劉 丹付希安暴芳芳史本青劉 紅田洪青張福仁?
·經(jīng)驗(yàn)交流·
遺傳性泛發(fā)性色素異常癥ABCB6基因突變檢測(cè)
劉 丹1,2,3付希安1暴芳芳1史本青1劉 紅1田洪青1張福仁1?
目的: 檢測(cè)3例遺傳性泛發(fā)性色素異常癥患者ABCB6基因的突變。方法: 提取患者外周血DNA,采用PCR擴(kuò)增患者ABCB6基因的全部外顯子及其側(cè)翼序列,對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物直接測(cè)序檢測(cè)基因突變。結(jié)果: 3例患者該基因編碼區(qū)所有外顯子均未發(fā)現(xiàn)突變。結(jié)論: 本研究中3例遺傳性泛發(fā)性色素異常癥患者的發(fā)病與ABCB6基因的編碼區(qū)序列無(wú)關(guān)。
遺傳性泛發(fā)性色素異常癥; ABCB6基因; 突變位點(diǎn)
遺傳性泛發(fā)性色素異常癥(DUH)是由德國(guó)學(xué)者Lchikawa和Hiraga于1933年首次報(bào)道的一種少見(jiàn)的孟德?tīng)栠z傳性皮膚病,其典型皮損為全身泛發(fā)相互夾雜的色素沉著和色素減退斑。1本病呈常染色體顯性或隱性遺傳。DUH作為一種遺傳性疾病,其表型改變是以基因的改變?yōu)榛A(chǔ),因此尋找其致病基因不僅可以對(duì)疾病做出明確診斷,而且可以在分子水平更好的認(rèn)識(shí)其發(fā)病機(jī)制。2003年賀林等首次將顯性遺傳DUH的致病基因定位于6q24.2~q25.2區(qū)域,2隱性遺傳DUH的致病基因定位于12q21~q23區(qū)域。3,42013年Zhang等運(yùn)用全基因組聯(lián)合分析及外顯子測(cè)序的方法首先發(fā)現(xiàn)ABCB6基因?yàn)镈UH的致病基因。5同時(shí),我們的研究團(tuán)隊(duì)也運(yùn)用相似的方法得出相同的結(jié)論,并且用模式動(dòng)物斑馬魚(yú)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證致病基因ABCB6的表達(dá)。6為進(jìn)一步驗(yàn)證ABCB6為DUH的致病基因,我們對(duì)收集到的2個(gè)DUH家系的先證者及1例散發(fā)共3例患者進(jìn)行ABCB6基因突變位點(diǎn)檢測(cè)。
1.1 研究對(duì)象 3例DUH患者來(lái)自山東省皮膚病性病防治研究所門(mén)診,均經(jīng)臨床和病理確診。2個(gè)DUH家系的家系圖如圖1所示:患者父母之一發(fā)病,男女發(fā)病機(jī)會(huì)大致均等;男女患者均可直接傳遞給后代且代代相傳,符合單基因遺傳中常染色體顯性遺傳的方式。家系中先證者及1例散發(fā)病例的平均發(fā)病年齡為2歲。典型的臨床表現(xiàn):全身泛發(fā)大小性狀不等色素斑,色素沉著與色素減退相互夾雜,無(wú)自覺(jué)癥狀(圖2)。組織病理學(xué)示:色素沉著區(qū)基底細(xì)胞甚至真皮層黑素增加;色素減退區(qū)黑素?cái)?shù)量明顯減少甚至缺如(圖3)。
圖1 家系圖(a:家系1;b:家系2)
圖2 a、b:散發(fā)病例的肩部及背部泛發(fā)大小形狀不等色素斑,色素沉著與色素減退相互夾雜圖3 散發(fā)病例背部組織病理示:色素沉著區(qū)基底細(xì)胞甚至真皮層黑素增加;而色素減退區(qū)黑素?cái)?shù)量明顯減少(HE,×400)
1.2 材料 經(jīng)患者知情同意后,留取詳細(xì)的臨床資料和臨床圖片及組織病理檢查結(jié)果,同時(shí)取患者靜脈血各5 mL,放置在EDTANa4抗凝管中,存入-70℃冰柜冷凍保存,采用AXYGEN試劑盒提取基因組DNA。取適量DNA進(jìn)行純度檢測(cè)并標(biāo)化。
1.3 方法
