魏華,劉敏,鮑時翔,朱軍,黃惠琴*
(1.海南大學(xué)環(huán)境與植物保護(hù)學(xué)院,海南海口570228;2.中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所農(nóng)業(yè)部熱帶作物生物學(xué)與遺傳資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海南???71101)
根結(jié)線蟲(Meloidogyne spp.)是一類分布廣、危害大、難以防治的植物寄生線蟲,嚴(yán)重危害農(nóng)作物生產(chǎn)。在我國熱帶、亞熱帶地區(qū)及寒帶溫室內(nèi)作物、蔬菜中都有根結(jié)線蟲發(fā)生,一般農(nóng)作物會減產(chǎn)10%左右,嚴(yán)重的高達(dá)75%以上[1]。此外,根結(jié)線蟲能使真菌和細(xì)菌更易于侵染植物,是誘發(fā)植物病害的重要原因之一[2]。防治根結(jié)線蟲病害主要采用化學(xué)農(nóng)藥,毒性高,且污染環(huán)境。近年來,從微生物代謝產(chǎn)物中尋找具有抗根結(jié)線蟲活性的物質(zhì),受到國內(nèi)外的高度重視。紅樹林生長于熱帶、亞熱帶海岸潮間帶,受周期性潮水浸淹,是以紅樹植物為主體的木本植物群落,主要分布在南北緯30度之間[3],是熱帶、亞熱帶海岸地帶重要的濕地類型,同時也是陸地向海洋過渡的特殊生態(tài)系統(tǒng)。該生境具有強(qiáng)還原性、強(qiáng)酸性、高含鹽量、營養(yǎng)豐富等特征,蘊(yùn)藏著豐富且獨(dú)特的微生物資源。從紅樹林底泥中分離的放線菌,可產(chǎn)生許多重要的次生代謝產(chǎn)物,目前研究主要集中于抗菌、抗腫瘤活性,在抗根結(jié)線蟲方面,國內(nèi)外研究不多。本研究從紅樹林這一特殊的生態(tài)系統(tǒng)中采集樣品,分離篩選具有殺線蟲活性的放線菌資源,并對活性菌株進(jìn)行分類鑒定,為開發(fā)新型殺蟲藥物提供科學(xué)依據(jù)。
1.1.1 樣品的采集于2010年4月從海南省東寨港紅樹林采集土壤樣品,帶回實(shí)驗(yàn)室自然風(fēng)干,備用。
1.1.2 培養(yǎng)基[4]放線菌分離培養(yǎng)基:高氏一號合成培養(yǎng)基、腐植酸-維生素培養(yǎng)基、1/10 ATCC培養(yǎng)基、酵母粉-淀粉發(fā)酵培養(yǎng)基;形態(tài)特征鑒定培養(yǎng)基:高氏一號合成培養(yǎng)基、酵母粉-淀粉培養(yǎng)基、無機(jī)鹽淀粉培養(yǎng)基、甘油天門冬素培養(yǎng)基、燕麥汁培養(yǎng)基和土豆汁培養(yǎng)基;液體發(fā)酵培養(yǎng)基:玉米粉1.0%、酵母粉0.1%、黃豆粉1.0%、淀粉0.5%、KH2PO40.05%(黃豆粉和玉米粉煮沸過濾,取汁),pH 7.2。以上培養(yǎng)基均用陳海水配制。
1.2.1 放線菌的分離取5 g樣品溶于45 mL無菌陳海水,28℃,180 r/min振蕩30 min制成土壤懸液。用無菌陳海水分別稀釋至10-2、10-3倍,涂布到放線菌分離培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng),待長出菌落后,挑取培養(yǎng)基上的放線菌于高氏一號培養(yǎng)基上劃線分離,得到純培養(yǎng)。
1.2.2 菌株的發(fā)酵培養(yǎng)挑取純化后的放線菌單菌落,接種于發(fā)酵培養(yǎng)基,28℃、180 r/min搖床培養(yǎng)7 d,10 000 r/min離心10 min,備用。
