姜?jiǎng)灼?,王黨偉,韓燕國(guó),張晉瑋,劉桂瓊
(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,武漢 430070)
近年來(lái),雜種優(yōu)勢(shì)在畜牧生產(chǎn)中得到廣泛應(yīng)用,目前研究主要集中于動(dòng)物生長(zhǎng)和繁殖性能方面[1]。分子標(biāo)記雜合性與動(dòng)物經(jīng)濟(jì)性狀間的關(guān)聯(lián)性研究已有大量報(bào)道[2-4],但基因雜合度對(duì)動(dòng)物血液影響方面研究報(bào)道較少。動(dòng)物血液是機(jī)體重要的內(nèi)環(huán)境,直接參與機(jī)體的新陳代謝、免疫應(yīng)激等復(fù)雜的生理生化過(guò)程[5-6]。血液生化指標(biāo)受遺傳因素影響,從分子水平上對(duì)血液生化指標(biāo)進(jìn)行比較分析具有一定的探索意義,本研究用SNP標(biāo)記估測(cè)個(gè)體基因雜合度,比較不同個(gè)體基因雜合度水平下血液生化指標(biāo)的差異,為探索個(gè)體基因雜合度對(duì)湖北烏羊血液生化指標(biāo)的影響提供依據(jù)。
實(shí)驗(yàn)羊均為1.5到2周歲健康無(wú)病的湖北烏羊,共計(jì)107只,選自湖北省通山縣湖北烏羊繁育基地羊群,自由放牧,夜晚補(bǔ)加精料,自由飲水。
清晨空腹頸靜脈采血,使用一次性血液采集針,采集血液7 mL分兩管,其中4 mL置于37℃水浴自然凝血后,3 500 r·min-1離心分離出血清,立即帶回實(shí)驗(yàn)室在12 h內(nèi)完成各項(xiàng)生化指標(biāo)的測(cè)定,3 mL血液按照文獻(xiàn)[7]提取DNA。
用羅氏P800全自動(dòng)生化分析儀MODULAR-PE(瑞士)對(duì)如下生化指標(biāo)進(jìn)行測(cè)定:谷丙轉(zhuǎn)氨酶(Al?anine aminotransferase,ALT)、谷草轉(zhuǎn)氨酶(Aspar?tate aminotransferase,AST)、堿性磷酸酶(Alkaline phosphatase,ALP)、總蛋白(Total protein,TP)、白 蛋 白(Albumin,ALB)、 球 蛋 白(Globulin,GLOB)、總膽固醇(Total cholesterol,TC)、甘油三酯(Triglycerides,TG)、磷酸肌酸激酶(Creatine ki?nase,CK)、乳酸脫氫酶(Lactate dehydrogenase,LDH)。其中,ALP,CK與LDH使用上海羅氏制藥有限公司試劑盒測(cè)定;ALT、ALP,TG和TC使用中生北控生物科技股份有限公司的試劑盒測(cè)定;TP,GLOB使用長(zhǎng)春匯力生物技術(shù)有限公司的試劑盒測(cè)定,具體操作方法按照相應(yīng)試劑盒推薦的程序完成。
1.3.1 SNP引物信息
根據(jù)已發(fā)表文獻(xiàn)中的研究成果及本實(shí)驗(yàn)室的積累,收集整理SNP位點(diǎn),在湖北烏羊群體中進(jìn)行掃描并基因分型,由于某些標(biāo)記可能與湖北烏羊血液生化指標(biāo)存在相關(guān),因此先統(tǒng)計(jì)分析各標(biāo)記基因型間是否存在差異,如果有則棄之,最終選取13個(gè)SNP標(biāo)記(見(jiàn)表1)來(lái)對(duì)湖北烏羊進(jìn)行雜合度進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。
表1 13個(gè)SNP的相關(guān)信息Table1 Informmation of 13 SNP sites
1.3.2 基因分型結(jié)果
本試驗(yàn)所選的13個(gè)SNP標(biāo)記位點(diǎn)之中,8個(gè)采用PCR-SSCP分型,6個(gè)采取PCR-RFLP分型,現(xiàn)各選取兩個(gè)PCR-SSCP分型位點(diǎn)和兩個(gè)PCR-RFLP分型位點(diǎn)結(jié)果作為代表。如圖1所示,圖1為IGF-Ⅰ基因部分?jǐn)U增片段,其長(zhǎng)度為363 bp,利用HaeⅢ內(nèi)切酶酶切后瓊脂糖凝膠電泳呈現(xiàn)3種基因型,3條帶的為363 bp-264 bp-99 bp雜合子個(gè)體;圖2為Mc1R基因部分?jǐn)U增片段,其長(zhǎng)度為167bp,利用HaeⅢ內(nèi)切酶酶切后瓊脂糖凝膠電泳呈現(xiàn)三種基因型,3條帶的為167 bp-121 bp-46 bp雜合子個(gè)體;圖3、圖4分別為Myf5和INHβA基因部分?jǐn)U增片段,其中PCR-SSCP電泳圖中3條帶的均為雜合子個(gè)體。
圖1 IGF-1基因多態(tài)位點(diǎn)瓊脂糖及PCR-RFLP電泳圖Fig.1 Mutation of IGF-1:Agarose gel electrophoresis of the PCR product of Primer IGF-1 and PCR-RFLP results
