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應(yīng)用EDTA協(xié)同法檢測腸桿菌科細(xì)菌產(chǎn)金屬β-內(nèi)酰胺酶的研究

2013-10-09 03:55:58解春寶肖代雯楊永長黃文芳
中國實驗診斷學(xué) 2013年3期
關(guān)鍵詞:烯類青霉測序

解春寶,喻 華,肖代雯,楊永長,姜 偉,劉 華,黃文芳

(四川省醫(yī)學(xué)科學(xué)院 四川省人民醫(yī)院 檢驗科,四川 成都610072)

金 屬 β-內(nèi) 酰 胺 酶 (metallo-beta-lactamase,MBL)是β-內(nèi)酰胺酶的一種,它屬于Ambler分子分類法中的B類。其主要特征是除單氨類抗生素(如氨曲南)以外,可水解碳青霉烯酶類等各種β-內(nèi)酰胺類抗生素,該酶可被金屬螯合劑EDTA或巰基類化合物所抑制,但不能被常見的β-內(nèi)酰胺酶抑制劑(如克拉維酸)所抑制。MBL見于銅綠假單胞菌、不動桿菌和腸桿菌科細(xì)菌。但近幾年報道[1]MBL在腸桿菌科中的檢出率有明顯上升的趨勢。因此,快速而準(zhǔn)確的檢測出產(chǎn)MBL的腸桿菌科細(xì)菌顯得尤為重要。本研究基于MBL必須依賴少數(shù)金屬離子(主要是Zn2+)的存在而發(fā)揮催化活性,選用金屬離子的螯合劑EDTA·Na2協(xié)同美羅培南(MEM)可起協(xié)同抗菌作用來檢測對碳青霉烯酶類抗生素敏感性降低腸桿菌科細(xì)菌的MBL。

1 材料與方法

1.1 儀器與試劑

全自動微生物分析儀VITEK-2以及VITEK-2配套藥敏試驗復(fù)合板購自法國梅里埃公司;離心機(jī)Microfuge 18Centrifuge購自美國貝克曼庫爾特公司;PCR擴(kuò)增儀、電泳儀和凝膠成像儀購自美國Bio-Rad公司;EDTA·Na2購自美國Sigma公司;美羅培南紙片、空白紙片均購自英國Oxoid公司;M-H瓊脂平板、麥康凱瓊脂平板均購自鄭州安圖綠科生物公司;GoldViewTM核酸染料購自北京賽百盛基因技術(shù)有限公司;瓊脂糖粉購自上?;蚣夹g(shù)有限公司;2×Taq PCR MasterMix、DNA Marker II購自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司;引物由上海英駿公司合成。

1.2 菌株來源及鑒定

對碳青霉烯類抗生素敏感性降低的腸桿菌科細(xì)菌共27株,其中肺炎克雷伯菌9株、陰溝腸桿菌8株、粘質(zhì)沙雷菌2株、產(chǎn)氣腸桿菌2株、奇異變形桿菌2株、大腸埃希菌1株、弗勞地枸櫞酸桿菌1株、植生拉烏爾菌1株、日維溝腸桿菌1株,所有菌株均用法國梅里埃公司的全自動微生物分析儀VITEK-2鑒定到種。質(zhì)控菌株為大腸埃希菌ATCC25922購自溫州康泰生物技術(shù)公司。

1.3 試驗方法

1.3.1 EDTA協(xié)同法篩查MBL 將-80℃保存的所有實驗菌株和大腸埃希菌ATCC25922復(fù)蘇后接種麥康凱瓊脂平板,35℃,6.5%CO2培養(yǎng)24h。挑取單個菌落用生理鹽水將每株菌稀釋成0.5麥?zhǔn)蠁挝坏拇龣z菌懸液涂布M-H瓊脂平板。將美羅培南紙片和空白紙片相距1cm貼在M-H瓊脂平板上,然后在空白紙片上加10μl 0.5MEDTA·Na2。在35℃,6.5%CO2孵育18小時后觀察結(jié)果。美羅培南抑菌環(huán)在靠近加EDTA·Na2紙片側(cè)明顯擴(kuò)大者為產(chǎn)MBL菌株。

1.3.2 PCR檢測 MBL DNA提?。簩⑿迈r細(xì)菌懸濁于200μl dH2O,沸水浴10min,12 000rpm離心5min,上清即為DNA模板。采用PCR法檢測各MBL基因的引物序列和目的產(chǎn)物長度見表1。PCR反應(yīng)體系(20μl):10μl 2×Taq PCR Master-Mix,正反向引物各1μl(10μmol/L),2μl DNA 模板,6μl dH2O。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3min,94℃變性1min,Tm℃退火1min(根據(jù)引物Tm值確定各基因合適的退火溫度),72℃延伸1min,30個循環(huán)周期,72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后用Bio-Rad凝膠成像儀檢測并成像。MBL基因擴(kuò)增陽性的PCR產(chǎn)物送上海英駿生物工程有限公司測序,測序結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對分析。

