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抑癌基因啟動子區(qū)甲基化在食管鱗狀細(xì)胞癌診斷、治療和預(yù)后中的應(yīng)用價值

2014-03-18 20:21:43郭明洲
關(guān)鍵詞:癌基因基轉(zhuǎn)移酶遺傳學(xué)

吳 亮 ,李 聞 ,郭明洲

中國人民解放軍總醫(yī)院消化內(nèi)科,北京100853

食管癌是嚴(yán)重威脅人類健康的常見惡性腫瘤之一,其發(fā)病率和死亡率在我國分別位居惡性腫瘤的第五位和第四位[1]。食管癌的兩個主要病理類型是鱗狀細(xì)胞癌(鱗癌)和腺癌,約占所有食管腫瘤病理類型的90%以上[2]。西方國家以腺癌多見,而我國則以鱗癌為主[3]。近年來,盡管食管癌的治療方法有了較大進(jìn)展,但是食管癌患者的預(yù)后仍然很差,5年生存率仍低于20%[4]。食管癌的發(fā)生是多階段、多基因參與的過程,其發(fā)生呈累積性改變[2]。越來越多的研究表明,遺傳學(xué)(基因突變、雜合子丟失、純合子缺失等)和表觀遺傳學(xué)(DNA甲基化、組蛋白修飾、基因組印跡、非編碼RNA等)的改變是腫瘤發(fā)生的主要原因[5],而DNA甲基化被認(rèn)為是表觀遺傳學(xué)改變最常見的改變之一[6]。本文主要介紹了食管癌發(fā)生、發(fā)展過程中一些關(guān)鍵抑癌基因的啟動子甲基化改變,以及相關(guān)改變在食管鱗癌早期診斷、預(yù)后評估以及治療等方面的應(yīng)用。

1 DNA甲基化

DNA甲基化是指DNA在甲基轉(zhuǎn)移酶的作用下,以S-腺苷甲硫氨酸為甲基供體,將甲基與基因CpG二核苷酸中的胞嘧啶結(jié)合,形成5'甲基胞嘧啶[7]。DNA甲基化主要發(fā)生在CpG二核苷酸,而人類基因組中CpG二核苷酸分布并不均一,其中位于基因啟動子區(qū)的CpG二核苷酸富集區(qū)(長度>200 bp,CG含量>50%)被稱為CpG島,大約50%的人類基因含有CpG島,且多位于基因的5'端[8]。人類正常組織中,大多數(shù)CpG島都是非甲基化的,并由多種轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控基因表達(dá)。正常情況下,啟動子區(qū)CpG島甲基化與胚胎發(fā)生、細(xì)胞分化以及某些等位基因的特異性失活有關(guān),如X染色體失活[9];而在癌變組織中則往往表現(xiàn)為全基因組序列的低甲基化及啟動子區(qū)域的高甲基化[7]。

2 抑癌基因啟動子高甲基化與食管鱗癌的發(fā)生、發(fā)展

在食管癌發(fā)生、發(fā)展過程中,多種抑癌基因由于啟動子區(qū)CpG島高甲基化而導(dǎo)致表達(dá)下降或缺失。以下主要介紹近年來報(bào)道得較多的一些抑癌基因在食管鱗癌中的甲基化改變及其功能研究。

2.1 細(xì)胞周期調(diào)控相關(guān)基因 P16(INK4a/MTS1/CDKN2A)基因:定位于染色體9p21,又稱作細(xì)胞周期素依賴激酶4的抑制物(CDK4I),全長8.5 kb,是一種細(xì)胞周期調(diào)控基因。p16可以通過與cyclinD競爭結(jié)合CDK 4/6,抑制CDK 4/6的活性,使pRb處于非磷酸化或低磷酸化狀態(tài),抑制細(xì)胞周期從G1期向 S期過渡[10]。食管鱗癌組織中,p16基因啟動子區(qū)甲基化率為10% ~88%[11-12]。王凡等[13]發(fā)現(xiàn),p16 基因在正常食管上皮組織中未見明顯甲基化改變,但是38.1%的食管不典型增生以及46.2%的食管鱗癌組織中存在p16基因啟動子高甲基化以及表達(dá)下降,而且該基因的甲基化表達(dá)下降跟食管鱗癌的侵襲和轉(zhuǎn)移相關(guān)[14]。提示該基因在食管鱗癌的發(fā)生、發(fā)展中具有重要作用。

