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γ-聚谷氨酸及其生物合成機制的研究進展

2014-04-09 03:19:49關陽王國良張國峰賈力耕梁穎超吳延東
食品研究與開發(fā) 2014年2期
關鍵詞:谷氨酸分子量芽孢

關陽,王國良,張國峰,賈力耕,梁穎超,吳延東

(玉米深加工國家工程研究中心,吉林長春130033)

γ-聚谷氨酸(γ-PGA)是一種聚陰離子多肽,它是由多個谷氨酸單體以γ-羧基和α-氨基經(jīng)肽鍵的形式縮合而成,且每一個谷氨?;及髯缘氖中灾行?。γ-PGA自發(fā)現(xiàn)以來就已然成為現(xiàn)代生物高分子聚合物的研究熱點。有關γ-PGA的純化和測定方法比較成熟,這為開展基因工程和生物化學等方面的研究提供了便利條件[1]。從立體構(gòu)型的角度來分析,γ-PGA具有3種不同類型:γ-D-聚谷氨酸(γ-D-PGA)、γ-L-聚谷氨酸(γ-L-PGA)以及 γ-D/L-聚谷氨酸(γ-DL-PGA)。

在γ-PGA開始實際應用之前,需解決一系列的問題。首先是成本問題,尤其是在現(xiàn)有條件下γ-PGA的成本遠遠高于其它材料。其次,截至目前還不能利用有機化學方法人工合成γ-PGA。此外,還需闡明γ-PGA的生物合成機制,進而為隨后的工業(yè)化生產(chǎn)提供理論支持。如今,我們國家正致力于構(gòu)建和諧社會,發(fā)展生態(tài)經(jīng)濟,實現(xiàn)可持續(xù)發(fā)展,而“白色生物技術”功不可沒,這為γ-PGA的發(fā)展提供了強大的推動力。

1 理化性質(zhì)

γ-PGA具有良好的成膜性、成纖維性、阻氧性、可塑性、粘結(jié)性、吸水性以及可生物降解性等,因而具有增稠、乳化、凝膠、成膜、保溫、助溶、緩釋和粘結(jié)等功能[2]。γ-PGA的pKa=2.23,這與谷氨酸α-羧基的pKa值非常接近[3]。通過熱重(TGA)和差示掃描量熱(DSC)分析可知,其熔點為223.5℃,熱分解溫度為235.9℃[4]。

γ-PGA 可溶于二甲基亞砜(DMSO)、熱的 N,N-二甲基甲酰胺(MSDS)、N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)[5]。分子量和多分散性是γ-PGA的重要特征參數(shù),γ-PGA的聚合度在200~700之間,分子量分散性為2~5,分子量越大,其流變性越難控制,也越難被化學修飾,從而限制其應用??刹捎枚喾N方法得到不同分子量的γ-PGA,如超聲波降解[6]、堿水解、微生物或酶降解[7]以及改變培養(yǎng)基成分[8]等。

γ-PGA易溶于水,能夠形成有粘彈性的弱凝膠,但有些物理或化學手段會破壞γ-PGA形成的凝膠網(wǎng)絡結(jié)構(gòu),甚至失去粘彈性,如長時間高溫加熱、酸或堿處理、金屬離子等。研究表明,γ-PGA溶液屬于非牛頓型(假塑性)流體,其表觀粘度隨剪切速率的升高而降低[9]。此外,γ-PGA平均分子量的倒數(shù)與水解時間在80、100℃和120℃下呈線性關系,說明在加熱條件下,水溶液中的γ-PGA多肽鏈可隨機斷裂而發(fā)生水解[10]。

2 應用

γ-PGA的3種構(gòu)型均安全無毒、可食用、可生物降解,很有潛力發(fā)展成為一種環(huán)境友好型高分子材料[11]。交聯(lián)γ-PGA具有很強的持水力,可以代替非降解型水凝膠成為新一代可降解水凝膠[12]。γ-PGA在環(huán)境、農(nóng)業(yè)及生物醫(yī)藥領域都有應用價值,包括生物可降解尿片、蓄水劑、藥物或肥料的緩釋劑等。其中,γ-PGA作為絮凝劑可用于污水處理以及食品和發(fā)酵工業(yè)的下游加工[13]。此外,γ-PGA在工業(yè)中的應用領域急劇擴大,可作為金屬/放射性核素交聯(lián)劑[11]、蛋白酶抑制劑、低溫防護劑[14]、苦味減緩劑[15]、增稠劑、飼料添加劑、骨質(zhì)疏松預防因子[16]、濕潤劑、藥物載體[17]、基因載體[18]、治療性生物粘合劑[19]、分散劑和抗體/酶結(jié)合(固定)材料[20]。

