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綿羊ISG15基因的克隆表達(dá)與純化

2013-11-10 08:31:08崔茹鵬沈文魯海富孫延鳴
關(guān)鍵詞:石河子大學(xué)綿羊克隆

崔茹鵬,沈文,魯海富,孫延鳴

(石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,石河子832003)

干擾素刺激基因 15(IFN-stimulated gene,isg15),編碼蛋白為ISG15。但隨后的研究發(fā)現(xiàn),人的ISG15所編碼的氨基酸序列實(shí)際包含165個(gè)氨基酸殘基,分子質(zhì)量約17.89 ku,由2個(gè)串聯(lián)的與泛素同源的氨基酸序列組成,2序列間由脯氨酸殘基橋接,氨基端及羧基端與泛素同源性分別為29%、31%,故又稱ISG15為類泛素蛋白(ubiquitin like protein,Ubls)[1]。脊椎動(dòng)物的多種細(xì)胞在受到干擾素、細(xì)菌脂多糖(LPS)、病毒感染等刺激后,ISG15可被高度誘導(dǎo)表達(dá)[2]。研究已證實(shí),類泛素ISG15以及其蛋白質(zhì)共價(jià)修飾對(duì)刺激細(xì)胞增殖、增強(qiáng)細(xì)胞抗病毒作用、促進(jìn)白細(xì)胞趨化作用等先天免疫功能的過程中有著重要的作用[3-4]。細(xì)胞外的ISG15具有細(xì)胞因子的活性,參與細(xì)胞免疫的調(diào)節(jié)[5]。細(xì)胞內(nèi)的ISG15在調(diào)節(jié)干擾素信號(hào)通路中起到了重要的作用[6]。目前已有一些對(duì)于ISG15功能的研究,但主要集中在人和小鼠上,其中對(duì)羊ISG15的研究更少,目前在羊上該基因是否也具有這些功能還有待進(jìn)一步的研究。

本研究利用綿羊外周血淋巴細(xì)胞(PBMC)克隆獲得了ISG15基因,將該基因克隆到原核表達(dá)載體p ET28a(+)中,并轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)[7-10],通過優(yōu)化表達(dá)條件,得到了ISG15的高效表達(dá)產(chǎn)物,且該表達(dá)產(chǎn)物易于純化,為進(jìn)一步研究綿羊ISG15的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1主要試劑

大腸桿菌(Escherichia coli)BL21(DE3)、DH5α和p ET-28a(+)載體由本實(shí)驗(yàn)室保存;TRIzol試劑購(gòu)自Invitrogen公司;Taq DNA酶、T4DNA連接酶均購(gòu)自北京天根生化科技有限公司;限制性內(nèi)切酶HindⅢ和Eco RⅠ、DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)、p MD18-T、蛋白質(zhì) Marker、IPTG 購(gòu)自 Fermentas公司;凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒購(gòu)自上海捷瑞生物工程有限公司;淋巴細(xì)胞分離液購(gòu)自上海生化試劑廠。

1.1.2實(shí)驗(yàn)動(dòng)物

中國(guó)美利奴羊(新疆軍墾型)5只。

1.2 方法

1.2.1引物設(shè)計(jì)與合成

根據(jù)GenBank中綿羊ISG15的基因序列(登錄號(hào):FJ844480)和 PET28a(+)多克隆位點(diǎn),利用primer 5軟件設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物,委托北京六合華大基因科技股份有限公司合成。

上游引物 P1為:5′-GAATTCATGGGCG-GGGACCTGA-3′,帶有EcoRⅠ酶切位點(diǎn)和起始密碼子;

下 游 引 物 P2 為:5′-AAGCTTTTTGCTACAACTTTATTCACTGCG-3′,帶有 HindⅢ酶切位點(diǎn)和終止密碼子。

1.2.2細(xì)胞總RNA的提取

從頸靜脈無(wú)菌采取健康綿羊抗凝外周血,用淋巴細(xì)胞分離液密度梯度離心分離出PBMC,經(jīng)PBS洗滌3次,用TRIzol試劑按照說明書提取總RNA:將PBMC 4℃4000 r/min離心5 min,棄上清,加入1 mL TRIzol試劑,混勻,室溫靜置10 min,充分裂解,加入200μL氯仿,混勻,室溫靜置5 min,4℃12000 r/min離心15 min;棄上清加入750 mL/L乙醇1 mL,振蕩懸浮,7500 r/min離心5 min,棄上清干燥,加入無(wú)RNA酶的DEPC水中,于-70℃保存。