2.2 侵襲、轉(zhuǎn)移相關(guān)基因 CDH1(Cadherin 1,E-cadherin)基因:定位于染色體16q24。該基因編碼的上皮型鈣粘蛋白(E-cadherin,E-cad)屬于跨膜糖蛋白家族成員,是介導(dǎo)同型細(xì)胞間黏附的黏附因子,在維持正常上皮細(xì)胞的細(xì)胞間連接方面起著重要作用[15]。食管鱗狀細(xì)胞癌中,CDH1表達(dá)缺失跟腫瘤的侵襲、轉(zhuǎn)移和不良預(yù)后相關(guān)[16]。CDH1啟動子區(qū)高甲基化發(fā)生率為34% ~80%[17-18]。CDH1高甲基化的食管鱗癌組織中,97.5%伴隨著 E-cad表達(dá)降低[19],并且跟早期食管癌的復(fù)發(fā)相關(guān)[20]。體外研究發(fā)現(xiàn),CDH1在完全甲基化的細(xì)胞株表達(dá)缺失,而去甲基化藥物可以恢復(fù)其表達(dá)[17,19]。進(jìn)一步證實(shí) CDH1基因甲基化是導(dǎo)致其表達(dá)下調(diào)的重要機(jī)制。

2.3 增殖、分化相關(guān)基因 RARβ(Retinoic acid receptor beta)基因,定位于染色體3p24。人類RARβ基因包括三種亞型(β1,β2和β4),分別編碼相應(yīng)的維甲酸受體亞型蛋白,通過介導(dǎo)維甲酸信號通路調(diào)控細(xì)胞的增殖和分化[21]。RARβ在啟動子區(qū)高甲基化的食管鱗癌細(xì)胞株中表達(dá)降低,經(jīng)去甲基化藥物處理可以恢復(fù)其表達(dá)[22-23],提示啟動子區(qū)高甲基化是導(dǎo)致RARβ表達(dá)下調(diào)的重要機(jī)制。食管鱗癌組織中,RARβ基因啟動子區(qū)甲基化率為22% ~72%[24-25]。Wang等[22]發(fā)現(xiàn),12%的正常食管上皮、58%的食管不典型增生上皮以及70%的食管鱗癌組織中有RARβ基因啟動子區(qū)CpG島甲基化。食管鱗癌患者外周血DNA中RARβ基因甲基化率為63.2%,并且在術(shù)后明顯下降[25]。提示該基因啟動子高甲基化與食管鱗癌的疾病進(jìn)程密切相關(guān)。

2.4 DNA修復(fù)相關(guān)基因 FHIT(Fragile histidine triad)基因,即脆性組氨酸三聯(lián)體基因,定位于染色體3p14.2,基因全長約1 Mb,由10個外顯子組成,覆蓋FRA3B脆性位點(diǎn)、腎癌相關(guān)t(3;8)斷裂點(diǎn)、抑癌基因PTPRG的5'末端及HPV16整合位點(diǎn)[26]。在食管鱗癌中,F(xiàn)HIT基因啟動子區(qū)甲基化率為6.4% ~84%[11,27],F(xiàn)HIT 基因高甲基化是導(dǎo)致 FHIT 表達(dá)降低的主要機(jī)制之一。食管鱗癌組織中FHIT基因啟動子高甲基化與患者吸煙史高度相關(guān),而且FHIT高甲基化的早期食管癌患者預(yù)后不良[28]。在正常食管鱗狀上皮細(xì)胞中,尼古丁也可以通過增加DNMT3B的表達(dá),引起FHIT基因高甲基化以及蛋白表達(dá)下調(diào)[29]。FHIT表達(dá)缺失的食管鱗狀細(xì)胞癌呈現(xiàn)出侵襲力和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移能力增加[30-31]。

2.5 細(xì)胞凋亡相關(guān)基因 DAPK(death associated protein kinase)基因:定位于染色體9q21.33。該基因編碼一種促凋亡絲/蘇氨酸激酶,在多種凋亡信號通路中發(fā)揮作用[32-33]。食管鱗癌中DAPK甲基化率為26%~51%[18,24],但是在正常食管上皮中卻鮮有甲基化發(fā)生。此外,DAPK在食管鱗癌組織中的表達(dá)較癌旁組織明顯降低。提示該基因的甲基化及表達(dá)下調(diào)是食管鱗癌的重要事件。