3 生產(chǎn)菌株

自發(fā)現(xiàn)第一株生產(chǎn)菌Bacillus anthracis后,又相繼發(fā)現(xiàn)古生菌、細菌和動物均能產(chǎn)生γ-PGA。

3.1 聚-γ-DL-谷氨酸產(chǎn)生菌

1913年,從日本納豆中分離出一株枯草芽孢桿菌(B.subtilis)。在后續(xù)研究中,在納豆粘液中發(fā)現(xiàn)了γ-DL-PGA[21]。

產(chǎn)γ-DL-PGA的芽孢桿菌可分為自產(chǎn)谷氨酸型和外源谷氨酸依賴型。B.subtilis 5E[15]、B.subtilis TAM-4[22]、B.licheniformis A35[23]和 B.licheniformis S173[24]等屬于前者。B.subtilis IFO 3335[25]、B.subtilis subsp.Chungkookjang[21]、B.licheniformis WBL-3[26]、B.licheniformis P-104[27]等屬于后者。地衣芽孢桿菌產(chǎn)生的γ-PGA具有立體結(jié)構(gòu)多樣性[28],很可能具有兩種或兩種以上γ-PGA合成體系。除枯草芽孢桿菌外,Staphylococcus epidermidis的某些菌株也可以產(chǎn)生γ-DL-PGA以避免激發(fā)哺乳動物的免疫反應[29]。

3.2 聚-γ-D-谷氨酸產(chǎn)生菌

20世紀50年代,僅發(fā)現(xiàn)B.anthracis可以生產(chǎn)γ-D-PGA[30]。雖說γ-D-PGA對哺乳動物無毒害作用,但是它可以減弱宿主的免疫力甚至加重炭疽熱癥狀[31]。

3.3 聚-γ-L-谷氨酸產(chǎn)生菌

從很多極端微生物體中分離得到γ-L-PGA[11]。極端嗜堿菌Bacillus halodurans[32]和 Natronococcus Occultus[33]分泌的低分子量γ-L-PGA可以中和菌體周圍的堿性環(huán)境,而極端嗜鹽古生菌Natrialba aegyptiaca產(chǎn)生的高分子量γ-L-PGA可以在高鹽環(huán)境中防止菌體脫水[34]。有研究表明,Bacillus megaterium在鹽的誘導下可以產(chǎn)生以L型為主的γ-PGA[35]。此外,γ-L-PGA還廣泛分布于多種刺胞生物中,比如水螅中刺細胞分泌粘液的主要成分就是γ-L-PGA[36]。在產(chǎn)生γ-L-PGA的過程中,具有生物活性的陽離子如K+、Mg2+和Ca2+可以輔助調(diào)節(jié)生物體內(nèi)滲透壓。

4 氨基酸多聚物的非核糖體聚合模式

抗菌多肽和抗菌聚氨基酸一般具有以下特點:含有非蛋白質(zhì)氨基酸(如γ-PGA中的D-谷氨酸殘基)、鍵合獨特(如γ-PGA中的γ-氨基參與成鍵)且修飾方式與眾不同。他們通常都是非核糖體合成模式。

4.1 γ-PGA的硫模板合成機制

有研究發(fā)現(xiàn),從L-谷氨酸合成γ-D-PGA的過程中需要細胞膜的輔助;反之,D-谷氨酸既不能作為底物也不充當抑制劑。這種核苷由副反應產(chǎn)生,比如L-谷氨酸存在下,ATP水解成AMP[37]。

以上發(fā)現(xiàn)有力地支持了γ-PGA的硫模板機制假說,尤其更適用于γ-D-PGA。酶中的兩個巰基基團可參與催化:結(jié)合位點S1H和延伸位點S2H。首先,L-谷氨酸活化,ATP水解生成L-谷氨酰-γ-腺苷酸;然后以共價鍵形式連接到S1H基團上,異構(gòu)成D-谷氨酸。γ-D-PGA鏈和S2H基團的硫酯鍵受到S1H位點上的D-谷氨酰的親核攻擊,進而使鏈得到延伸。最后,γ-DPGA鏈重新回到S2H位點或被終止子釋放從而反應結(jié)束。雖然,B.licheniformis的基因組已被破解,但類似非核糖體肽合成酶(NRPS)的γ-PGA合成酶基因圖譜尚不清楚。而一旦被獲悉,人們將很可能發(fā)現(xiàn)一種全新的合成生物多聚氨基酸分子機制及其嚴格的立體結(jié)構(gòu)規(guī)則。

