郭 紅,徐殿勝,王慶誠
(1.華東理工大學(xué) 生物反應(yīng)器工程國家重點(diǎn)實驗室,上海200237;2.上海南方模式生物研究中心,上海201210)
核糖核酸酶是一類廣泛存在于動植物體內(nèi)的、具有水解作用的一類酶。它通過剪切轉(zhuǎn)錄核糖核酸及對核糖核酸進(jìn)行修飾和降解來達(dá)到抑制腫瘤細(xì)胞生長的目的[1]。
Onconase(豹蛙酶)是一種從北極豹蛙卵母細(xì)胞和早期胚胎中提取的核糖核酸酶,對人肺腺癌細(xì)胞、慢性粒細(xì)胞白血病細(xì)胞、黑色素瘤細(xì)胞及人體肺腺癌上皮細(xì)胞等都有細(xì)胞毒性作用[2,3],是一種具有很大開發(fā)潛力的蛋白質(zhì)。
目前,國內(nèi)多通過畢赤酵母和大腸桿菌發(fā)酵來制備Onconase。作者在此先提純大腸桿菌發(fā)酵獲得的包涵體,再使包涵體復(fù)性得到有活力的Onconase蛋白。由于氧化型谷胱甘肽(GSSG)對蛋白質(zhì)中二硫鍵的重新形成起到很重要的作用,尿素對蛋白質(zhì)的復(fù)性也有意想不到的效果,因此,在復(fù)性緩沖溶液[4]中加入一定量的GSSG和尿素,并考察了復(fù)性溫度、尿素濃度、GSSG加入時間對復(fù)性效果的影響,以確定最優(yōu)稀釋復(fù)性條件,并與傳統(tǒng)的醋酸沉淀復(fù)性法進(jìn)行了對比。擬為Onconase生產(chǎn)工業(yè)化、提高Onconase產(chǎn)量提供幫助。
牛血清白蛋白(BSA)、二硫蘇糖醇(DTT)、尿素(Genebase)、RNase A、Tween-20、鹽酸胍(BIO BASIC INC),Triton X-100、GSSG(Amresco)等。
TES 緩 沖 溶 液:50mmol·L-1Tris-HCl,20 mmol·L-1EDTA,100mmol·L-1NaCl,pH 值8.0。
DIBB緩沖溶液:20mmol·L-1Tris-HCl,6mol·L-1Guanidine-HCl,65mmol·L-1DTT(現(xiàn)加),10 mmol·L-1EDTA,pH 值8.0。
RB緩沖溶液:100mmol·L-1Tris-AcOH,100 mmol·L-1NaCl,3.0mmol·L-1還原型谷胱甘肽,0.6mmol·L-1氧化型谷胱甘肽,pH值8.0。
DB緩沖溶液:20mmol·L-1乙酸。
多功能酶標(biāo)儀(BIOTEK),AKTA Purifier(GE)。
1.2.1 菌體破碎及包涵體的洗滌
在內(nèi)含Onconase包涵體的大腸桿菌發(fā)酵液中加入溶菌酶,勻漿破碎,于6000r·min-1離心1h;加入TES緩沖溶液及25%Triton X-100,勻漿后再于6000 r·min-1離心1h,重復(fù)操作1次;再加入TES緩沖溶液,勻漿,于6000r·min-1離心1h,重復(fù)操作直至上清液澄清,得到包涵體。
1.2.2 包涵體蛋白的溶解和稀釋復(fù)性
將包涵體溶解于一定體積的DIBB緩沖溶液中,室溫振蕩過夜。測定蛋白含量后,用DIBB緩沖溶液將蛋白質(zhì)濃度稀釋到10mg·mL-1。
將包涵體裂解液緩慢滴加至配制好的包涵體復(fù)性緩沖溶液中,設(shè)定合適的轉(zhuǎn)速進(jìn)行攪拌,保證蛋白質(zhì)的終濃度為0.1mg·mL-1,置于4℃層析柜中復(fù)性72h。然后于6000r·min-1離心1h,去除因聚集產(chǎn)生的蛋白質(zhì)沉淀。
1.2.3 傳統(tǒng)的醋酸沉淀復(fù)性
將1mL包涵體溶液迅速用50mL DB稀釋,于4℃、12 000r·min-1離心30min,去沉淀,透析,去除變性劑。向溶液中加入20BV RB,并調(diào)節(jié)pH值為8.0,于4℃、12 000r·min-1離心30min,去沉淀。在復(fù)性緩沖溶液RB中4℃復(fù)性36~48h,于4℃、12 000r·min-1離心20min,去除復(fù)性過程產(chǎn)生的蛋白沉淀。
1.3.1 蛋白含量的測定
