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MLPA技術(shù)用于產(chǎn)前DMD基因診斷的應(yīng)用探討

2012-12-26 09:34吳建力杜華榮尹耕心吳玉鵬傅克勤
關(guān)鍵詞:證者攜帶者家系

吳建力 杜華榮 尹耕心 吳玉鵬 傅克勤

安徽省計(jì)劃生育科學(xué)技術(shù)研究所(合肥,230031)

MLPA技術(shù)用于產(chǎn)前DMD基因診斷的應(yīng)用探討

吳建力 杜華榮 尹耕心 吳玉鵬 傅克勤*

安徽省計(jì)劃生育科學(xué)技術(shù)研究所(合肥,230031)

假肥大性肌營養(yǎng)不良癥是一種嚴(yán)重的神經(jīng)肌肉疾病,分為杜氏肌營養(yǎng)不良癥(DMD)和貝氏進(jìn)行性肌營養(yǎng)不良癥 (BMD),均是由于 DMD基因(Xp21.2)突變所致[1]。由于本病目前無有效的治療方法,產(chǎn)前診斷成為控制致病基因傳遞、防止患兒出生及降低發(fā)病率的主要措施。本研究對DMD產(chǎn)前診斷家系中具有高患病風(fēng)險(xiǎn)的2個(gè)胎兒,提取其羊水基因組DNA,采用多重連接探針擴(kuò)增技術(shù)(MLPA)進(jìn)行產(chǎn)前基因診斷的探索。

1 資料與方法

1 1 一般資料

2例均為進(jìn)行DMD基因診斷,經(jīng)MLPA技術(shù)確診為DMD基因外顯子缺失者,其母親再次妊娠,經(jīng)超聲性別檢查胎兒均為男性,有50%患DMD風(fēng)險(xiǎn),要求對胎兒進(jìn)行DMD基因產(chǎn)前診斷。對標(biāo)本的使用均知情同意。

1.2 方法

1.2.1基因組DNA提取采集2例患兒及父母外周靜脈血3~4ml至含EDTA抗凝劑的采血管中。抽取孕16~22周婦女羊水20ml,均使用基因組DNA提取試劑盒(QIAamp Blood DNA mini Kit)抽提DNA,加入適量的TE液,充分溶解DNA,紫外分光光度計(jì)測定DNA純度和濃度。將DNA濃度控制在50 ~200ng/μl,-20℃保存。

1.2.2 MLPA檢測MLPA檢測試劑盒 P034/P035購自MRC Holland。①基因組DNA變性和SALSA MLPA探針雜交:取約100ng(3μl)的基因組DNA,將其95℃變性5min,25℃保溫,然后向變性后的DNA中分別加入MLPA探針混合物和MLPA緩沖液,小心混勻,95℃ 孵育1 min,60℃過夜雜交15h以上。②連接反應(yīng):冷卻至54℃后,再加入連接緩沖液A、B和連接酶,小心混勻,54℃孵育15min,98℃加熱5 min終止連接反應(yīng),4℃保溫。③PCR反應(yīng):由SALSA FAM PCR引物、SALSA PCR緩沖液、水和SALSA聚合酶配制的SALSA PCR體系9.8μl中加入 2.7μl連接產(chǎn)物,95℃ 30s,60℃ 30s,72℃60s,循環(huán)35次,72℃延伸20min。④毛細(xì)管電泳檢測:0.5μl PCR 產(chǎn)物與 0.15μl Genescan LIZ500 和10μl去離子甲酰胺混合,在ABI PRISM 3130 Genetic Analyzer上經(jīng)36cm毛細(xì)管電泳分離,溫度控制在60℃。3130 Data Collection Software(Applied Biosystems)收集數(shù)據(jù),用GeneMapper ID v3.2軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。每次MLPA檢測都包括一個(gè)正常的對照樣本,檢測結(jié)果均經(jīng)過2次獨(dú)立的實(shí)驗(yàn)證實(shí)。

2 結(jié)果

采用SALSA probe mix P034和P035兩套探針可同時(shí)檢測DMD基因79個(gè)外顯子缺失型和攜帶者。

2.1 家系1

見圖1、圖2。先證者(患病者)是DMD 45號外顯子缺失突變,母親為攜帶者:45號外顯子雜合缺失突變,胎兒為一正常男性胎兒。

2.2 家系2

見圖3,圖4。先證者是DMD 46~53號外顯子缺失突變,母親為DMD 45~53號外顯子雜合缺失突變,胎兒為一正常男性胎兒。

3 討論

假性肥大性肌營養(yǎng)不良為性染色體隱性遺傳。DMD患者一般有典型臨床表現(xiàn)和家族史,約1/3為散發(fā)型,男性患病,女性攜帶。BMD起病較晚,癥狀較輕且進(jìn)展緩慢,多在16歲之后靠輪椅生活,壽命可達(dá)40~50歲。血清生化檢測是確定DMD/BMD攜帶者及患者的傳統(tǒng)方法,肌酶在疾病早期和進(jìn)展期均明顯增高,尤以血清肌酸磷酸激酶最敏感。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,對疑似DMD進(jìn)行準(zhǔn)確的基因診斷可以避免誤診和誤治,給患者提供更加詳細(xì)準(zhǔn)確的優(yōu)生優(yōu)育指導(dǎo)。

