張云華,朱井玲,熊安英,單莉婭,朱美意,鄭艷,郝慧星,黃瑾
(新疆地方與民族高發(fā)病教育部重點實驗室/石河子大學醫(yī)學院生物化學教研室,石河子 832002)
神經(jīng)系統(tǒng)病變和損傷的治療一直是困擾醫(yī)學界的難題,目前臨床上多用以神經(jīng)營養(yǎng)因子為主的藥物治理。神經(jīng)營養(yǎng)因子是一類能夠促進神經(jīng)細胞存活、生長和分化的多肽或蛋白質,可以為神經(jīng)再生提供良好的微環(huán)境,在防止神經(jīng)細胞的退變和促進神經(jīng)突起的生長等方面起著十分重要的作用[1-3]。因此關于神經(jīng)營養(yǎng)因子神經(jīng)再生和防止神經(jīng)元退行性變的應用研究一直是研究領域中的熱點。Neuritin是一種與神經(jīng)可塑性相關的營養(yǎng)因子,1993年Nedivi等[4]在谷氨酸類似物紅藻氨酸鹽的誘導下從大鼠海馬齒狀回篩選到CPG15(candidate plasticity-related gene15)。1997年對CPG15研究顯示,CPG15能夠促進神經(jīng)突起的快速生長,故將其命名為 Neuritin[5]。
Neuritin在胚胎發(fā)育期可維持神經(jīng)元存活、抑制凋亡[6],調節(jié)神經(jīng)祖細胞分化、移行和突觸成熟[7];在成年期,能促進突起的生長[5],調節(jié)突觸回路的形成[8],還介導了學習和記憶的突觸重塑過程,可能是BDNF控制的突觸可塑性和記憶鞏固的效應器[9],另外它是一類新發(fā)現(xiàn)的血管生長因子,并作為潛在的癌癥治療靶點[10]。為獲得大量Neuritin基因工程產(chǎn)物以進行生物學功能的研究,本實驗利用前期構建重組GSll5/pPIC9K-Neuritin畢赤酵母工程菌,誘導表達重組的Neuritin蛋白并進行純化和鑒定。
1.1.1 菌株GS115/pPIC9K-Neuritin由本實驗室構建并保存。
1.1.2 儀器與試劑AKTA purifier蛋白純化系統(tǒng)購自GE公司;His-Trap Crud親和層析預裝柱購自GE公司;電泳儀購自BIO-RAD公司;離心超濾管購自Millipore公司。
酵母提取物和胰蛋白胨購自Oxide公司;酵母氮源(YNB)和 G418均購自 Invitrogen公司;YPD、BMGY和BMMY培養(yǎng)基配方見Invitrogen公司提供的畢赤酵母操作手冊;NC膜購自Whatman公司;His抗體和羊抗鼠IgG-HRP購自Bio-Rad公司;化學發(fā)光試劑盒購置Pierce公司;透析袋購自spectrum labs公司;蛋白分子量marker購自Thermo公司;其他試劑均為國產(chǎn)或進口分析純。
1.2.1 重組酵母菌的誘導表達挑取GSll5/pPIC9K-Neuritin工程菌的單克隆菌落,在YPD培養(yǎng)基中30℃ 220 r/min培養(yǎng)過夜。按照1∶50接種于1 L BMGY培養(yǎng)基,30℃ 220 r/min繼續(xù)培養(yǎng)至OD600約4 h,5000 r/min離心 5 min, 棄上清,收集菌體重懸于1 L BMMY培養(yǎng)液中,加入終濃度為1%的甲醇。30℃ 220 r/min繼續(xù)培養(yǎng)72 h,每隔24 h補加甲醇至終濃度為1%。
1.2.2 表達產(chǎn)物的鹽析離心誘導表達的培養(yǎng)液14000 r/min 30 min 4℃,收集上清,用終濃度為65%的硫酸銨飽和沉淀,4℃過夜。過夜鹽析后的溶液,14000 r/min 30 min 4℃離心沉淀。
1.2.3 親和層析收集離心沉淀的蛋白,加start buffer溶解,0.22 μm濾器過濾,純化過程參考GE Healthcare親和層析純化手冊。其中start buffer(20 mmol/L sodium phosphate,0.5 mol/L NaCl,10 mmol/L imidazole,pH 7.4),elution buffer (20 mmol/L sodium phosphate,0.5mol/L NaCl,300 mmol/L imidazole,pH7.4), 采用線性梯度洗脫方 法,start buffer 和elution buffer分別以0%~100%的比例進柱,即咪唑濃度逐漸增加,分別收集蛋白流出液和洗脫蛋白液,并SDS-PAGE檢測。
1.2.4 表達產(chǎn)物的SDS-PAGE鑒定
收集的蛋白行15%SDS-PAGE,恒壓90V100min。電泳結束后考馬斯亮藍R-250染色。
1.2.5 Western-blot和生物質譜檢測
1.2.5.1 Western-blot檢測 蛋白經(jīng)SDSPAGE后,23 V,45 min將蛋白轉至硝酸纖維素膜(NC)上,膜以封閉液封閉過夜,加入1∶1000稀釋的His抗體,37℃孵育4 h后,洗滌NC膜3次,辣根過氧化物酶標記的羊抗鼠IgG二抗(1:50000),37℃孵育2 h,洗滌NC膜3次,最后用ECL顯色曝光。
