付進(jìn)剛,覃呂高,陳克平
(江蘇大學(xué)生命科學(xué)研究院,鎮(zhèn)江212013)
農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中雜種優(yōu)勢(shì)(heterosis,hybrid vigor)的發(fā)現(xiàn)極大地推動(dòng)了動(dòng)植物品質(zhì)和產(chǎn)量的革新,這是人類改造自然的創(chuàng)舉,它的貢獻(xiàn)在于使人類有限的資源得到極大的豐富。雜種優(yōu)勢(shì)20世紀(jì)30年代在玉米中得到真正廣泛的應(yīng)用,開創(chuàng)了雜種優(yōu)勢(shì)應(yīng)用的歷史先河。家蠶雜種優(yōu)勢(shì)的采用可以說(shuō)與玉米“并駕齊驅(qū)”,是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中實(shí)際應(yīng)用早的物種之一。雜種優(yōu)勢(shì)的理論是一個(gè)重大學(xué)術(shù)問(wèn)題,目前有顯性基因互補(bǔ)假說(shuō)、超顯性假說(shuō)、遺傳平衡假說(shuō)等。這些假說(shuō)雖然可以部分合理地解釋許多雜交實(shí)驗(yàn)結(jié)果,然而其遺傳基礎(chǔ)研究仍處于萌芽狀態(tài),在許多方面機(jī)理仍然不明。
1865年,孟德爾進(jìn)行豌豆雜交試驗(yàn)時(shí),發(fā)現(xiàn)了雜種優(yōu)勢(shì)的現(xiàn)象,由此提出了雜種活力(hybrid vigour)。C.R.達(dá)爾文于1876年首次提出了雜種優(yōu)勢(shì),這是由于他觀察到雜交授粉玉米高度的雜種優(yōu)勢(shì)現(xiàn)象。1880年,Beal將雜種優(yōu)勢(shì)應(yīng)用于糧食作物的遺傳改良獲得的雜種一代的產(chǎn)量比親本高出50%。1908年,shull和East研究了玉米近交與雜交,并且根據(jù)其結(jié)果再次提出了雜種優(yōu)勢(shì)的現(xiàn)象。1914年,Shull提出雜合性對(duì)有機(jī)體的細(xì)胞分裂及其生長(zhǎng)所產(chǎn)生的刺激作用為雜種優(yōu)勢(shì)(Heterosis)。1918年,隨著Jones提出在生產(chǎn)上利用玉米雙雜交種,第一批在生產(chǎn)上應(yīng)用的玉米雜種出現(xiàn)在美國(guó)。
1910年,Bruce提出了顯性假說(shuō)(Dominance Hypothesis),而1917年,Jones對(duì)其做了進(jìn)一步補(bǔ)充,提出了顯性連鎖基因假說(shuō)。該假說(shuō)認(rèn)為:多個(gè)基因控制雜種優(yōu)勢(shì)的數(shù)量性狀,在這些基因中顯性基因?qū)τ谏矬w正常生長(zhǎng)發(fā)育是有利的,而隱性基因則反之,并且顯性基因能夠掩蓋隱性基因,因此,在進(jìn)行雜交時(shí),雜交代中獲得顯性基因的組合往往比親本多,這樣就增加雜交代的生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì),從而表現(xiàn)出雜種優(yōu)勢(shì)。2010年,Li等通過(guò)對(duì)水稻雜交代的研究,發(fā)現(xiàn)顯性假說(shuō)在其雜種優(yōu)勢(shì)中起著重要的作用[1]。
超顯性假說(shuō)(overdomiance Hypothesis)是由Shull和East于1908年分別提出來(lái)的,該假說(shuō)認(rèn)為:雜種優(yōu)勢(shì)是由于不同基因型的配子相互結(jié)合后產(chǎn)生的一種刺激生長(zhǎng)發(fā)育的效應(yīng)。后來(lái)East又做了進(jìn)一步補(bǔ)充,認(rèn)為雜種優(yōu)勢(shì)是由于雙親異質(zhì)基因型的結(jié)合,引起了等位基因間的互作,這樣就刺激了雜交代生長(zhǎng),所以雜交代有較大的優(yōu)勢(shì)。
