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廣西殼菜果遺傳多樣性的ISSR研究

2012-11-22 01:19:22彭繼慶曹福祥許若嫻
湖南師范大學自然科學學報 2012年1期
關鍵詞:多態(tài)條帶多態(tài)性

彭繼慶,曹福祥 許若嫻

(中南林業(yè)科技大學生命科學與技術學院,中國 長沙 410004)

殼菜果(MytilarialaosensisLecomte),別名米老排、三角楓、山桐油、米顯靈、馬蹄荷、朔潘[1],屬金縷梅科(Hamamelidaceae)殼菜果屬(Mytilaria)常綠闊葉樹種.天然林分布于廣東的封開、信陽、陽春,廣西西南部的十萬大山、龍川、那坡、德保、靖西和云南南部,老撾和越南也有分布,垂直分布在廣東海拔250~1 000 m,廣西和云南在海拔1 100~1 800 m之間的山谷、丘陵的中下部和溝谷兩旁[2],是優(yōu)良速生用材樹種.其樹干通直,枝條較細,材質(zhì)較好,色澤美觀,經(jīng)久耐用,適于制作家具、膠合板等,在水土保持、土壤改良、混交造林、生物防火等方面作用明顯[3-4].殼菜果葉子肥大嫩綠,營養(yǎng)成分含量較高,是一種很好的飼料資源[5];所分泌的樹脂的化學成分主要是脂類物質(zhì)[6],其種仁含油質(zhì)量分數(shù)高達36.8%,是重要的油脂資源[7].目前對殼菜果的研究多集中在引種[8]、育苗造林[9]和材質(zhì)利用等方面[2-3],而殼菜果種群遺傳多樣性方面的文章迄今未見報道.

ISSR(inter simple sequence repeat)即簡單重復序列區(qū)間擴增多態(tài)性,由Zietkiewiez等[10]在 PCR反應基礎上發(fā)展起來的一種新的分子生物學技術,ISSR標記技術與RAPD相比具有檢測位點多、穩(wěn)定可靠、重復性更好等優(yōu)點[11];與AFLP相比具有操作簡單、技術性低、花費低等優(yōu)點,適合一般的實驗室使用.因此ISSR分子標記技術已在生物種質(zhì)鑒定、遺傳多樣性檢測、基因定位及遺傳圖譜等方面得到廣泛應用[12].利用ISSR分子標記技術對殼菜果種群多樣性進行研究有助于從DNA分子水平上揭示殼菜果種群的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性水平,了解殼菜果的生存狀況和對環(huán)境的適應能力,了解殼菜果種群間的親緣關系,為殼菜果的合理開發(fā)和利用提供參考依據(jù).

1 材料與方法

1.1 樣品采集與處理

殼菜果樣品分別采自廣西憑祥、廣西德保、廣西靖西、廣西那坡4個殼菜果天然分布區(qū),采樣過程中要防止采到同一棵樹的后代;每一樣品為同一株的新鮮葉片,選取沒有病蟲害的比較干凈的葉片,用紗布擦洗干凈后放入自封袋中,加入一定量的硅膠,搖動袋子使硅膠與葉子充分接觸.將樣品放入保溫箱中,加入冰袋帶回實驗室,置于-70℃超低溫冰箱中保存?zhèn)溆茫畼悠凡杉闆r見表1.

表1 殼菜果種群分布地的基本情況

1.2 殼菜果基因組DNA提取及檢測

殼菜果基因組DNA的提取采用天根生化科技(北京)有限公司的植物基因組提取試劑盒進行提取,具體操作按照植物基因組提取試劑盒說明書進行,僅對離心時間和裂解時間稍作修改.

所提取的基因組 DNA 用10 g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測,倒膠前加入EB,終濃度為0.5 mg/L;用核酸蛋白測定分析儀檢測DNA樣品純度和濃度,將所有樣品DNA濃度稀釋為 40 mg/L,置于-20 ℃冰箱中保存?zhèn)溆茫?/p>

1.3 引物的合成與篩選

ISSR引物是根據(jù)加拿大哥倫比亞大學公布的第九套ISSR引物序列,由南京金斯瑞生物科技有限公司合成.從中篩選出9條擴增條帶較多、條帶清晰、重復性好的引物用于ISSR-PCR擴增.