1868年Duchenne首次描述此病,同年Monaco等首次將DMD基因定位于Xp21.2,1987年Koenig等克隆了整個(gè)DMD基因約14kb的cDNA。DNA全長為2.4Mb,RNA 全長為 14.2Kb,含有 79 個(gè)外顯子,占X染色體全長的1.5%,包含79個(gè)外顯子和78 個(gè)內(nèi)含子,是目前發(fā)現(xiàn)的人類最大的基因[2,3]。在DMD基因內(nèi)存在許多重復(fù)序列,有許多斷裂和交換熱點(diǎn),導(dǎo)致基因缺失/重復(fù)極容易發(fā)生新生突變。DMD基因具有突變長度不一、突變位置無固定規(guī)律等特點(diǎn),突變無明顯種族、地理差異,突變中以外顯子缺失突變最常見(55% ~65%)[4]。

White等[5]2002年設(shè)計(jì)了多重可擴(kuò)增探針雜交技術(shù)(MAPH),同年 Schouten等[6]在 MAPH 技術(shù)的基礎(chǔ)上又發(fā)展了一種快速簡單的檢測技術(shù),即MLPA。MLPA可以用2套引物通過2次 PCR檢測DMD基因79個(gè)外顯子缺失或重復(fù),具有需要DNA量小、靈敏度高和重復(fù)檢測的優(yōu)點(diǎn),是一種檢測DMD/BMD基因大片段缺失/重復(fù)的快速可靠方法,通過直觀圖譜進(jìn)行檢測結(jié)果分析[7]。變性高效液相色譜(DHPLC)對DMD的基因缺失重復(fù)進(jìn)行檢測,其他還可以利用高分辨溶解曲線、基因芯片、免疫組化等方法檢測DMD基因的突變類型[8]。

由于DMD涉及基因突變類型多,不同家系的突變類型可完全不同,需采用不同基因診斷方法和策略,因此在擬開展DMD的產(chǎn)前診斷之前必須首先完成家系中先證者的臨床確診和基因診斷,進(jìn)行產(chǎn)前基因診斷才有意義。本所現(xiàn)階段僅對DMD外顯子缺失突變的先證者家系中具有髙致病風(fēng)險(xiǎn)的胎兒運(yùn)用MLPA技術(shù)進(jìn)行產(chǎn)前基因診斷。通常先運(yùn)用MLPA技術(shù)檢測先證者及家系中其他患者的DMD基因所有外顯子,在明確存在DMD基因缺失型突變,確定缺失外顯子片段后,再對家系中的高風(fēng)險(xiǎn)致病胎兒進(jìn)行針對同一片段的基因診斷。本文通過對2個(gè)家系的基因診斷,2個(gè)家系中的高致病風(fēng)險(xiǎn)胎兒檢測均未見DMD外顯子明顯缺失后,先證者母親繼續(xù)妊娠至胎兒分娩,取嬰兒血液經(jīng)MLPA檢測證實(shí)與用羊水的檢測結(jié)果一致。嬰兒經(jīng)產(chǎn)科及兒科醫(yī)生體檢,未見明顯異常臨床表現(xiàn)。進(jìn)行血清酶學(xué)檢查及后期隨訪,也沒有發(fā)現(xiàn)異常臨床體征。如DMD外顯子篩查未發(fā)現(xiàn)缺失位點(diǎn),則需開展先證者、先證者父母及家庭其他成員的DMD基因連鎖標(biāo)志分析,確定家系突變DMD基因類型,而后建立相應(yīng)的基因診斷技術(shù)[9,10]。這是本所下一階段爭取開展的項(xiàng)目研究,不僅可以降低發(fā)病率,而且可以檢測胎兒是否為基因攜帶者,從而有效控制致病基因的傳遞。

1 Francesco Muntoni,Silvia Torelli,Alessandra Ferlini,et al.Dystrophin and mutations:one gene,several proteins,multiple phenotypes[J].The Lancet Neurology,2003,2(12):731 -740.

2 Monaco AP,Neve RL,Colletti- Feener,et al.Isolation of candidate cDNAs for portions of the Duchenne muscular dystrophy gene [J].Nature,1986,(6089)323:646 -650.

3 Koenig M,Hoffman EP,Berteison CJ,et al.Complete cloning of the Duchenne muscular dystrophy(DMD)cDNA and preliminary genomic organization of the DMD gene in normal and affected individuals[J].Cell,1987,50(3):509 -517.

4 Mendell J R,Buzin CH,F(xiàn)eng J,et al.Diagnosis of Duchenne dystrophy by enhanced detection of small mutations[J].Neurology,2001,57:645-650.

5 White S,Kalf M,Liu Q,et al.Comprehensive detection of genomic duplications and deletions in the DMD gene,by use of multiplex amplifiable probe hybridization[J].The American journal of human genetic,2002,71(2):365 -368.

6 Schouten JP,McElgunn CJ,Wanijer R,et al.Relative quantification of 40 nucleic acid sequences by multiplex ligation-dependent probe amplification[J].Nucleic Acids Resarch,2002,30(12):1 -13.

7 吳玉鵬,吳德,尹耕心,等.MLPA和PCR-RFLP技術(shù)用于脊髓性肌萎縮癥的基因診斷[J].中國計(jì)劃生育學(xué)雜志,2008,16(9):535-539.

8 古艷,謝建生,韓春錫,等.應(yīng)用多重連接依賴探針擴(kuò)增技術(shù)對脊髓性肌萎縮患者及致病基因攜帶者進(jìn)行基因診斷[J].中華臨床醫(yī)師雜志(電子版),2010,4(9):1512 -1519.

9 蒲祥元,金帆.Duchenne型肌營養(yǎng)不良癥的植入前遺傳學(xué)診斷[J].國際生殖健康/計(jì)劃生育雜志,2009,28(5):324 -325.

10 LI Q,Li SY,Hu DG,et al.Prenatal molecular diagnosis of Duchenne and Becker muscular dystrophy[J].北京大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版),2006,38(1):53 -56.

2012-05-11

2012-07-06*

jhsykys@163.com

[責(zé)任編輯:張 璐]

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