1.2.5.2 生物質譜進行分子量和序列分析 純化后的重組Neuritin蛋白制作凍干粉,MALDI-TOFMS由北京毅新興業(yè)科技有限發(fā)展公司完成,獲得Neuritin重組蛋白精確的分子量和肽質量指紋圖譜(Peptide mass finger-priting,PMF)。應用 Mascot搜索引擎在蛋白質數(shù)據(jù)庫中檢索,結果的可靠性用序列覆蓋率進行分析。
采用線性梯度洗脫,收集蛋白流出液和洗脫蛋白液(圖 1)。
圖1 Neuritin蛋白的親和層析色譜圖Fig.1 Affinity chromatography of Neuritin protein
SDS-PAGE檢測所收集的蛋白(圖2),分子量大約11 ku,與理論值(包括6個His插入序列,共計93個氨基酸,理論值11.16 ku)相符。
圖2 15﹪SDS-PAGE分析純化的融合蛋白Fig.2 SDS-PAGE analysis of identified Neuritin-His fusion protein
純化后的融合蛋白經(jīng)SDS-PAGE分析后,利用His抗體對該蛋白行免疫印跡分析,由結果(圖3)可見,有與His抗體特異結合的蛋白條帶,分子量與理論值相符。
圖3 表達產(chǎn)物的Western-blot鑒定結果Fig.3 Western-blot results of expression products of GS115/pPIC9K-neuritin
MALDI-TOF-MS測得的Neuritin重組蛋白的分子量結果見圖4,橫坐標顯示質量電荷比(m/z),蛋白質分子離子化后通過質量分析器對其質量電荷比進行分析,結果得到樣品的精確分子量為10965.6621 u。
圖4 Neuritin重組蛋白的MALDI-TOF-MS分子質量質譜圖Fig.4 Molecular mass spectrum of Neuritin recombination protein
采用MALDI-TOF-MS,對酶解后的Neuritin重組蛋白肽段進行肽指紋圖譜測定(圖5)。
圖5 Neuritin重組蛋白的MALDI-TOF-MS肽指紋圖譜Fig.5 PMF of neuritin recombination protein
應用Mascot搜索引擎在SwissProt蛋白數(shù)據(jù)庫 中輸入Neuritin蛋白肽指紋圖譜后檢索肽段序列的覆蓋率。紅色標注為匹配片段(圖6),其中HHHHHHAGK為蛋白第 1~9個氨基酸,LGDSMANYPQGLDDK為蛋白第 24~38個氨基酸,NLNIQGSLFELCGSG為蛋白第79~93個氨基酸,總覆蓋率41.9%,提示純化后的蛋白很可能是Neuritin重組蛋白。
圖6 應用SwissProt蛋白數(shù)據(jù)庫檢索PMFFig.6 Searcher for PMF in the SwissProt Databas
Neuritin是近年發(fā)現(xiàn)的神經(jīng)營養(yǎng)因子,在研究和應用前景方面具有較明顯的優(yōu)勢。首先,Neuritin能促進突起生長[5]、維持神經(jīng)元存活[6]。其次,Neuritin為僅含一條肽鏈的蛋白質,可以利用基因工程方法制備人源性制品,克服了鼠源性神經(jīng)營養(yǎng)因子無法避免的免疫原性弊端。第三,Neuritin基因工程產(chǎn)品可通過微生物發(fā)酵大量獲取,利于研究及大規(guī)模應用。因此,開發(fā)Neuritin基因工程產(chǎn)品,有助于深入挖掘Neuritin功能,為神經(jīng)損傷后的修復及再生奠定物質基礎。
畢赤酵母表達系統(tǒng)是近年來發(fā)展很快的一個真核表達系統(tǒng),非常適合于真核生物蛋白質的表達。由于該表達系統(tǒng)有很強的真核蛋白質修飾功能,重組蛋白能在菌體內得到正確折疊和糖基化修飾,因此廣泛應用于基因工程產(chǎn)品的研制和開發(fā)。
本實驗室構建的GSll5/pPIC9K-Neuritin畢赤酵母工程菌株中,Neuritin的N端插入6個組氨酸序列。6個組氨酸作為標簽蛋白由于分子量小,一般不影響蛋白的折疊和干擾Neuritin蛋白的結構和功能;另外Ni2+與6×His融合蛋白的結合非常有效,因此允許融合蛋白Neuritin-His結合到Ni2+螯合表面上,操作簡便快速,有利于蛋白的純化并且在非變性條件下進行,保持了目的蛋白的生物學活性,純化后的Neuritin蛋白可直接用于功能研究,所以本研究選用Ni2+螯合層析進行純化。
氨基酸序列覆蓋率分析發(fā)現(xiàn),匹配的序列并不是很多,可能是Neuritin重組蛋白酶解后某些肽段的特征不明顯,不能在數(shù)據(jù)庫中檢出。雖然測得的序列覆蓋率可以說明純化的蛋白很可能為Neuritin重組蛋白,但為了進一步確定其結構的準確性,我們將進行氨基酸序列測定。在目前的情況下,氨基酸全序列測定仍然比較困難,且費用昂貴,因此下一步?jīng)Q定通過EDMAN降解法測定純化蛋白的N端和C端序列。
對Neuritin蛋白純化的研究,可以得到較多較純的Neuritin蛋白,為后續(xù)的關于神經(jīng)方面的功能研究以及Neuritin蛋白的大規(guī)模純化奠定基礎,因此具有很好的意義。
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