圖2 Mc1R基因多態(tài)位點(diǎn)瓊脂糖及PCR-RFLP電泳圖Fig.2 Mutation of Mc1R:Agarose gel electrophoresis of the PCR product of Primer Mc1R and PCR-RFLP results
圖3 Myf5基因多態(tài)位點(diǎn)瓊脂糖及PCR-SSCP電泳圖Fig.3 Mutation of Myf5:Agarose gel electrophoresis of the PCR product of PrimerMyf5and PCR-SSCP results
圖4 INHβA基因多態(tài)位點(diǎn)瓊脂糖及PCR-SSCP電泳圖Fig.4 Mutation of INHβA:Agarose gel electrophoresis of the PCR product of PrimerINHβAand PCR-SSCP results
個(gè)體基因雜合度Hi的計(jì)算:假設(shè)n是山羊基因組內(nèi)所有基因座的取樣,在取樣的n個(gè)基因座位中,雜合座位數(shù)Hl與取樣座位數(shù)n的比值Hi就是個(gè)體基因雜合度,其反映一個(gè)個(gè)體的基因雜合程度[12]。計(jì)算公式如下:
按照個(gè)體基因雜合度以0.15為步長(zhǎng),將107只湖北烏羊分為4個(gè)雜合度水平,用SAS(V8.1)統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)不同雜合度水平與湖北烏羊的血液生化指標(biāo)進(jìn)行比較分析。
由13個(gè)SNP標(biāo)記計(jì)算出的基因雜合度范圍在0.1538~0.6154,分為4個(gè)水平,結(jié)果見(jiàn)表2。表中平均觀察雜合度較低主要原因是在某些座位上,個(gè)體以純合子為主。
不同雜合度水平下血液生化指標(biāo)的差異分析見(jiàn)表3,由表可見(jiàn)基因雜合度水平只對(duì)所測(cè)血液生化指標(biāo)中的CK具有顯著影響(P<0.05),其他血液生化指標(biāo)在4個(gè)雜合度水平下均無(wú)顯著差異(P>0.05)。雜合度水平為1(平均雜合度為0.2028)時(shí),血液生化指標(biāo)CK含量較高平均為306.22 U·L-1,雜合度水平為3(平均雜合度為0.4615)時(shí),血液生化指標(biāo)CK含量較低平均為234.52 U·L-1。
表2 個(gè)體基因雜合度Table2 Individual gene heterozygosity range for four levels
表3 各個(gè)體基因雜合度水平下湖北烏羊的血液生化指標(biāo)Table3 Hubei Black-boned goat blood biochemical parameters at 4 levels for individual gene heterozygocity
機(jī)體通過(guò)血液循環(huán)將營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)運(yùn)送到各組織細(xì)胞中,從而發(fā)揮營(yíng)養(yǎng)調(diào)控作用以及一系列復(fù)雜的生化反應(yīng),因此血液生化指標(biāo)某種程度上可以間接反應(yīng)機(jī)體的健康狀況、應(yīng)激和免疫能力。
本研究發(fā)現(xiàn)湖北烏羊血清中CK含量與個(gè)體基因雜合度之間存在倒鐘形曲線關(guān)系,CK含量先隨個(gè)體基因雜合度增加逐漸降低,在雜合度水平3(0.38~0.54)時(shí),CK含量達(dá)到最低值,此時(shí)隨群體雜合度增加時(shí)CK水平反而會(huì)升高。多重比較表明雜合度水平1與雜合度水平3之間差異顯著(P<0.05);CK水平可以反映動(dòng)物的應(yīng)激,CK活性高則表示動(dòng)物受到刺激時(shí)大量表達(dá),表明該動(dòng)物抗應(yīng)激能力較弱[14-16]。本研究發(fā)現(xiàn)湖北烏羊的最適雜合度水平0.38<hi≤0.53,說(shuō)明此雜合度下湖北烏羊的抗應(yīng)激能力可能較強(qiáng)。
除CK外,LDH是另一個(gè)與抗應(yīng)激相關(guān)的指標(biāo)。研究表明個(gè)體LDH水平越高,肌肉代謝水平越高,意味著動(dòng)物抗應(yīng)激能力越弱[13-14]。本研究中不同雜合度水平下湖北烏羊血清中LDH含量差異不顯著,但是雜合度水平3 LDH含量(352.12 U·L-1)略低于雜合度水平1(373.45 U·L-1),這與CK含量在雜合度水平1與雜合度水平3之間的變化趨勢(shì)相一致,CK含量低,LDH含量也相對(duì)較低,個(gè)體的抗應(yīng)激能力相對(duì)較強(qiáng)。
GB是體液免疫的主要成分,其含量反映機(jī)體抗病能力。本研究中GB含量隨著雜合度的增加先升高后降低,在雜合度水平3時(shí)最高,更進(jìn)一步揭示在雜合度水平3的情況下,湖北烏羊的抗應(yīng)激能力可能最好,在選種過(guò)程中湖北烏羊個(gè)體基因雜合度最好控制在0.38~0.54水平,此雜合度水平下可能有利于提高湖北烏羊種群的抗應(yīng)激能力使得適應(yīng)性增強(qiáng)。