1.3.1 PCR擴(kuò)增 通過(guò)美國(guó)國(guó)家生物信息中心(NCBI)基因庫(kù)及UCSC數(shù)據(jù)庫(kù)檢索到ABCB6基因的基因組序列,采用Premier Primer 5.0軟件設(shè)計(jì)合適的引物,由北京華大基因科技有限公司合成(表1)。按照說(shuō)明書(shū)將其稀釋為20μmol/L,并采用溫度梯度法探索每一對(duì)引物的最佳退火溫度。PCR反應(yīng)在9700型PCR擴(kuò)增儀(美國(guó)ABI公司)上完成,反應(yīng)條件為: 94℃預(yù)變性3 min后,94℃變性30 s,退火45 s,72℃延伸45 s,共35個(gè)循環(huán)。最后72℃延伸8 min,4℃保存。
表1 本研究中設(shè)計(jì)的引物
1.3.2 DNA測(cè)序 PCR產(chǎn)物采用3130xl遺傳分析儀(美國(guó)ABI公司)直接測(cè)序。
直接測(cè)序結(jié)果ABCB6基因整個(gè)編碼區(qū)的19條外顯子及其側(cè)翼序列被擴(kuò)增,并且個(gè)別外顯子采用了雙向測(cè)序,以確保測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性。3例患者的DNA測(cè)序結(jié)果中均未發(fā)現(xiàn)突變位點(diǎn)(圖4為散發(fā)病例12號(hào)外顯子的一段正常序列)。
圖4 散發(fā)病例12號(hào)外顯子的一段正常序列,箭頭所指為文獻(xiàn)5中報(bào)道的突變位點(diǎn)c.1736 G>A(p.Gly579Glu)
DUH是一種少見(jiàn)的色素異常性皮膚病,其典型皮損為全身泛發(fā)色素沉著伴色素減退斑。該病的診斷主要依靠臨床表型及組織病理學(xué)檢查,但臨床存在許多與其表型相類似的色素異常性疾病,如遺傳性對(duì)稱性色素異常癥(DSH)、網(wǎng)狀肢端色素沉著(RAPK)、屈側(cè)網(wǎng)狀色素異常癥(DDD)等,給臨床診斷帶來(lái)一定困難。而遺傳性疾病的表型改變往往以基因的改變?yōu)榛A(chǔ),因此確定疾病的致病基因尤為重要。
早在2003年賀林等就首次將顯性遺傳及隱性遺傳DUH的致病基因分別定位于6q24.2~q25.2和12q21~q23區(qū)域,但均未發(fā)現(xiàn)致病基因。
2013年Zhang等5首先通過(guò)連鎖分析及相關(guān)的功能分析發(fā)現(xiàn)該病的致病基因?yàn)锳BCB6且該基因在皮膚的表皮表達(dá)。Cui等7通過(guò)連鎖分析及外顯子測(cè)序技術(shù)進(jìn)一步驗(yàn)證了ABCB6基因?yàn)镈UH的致病基因,并認(rèn)為不同位置的突變位點(diǎn)可以產(chǎn)生不同的表型。
ABCB6基因位于2號(hào)染色體2q36區(qū)域,屬于ABC轉(zhuǎn)運(yùn)超家族,參與轉(zhuǎn)運(yùn)多肽、類固醇等。8該基因表達(dá)于多種組織,如心臟、骨骼肌、黑素細(xì)胞及黑素瘤細(xì)胞等。8ABCB6亞細(xì)胞定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體、溶酶體及質(zhì)膜。9,10既往研究發(fā)現(xiàn)DUH可能與黑素細(xì)胞成熟障礙相關(guān)。我們的動(dòng)物模式斑馬魚(yú)實(shí)驗(yàn)表明ABCB6在黑素的轉(zhuǎn)運(yùn)及生成方面發(fā)揮著極其重要的作用。6
迄今已發(fā)現(xiàn)7個(gè)DUH相關(guān)的ABCB6基因突變位點(diǎn)(表2),但本研究中3例患者所有ABCB6基因編碼區(qū)域及側(cè)翼序列均未發(fā)現(xiàn)突變。我們推測(cè)可能的原因:一是突變位點(diǎn)可能位于啟動(dòng)子區(qū)域,而我們并沒(méi)有檢測(cè)所有的內(nèi)含子區(qū)域。二是該病可能存在其他致病基因。下一步我們會(huì)對(duì)非編碼區(qū)進(jìn)行測(cè)序,檢測(cè)內(nèi)含子區(qū)域是否存在突變。
表2 文獻(xiàn)中報(bào)道的關(guān)于顯性遺傳DUH的致病基因ABCB6突變位點(diǎn)
1 Ichigawa T,Hiraga Y.A previously undescribed anomaly ofpigmentation dyschromatosis universalis hereditaria.J Dermatol,1933,34:360-364.
