chǎn)物HhaI酶切結(jié)果見(jiàn)附圖。

附圖 氟烷基因PCR產(chǎn)物HhaI酶切結(jié)果

4 討論

M—2000 bp的DNAmarker;1、2、3—NN型;4—Nn型

4.1 豬毛中DNA樣品的制備

以純化的DNA作為模板,在一定范圍內(nèi)增加模板的量可以提高擴(kuò)增產(chǎn)物的量。本試驗(yàn)中隨著豬毛根數(shù)的增加,PCR產(chǎn)物也隨著增加。以4~6根時(shí)效果最好,7根以后擴(kuò)增產(chǎn)物的量開(kāi)始下降。有研究表明,當(dāng)細(xì)胞數(shù)增加到600時(shí),PCR產(chǎn)物量并不增加到4 800,PCR產(chǎn)物量則開(kāi)始下降,這是由于DNA鏈附近大量細(xì)胞碎片使PCR反應(yīng)受到了一定的抑制。其次,設(shè)計(jì)反應(yīng)體系的關(guān)鍵是既能使DNA得到抽提,而又不破壞Taq酶的活性。在DNA抽提過(guò)程中通常用蛋白酶溶解細(xì)胞成分和蛋白,蛋白酶的活性受熱易失活,不會(huì)影響DNA的抽提,而與DNA結(jié)合緊密的粗蛋白,Taq酶卻不受低熱和無(wú)毒性試劑的影響,確保了Taq酶的活性。

4.2 PCR-RFLP分析

PCR產(chǎn)物經(jīng)內(nèi)切酶HhaI酶切后,基因未發(fā)生突變時(shí),內(nèi)切酶HhaI可將PCR擴(kuò)增的特異片段酶切成493 bp和166 bp兩條帶,則可判定基因型為NN。當(dāng)氟烷基因兩個(gè)位點(diǎn)都發(fā)生突變(C1843→T1843)時(shí),HhaI限制內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)消失,659 bp擴(kuò)增的片段不能被酶切消化,電泳后只有一條帶,基因型為nn。當(dāng)一個(gè)氟烷等位基因發(fā)生突變(C1843→T1843),而另一個(gè)正常,用HhaI酶切可以觀察到659 bp、493 bp和166 bp 3條帶,其基因型為Nn。

5 結(jié)論

豬應(yīng)激綜合征檢測(cè)的傳統(tǒng)方法是用氟烷麻醉法,但該方法不能識(shí)別雜合子和陰性豬,且操作誤差較大。而通過(guò)提取DNA利用PCR-RLFP進(jìn)行檢測(cè),可以100%地檢測(cè)出純合子和雜合子,這樣就克服了用氟烷檢測(cè)費(fèi)時(shí)、費(fèi)力而且不能測(cè)出雜合子的弊端。用血樣和毛囊均能提取DNA,血樣中DNA純度更高,便于擴(kuò)增但血樣的采集要保定豬只,通常體重在30 kg以?xún)?nèi)的仔豬采用該法,對(duì)成年豬由于體重原因往往僅采用毛囊提取DNA。通過(guò)對(duì)種豬場(chǎng)的長(zhǎng)白、大約克和杜洛克的檢測(cè)發(fā)現(xiàn),由于高瘦肉率種豬的大量引進(jìn)使種豬群中氟烷基因頻率明顯增高,長(zhǎng)白、大約克和杜洛克豬群都含有一定比例的氟烷應(yīng)激基因。

種豬的遺傳改良是豬群生產(chǎn)性能改良的基礎(chǔ),而種豬性能測(cè)定制度是豬遺傳改良的重要技術(shù)措施和保證條件,因此,在種豬性能測(cè)定中,除使用現(xiàn)有的生長(zhǎng)發(fā)育性能測(cè)定和外貌選擇外,還要從種豬分子遺傳結(jié)構(gòu)方面進(jìn)行性能測(cè)定,特別是對(duì)氟烷基因型的檢測(cè)。張金玲等通過(guò)PCR-RFLP技術(shù)對(duì)嘉興地區(qū)部分豬場(chǎng)新嘉興黑豬血樣進(jìn)行氟烷基因檢測(cè),結(jié)果表明,37頭新嘉興黑豬基因型均為NN,未出現(xiàn)Nn和nn基因型[11]。及早進(jìn)行檢測(cè)具有可以及時(shí)淘汰隱性純合子個(gè)體、在父母代選配上避開(kāi)雜合子公豬和雜合子母豬的選配、在后備豬群中控制氟烷基因的存在。

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