超顯性假說(shuō)能夠很好地解釋很多雜交代優(yōu)于親本的現(xiàn)象,特別是一些單基因控制的性狀。Hull證實(shí)了超顯性在玉米雜種優(yōu)勢(shì)中的作用。Mithell-Olds等通過(guò)對(duì)擬南芥的雜種優(yōu)勢(shì)研究表明,超顯性在擬南芥雜種優(yōu)勢(shì)中起主要作用[2]。LI等認(rèn)為超顯性與白羊雜種優(yōu)勢(shì)形成有著重要的聯(lián)系。Lariepe等發(fā)現(xiàn)在玉米中超顯性起著主要作用[3]。
由于超顯性假說(shuō)認(rèn)為,等位基因間沒(méi)有顯隱性關(guān)系,所以超顯性很難在多基因控制的性狀中得到證實(shí);而且在自花授粉植物中一些雜交代也沒(méi)有發(fā)現(xiàn)雜種優(yōu)勢(shì)的現(xiàn)象,這也說(shuō)明雙親異質(zhì)基因型的結(jié)合也可能不會(huì)產(chǎn)生優(yōu)勢(shì)。
該假說(shuō)認(rèn)為:雜種優(yōu)勢(shì)是由于非等位基因間的相互作用產(chǎn)生的。Powers認(rèn)為非等位基因間的相互作用在群體的雜種優(yōu)勢(shì)形成過(guò)程中起著主要作用[4]。Yu等通過(guò)對(duì)水稻產(chǎn)量性狀的研究,發(fā)現(xiàn)上位性效應(yīng)在水稻產(chǎn)量雜種優(yōu)勢(shì)中起著重要的作用[5]。Macia等發(fā)現(xiàn)上位性能夠增加有機(jī)體的復(fù)雜性并且可以提高基因網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)的性能[6]。
雜種優(yōu)勢(shì)是諸多因素相互作用的結(jié)果,因此僅僅根據(jù)基因組的雜合性來(lái)解釋雜種優(yōu)勢(shì)的形成原因是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的。很多研究表明:雜種優(yōu)勢(shì)與核基因組以及細(xì)胞質(zhì)基因組都有關(guān)[7-8]。Srivastava認(rèn)為雜交一代之所以表現(xiàn)出雜種優(yōu)勢(shì)是由于基因表達(dá)以及蛋白表達(dá)量的增加,是由于其細(xì)胞中各種代謝調(diào)控元件工作效率的提高[9]。
由于DNA甲基化在生物發(fā)育中有著重要的作用,而且在真核細(xì)胞中,甲基化能夠調(diào)節(jié)基因表達(dá),所以很多研究者開始從DNA甲基化水平與轉(zhuǎn)錄調(diào)控角度去研究雜種優(yōu)勢(shì)的遺傳機(jī)理。
Tsaftaris對(duì)玉米甲基化研究發(fā)現(xiàn),雜交代甲基化比例比兩親本低。所以Tsaftaris認(rèn)為玉米雜種優(yōu)勢(shì)與甲基化有一定的關(guān)系[10]。Xiong的研究結(jié)論恰與Tsaftaris相反,并認(rèn)為在水稻雜種中,甲基化降低與雜種優(yōu)勢(shì)沒(méi)有線性關(guān)系[11]。這說(shuō)明,雜種優(yōu)勢(shì)產(chǎn)生過(guò)程中某些基因表達(dá)增強(qiáng)是有利的,而一些基因被抑制也可能是有利的。Nakamura等發(fā)現(xiàn)DNA甲基化在二倍體馬鈴薯的雜種優(yōu)勢(shì)中起著重要的作用[12]。
基因網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)是鮑文奎[13]首先提出的,該系統(tǒng)認(rèn)為,不同的生物其基因組都有一套保證個(gè)體正常生長(zhǎng)與發(fā)育的遺傳信息,包括全部的編碼基因,控制基因表達(dá)的控制序列協(xié)調(diào)不同基因之間相互作用的組分?;蚪M將這些看不見(jiàn)的信息編碼在DNA上,組成了一個(gè)使基因有序表達(dá)的網(wǎng)絡(luò),在這個(gè)新組建的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)中,等位基因成員處在最好的工作狀態(tài),使整個(gè)遺傳體系發(fā)揮最佳效率時(shí),即可實(shí)現(xiàn)雜種優(yōu)勢(shì)。