1.2.3 抗根結(jié)線蟲放線菌的篩選①供試線蟲:供試線蟲的培養(yǎng)參照雷敬超[5]的方法進(jìn)行。初篩時使用松材線蟲,采用鐮刀菌培養(yǎng);復(fù)篩時使用根結(jié)線蟲,是將含有大量卵塊的胡椒根沖洗干凈,挑取卵塊,28℃孵化所得;②初篩:采用24孔板液體篩選模型[6]。在24孔板中分別加入50 μL發(fā)酵液,550 μL無菌蒸餾水,約400 μL(約200條)松材線蟲混懸液,混合均勻,28℃放置24 h后用倒置顯微鏡觀察,僵直或卷曲不動的蟲體視為被擊倒,以發(fā)酵培養(yǎng)基為對照,每處理重復(fù)3次,計(jì)算線蟲校正擊倒率。向24孔板中加入清水,觀察恢復(fù)情況,不能恢復(fù)活性的記為死亡,計(jì)算校正死亡率。校正擊倒率(%)=100×(處理擊倒率-對照擊倒率)/(1-對照擊倒率),校正死亡率(%)=校正擊倒率×(1-恢復(fù)率);③復(fù)篩:采用根結(jié)線蟲,對初篩中校正死亡率50%以上的菌株按照②方法進(jìn)行復(fù)篩,同時對活性菌株發(fā)酵液進(jìn)行不同作用時間的抗線蟲活性測試;④菌株HA11090遺傳穩(wěn)定性測定:高效穩(wěn)定的殺蟲微生物是進(jìn)一步研究開發(fā)利用的前提和基礎(chǔ)[7],本研究將菌株HA11090連續(xù)繼代培養(yǎng)5代,再按照②的方法測定每代菌株發(fā)酵液對根結(jié)線蟲的校正死亡率。
1.2.4 活性菌株的分類鑒定①形態(tài)特征:采用平皿插片法[8]培養(yǎng)放線菌,顯微鏡下觀察活性菌株的菌絲及孢子特征;②培養(yǎng)特征:將菌株接種于放線菌形態(tài)特征鑒定培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)1~2周,觀察菌株基內(nèi)菌絲、氣生菌絲的形態(tài)特征,有無色素產(chǎn)生等;③生理生化特征:生理生化特征鑒定參照Lechevalier等[9]的方法進(jìn)行;④16S rDNA序列測定:采用苯酚氯仿法[10]提取放線菌的基因組DNA。以提取的放線菌DNA作為模板,用放線菌通用引物27f(AGAGTTTGATCCTGGCTCAG)和1492r(GGTTACCTTGTTACGACTT)對菌株的16S rDNA片段進(jìn)行擴(kuò)增。PCR反應(yīng)條件:94℃5 min;94℃1 min,55℃30 s,72℃1 min,30個循環(huán),72℃10 min。PCR反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,檢測合格后送生工生物工程(上海)有限公司測序;⑤16S rDNA序列系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建[11]:將菌株的核苷酸序列提交至EzTaxon核苷酸序列庫進(jìn)行比對。利用ClustalX(Version1.8)和MEGA4.0軟件進(jìn)行多序列比對,用Neighbor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
本研究從紅樹林土壤樣品中共分離206株形態(tài)特征各不相同的放線菌。初篩獲得28株線蟲校正死亡率在50%以上的菌株,占供試菌株的13.6%;復(fù)篩獲得3株線蟲校正死亡率在65.0%以上的菌株,其中菌株HA11090線蟲校正死亡率為70.5%。菌株HA11090發(fā)酵液處理不同時間的抗線蟲活性結(jié)果見圖1,可以看出,線蟲的校正擊倒率和校正死亡率隨著時間的延長而逐漸增大。對菌株HA11090連續(xù)進(jìn)行5次繼代培養(yǎng),結(jié)果表明,其產(chǎn)生抗線蟲活性物質(zhì)的遺傳性保持穩(wěn)定。因此,將菌株HA11090作為進(jìn)一步研究的對象。
圖1 菌株HA11090發(fā)酵液對線蟲校正擊倒率及校正死亡率的時間變化曲線Fig.1 Time curve of revised knockdown rate and revised mortality of strain HA11090 fermentation broth
圖2 菌株HA11090的孢子形態(tài)Fig.2 Scanning electron micrograph of strain HA11090 grown on Gauze’s No.1 agar
2.2.1 形態(tài)特征菌株HA11090在燕麥汁、酵母粉-淀粉、土豆汁、甘油天門冬素、高氏一號、無機(jī)鹽-淀粉等6種固體培養(yǎng)基上均生長良好,能形成豐富的基內(nèi)菌絲和氣生菌絲,氣絲白色,基絲白色至粉紅色,在6種培養(yǎng)基上均發(fā)現(xiàn)有黃色至棕褐色的可溶性色素產(chǎn)生。掃描電鏡下可看出菌株HA11090孢子絲直或彎曲,孢子卵圓形、表面光滑、有毛發(fā)(圖2)。