一般認(rèn)為高雜合度與近交衰退呈負(fù)相關(guān),與雜種優(yōu)勢(shì)呈正相關(guān),但基因雜合度與機(jī)體性狀間不是簡(jiǎn)單的相關(guān)關(guān)系[15]。根據(jù)不同雜合度水平分析,不同性狀的適當(dāng)基因雜合度才能保證其最優(yōu)的含量水平或生產(chǎn)能力。
[1]Cam M A,Olfaz M,Soydan E.Body measurements reflect body weights and carcass yields in karayaka sheep[J].AsianJournal of Animal and Veterinary Advances,2010,5(2):120-127.
[2]Lee M,Godshalk E B,Lamkey K R.Association of restricton frag?ment length polymorphisms among maize inbred with agronomic performance of their crosses[J]Crop Science,1989,29:1067-1071.
[3]Dudley J W,Saghai M A,Rufener G K.Molecular marker informa?tion and grouping of parents in corn breeding programs[J].Crop Science,1991,31:718-723.
[4]吳曉林,李栒,Merete Fredholm.連續(xù)雜交下家豬微衛(wèi)星基因雜合度與經(jīng)濟(jì)性狀的相關(guān)性研究[J].遺傳學(xué)報(bào),2001,28(1):20-28.
[5]王勇,張才駿,盧福山.歐拉羊的血紅蛋白多態(tài)性及其與血液指標(biāo)的聯(lián)系[J].青海大學(xué)學(xué)報(bào),2007(4):61-63.
[6]劉湘帆,王學(xué)峰,樊綺詩(shī).聯(lián)合多個(gè)微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)進(jìn)行血友病B基因診斷[J].中華血液學(xué)雜志,2002,23(3):147-150.
[7]薩姆布魯克J,弗里奇E F,曼尼阿蒂斯T.分子克隆實(shí)驗(yàn)指南[M].金冬雁,黎孟楓,譯.北京:科學(xué)出版社,1992.
[8]王憑青,魯浪,儲(chǔ)明星.孕酮受體多態(tài)性及其與濟(jì)寧青山羊產(chǎn)羔數(shù)關(guān)系[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2009,42(5):1768-1775.
[9]孫瑞平,王利心,王建剛.山羊LHβ基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)的相關(guān)分析[J].西北農(nóng)林科大學(xué)學(xué)報(bào),2009(6):53-55.
[10]張海軍,陳宏,房興唐.山羊MyoD基因家族多態(tài)性及與體尺性狀的相關(guān)性[J].遺傳,2007,29(9):1077-1082.
[11]Liu W J,Fang G X,FangY.The Polymorphism of a Mutation of IGF-1 Gene on Two Goat Breeds in China[J].Journal of Animal and Veterinary Advances.2010,9(4):790-794.
[12]姜?jiǎng)灼?熊遠(yuǎn)著,劉桂瓊.豬個(gè)體基因雜合度對(duì)生產(chǎn)形狀的影響[J].遺傳學(xué)報(bào),2003,30(5):431-436.
[13]Suchint S,Orawan C,Worapol A.Hematological,electrolyte and serum biochemical values of the Thai indigenous chickens(Gallus domesticus)in northeastern Thailand,Songklanakarin[J].J.Sci.Technol.2004,26(3):425-430
[14]Damir?ubcic.Some biochemical parameters in the blood of graz?ing German improved fawn goats from Istria,Croatia[J].Veterinar?ski Arhiv,2001,71(5):237-244.
[15]劉國(guó)慶,孫業(yè)良,楊利國(guó).級(jí)進(jìn)雜交綿羊微衛(wèi)星基因雜合度與生長(zhǎng)性能的關(guān)系[J].南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2006,29(1):67-71.