4.2 γ-PGA的氨基連接合成機制

在B.subtilis subsp.chungkookjang中發(fā)現(xiàn),合成γ-PGA需要細胞膜的輔助[38]。與 B.licheniformis ATCC9945不同,它可以同時利用D-和L-谷氨酸作為底物;而且,ATP水解后得到的是ADP而非AMP[39]。有學者研究表明,B.subtilis中的γ-DL-PGA合成酶不是類似NRPS,而是一種內(nèi)含氨基連接酶的模塊蛋白復合體[40]。有趣的是,B.anthracis 合成 γ-D-PGA[41]、B.licheniformis合成 γ-DL-PGA[42]、S.epidermidis合成 γ-DL-PGA[29]的酶均與B.subtilis中PGA合成酶的一級結(jié)構(gòu)相類似。

上述發(fā)現(xiàn)均與氨基連接機制假說相一致。該假說中,在任何反應階段γ-PGA都不以共價鍵的方式與細胞膜輔助的酶相連接;因此,必須有一步與胞壁質(zhì)的粘合反應[43]。首先,ATP中的磷?;D(zhuǎn)移到γ-PGA鏈末端的羧基上,處于活性位點的ADP得以釋放。然后D-/L-谷氨酸單體對γ-PGA的磷酸化羧基進行親核攻擊,進而形成一個新氨基連接。該反應在酶活性位點上重復進行,γ-PGA鏈便得以延伸。在解釋芽孢桿菌分泌的γ-PGA為何分子量差異較大且立體結(jié)構(gòu)多樣性時,氨基連接機制似乎比硫模板機制更加合理。

5 生物法合成γ-PGA的前體

毫無疑問,谷氨酸是γ-PGA的直接前體,但D-谷氨酸是否可以成為γ-D-和γ-DL-PGA的底物?正因為如此,才會出現(xiàn)兩種截然不同的γ-PGA合成機制假說。一項關于合成含有D-谷氨酸微囊藻毒素的NRPS研究中發(fā)現(xiàn),由谷氨酸消旋酶生成的D-谷氨酸可以直接進入相應的氨基酸殘基位點[44]。但在硫模板機制中,L-到D-的單向異構(gòu)作用是不存在的。

5.1 L-谷氨酸的生物合成

在B.subtilis中,合成代謝和分解代謝均可生成L-谷氨酸。一般而言,一個L-谷氨酸分子和一個α-酮戊二酸分子在L-谷氨酰胺合成酶和L-谷氨酸合酶的催化下得到兩分子L-谷氨酸[45]。谷氨酸鹽缺乏時,α-酮戊二酸和NH4+經(jīng)L-谷氨酸脫氫酶催化生成L-谷氨酸。而L-天冬氨酸和α-酮戊二酸經(jīng)L-天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶生成草酰乙酸和L-谷氨酸。此外,谷氨酸族的外源氨基酸,如L-精氨酸和L-脯氨酸均可異化生成L-谷氨酸[15]。很可能是因為胞內(nèi)過量的L-谷氨酸誘導合成γ-PGA。通過分析B.subtilis中的外源L-谷氨酸,有助于闡明外源L-谷氨酸依賴型γ-PGA的合成機制。

5.2 D-谷氨酸的生物合成

研究芽孢桿菌中D-谷氨酸的合成時,D-氨基酸轉(zhuǎn)氨酶(DAT)和谷氨酸消旋酶(GLR)是非常重要的兩種酶。除此之外,人們更關注兩種酶活性之間的關系和γ-PGA的立體結(jié)構(gòu)。一般而言,完全D-或優(yōu)先合成D-的 γ-PGA 產(chǎn)生菌(B.anthracis和 B.licheniformis),其DAT活性較高;γ-DL-PGA產(chǎn)生菌(B.subtilis)具有GLR活性;完全L-或優(yōu)先合成L-的γ-PGA產(chǎn)生菌(B.megaterium和N.aegyptiaca),其D-谷氨酸合成相關酶的活性較低或不存在[47]。

6 γ-PGA合成酶

若合成的γ-PGA分泌至胞外(分泌型),則相關基因命名為 pgs(Polyglutamate synthase);若作為莢膜成分(結(jié)構(gòu)型),其相關基因命名為 cap(Capsule)[48]。

6.1 分泌型γ-PGA合成酶

Ashiuchi等人對一株野生型B.subtilis染色體DNA中合成γ-DL-PGA的基因簇進行了鑒定,這個基因簇包含四個開放閱讀框(ORF),即 pgsB、pgsC、pgsA(或 pgsAA)和 pgsE[38]。