2Xing QH,Wang MT,Chen XD,etal.A gene locus responsible for dyschromatosis(DSH)maps to chromosome 6q24.2-q25.2. Am JHum Genet,2003,73:377-382.
3 Bukhari IA,El-Harith EA,Stuhrmann M.Dyschromatosis universalis hereditaria as an autosomal recessive disease in five members of one fam ily.JEur Acad Dermatol Venereol,2006,20 (5):628-629.
4 Stuhrmann M,Hennies HC,Bukhari IA,et al.Dyschromatosis universalis hereditaria:evidence for autosomal recessive inheritance and identification of a new locus on chromosome 12q21-q23.Clin Genet,2008,73(6):566-572.
5 Zhang C,LiD,Zhang J,etal.Mutations in ABCB6 Cause Dyschromatosis Universalis Hereditaria.J Invest Dermatol,2013,133 (9):2221-2228.
6 Liu H,Li Y,Hung KKH,et al.Genome-wide linkage,exome sequencing and functional analyses identify ABCB6 as the pathogenic gene of dyschromatosis universalis hereditaria.PLoSOne,2014;9(2):87250.
7 Cui YX,Xia XY,Zhou Y,etal.Novelmutations of ABCB6 associated with autosomal dominant dyschromatosis universalis hereditaria.PLoSOne,2013,8(11):79808.
8Mitsuhashi N,Miki T,Senbongi H,et al.MTABC3,a novel mitochondrial ATP-binding cassette protein involved in iron homeostasis.JBiol Chem,2000,275:17536-17540.
9 Tsuchida M,Emi Y,Kida Y,et al.Human ABC transporter isoform B6(ABCB6)localizes primarily in the Golgi apparatus. Biochem Biophys Res Commun,2008,369(2):369-375.
10 Kiss K,Brozik A,Kucsma N,etal.Shifting the paradigm:the putativemitochondrial protein ABCB6 resides in the lysosomes of cells and in the plasma membrane of erythrocytes.PLoS One,2012,7(5):37378.
(收稿:2014-03-20 修回:2014-05-04)
M utation detection of ABCB6 gene w ith dyschromatosis universalis hereditaria
LIU Dan,F(xiàn)U Xi-an,BAO Fang-fang,et al.Shandong Provincial Institute of Dermatology and Venereology,250022,Jinan
Objective:To identifymutations of ABCB6 gene in three patientswith dyschromatosis universalis hereditaria.Methods:After extracting DNA from peripheral blood,all the exonsof ABCB6 geneand their flanking intronic sequences were amplified by PCR,and then,direct sequencing was performed to screen the mutations in the gene.Results:Nomutation was found in any of the exon in ABCB6 gene from the three patients.Conclusion:The pathogenesis of the three patients with dyschromatosis universalis hereditaria has nothing to do with the sequence of coding region in ABCB6 gene.
dyschromatosis universalis hereditaria;ABCB6 gene;mutations
1山東省皮膚病性病防治研究所,濟(jì)南,250022
2山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院,濟(jì)南,250062
3濟(jì)南大學(xué)山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院,濟(jì)南,250062
?通信作者