采用Brandford法測定蛋白含量。
1.3.2 蛋白相對活力的測定
由于目的蛋白是核糖核酸酶,所以采用RNA熒光底物法測定目的蛋白活力,即目的蛋白Onconase和帶有熒光標(biāo)記的底物RNA進(jìn)行反應(yīng),通過檢測吸光度值得到蛋白相對活力(由于不需要各組實驗間的對比,為簡化實驗,直接利用每個時刻得到的活力曲線的斜率作為縱坐標(biāo),比較各組條件下得到的蛋白相對活力)。
圖1 醋酸沉淀法的復(fù)性效果Fig.1 The renaturation efficiency of acetic acid sinking method
由于醋酸沉淀法無需加入輔助復(fù)性的物質(zhì),節(jié)省了工藝成本,所以不失為一種可供選擇的方法。
2.2.1 復(fù)性溫度的影響
復(fù)性緩沖溶液pH值為8.0、尿素濃度為2mol·L-1、GSSG先于包涵體加入復(fù)性緩沖溶液中、復(fù)性緩沖溶液體積為50mL、蛋白質(zhì)終濃度控制在0.1mg·mL-1,考察復(fù)性溫度對復(fù)性效果(復(fù)性緩沖溶液中總蛋白相對活力)的影響,結(jié)果見圖2。
圖2 復(fù)性溫度對復(fù)性效果的影響Fig.2 The effect of renaturation temperature on renaturation efficiency
從圖2可知,4℃下復(fù)性緩沖溶液中總蛋白相對活力最高。蛋白活力應(yīng)該隨著溫度升高而增大,且到達(dá)某一臨界溫度后不會再繼續(xù)上升。但包涵體復(fù)性過程需要經(jīng)過中間狀態(tài)——熔球態(tài),25℃時的復(fù)性效果沒有4℃好,這可能是因為25℃時包涵體進(jìn)入熔球態(tài)的速度較快,容易出現(xiàn)錯誤折疊的情況,進(jìn)而影響到總蛋白的相對活力。
2.2.2 尿素濃度的影響
復(fù)性緩沖溶液pH值為8.0、復(fù)性溫度為4℃、復(fù)性緩沖溶液體積為50mL、蛋白質(zhì)終濃度控制在0.1 mg·mL-1,考察尿素濃度對復(fù)性效果的影響,結(jié)果見圖3。
圖3 尿素濃度對復(fù)性效果的影響Fig.3 The effect of urea concentration on renaturation efficiency
從圖3可知,尿素濃度為2mol·L-1時,復(fù)性緩沖溶液中的總蛋白相對活力最高,這可能是因為,濃度小于2mol·L-1時,尿素的主要作用是屏蔽蛋白質(zhì)所帶電荷,防止蛋白質(zhì)聚集沉淀的損失;而濃度大于2 mol·L-1時,尿素奪取蛋白質(zhì)氫鍵的作用要強(qiáng)于屏蔽蛋白質(zhì)電荷的作用,從而促進(jìn)了蛋白質(zhì)變性的發(fā)生。
2.2.3 GSSG加入時間的影響
復(fù)性緩沖溶液pH值為8.0、復(fù)性溫度為4℃、復(fù)性緩沖溶液體積為50mL、蛋白質(zhì)終濃度控制在0.1 mg·mL-1、復(fù)性緩沖溶液中尿素濃度分別為2mol·L-1和1.5mol·L-1,考察 GSSG加入時間對復(fù)性效果的影響,結(jié)果見圖4。
從圖4可知,當(dāng)尿素濃度為2mol·L-1時,GSSG先于包涵體加入復(fù)性緩沖溶液中效果稍好,但差別不明顯;當(dāng)尿素濃度為1.5mol·L-1時,GSSG后于包涵體加入復(fù)性緩沖溶液中效果較好。
基于以上實驗結(jié)果,分別取350mL3種緩沖溶液:加有GSSG的含2mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液、含1.5mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液、醋酸沉淀復(fù)性緩沖溶液,采用稀釋復(fù)性方法[5],緩慢滴加包涵體裂解液,攪拌(5min后,在含1.5mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液中加入等量的GSSG),放入4℃層析柜中復(fù)性72h。然后于6000r·min-1、4℃離心1h,去除沉淀,用陽離子交換柱South15s進(jìn)一步純化。測定Onconase含量,并計算回收率,結(jié)果見表1。