B.subtilis中的 γ-PGA 合成酶(PgsB,Pgs-C,Pgs-A,和Pgs-E)均位于膜上,但是Pgs組分的特點是含有一些可溶解的形式。有人發(fā)現(xiàn)PgsB只有在L-谷氨酸存在時才會催化ATP水解,而溶解的PgsBC和PgsBCA可以在D-/L-谷氨酸存在時水解ATP。到目前為止,已鑒定出來的所有水溶性的Pgs組分都不是γ-PGA合成酶。它們僅僅是依賴谷氨酸的ATP水解酶或者是特有的酰胺連接酶,可能會合成非常短的γ-谷氨酰基肽段。目前,只有一種位于細胞膜的γ-PGA合成酶能催化合成高分子量的γ-PGA。

為了進一步了解γ-PGA生物合成的分子機制,應該對γ-PGA合成酶的結(jié)構(gòu)生物學進行研究。下面總結(jié)了每種Pgs組分的結(jié)構(gòu)特點和預測的功能。

通常認為PgsB是發(fā)揮催化作用的最主要組分[49],因為它的一級結(jié)構(gòu)跟那些依賴Mg/ATP的水溶性的酰胺連接酶相類似,而酰胺連接酶可以催化短的γ-L-谷?;溞纬梢粋€葉酸基[50]。

PgsC很有可能是這種酶嵌入膜內(nèi)的一種組分[11]。PgsC與N-乙酰谷氨酸合成酶的N-乙酰轉(zhuǎn)移酶域結(jié)構(gòu)域相似[51]。而ε-聚-L-賴氨酸合成酶在C-末端也有類似于N-乙酰轉(zhuǎn)移酶的三個串聯(lián)重復單元,并且所有重復單元在催化過程中都發(fā)揮著重要的作用[52]。

PgsA有膜錨定區(qū)域[11],可以使酶固定在細胞表面[53],在很多微生物中都可以找到類似的組分。B.subtilis中的PgsA可能在γ-PGA分泌和(或)含有D-谷氨酸的γ-PGA合成酶的翻譯后修飾中發(fā)揮重要作用。

與Pgs的其他組分相比,PgsE的作用還不完全清楚。不過有研究結(jié)果顯示,它可能和一種膜相關的CapE(γ-PGA合成酶結(jié)構(gòu)型)在功能上相同,這種CapE在B.anthracis中以質(zhì)粒為負載的γ-PGA合成體系內(nèi)是一種主要成分[43]。

6.2 結(jié)構(gòu)型γ-PGA合成酶

B.anthracis的莢膜中含有γ-D-PGA,其為該病原菌毒性的主要成分之一[31]。B.anthracis中包含兩個質(zhì)粒 pXO1(108 kb)和 pXO2(951 kb)。研究表明,在質(zhì)粒pXO2上鑒定出基因簇狀的三個ORF,即capB、capC和capA;它們對消除了質(zhì)粒pXO2的B.anthracis突變體的莢膜恢復至關重要,并推斷γ-D-PGA的合成體系是一位于膜上的多酶復合體[54]。將capBCA克隆到Escherichia coli中,表達后發(fā)現(xiàn)capB為重疊基因,它能夠編碼兩種蛋白CapB和CapB′,CapBCA以膜結(jié)合蛋白形式存在;另外,在capBCA基因簇下游發(fā)現(xiàn)了編碼γ-D-PGA降解酶的基因dep[46]。

7 結(jié)論與展望

自從γ-PGA發(fā)現(xiàn)以來已有整整一百年了。盡管現(xiàn)代遺傳學的發(fā)展有助于闡明γ-PGA的產(chǎn)生機制,但是酶學研究仍然處于初期階段。鑒于一些帶有γ-L-/γ-D-谷氨酰胺殘基相對較小的化合物是通過酰胺連接形成的,因此可以推測γ-PGA也是通過同樣的途徑合成的;另一方面,鏈延伸的過程在γ-PGA的合成中并不多見,仍需進一步闡明γ-PGA生物合成的分子機制。γ-PGA合成酶的膜關聯(lián)性是否對鏈的延伸起著關鍵作用還有待研究。

塑料和水凝膠因其便利性和經(jīng)濟性逐漸成為一種現(xiàn)代工業(yè)和日常生活中的必需品,而絕大多數(shù)都來自于石油化工產(chǎn)品。但是不合理的利用會對環(huán)境和健康帶來負面影響。因此,當今社會亟需環(huán)境友好型生物可降解大分子材料,從而有助于節(jié)約資源和能源、抑制溫室效應、提高糧食產(chǎn)量、實現(xiàn)可持續(xù)發(fā)展。γ-PGA正是這樣一種順應潮流的生物高分子材料,希望γ-PGA合成機制的闡明可以幫助確立一個有效的γ-PGA生產(chǎn)體系,進而被以γ-PGA為原材料的制造業(yè)所采用,來生產(chǎn)適合未來生活方式的生態(tài)材料。

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