1.2.3 ISG15 cDNA的克隆及測(cè)序

按照RT-PCR試劑盒說明書進(jìn)行操作:取上述制備的總RNA 1μg,加入20μL逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系中,在AMV反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,以O(shè)ligo(d T)為引物,于42℃50 min,95℃5 min,終止反應(yīng)。將逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物2μL加入到20μL的PCR反應(yīng)體系,以P1、P2為引物進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)條件為:95℃5 min,充分變性后進(jìn)入循環(huán)體系:95℃30 s,55℃30 s,72℃30 s,35個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10 min,取PCR產(chǎn)物5μL在1.5%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行鑒定。

將RT-PCR產(chǎn)物回收純化,直接與p MD18-T載體連接,轉(zhuǎn)化到DH5α大腸桿菌感受態(tài)中,對(duì)轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)的菌落提取質(zhì)粒,經(jīng)Eco RⅠ、HindⅢ雙酶切和PCR進(jìn)行初步鑒定,并委托北京六合華大基因科技有限公司對(duì)其進(jìn)行核苷酸序列測(cè)定,將鑒定正確的重組陽(yáng)性質(zhì)粒命名為p MD18-ISG15。

1.2.4原核表達(dá)載體pET28a-ISG15的構(gòu)建與鑒定

將上述重組質(zhì)粒p MD18-ISG15用P1、P2引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并回收純化,將純化的PCR產(chǎn)物和表達(dá)載體p ET-28a分別用EcoRⅠ和 HindⅢ雙酶切,分別回收ISG15和pET-28a(+)的目的基因片段,并用T4DNA連接酶連接,構(gòu)建重組表達(dá)質(zhì)粒p ET28a-ISG15,然后轉(zhuǎn)化至E.coli BL21(DE3)感受態(tài),挑取單菌落,提取質(zhì)粒,用EcoRⅠ和 HindⅢ雙酶切和PCR進(jìn)行初步鑒定,并委托北京六合華大基因科技有限公司測(cè)序,用DNAStar軟件分析插入片段的正確性,將鑒定正確的重組陽(yáng)性質(zhì)粒命名為p ET28a-ISG15。

1.2.5 pET28a-ISG15的誘導(dǎo)表達(dá)

將鑒定正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coli BL21感受態(tài)細(xì)胞,接種于2×LB培養(yǎng)液37℃培養(yǎng)過夜,次日按1%比例轉(zhuǎn)種于同樣培養(yǎng)液,至A600達(dá)到0.5~0.6時(shí),加入IPTG(終濃度為1.0 mmol/L)進(jìn)行誘導(dǎo),誘導(dǎo)4 h后離心收集菌體,溶于2×SDS凝膠加樣 緩 沖 液 (50 mmol/L Tris-HCl、100 mmol/L DTT、2%SDS、10%甘油)中,100℃5 min,然后進(jìn)行SDS-PAGE電泳,考馬斯亮藍(lán)染色,分析目的蛋白表達(dá)情況,同時(shí)設(shè)空載體和不加IPTG的對(duì)照。

1.2.6表達(dá)產(chǎn)物的純化

將表達(dá)產(chǎn)物用Ni2+-NTA樹脂進(jìn)行純化。大量收集誘導(dǎo)表達(dá)的菌體,超聲破碎,將上清用0.45 μm濾膜過濾,濾液裝入Ni2+-NTA樹脂層析柱中,用洗脫液多次重懸樹脂,取洗脫液進(jìn)行SDSPAGE,分析目的蛋白的純化效果。

2 結(jié)果

2.1 RT-PCR擴(kuò)增

以綿羊PBMC細(xì)胞總RNA為模板,經(jīng)RTPCR擴(kuò)增,在分子量大小約541 bp位置可見清晰的擴(kuò)增條帶,與預(yù)期片段大小一致(圖1)。