1.4 ISSR-PCR擴增與電泳檢測

利用篩選出的9條引物對43個樣品進行PCR擴增,ISSR-PCR擴增體系為:在20 μL的反應體系中,模板DNA為30 ng,Mg2+濃度為2.75 mmol/L,TaqDNA聚合酶為36.67 nkat,dNTPs濃度為0.20 mmol/L,引物濃度為0.6 μmol/L,10×PCR Buffer 2.0 μL,最后用滅菌好的ddH2O將體系補足.擴增程序為:94 ℃預變性5 min,94 ℃變性30 s,50~54 ℃(依據(jù)引物而定)退火45 s,72 ℃延伸90 s,36個循環(huán),72 ℃延伸7 min,4 ℃保存.擴增產(chǎn)物用10 g/L的瓊脂糖凝膠電泳檢測,用200 bp DNA Ladder Marker(200~3 000 bp)作標記,溴化乙錠染色后在凝膠成像系統(tǒng)上成像,拍照.

1.5 數(shù)據(jù)處理與分析

M:200 bp DNA Ladder圖1 引物UBC835對殼菜果的多態(tài)性擴增

電泳圖譜中擴增出的每一條帶代表引物的一個結(jié)合位點,視為有效的分子標記,同一引物的擴增產(chǎn)物中電泳遷移率一致的條帶被認為具有同源性.根據(jù)電泳圖譜中擴增條帶的有無及擴增片段的大小,有條帶的記作“1”,否則記作“0”,建立0/1數(shù)據(jù)矩陣,通過Popgene32軟件計算殼菜果群落的多態(tài)性位點百分比(PPB)、觀測等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)、Shanon多樣性指數(shù)(I)、種群總基因多樣性(Ht)、種群內(nèi)基因多樣性(Hs)、種群間遺傳分化指數(shù)(Gst)及Nei’s遺傳距離(D).

2 結(jié)果與討論

2.1 廣西殼菜果種群的擴增產(chǎn)物多態(tài)性

9條引物對4個種群的43份廣西殼菜果樣品進行擴增,結(jié)果顯示,9條引物均能擴增出很好的圖譜,(圖1為引物UBC836對43份廣西殼菜果樣品進行擴增的圖譜)共擴增出129條帶,平均每條引物擴增出14.3條帶,其中105條帶是多態(tài)性條帶,多態(tài)性條帶占81.40%,說明43個廣西殼菜果樣品的ISSR標記存在較高的遺傳多樣性.引物UBC841擴增出13條帶,有12條帶是多態(tài)性條帶,多態(tài)性最高為92.30%,引物UBC840擴增的多態(tài)性條帶最少,多態(tài)性也最低,為61.54%(表2).

表2 ISSR引物擴增位點

2.2 廣西殼菜果自然種群的遺傳多樣性分析

4個廣西殼菜果自然種群43個樣品的遺傳多樣性分析表明(見表3),殼菜果在物種水平上的多態(tài)位點百分率(PPB)為81.40%,表明其擁有較高的遺傳多樣性.在種群水平上,廣西憑祥種群的最高,為69.77%;其次為廣西德保和廣西靖西的種群,同時為62.79%;廣西那坡種群的最低,為54.26%.利用Popgene32軟件分析表明4個種群總體水平上的觀測等位基因數(shù)(Na)為1.845 0;有效等位基因數(shù)(Ne)為1.511 9;Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)為0.296 9;Shannon多樣性指數(shù)(I)為0.440 4.對4個種群而言,Na的變化幅度為1.542 6~1.697 7;Ne的變化幅度為1.355 9~1.471 8;H的變化幅度為0.203 1~0.268 6;I的變化幅度為0.300 4~0.394 5,其變化趨勢與種群位點多態(tài)性一致.說明廣西殼菜果自然種群具有豐富的遺傳多樣性,在這4個種群中,廣西憑祥種群適應環(huán)境的能力最強,其次為廣西德保種群和廣西靖西種群,廣西那坡種群最弱.因此,廣西憑祥的遺傳基礎最好,在將來的引種試驗中建議從廣西憑祥引種是比較合理的.

