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維生素D受體基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感性關(guān)系的研究進(jìn)展

2014-04-04 12:24:46
實(shí)用老年醫(yī)學(xué) 2014年12期
關(guān)鍵詞:易感性結(jié)核結(jié)核病

結(jié)核是一種古老的慢性傳染病,近年來(lái),隨著分子生物學(xué)技術(shù)迅猛發(fā)展,人類(lèi)對(duì)結(jié)核病的認(rèn)識(shí)不斷深入。從20世紀(jì)70年代起,以家族研究為基礎(chǔ)的連鎖分析和以病例對(duì)照研究為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)分析使人們?cè)俅握J(rèn)識(shí)到結(jié)核病與遺傳因素有關(guān)[1]。流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn)結(jié)核病的易感性有種族差異,與黑種人和愛(ài)斯基摩人相比,白種人對(duì)結(jié)核桿菌有更強(qiáng)的抵抗能力。雙生子研究也發(fā)現(xiàn),同卵雙生子比異卵雙生子有更高的同病率(前者為70%~80%,后者為30%)。Comstock和Stead等的研究也強(qiáng)烈提示遺傳因素在結(jié)核桿菌致病中起重要作用[2-3]。

既往有許多研究者對(duì)人類(lèi)結(jié)核病的易感基因進(jìn)行了篩選,包括維生素D受體(VDR)基因、自然抗性相關(guān)巨噬細(xì)胞蛋白1基因、人類(lèi)白細(xì)胞抗原基因等[1]。VDR基因最初因?yàn)槠渑c骨質(zhì)疏松癥的關(guān)聯(lián)而受到重視,隨之發(fā)現(xiàn)該基因的多態(tài)性與癌癥、骨關(guān)節(jié)病、甲狀旁腺機(jī)能亢進(jìn)癥、感染性疾病等均存在關(guān)聯(lián)。近年來(lái),國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)VDR基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感性進(jìn)行了廣泛研究,現(xiàn)綜述如下。

1 VDR基因的結(jié)構(gòu)與功能

人類(lèi)VDR基因位于常染色體12q13.11上,基因組DNA全長(zhǎng)75 kb,由9個(gè)外顯子和8個(gè)內(nèi)含子組成。盡管不同種屬的VDR分子量存在較大差異,但它們的結(jié)構(gòu)及氨基酸組成極為相似。VDR包含427個(gè)氨基酸殘基,分子量為50 kD,功能上主要分為5個(gè)結(jié)構(gòu)域:A/B區(qū)(1~24)、DNA 結(jié)合區(qū) (DBD)(24~91)、鉸鏈區(qū)(91~115)、配體結(jié)合區(qū) (1igand binding domain,LBD)(115~409)和AF-2區(qū)(409~427),分別稱(chēng)為A/B、C、D、E、F 5個(gè)功能區(qū),每個(gè)功能區(qū)分工不同但又相互協(xié)作。A/B區(qū)為不依賴(lài)配體的細(xì)胞、組織特異性的轉(zhuǎn)錄激活自主調(diào)節(jié)功能區(qū)AF-1(activation function-1 domain)。C區(qū)主要參與DNA序列識(shí)別,也部分參與二聚體的形成。E區(qū)相對(duì)較大,功能也較多,主要參與:(1)配體結(jié)合;(2)視黃酸X受體(RXR)形成二聚體;(3)形成配體依賴(lài)的轉(zhuǎn)錄激活/抑制功能區(qū)AF-2,并與AF-1協(xié)同作用。此外,E區(qū)對(duì)DNA識(shí)別也有協(xié)同作用。D區(qū)和F區(qū)的功能不詳,D區(qū)可能是一個(gè)絞鏈區(qū),并可能與核受體定位有關(guān)。

VDR基因是激素受體家族中的一員,與類(lèi)固醇和甲狀腺激素的受體序列有相似性,共同特征是具有高度保守的DNA結(jié)合區(qū)及一定保守性的配基結(jié)合區(qū)。維生素D的活性代謝產(chǎn)物1,25-(OH)2-D3是重要的免疫調(diào)節(jié)物之一,它可能參與了機(jī)體對(duì)結(jié)核分枝桿菌的宿主免疫反應(yīng),而這些生物學(xué)活性主要由VDR介導(dǎo)。1,25-(OH)2-D3激素信號(hào)分子在靶細(xì)胞與VDR結(jié)合形成激素-受體復(fù)合物,該復(fù)合物作用于特定的DNA序列,從而對(duì)結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)產(chǎn)生調(diào)節(jié)作用。因此,VDR在本質(zhì)上是一種配體依賴(lài)的核轉(zhuǎn)錄因子,屬于配體激活的受體超基因家族,它在維持體內(nèi)礦物質(zhì)動(dòng)態(tài)平衡、鈣及磷酸根代謝、骨代謝、多種組織細(xì)胞的生長(zhǎng)分化和免疫調(diào)節(jié)等方面起非常重要的作用。