2.2.2 生理生化鑒定菌株HA11090能利用果糖、葡萄糖、甘露醇、棉子糖、蔗糖,產(chǎn)生H2S,淀粉水解,硝酸鹽還原,明膠不液化,牛奶既能凝固也能胨化,不產(chǎn)生黑色素,生長溫度范圍為15~45℃,具體情況參見表1。
表1 菌株HA11090的生理生化特征Table 1 Physiological and biochemical characteristics of strain HA11090
2.2.3 16S rDNA序列測定及系統(tǒng)發(fā)育分析經(jīng)測序獲得菌株HA11090的16S rDNA近全序列1 393 bp。經(jīng)過相似性比對分析,可發(fā)現(xiàn)與菌株HA11090同源性高的菌株都為糖多孢菌屬。同源性最高的為Saccharopolyspora hirsuta subsp.kobensis JCM 9109T(99.35%),其次為Saccharopolyspora jiangxiensis W12T(99.27%),根據(jù)序列同源性從高到低的順序選取7株模式菌株,利用ClustalX(Version1.8)和Mega4.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。由圖3可知,菌株HA11090與S.hirsuta subsp.kobensis和S.Jiangxiensisza在發(fā)育樹上處于同一個大的分支,親緣關(guān)系最近。
2.2.4 菌株HA11090的鑒定結(jié)果菌株HA11090與S.hirsuta subsp.kobensis[12]和S.jiangxiensis[13]的相似性最高,且發(fā)育樹上處于同一個分支。在形態(tài)和生理生化特征方面,菌株HA11090與S.jiangxiensis基本一致,差別僅在于:菌株HA11090不能利用D-木糖、L-肌醇、L-阿拉伯糖;S.hirsuta subsp.kobensis孢子表面粗糙,形成長的孢子鏈,不產(chǎn)生H2S,而菌株HA11090孢子卵圓形、表面光滑、有毛發(fā),二者差異顯著。綜合分析,將菌株HA11090鑒定為S.jiangxiensis。
圖3 基于16S rDNA的菌株HA11090與相關(guān)菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3 Phylogenetic tree of strain HA11090 and related strains based on 16S rDNA
在篩選中,采用松材線蟲作為初篩線蟲,主要是考慮到松材線蟲的培養(yǎng)技術(shù)較為成熟,以鐮刀菌培養(yǎng)線蟲,線蟲4~5 d就可以繁殖一代,而且雌蟲可以連續(xù)29次產(chǎn)卵[14],可以在較短時間內(nèi)獲得大量供試線蟲,滿足篩選工作對線蟲的大量需求。活性檢測時,將菌株發(fā)酵液稀釋20倍,是因?yàn)榫闔A11090分離自紅樹林區(qū)域,發(fā)酵時培養(yǎng)基用海水配制。為避免高濃度無機(jī)鹽對線蟲的傷害,經(jīng)反復(fù)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),培養(yǎng)基在稀釋20倍后可消除對線蟲的影響。
16S rDNA序列分析的系統(tǒng)發(fā)育學(xué)和表型特征存在較好的相關(guān)性[15],通過16S rDNA序列同源性分析與生理生化試驗(yàn)相結(jié)合是一種比較快速準(zhǔn)確的方法[16],越來越廣泛地應(yīng)用于細(xì)菌分類。本研究結(jié)合該方法,將菌株HA11090鑒定為S.jiangxiensis。菌株HA11090發(fā)酵液稀釋20倍和40倍后,線蟲校正死亡率分別為70.5%和65.0%,線蟲的校正擊倒率和校正死亡率隨著時間的延長而逐漸增大,且菌株HA11090抗根結(jié)線蟲活性穩(wěn)定。目前對于該菌株,文獻(xiàn)上只有一些分類鑒定上的報(bào)道,而具有抗根結(jié)線蟲活性,本文尚屬首次報(bào)道。
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