蔣斌元,張 齊,康 敏,王勝利,龔建華,洪亞輝
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南 長沙 410128;2.株洲市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,湖南 株洲 412000)
水稻是一種重要的糧食作物,是人類主要的糧食來源,提高水稻產(chǎn)量以及防治病蟲害一直是科研工作者們努力的方向[1]。普通野生稻是栽培稻的近緣祖先,保有許多寶貴的基因資源,是水稻突破性育種與生產(chǎn)的重要基因源[2-4]。在茶陵已發(fā)掘的新石器時(shí)代大塘文化遺址中發(fā)現(xiàn)了已碳化的谷物堆,由此可見,茶陵地區(qū)谷物種植歷史悠久,茶陵野生稻具有重要的研究價(jià)值。湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)細(xì)胞生物學(xué)研究室與株洲農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所合作,將茶陵野生稻的基因組DNA采用花粉管通道法[5]導(dǎo)入受體栽培稻R9810、RCP08-29,其中R9810這一系中獲得的后代已培育到第4代,表型各異,表現(xiàn)出明顯的耐寒能力并且具有對株洲當(dāng)?shù)氐疚敛【》N的抗性。筆者以茶陵野生稻及其導(dǎo)入后代為研究對象,輔以受體材料為對照,采用RAPD方法[6-9]研究總基因組導(dǎo)入后在遺傳上所造成的影響,旨在配合大田表型篩選,為后續(xù)有目的性地篩選試驗(yàn)材料提供科學(xué)依據(jù)。
供試材料為茶陵野生稻(W)、超級稻R9810(C)、 導(dǎo)入后代D4(1:ys09203;2:ys09004;3:ys090015;4:ys090026;5:ys090027c)
1.2.1 總DNA的提取 將供試材料洗凈剪碎分別置于研缽中,加入液氮研磨破碎細(xì)胞,使用CTAB法[10]提取DNA,電泳檢測。
1.2.2 RAPD擴(kuò)增 經(jīng)過多次篩選確定使用引物(表1)與25 μL反應(yīng)體系,PCR反應(yīng)程序?yàn)?4℃預(yù)變性 5 min;94℃變性 40 s,36℃復(fù)性 40 s,72℃延伸1 min,共計(jì)40個(gè)循環(huán);最后72℃延伸7 min。引物濃度為10 μM。隨機(jī)引物由華大基因合成,利用隨機(jī)引物對各樣品基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,凝膠電泳檢測擴(kuò)增產(chǎn)物。
表1 RAPD隨機(jī)引物序列
1.2.3 數(shù)據(jù)分析 對凝膠電泳圖譜進(jìn)行統(tǒng)計(jì),使用統(tǒng)計(jì)類軟件NTSYSpc 2.1,基于非加權(quán)組平均法(UPGMA)對所得結(jié)果進(jìn)行聚類分析[11-13]。
提取的水稻基因組DNA經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,顯示條帶清晰(圖1)。這說明所提取的水稻基因組DNA大分子較為完整,雜質(zhì)和DNA的降解均比較少,符合RAPD所需要的PCR模板要求。經(jīng)蛋白核酸測定儀測量,所提取的基因組DNA的A260/A280值為2.10,基本符合DNA的純度要求。
用篩選出的18個(gè)RAPD隨機(jī)引物對各樣品基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,圖2為部分RAPD電泳圖。
對顯示的凝膠電泳圖譜進(jìn)行統(tǒng)計(jì),使用1和0表示帶的有和無(表2)。使用統(tǒng)計(jì)類軟件NTSYSpc 2.1基于UPGMA算法對所得結(jié)果進(jìn)行聚類分析,做出聚類圖(圖3)。基于該聚類圖所顯示的遺傳關(guān)系,發(fā)現(xiàn)茶陵野生稻總DNA經(jīng)花粉管通道法導(dǎo)入栽培稻后,其導(dǎo)入后代在遺傳關(guān)系上表現(xiàn)各異,有仍然趨向于受體R9810的,如5號導(dǎo)入后代,也有隨機(jī)插入DNA片段后在遺傳距離上發(fā)生了改變的,如 1、2、3、4 號導(dǎo)入后代。
表2 隨機(jī)引物RAPD圖譜條帶讀取結(jié)果
采用花粉管通道法將茶陵野生稻的總基因組DNA導(dǎo)入栽培稻后,在表型上獲得了許多變異,筆者使用RAPD法在分子水平上對基因組導(dǎo)入所引起的變異進(jìn)行了分析說明。研究結(jié)果表明,茶陵野生稻在進(jìn)化上處于比較原始的位置,受體R9810與5號導(dǎo)入后代有著較近的親緣關(guān)系,5號材料在遺傳上并未出現(xiàn)很大的改變,而1、2、3、4號導(dǎo)入后代在遺傳上則受到了較大的改變,這些變化可能是由于DNA片段的隨機(jī)插入而引起,亦或者是僅限于所選引物進(jìn)行擴(kuò)增才會顯示的結(jié)果??偠灾?,RAPD法能在某種程度上顯示出采用花粉管通道法將供體基因組DNA導(dǎo)入受體后所產(chǎn)生的后代在基因組水平的變化,能為后續(xù)選育試驗(yàn)提供一定的參考。與表現(xiàn)型相結(jié)合,通過對花粉管通道法導(dǎo)入總DNA后獲得的大量后代進(jìn)行歸類研究,能提高分類的準(zhǔn)確性。
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