2 VDR基因多態(tài)性

編碼VDR的基因存在多態(tài)現(xiàn)象,這種多態(tài)可影響宿主對(duì)結(jié)核病的易感性。VDR基因包括多個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),目前研究較多的有4個(gè),即rs731236、rs2228570、rs1544410、rs7975232 位點(diǎn),分別對(duì)應(yīng)限制性?xún)?nèi)切酶TaqI、FokI、BsmI和ApaI的酶切位點(diǎn),一般用b、a、t、f表示該基因存在4種內(nèi)切酶的多態(tài)性位點(diǎn),用B、A、T、F表示缺乏4種內(nèi)切酶的多態(tài)性位點(diǎn)。

rs2228570(Fok1)位點(diǎn)位于5′端第2外顯子處,其多態(tài)性表現(xiàn)為5′端第2外顯子處第一個(gè)起始密碼子ATG上的T→C變異,從而造成一個(gè)潛在的ATG起始位點(diǎn)與轉(zhuǎn)錄因子IIB不能有效地相互作用,最終翻譯出的蛋白質(zhì)少了3個(gè)氨基酸,從而影響蛋白質(zhì)的正常功能,不僅使轉(zhuǎn)錄效率降低了1.7倍[4],而且導(dǎo)致VDR不能有效結(jié)合1,25-(OH)2-D3,使其協(xié)助單核巨噬細(xì)胞抑制結(jié)核分枝桿菌胞內(nèi)生長(zhǎng)的作用顯著降低。此位點(diǎn)多態(tài)性可產(chǎn)生2種不同長(zhǎng)度肽鏈的VDR分子,多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)由“F”基因編碼的短鏈反應(yīng)比較活躍,FF基因型者外周血單核細(xì)胞中VDR的mRNA水平比f(wàn)f基因型者高19.7%[1]。

rs731236(Taq1)位點(diǎn)位于3′端第9外顯子中,其多態(tài)性是由于第352個(gè)密碼子上的同義突變?cè)斐傻?即T→C突變使密碼子ATT變?yōu)锳TC,兩者均為異亮氨酸的密碼子。Taq1多態(tài)性中,T基因被認(rèn)為是結(jié)核病的易感基因,t基因?yàn)楸Wo(hù)基因。有研究顯示TT基因型表達(dá)VDR的mRNA水平和蛋白水平最高,較tt者分別高25.8%和72.9%[5]。

rs7975232(Apa1)和rs1544410(Bsm1)位點(diǎn)均位于VDR基因3′端的內(nèi)含子8,其多態(tài)性不影響編碼氨基酸的序列,能合成正常的VDR蛋白,不影響其生物學(xué)功能的發(fā)揮。

3 VDR基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感性的關(guān)聯(lián)研究

Bellamy等[6]1998年首次在西非人群中報(bào)道VDR基因多態(tài)與結(jié)核易感性有關(guān);1999年,Bellamy等[7]再次報(bào)道,VDR基因多態(tài)與非洲人結(jié)核病的發(fā)病有關(guān)。2000年以后,中國(guó)大陸和加拿大等國(guó)相繼有研究報(bào)道VDR基因多態(tài)與結(jié)核易感性相關(guān)[8-9]。Liu等[8]不僅在藏族,還在我國(guó)漢族人群中研究證實(shí)Fok1的ff基因型為結(jié)核病易感基因型,該結(jié)論與Selvaraj等[10]以及劉瑋等[11]的研究結(jié)論一致。Liu等[12]進(jìn)一步闡釋了VDR基因與結(jié)核病易感性的關(guān)聯(lián)機(jī)制,指出Toll樣受體在人類(lèi)巨噬細(xì)胞的活化上調(diào)了VDR基因與維生素D1羥化酶基因的表達(dá),誘導(dǎo)抗菌肽(cathelicidin)的產(chǎn)生,有助于殺滅胞內(nèi)分枝桿菌;非裔美國(guó)人因?yàn)?,25-(OH)2-D3血清水平過(guò)低,不能促使抗菌肽信使RNA產(chǎn)生,從而對(duì)結(jié)核病易感。Gao等[13]在前人所作的系統(tǒng)綜述和Meta分析的基礎(chǔ)上繼續(xù)研究,認(rèn)為在亞洲人群,Fok1 ff基因型攜帶者結(jié)核病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)約增加1倍(OR=2.0,95%CI:1.3~3.2)。王喜等[14]對(duì)新疆哈薩克族人群的研究結(jié)果顯示,VDR-Ff基因型為肺結(jié)核的危險(xiǎn)因素。

Freidin等[15]對(duì)俄羅斯的圖瓦族人群的結(jié)核易感基因進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn)圖瓦族Bsm1位點(diǎn)的b基因型與結(jié)核易感性顯著相關(guān)。在馬拉維HIV陽(yáng)性的結(jié)核患者中,VDR基因Bsm1多態(tài)似乎對(duì)結(jié)核的發(fā)病起到保護(hù)作用[16]。Gao等[13]Meta分析結(jié)果所示,在亞洲人群,Bsm1 bb基因型攜帶者結(jié)核病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)則顯著降低(OR=0.5,95%CI:0.4~0.8)。