1999年,向道權(quán)等[14]在基因網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)和雜種優(yōu)勢(shì)的形成關(guān)系基礎(chǔ)上提出:雜種通過(guò)自組織理論而形成的最優(yōu)基因表達(dá)調(diào)控體系是雜種優(yōu)勢(shì)形成的遺傳基礎(chǔ)。
2008年,Ni等在《Nature》上發(fā)表論文,認(rèn)為生物鐘調(diào)節(jié)和雜種優(yōu)勢(shì)有著直接聯(lián)系[15]。他發(fā)現(xiàn),在擬南芥的雜交F1代和異源四倍體中,生物鐘基因CCA1和LHY表達(dá)被壓制將誘導(dǎo)TOC1,GI基因表達(dá),并誘導(dǎo)表達(dá)了一些與光合作用和淀粉代謝途徑有關(guān)的下游基因,從而表現(xiàn)出比親本更強(qiáng)的光合作用,產(chǎn)生更多的葉綠素和淀粉。
Munaro等發(fā)現(xiàn)植物谷粒產(chǎn)量的中親雜種優(yōu)勢(shì)隨著環(huán)境質(zhì)量的降低而降低,而且他認(rèn)為在有利的條件下,收獲指數(shù)的中親雜種優(yōu)勢(shì)是限制植物谷粒產(chǎn)量的中親雜種優(yōu)勢(shì)的主要因素[16]。Fu等通過(guò)研究5個(gè)不同品種的玉米胚蛋白組發(fā)現(xiàn),在玉米種子發(fā)芽過(guò)程中,顯性作用和超顯性作用在其雜種優(yōu)勢(shì)中有著重要的作用[17]。Fujimoto在研究擬南芥雜種優(yōu)勢(shì)時(shí)發(fā)現(xiàn),抑制光合作用減少了雜種優(yōu)勢(shì),而加強(qiáng)光照則提高了光合作用和雜種優(yōu)勢(shì)[18]。Girke等通過(guò)對(duì)甘藍(lán)型油菜分析發(fā)現(xiàn),雜交代產(chǎn)量的雜種優(yōu)勢(shì)與親本的遺傳距離沒(méi)有明顯的關(guān)聯(lián)[19]。通過(guò)對(duì)玉米,水稻以及其他物種研究表明蛋白代謝在雜交代的雜種優(yōu)勢(shì)中起著重要的作用[20]。Zhu等通過(guò)對(duì)旱地棉花研究發(fā)現(xiàn),在其雜交代中營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)與其產(chǎn)量雜種優(yōu)勢(shì)是呈正相關(guān)的[21]。
綜上所說(shuō),影響雜種優(yōu)勢(shì)形成的因素是多方面的,它是環(huán)境與基因相互作用以及多種機(jī)理綜合作用的結(jié)果。而且不同種群的特定性狀雜種優(yōu)勢(shì)形成的機(jī)理可能不一樣,因此在研究雜種優(yōu)勢(shì)時(shí)需具體分析。
雜種優(yōu)勢(shì)遺傳學(xué)原因復(fù)雜,涉及的生理生化過(guò)程眾多,因此,僅通過(guò)單一的研究手段或只對(duì)少數(shù)基因的研究是無(wú)法對(duì)雜種優(yōu)勢(shì)進(jìn)行全面揭示,最近幾年,轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究發(fā)展很快。基因表達(dá)和蛋白功能具有與表型更加緊密地聯(lián)系,一旦高通量的研究手段日趨完善,我們有理由相信雜種優(yōu)勢(shì)的機(jī)理將會(huì)進(jìn)一步明確。
[1]Li L,Lu K,Chen Z,et al.Dominance,overdominance and epistasis condition the heterosis in two heterotic rice hybrids[J].Genetics,2008,180(3):1725-1742.