3 抑癌基因啟動子高甲基化與食管鱗癌的早期診斷和預(yù)后評估

與傳統(tǒng)的病理學(xué)檢查方法比較,抑癌基因啟動子的甲基化檢測用于食管鱗癌早期診斷和預(yù)后評估具有明顯的優(yōu)勢。一方面,比起RNA和蛋白質(zhì),DNA要穩(wěn)定得多,而且取材方便,無論是組織DNA還是外周血DNA都可以用于甲基化檢測[25,34];另一方面,甲基化特異性PCR(MSP)技術(shù)作為DNA甲基化檢測的常用方法,具有非常高的檢測靈敏度,例如,MSP技術(shù)可以將1個甲基化的DNA拷貝從混有1 000個非甲基化的 DNA 拷 貝 中 檢 測 出 來[35]。 p16[13]、ENG[36]、HIN[37]、SOX17[38]、TAC1[39]等抑癌基因啟動子甲基化改變往往在早期食管鱗癌、甚至在不典型增生等食管癌的癌前病變中就已經(jīng)出現(xiàn),并且甲基化程度隨著疾病的進(jìn)展而升高,提示這些抑癌基因的啟動子甲基化狀態(tài)檢測可以用于食管鱗癌的早期診斷。食管鱗癌患者術(shù)前外周血DNA中p16和RARβ基因甲基化率分別高達(dá)71.1%和63.2%,而在術(shù)后兩種基因的甲基化程度均明顯下降[25],提示p16和RARβ基因甲基化水平對于食管鱗癌手術(shù)效果評價有重要價值。此外,CDH1和ITGA4基因啟動子高甲基化與食管鱗癌的臨床分期有重要關(guān)系,這兩個基因的高甲基化狀態(tài)分別與Ⅰ期和Ⅱ期食管鱗癌患者術(shù)后較高的復(fù)發(fā)風(fēng)險以及較低的無病生存率高度相關(guān)[20]。而 Lee等[24]也發(fā)現(xiàn),不伴有p14、DCC和CADM1啟動子高甲基化改變的Ⅰ期食管鱗癌患的五年無病生存率,是p14、DCC和(或)CADM1基因啟動子同時出現(xiàn)高甲基化的Ⅰ期食管鱗癌患者的7.13倍。提示這些抑癌基因啟動子高甲基化可以作為Ⅰ期或Ⅱ期食管鱗癌患者術(shù)后復(fù)發(fā)的預(yù)后評價指標(biāo)。

4 抑癌基因啟動子區(qū)高甲基化與食管鱗癌的治療

表觀遺傳學(xué)改變與遺傳學(xué)改變的一個最大不同點(diǎn)就在于前者往往是可逆的,這就意味著表觀遺傳學(xué)所導(dǎo)致的基因表達(dá)改變可以通過一定的方法使之恢復(fù)正常表達(dá),為腫瘤的防治提供了一條新的思路[40]。DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑由于可以通過抑制DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的活性,阻斷DNA的高度甲基化,對于腫瘤的表觀遺傳學(xué)治療具有重要意義。2004年,胞嘧啶核苷類似物阿扎胞苷獲得美國食品藥物管理局批準(zhǔn)用于骨髓異常綜合癥的治療[41],成為歷史上最先進(jìn)入臨床應(yīng)用的DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑。2006年,作為阿扎胞苷脫氧核糖類似物,5-氮雜-2'-脫氧胞苷(5Aza-dc,又名地西他濱)也獲得美國食品藥物管理局批準(zhǔn)用于臨床治療。目前,很多新的DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑正在開發(fā)中,其中一些已經(jīng)進(jìn)入臨床前研究,包括Zebularine(又名折布拉林)、RG108、EGCG、鹽酸肼屈嗪和普魯卡因胺等[42]。食管鱗癌細(xì)胞株中,原來存在甲基化表達(dá)沉默的 ENG[36]、CDH1[19]、RARβ[43]和 SOX17[38]等基因在5Aza-dc處理后得以恢復(fù)表達(dá),并發(fā)揮抑制細(xì)胞侵襲[30]、細(xì)胞增殖、克隆形成以及裸鼠體內(nèi)成瘤[38,43]等抑癌功能。盡管核苷類DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑可能在腫瘤的表觀遺傳學(xué)治療方面發(fā)揮重要作用,但是目前尚沒有關(guān)于該類藥物用于食管鱗癌臨床治療的報(bào)道。該類藥物固有的細(xì)胞毒性作用以及作用靶點(diǎn)的非選擇性等缺陷,可能是制約其臨床應(yīng)用的重要因素[42]。因此,開發(fā)非核苷類的DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑以及進(jìn)一步研究作用靶點(diǎn)高選擇性的核苷類抑制劑,可能是今后腫瘤表觀遺傳學(xué)治療藥物研究的重要方向。

5 展望

食管鱗癌中大量抑癌基因因?yàn)閱幼痈呒谆鴮?dǎo)致表達(dá)下調(diào)或失活,提示多個抑癌基因的遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)改變共同導(dǎo)致了食管鱗癌的發(fā)生,對這些基因的甲基化檢測有利于食管鱗癌的早期診斷、預(yù)后評估以及靶向治療。但是,一方面,單個抑癌基因甲基化檢測靈敏度在不同研究報(bào)道中存在較大的波動,這與目前所應(yīng)用的硫化修飾后的檢測方法較復(fù)雜,不易掌握有關(guān)。因此,研發(fā)新的不需要硫化修飾的檢測方法,將改善DNA甲基化檢測在臨床檢測中的應(yīng)用。聯(lián)合檢測多基因甲基化可能用于食管鱗癌的早期診斷、鑒別診斷和預(yù)后評估。另一方面,目前針對抑癌基因甲基化改變的研究積累尚不足,進(jìn)一步對食管鱗癌甲基化組的研究有望揭開表觀遺傳在食管癌發(fā)生發(fā)展中的秘密,為食管癌的表觀遺傳治療奠定基礎(chǔ)。

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