對(duì)于Taq1位點(diǎn),Bellamy等[17]在西非岡比亞人中的研究發(fā)現(xiàn)編碼密碼子352的Taq1tt基因頻率在結(jié)核病人中低得多。Selvaraj等[18]認(rèn)為T(mén)aq1多態(tài)性與印度女性結(jié)核病易感性有關(guān)。陳丹丹等[19]在寧夏回族人群中開(kāi)展的大樣本病例對(duì)照研究結(jié)果顯示,VDR-(TT+Tt)、男性VDR-TT基因型可能是肺結(jié)核病的保護(hù)因素;VDR-(FF+ff)、回族VDR-(FF+ff)基因型可能是肺結(jié)核發(fā)病的危險(xiǎn)因素。此外,在西非的病例對(duì)照研究顯示Bsm1、Apa1和Taq1存在明顯的連鎖不平衡,這幾個(gè)多態(tài)位點(diǎn)構(gòu)成的單倍型與結(jié)核易感性有關(guān)[20]。

然而,亦有許多研究證實(shí)VDR基因與結(jié)核病易感性無(wú)關(guān)。Bellamy等[21]通過(guò)全基因組掃描研究,未在VDR基因中發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的結(jié)核病遺傳易感性多態(tài)位點(diǎn)。馮福民等[22]在中國(guó)唐山的研究中未發(fā)現(xiàn)VDR基因多態(tài)與漢族人肺結(jié)核發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的關(guān)聯(lián)。

2009年Merza等[23]對(duì)伊朗結(jié)核病患者進(jìn)行研究,未發(fā)現(xiàn)VDR基因Fok1位點(diǎn)與結(jié)核病存在關(guān)聯(lián),這與Liu等[1,8]在唐山地區(qū)的漢族人群、高玉婧等[24]在寧夏、Soborg等[25]在東非的坦桑尼亞、焦偉偉等[26]在中國(guó)漢族人群、孟憲杰等[27]在新疆維吾爾族人群中研究結(jié)論一致。對(duì)于Bsm1位點(diǎn),Freidin等[15]對(duì)Tomsk州的俄羅斯民族人群的結(jié)核易感基因進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn):俄羅斯族的VDRb基因型與結(jié)核易感性無(wú)明顯相關(guān)性。陳雪融等[28]對(duì)我國(guó)藏族人群的研究未見(jiàn)Taq1多態(tài)性與肺結(jié)核發(fā)病存在關(guān)聯(lián)。對(duì)于Apa1位點(diǎn),2007年Soborg等[25]以東非的坦桑尼亞人群為研究對(duì)象,發(fā)現(xiàn)VDR基因的多態(tài)性位點(diǎn)Apa1的基因型分布頻率在結(jié)核病患者和對(duì)照者間的分布無(wú)顯著差異性。

一些Meta分析結(jié)果也顯示,VDR基因多態(tài)性與結(jié)核病易感性無(wú)顯著關(guān)聯(lián)。比如,2005年,Lewis等[4]對(duì)VDR基因多態(tài)性與結(jié)核病易感性關(guān)系的Meta分析指出,目前得出VDR基因Fok1多態(tài)性及Taq1多態(tài)性與結(jié)核病易感性有關(guān)的結(jié)論尚為時(shí)過(guò)早。因?yàn)樵趥惗?、西非等?guó)家和地區(qū)的研究中均未發(fā)現(xiàn)VDR基因多態(tài)性與結(jié)核病相關(guān)[9,20]。楊本付等[29]對(duì)VDR基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感性做了Meta分析,結(jié)果表明各地的研究結(jié)果存在差異,尚不能認(rèn)為VDR基因多態(tài)性是肺結(jié)核易感性的影響因素,VDR基因可能與別的易感基因存在連鎖不平衡。

4 展望

綜上所述,國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)VDR基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感性的研究結(jié)果并不一致。原因可能在于:(1)VDR基因多態(tài)性存在種族差異。(2)結(jié)核病的發(fā)病是由多個(gè)基因共同調(diào)控的,可能VDR基因的調(diào)控作用不占據(jù)主要地位。因此,其結(jié)果會(huì)由于樣本選擇的不同而受到影響。(3)VDR 基因可能與別的基因存在連鎖不平衡??傊?我們目前尚不能證實(shí)VDR基因多態(tài)性與結(jié)核病易感性的關(guān)系是否真正成立,因?yàn)槲覀儾荒芘懦@是VDR與NRAMP1、TNF等功能基因連鎖不平衡造成的假象,無(wú)法證實(shí)這些突變點(diǎn)會(huì)引起基因功能改變。因此,VDR基因多態(tài)性在肺結(jié)核發(fā)病中所起的真正作用及其與環(huán)境、其他易感基因間的交互作用還需進(jìn)一步研究確定。隨著研究的進(jìn)一步深入,人們一定能揭示人類(lèi)肺結(jié)核發(fā)生的相關(guān)的遺傳學(xué)基礎(chǔ),使我們能從基因水平定位高危人群,最終為臨床對(duì)結(jié)核病的診斷、治療及進(jìn)行流行病學(xué)研究服務(wù)。

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