圖4 GSSG加入時間對復(fù)性效果的影響Fig.4 The effect of addition time of GSSG on renaturation efficiency
表1 復(fù)性并純化后的Onconase蛋白含量及回收率Tab.1 The content and recovery of Onconase after renaturation and purification
由表1可知,先加GSSG的含2mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液的復(fù)性效果最好,Onconase含量和回收率均高于其它兩種復(fù)性體系。
(1)由于Onconase的等電點(diǎn)較高,為9.7左右,故選用陽離子交換柱層析進(jìn)行純化。
(2)常用的蛋白質(zhì)變性劑為6mol·L-1尿素或4 mol·L-1鹽酸胍。這是由于高濃度的尿素或鹽酸胍可以破壞蛋白質(zhì)的氫鍵,即蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu),從而使蛋白質(zhì)不能形成活性所必需的高級結(jié)構(gòu),起到變性作用。然而近年來研究發(fā)現(xiàn),低濃度的尿素具有降低非正確折疊和蛋白的活性狀態(tài)、提高解折疊狀態(tài)和折疊中間體的穩(wěn)定性的作用[6,7]。這可能是因為尿素的溶解作用一方面會奪取蛋白質(zhì)的氫鍵,另一方面卻可以防止蛋白質(zhì)的聚集(可能是由于尿素屏蔽了蛋白質(zhì)之間的電荷作用)。為此,本研究選擇尿素作為變性劑,并考察了尿素濃度對復(fù)性效果的影響。
(3)研究發(fā)現(xiàn),待復(fù)性的蛋白質(zhì)本身含有二硫鍵時,應(yīng)該在復(fù)性過程中加入諸如GSH(還原型谷胱甘肽)/GSSG、DTT/GSSG等具有氧化還原作用的體系。氧化還原體系通過促進(jìn)不正確形成的二硫鍵快速交換反應(yīng),提高了正確配對的二硫鍵的產(chǎn)率。Onconase本身只有104個氨基酸,卻含有4個二硫鍵,其二硫鍵能否正確折疊對蛋白活力影響很大。因此,實驗選擇DTT/GSSG氧化還原體系,以確保Onconase的正確折疊。
以往的實驗中曾選擇在過夜裂解包涵體時加入DTT、在配制復(fù)性緩沖溶液時加入GSSG的方式,并取得了良好的效果。后有報道稱將GSSG后于包涵體加入到復(fù)性緩沖溶液中效果更好[6]??紤]到在蛋白質(zhì)折疊過程中,從伸展態(tài)到中間態(tài)的速度只需要幾毫秒,因此將GSSG和包涵體加入到復(fù)性緩沖溶液中的時間間隔設(shè)為5min,對GSSG先于、后于包涵體加入到復(fù)性緩沖溶液中的效果進(jìn)行比較,但由于時間所限,并沒有進(jìn)行時間梯度上的探討。
然而,對于1.5mol·L-1尿素體系和2mol·L-1尿素體系所得出的結(jié)論為何相反的問題,由于因素復(fù)雜,有待進(jìn)一步深入探討。
(4)對蛋白HPLC級別的純度分析需要進(jìn)一步研究。
采用稀釋復(fù)性方法從包涵體中復(fù)性得到有活力的Onconase蛋白,并與傳統(tǒng)的醋酸沉淀復(fù)性方法進(jìn)行了比較,考察了復(fù)性溫度、尿素濃度、GSSG加入時間對復(fù)性效果的影響。結(jié)果表明,在最佳復(fù)性溫度為4℃、采用最佳復(fù)性體系(先加GSSG的含2mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液)時,復(fù)性純化后Onconase含量和回收率明顯高于醋酸沉淀復(fù)性法。
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