DNA測(cè)序結(jié)果與Gen-Bank中報(bào)道羊的序列相似性為98.48%(測(cè)序結(jié)果略),說明已經(jīng)成功克隆了綿羊ISG15基因。

圖1 ISG15基因的RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 The RT-PCR amplification results of the ISG15 gene

2.2 重組質(zhì)粒的酶切、PCR及測(cè)序鑒定

將重組質(zhì)粒p ET28a-ISG15經(jīng)EcoRⅠ和 HindⅢ雙酶切鑒定及PCR鑒定,得到與目的基因大小一致的片段(圖2、3),并且將重組質(zhì)粒進(jìn)行序列測(cè)定,結(jié)果表明編碼ISG15的基因已經(jīng)正確地插入到原核表達(dá)載體p ET-28a的克隆位點(diǎn)(測(cè)序結(jié)果略)。

圖2 重組質(zhì)粒pET28a-ISG15的PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.2 PCR analysis of recombinant plasmid pET28a-ISG15

圖3 重組質(zhì)粒pET28a-ISG15的雙酶切鑒定結(jié)果Fig.3 The restriction enzyme analysis of the recombinant plasmid pET28a-ISG15

2.3 ISG15融合蛋白的表達(dá)與鑒定

將鑒定正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coli BL21感受態(tài)細(xì)胞,用終濃度為1.0 mmol/L IPTG誘導(dǎo)4 h后收集菌體,經(jīng)裂解后取上清進(jìn)行SDS-PAGE電泳,考馬斯亮藍(lán)染色,結(jié)果顯示目的條帶為25 ku,與預(yù)期結(jié)果一致,而非重組的p ET-28a(+)中未見明顯條帶,說明重組質(zhì)粒p ET28a-ISG15獲得了表達(dá)(圖4)。

圖4 pET28a-ISG15在E.coli BL21中表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE分析Fig.4 The expression product of pET28a-ISG15 in E.coli BL21 by SDS-PAGE

2.4 表達(dá)蛋白的純化

目的蛋白經(jīng)Ni2+-NTA樹脂純化后,得到單一的條帶,純化效果較好(圖5)。

圖5 pET28a-ISG15表達(dá)純化產(chǎn)物的檢測(cè)Fig.5 The purification of pET28a-ISG15 expressed product by SDS-PAGE analysis

3 討論

本試驗(yàn)根據(jù)GenBank中的綿羊ISG15基因序列設(shè)計(jì)特異性引物,利用 RT-PCR[11-12]的方法克隆得到綿羊ISG15基因,并將綿羊ISG15基因克隆到高效表達(dá)載體p ET-28a(+)中進(jìn)行表達(dá)。本試驗(yàn)選用p ET-28a(+)載體作為表達(dá)載體,主要是由于p ET-28a的MCS前面沒有信號(hào)肽,直接用IPTG誘導(dǎo)表達(dá),并且p ET-28a帶有his標(biāo)簽,便于后續(xù)的蛋白純化工作。本試驗(yàn)采用Ni2+-NTA樹脂對(duì)目的蛋白進(jìn)行分離純化,由于帶有his標(biāo)簽的目的蛋白能夠與Ni2+-NTA樹脂特異性結(jié)合,分離的目的蛋白純度較高,而且Ni2+-NTA樹脂可再生反復(fù)利用,因此本試驗(yàn)采用Ni2+螯合親和層析法[13]將目的蛋白純化。另外,為了提高目的蛋白的表達(dá)量,本試驗(yàn)對(duì)IPTG的不同用量及不同誘導(dǎo)時(shí)間分別進(jìn)行了篩選與優(yōu)化,找到了最佳表達(dá)條件,即當(dāng)IPTG為1.0 mmol/L且誘導(dǎo)4 h時(shí),ISG15融合蛋白獲得了高效表達(dá),表達(dá)的蛋白分子量為25 ku,為今后對(duì)該基因的功能研究奠定了基礎(chǔ)。

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