表1 MBL基因引物序列及目的產(chǎn)物長度

2 結(jié)果

2.1 EDTA協(xié)同法結(jié)果

從對碳青霉烯類抗生素敏感性降低的27株腸桿菌科細(xì)菌中檢測出4株菌產(chǎn)生協(xié)同效應(yīng),美羅培南抑菌環(huán)在靠近加EDTA·Na2紙片側(cè)明顯擴(kuò)大(圖1A)。對照所用大腸埃希菌ATCC25922試驗結(jié)果為陰性(圖1B)。

2.2 PCR結(jié)果

PCR檢測所有試驗菌株的MBL的基因NDM-1A、NDM-1B、VIM、SIM 均為陰性,而IMP陽性有4株,且該4株與EDTA協(xié)同法檢測出的4株相一致。擴(kuò)增陽性的PCR產(chǎn)物測序結(jié)果,見圖2。測序的DNA與GenBank數(shù)據(jù)庫提供基因進(jìn)行比對后發(fā)現(xiàn)該序列與IMP-4的序列完全相同(圖3),說明該4株菌所產(chǎn)MBL均為IMP-4型。

圖1 EDTA協(xié)同法結(jié)果

圖2 IMP基因擴(kuò)增陽性測序部分峰圖

圖3 IMP擴(kuò)增陽性的DNA與GenBank比對后的結(jié)果

3 討論

腸桿菌科細(xì)菌作為社區(qū)獲得性感染和院內(nèi)感染的重要病原菌,可引起呼吸道、尿道等各種部位的感染。碳青霉烯類抗生素是治療該類細(xì)菌感染的最有效藥物之一,但近年來由于該類抗生素的大量、不合理使用加速了臨床腸桿菌科細(xì)菌耐藥菌株的產(chǎn)生,其耐藥主要機(jī)制之一是產(chǎn)生MBL,嚴(yán)重威脅著人類健康。MBL發(fā)現(xiàn)于20世紀(jì)60年代中葉,但編碼該MBL的基因攜帶可移動DNA片段在革蘭陰性菌中播散是在20世紀(jì)90年代才被發(fā)現(xiàn)[4]。MBL是β-內(nèi)酰胺酶的一種,它必須依賴少數(shù)金屬離子(主要是Zn2+)的存在而發(fā)揮催化活性。根據(jù)氨基酸序列的不同MBL可分為不同的類型,迄今發(fā)現(xiàn)有40多種。腸桿菌科細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的MBL主要包括NDM-1、IMP、VIM、KHM-1、GIM-1和SIM-1。其主要特征是除單氨類抗生素(如氨曲南)以外,可水解碳青霉烯酶類等各種β-內(nèi)酰胺類抗生素。因此有必要快速而準(zhǔn)確的檢測出產(chǎn)MBL的腸桿菌科細(xì)菌。

目前國內(nèi)外利用PCR技術(shù)檢測MBL被認(rèn)為是最為準(zhǔn)確的方法[5]??僧a(chǎn)生 MBL的基因有多種,PCR法通常一種引物只能檢測到一種產(chǎn)MBL的基因,導(dǎo)致該技術(shù)檢測的MBL比較單一,且其步驟繁瑣、價格昂貴,不適合在臨床微生物實驗室用作常規(guī)檢驗。EDAT協(xié)同法就是利用EDTA是一種較強(qiáng)的金屬離子螯合劑,可結(jié)合鋅離子而使其失去活性,導(dǎo)致試驗中出現(xiàn)抑菌環(huán)擴(kuò)大的現(xiàn)象來檢測MBL。據(jù)文獻(xiàn)[6-10]報道EDAT協(xié)同法檢測 MBL的準(zhǔn)確率較高,均在90%以上。

本研究利用EDTA協(xié)同法從27株對碳青霉烯類抗生素敏感性降低的腸桿菌科細(xì)菌中檢測出4株菌產(chǎn)生明顯的協(xié)同效應(yīng),且該4株菌與PCR檢測出結(jié)果相一致。4株菌所產(chǎn)MBL均為IMP-4型。表明EDTA協(xié)同法檢測對碳青霉烯類抗生素敏感性降低腸桿菌科細(xì)菌的MBL具有較高的準(zhǔn)確性、方法簡便、可操作性強(qiáng)、結(jié)果可靠,適用于臨床對產(chǎn)MBL腸桿菌科細(xì)菌的快速篩查,從而更好的指導(dǎo)臨床的合理用藥。

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