表3 殼菜果種群內(nèi)的遺傳多樣性

2.3 廣西殼菜果自然群落的遺傳分化研究

殼菜果種群總基因多樣性(Ht)為0.294 8,種群內(nèi)的基因多樣度(Hs)為0.243 0,種群間基因多樣性等于總基因多樣性減去種群內(nèi)的遺傳多樣性,即種群間的基因多樣性為0.051 8;在物種水平上有82.43%的遺傳變異存在于種群內(nèi),而17.57%的遺傳變異存在于種群間.各個種群之間的基因分化系數(shù)Gst為0.175 8,說明殼菜果自然種群間存在一定程度的遺傳分化,但分化程度比較低.殼菜果種群間的基因流(Nm)為2.344 7,大于1,證明種群間存在一定的基因流動,足以抵制遺傳漂變的作用.

2.4 遺傳一致度與聚類分析

如表4所示,廣西殼菜果4個自然種群之間的Nei’s遺傳距離范圍在0.055 8~0.138 5之間.廣西德保和廣西靖西2個種群之間的遺傳距離最小,說明它們之間的遺傳差異最小;而廣西那坡種群與廣西憑祥之間的遺傳距離最大,為0.138 5,表明廣西憑祥與廣西那坡之間存在的遺傳差異也最大;4個種群的遺傳一致度變化范圍在0.870 7~0.945 7之間,變化趨勢與4個種群之間的遺傳距離變化趨勢一致.

表4 4個殼菜果種群間的遺傳一致度和遺傳距離

圖2 4個殼菜果種群間遺傳距離的聚類分析

根據(jù)Nei’s(1978)的遺傳距離對廣西殼菜果種群進行UPGMA聚類分析(見圖2),聚類結(jié)果表明:4個廣西殼菜果自然種群聚為兩大類,一類是廣西德保和廣西靖西的2個種群聚在一起,再與廣西憑祥的聚在一起;廣西那坡種群單獨聚為一類.表明廣西德保與廣西靖西2個自然種群之間的親緣關系最近,與廣西那坡之間的親緣關系最遠.

3 討論

遺傳多樣性是生物多樣性的基本特性,是物種長期進化的結(jié)果,遺傳多樣性的高低對種群的生存和分布有很大影響[13].通過ISSR分子標記技術對殼菜果遺傳多樣性進行分析,多態(tài)位點百分率為81.40%,比廣布型植物略低,如木荷的多態(tài)位點百分率為90.02%[14],油松的多態(tài)位點百分率為91.67%[15],楓香的多態(tài)位點百分率為87.41%[16],比頻危植物要高,如資源冷杉的多態(tài)位點百分率為77.78%[17].表明盡管殼菜果的多態(tài)位點百分率比廣布型植物要低,但殼菜果仍處于較高水平,仍有很強的適應能力.廣西殼菜果的多態(tài)位點百分率介于廣布型植物和頻危植物之間,可能與兩方面原因有關:一是與廣西殼菜果自然群落的分布狀況有關,目前廣西殼菜果除了在廣西憑祥有大面積的天然林外,在廣西其他地方很少有成片的天然林,且多集中在一些林場或者在一些自然保護區(qū),地理距離比較遠,因此殼菜果的多態(tài)位點百分率比廣布型的要低;另一方面是殼菜果結(jié)實量大,種子的含油量高達36.8%[7],種子的萌發(fā)能力比較強,發(fā)芽率在90%左右,易于植株的存活,這與Hamrick[18]提出的具有高水平遺傳變異的物種壽命長、結(jié)實性高的觀點一致.

廣西殼菜果自然群落的遺傳分化程度比較低,種群內(nèi)的遺傳變異占主導地位,種群間遺傳變異小,這是由基因流和微環(huán)境共同作用的.基因流被視為是使種群遺傳結(jié)構(gòu)均質(zhì)化的主要因素之一, 具有廣泛基因流的物種遺傳分化程度也比較小[19].殼菜果種群間的基因流(Nm)為2.344 7,說明基因流發(fā)揮了均質(zhì)化作用.種群間微生境的差異也是產(chǎn)生種群間遺傳分化的原因之一,不同的微生境條件下存在不同的適應型,種群的基因型之間必存在相應的差異,從而產(chǎn)生種群間的遺傳分化[20].本研究中的殼菜果樣品均來自廣西,溫度、水分、光照、土壤等生態(tài)因子變化較小, 微生境差異不大,不同種群所承受的生境選擇壓力差異比較?。悄壳昂芏鄰V西殼菜果天然種群都被分割開來,種群之間相距比較遠,產(chǎn)生了生境片段化,而生境片段化可以阻斷原種群之間的基因交流[21],降低遺傳多樣性,加大遺傳分化程度,估計隨著時間的推移,各種群之間的遺傳分化將逐漸增大.