[2]Mitchell-Olds T.Interval mapping of viability loci causing using heterosis Arabidoposis[J].Geneties 1995,140(3):1105-1109.
[3]Lariepe A,Mangin B,Jasson S,et al.The genetic basis of heterosis:multiparental quantitative trait loci mapping reveals contrasted levels of apparent overdominance among traits of agronomical interest in maize(Zea mays L.)[J].Genetics ,2012,190:795-811.
[4]Powers L.An expansion of Jone's theory for the explanation of heterosis[J].The Ameriean Naturalist,1994,7(3):8-27.
[5]Yu S B,Li J X,Xu C G,et al.Importance of epistasis as the genetic basis of heterosis in an elite rice hybrid[J].Proc Natl Acad Sci U S A ,1997,94(10):9226-9231.
[6]Macia J,Sole R V,Elena S F.The causes of epistasis in genetic networks[J].Evolution,2012,66:586-596.
[7]Birky C W Jr.Relaxed cellular controls and organelle heredity[J].Science,1978,222(4623):468-475
[8]Tilney N L,Bancewicz J,Rowinski W,et al.Enhancement of cardiac allografts in rats.Comparison of host responses to different treatment protocols[J].Transplantation,1978,25(1):1-6.
[9]Srivastava D,Vyas M C,Chaudhary R K.Prognostic significance of eosinophil count during radiotherapy[J].Indian J Med Res,1983,78 Suppl:162-163.
[10]Tsaftaris A S.Biochemical analyses of inbreds and their heterotic hybrids in maize[J].Prog Clin Biol Res,1990,344(12):639-664.
[11]Xiong L,Andrews D,Regnier F.Comparative proteomics of glycoproteins based on lectin selection and isotope coding[J].J Proteome Res,2003,2(6):618-625.
[12]Nakamura S,Hosaka K.DNA methylation in diploid inbred lines of potatoes and its possible role in the regulation of heterosis[J].Theor Appl Genet,2010,120(2):205-214.
[13]鮑文奎.機(jī)會(huì)與風(fēng)險(xiǎn)—40年育種研究的思考[J].植物雜志,1990,4:35-37.
[14]王得元,殷秋妙,李穎,等.作物雜種優(yōu)勢(shì)的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 西北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào) ,1999,27(1):45-47
[15]Ni Z,Kim E D,Ha M,et al.Altered circadian rhythms regulate growth vigour in hybrids and allopolyploids[J].Nature,2009,457(7227):327-331.
[16]Munaro E M,Eyherabide G H,D'Andrea K E,et al.Heterosis x environment interaction in maize:what drives heterosis for grain yield?[J].Field Crops Research,2011,124(3):441-449.
[17]Fu Z Y,Jin X N,Ding D,et al.Proteomic analysis of heterosis during maize seed germination[J].Proteomics,2011,11(8):1462-1472.
[18]Fujimoto R,Taylor J M,Shirasawa S,et al.Heterosis of Arabidopsis hybrids between C24 and Col is associated with increased photosynthesis capacity[C].Proceedings of the National Academy of Sciences of the U-nited States of America,2012,109(18):7109-7114.
[19]Girke A,Schierholt A,Becker H C.Extending the rapeseed gene pool with resynthesized Brassica napus II:Heterosis[J].Theor Appl Genet,2012,124(6):1017-1026.
[20]Goff S A.A unifying theory for general multigenic heterosis:energy efficiency,protein metabolism and implications for molecular breeding[J].New Phytologist,2011,189:923-937.
[21]Zhu X,Ainijiang,Zhang Y,et al.Relationships between differential gene expression and heterosis in cotton hybrids developed from the foundation parent CRI-12 and its pedigree-derived lines[J].Plant Sci,2011,180(2):221-227.