本文從分子水平對殼菜果遺傳多樣性的研究,有助于了解其遺傳基礎,為種群保護、引種栽培和生產(chǎn)實踐提供參考依據(jù);UPGMA聚類分析結(jié)果有助于探清殼菜果種群間的演化規(guī)律.但目前僅僅對廣西殼菜果天然種群進行了研究,其他省份的殼菜果的生長狀況和親緣關系還不清楚.下一步將在全國范圍內(nèi)對殼菜果進行研究,除探清殼菜果天然種群間的親緣關系外,還要探清天然林與引種地之間的差異,從分子水平上了解殼菜果是怎樣對遷移地進行適應的,對引種是否成功從分子水平上作出評價.

參考文獻:

[1] 中國科學院中國植物志編輯委員會.中國植物志[M].北京:科學出版社,1979:50-52.

[2] 梁善慶,羅建舉.人工林米老排木材化學成分及其在樹干高度上的變異[J].中南林學院學報,2004,24(5):28-31,52.

[3] 梁善慶,羅建舉.人工林米老排木材的物理力學性質(zhì)[J].中南林業(yè)科技大學學報, 2007, 27(5): 97-100,116.

[4] 鄭萬鈞.中國樹木志(第二冊)[M].北京:中國林業(yè)出版社,1985.

[5] 景躍波,楊德軍,馬賽宇,等.熱帶速生樹種米老排的育苗與造林[J].林業(yè)實用技術,2008(1):21-23.

[6] 黃秦康.常用中藥成分與藥理手冊[M].北京:中國醫(yī)學科技出版社,1994:18.

[7] 中國油脂植物編寫委員會.中國油脂植物[M].北京:科學出版社,1987:346-347.

[8] 李良昌,廖翠蘭,黃德林,等.米老排在樂昌林場的引種及生長表現(xiàn)[J].廣東林業(yè)科技,2003,19(4):66-68.

[9] 唐社云.米老排與南酸棗混交造林試驗報告[J].西部林業(yè)科學,1992(2):35-40.

[10] ZIETKIEWIEZ E, RAFALSKI A, LABUDA D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification [J]. Genomics, 1994, 20: 176-183.

[11] GILBERT J E, LEWIS R V, WILKINSONM J,etal. Developing an appropriate strategy to assess genetic variability in plant germ plasm collections[J]. Theor Appl Genet, 1999,6(98):1125-1131.

[12] 魏小玲,曹福祥,陳 建.海南木蓮基因組DNA提取及ISSR反應體系的優(yōu)化[J].中南林業(yè)科技大學學報,2010,30(5):91-96.

[13] 錢迎倩,馬克平. 生物多樣性研究的原理和方法[M]. 北京: 中國科學技術出版社, 1994: 123-140.

[14] 金則新, 李鈞敏, 李建輝. 木荷種群遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 浙江大學學報:農(nóng)業(yè)與生命科學版, 2007, 33(3): 271-276.

[15] 李 毳, 柴寶峰, 王孟本. 華北地區(qū)油松種群遺傳多樣性分析[J]. 植物研究, 2006, 26(1): 98-102.

[16] 畢泉鑫,金則新,李鈞敏,等. 楓香自然種群遺傳多樣性的ISSR分析[J].植物研究,2010,30(1):120-125.

[17] 張玉榮,羅菊春,喻錦秀. 資源冷杉遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 北京林業(yè)大學學報, 2007,29(6):41-46.

[18] HAMRICK J L, MITTON J B, LINHART Y B. Leves of genetic variation in trees: The influence of life history characteristics[C]//PACIFIC S W. Proc Symp on Isozymes of North American Forest Trees and Forest Insects. For Range Expt Stat Tech Report PSW-48,1981: 35-41.

[19] HAMRICK J L, LINHART Y B, MITTON J B. Relationships between life history characteristics and electropho retically detectable genetic variation in plants[J]. Annu Rev Ecol Syst,1979, 10:173-200.

[20] 陳小勇, 宋永昌. 安徽黃山西部青岡種群小地理范圍的遺傳分化[J]. 植物資源與環(huán)境學報, 1998, 7(1): 10-14.

[21] 陳小勇. 生境片斷化對植物種群遺傳結(jié)構(gòu)的影響及植物遺傳多樣性保護[J]. 生態(tài)學報,2000,20(5):884-892.

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