李 悅,李世俊,薛橋麗,胡永金*
(1.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 食品科學(xué)技術(shù)學(xué)院,云南 昆明 650201;2.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 圖書館,云南 昆明650201)
隨著人口膨脹和全球經(jīng)濟的迅猛發(fā)展,人類對于能源的需求也呈現(xiàn)逐年增長的趨勢,能源短缺問題日益嚴重,并且全世界每年產(chǎn)生大量的農(nóng)業(yè)廢棄纖維素資源沒有得到充分利用,造成極大浪費和環(huán)境污染[1-3],這為開發(fā)和利用纖維素提供了無窮的可再生資源。其次近年來對纖維素降解方面的研究最經(jīng)濟、環(huán)保的方法就是生物降解[4],所以尋找和開發(fā)高產(chǎn)纖維素酶菌種,是開發(fā)利用纖維素資源的前提和關(guān)鍵[5-6]。因此,從環(huán)境中篩選酶活高的野生菌株有著重要的意義[7-8]。
實驗以大圍山原始森林土壤為材料,通過初篩(剛果紅纖維素水解試驗和濾紙條分解試驗)和復(fù)篩(利用3,5-二硝基水楊酸法測定內(nèi)切纖維素酶活,濾紙酶活和β-葡萄糖苷酶活),篩選出了一株具有較強纖維素酶分解能力的菌株,期望能有效回收利用纖維素廢棄物,提高其附加價值,以適應(yīng)纖維素酶和纖維素乙醇工業(yè)化生產(chǎn)的需求。
1.1.1 實驗材料
土壤樣品:云南省紅河州屏邊苗族自治縣大圍山原始森林腐爛落葉下面土壤。
1.1.2 主要試劑
羧甲基纖維素鈉(sodium carboxyl methyl cellulose,CMC-Na,分析純)、3,5-二硝基水楊酸(分析純):國藥集團化學(xué)試劑有限公司;水楊苷(≥99%):上海源葉生物科技有限公司;剛果紅(分析純):天津博迪化工股份有限公司;酒石酸鉀鈉(分析純):天津市永大化學(xué)試劑有限公司;瓊脂粉:廣東環(huán)凱微生物科技有限公司;定量濾紙(中速):杭州富陽特種紙業(yè)有限公司。
1.1.3 培養(yǎng)基
種子培養(yǎng)基采用馬鈴薯葡萄糖瓊脂(potato dextrose agar,PDA)培養(yǎng)基:土豆200 g,去皮,切成小塊,煮沸30 min,紗布過濾,定容至1 L,再加2%葡萄糖,1.5%瓊脂,自然pH,121 ℃滅菌30 min。
CMC-Na培養(yǎng)基:CMC-Na 1.5%,NH4NO30.1%,酵母膏0.1%,MgSO4·7H2O 0.05%,KH2PO40.1%,瓊脂2%,pH自然,121 ℃滅菌30 min。
剛果紅纖維素瓊脂培養(yǎng)基:CMC-Na 1.5%,NH4NO30.1%,KH2PO40.1%,MgSO4·7H2O 0.05%,瓊脂2%,pH自然,121 ℃滅菌30 min。培養(yǎng)4 d之后用剛果紅染色進行鑒定。
濾紙液體培養(yǎng)基[9]:濾紙2%,酵母膏0.4%,NH4NO30.4%,MgSO4·7H2O 0.02%,KH2PO40.4%,pH自然,121 ℃滅菌30 min。
液體產(chǎn)酶培養(yǎng)基[9]:CMC-Na l%,蛋白胨0.3%,酵母膏0.02%,(NH4)2SO40.2%,KH2PO40.4%,CaC12·2H2O 0.03%,MgSO4·7H2O 0.03%,pH自然,121 ℃滅菌30 min。
HX121-0054立式壓力蒸汽滅菌鍋:上海華線醫(yī)用核子儀器有限公司;SHA-BA恒溫振蕩器:常州澳華儀器有限公司;101-2A電熱鼓風(fēng)干燥箱:北京中興偉業(yè)儀器有限公司;SW-CJ-2D超凈工作臺:蘇州凈化設(shè)備有限公司;7200型可見分光光度計:尤尼柯(上海)儀器有限公司;DT5-2型低速臺式離心機:北京時代北利離心機有限公司。
1.3.1 樣品的處理
將從菌源地采樣得來的樣品分別溶于無菌水中,稀釋成一系列不同的稀釋度,取10-3、10-4、10-53種稀釋度,涂布于CMC-Na培養(yǎng)基,每個稀釋度涂布3個平板,培養(yǎng)。反復(fù)劃線分離至單個菌落。
1.3.2 初篩[10-11]
(1)將分離得到的單菌落接種于剛果紅纖維素瓊脂平板上,28 ℃恒溫箱中培養(yǎng)4 d后用1 mg/mL的剛果紅溶液染色30 min,再用蒸餾水清洗,最后用1 mo1/L的NaCl溶液脫色30 min。以透明圈的直徑和菌落直徑的比值大小作為篩選的標準,挑選出該比值較大的菌再進行劃線分離,鏡檢確定菌體為單菌落后,接種于保藏培養(yǎng)基上保存。
(2)將濾紙條培養(yǎng)基的液體部分裝入250 mL三角瓶中,每個100 mL,再加入2張滅過菌的濾紙條(濾紙經(jīng)烘干后稱質(zhì)量),將保存的菌種制成菌懸液,分別接種于濾紙條培養(yǎng)基,于28 ℃恒溫培養(yǎng),于第7天采用失重法測定濾紙潰解情況,重復(fù)3次,測定反應(yīng)體系中濾紙失重率,挑選出失重率較高的菌再去進行復(fù)篩。失重率計算公式如下:
式中:x為失重率,%;m為接種前濾紙條干質(zhì)量,g;m1為接種培養(yǎng)后濾紙條干質(zhì)量,g。
1.3.3 復(fù)篩[9,12-13]
通過初篩得到的菌株分別接種到CMC-Na液體種子培養(yǎng)基中于28 ℃、120 r/min培養(yǎng)3 d獲得均勻的種子,然后按一定比例分別接種到液體產(chǎn)酶培養(yǎng)基中于28 ℃、120 r/min培養(yǎng)6d后離心獲得粗酶,以3,5-二硝基水楊酸(dinitrosalicylic acid,DNS)法測定羧甲基纖維素酶活(carboxyl methyl cellulose activity,CMCA),濾紙酶活(filter paper activity,F(xiàn)PA)和β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase)酶活。
粗酶液制備:將發(fā)酵液5 000 r/min離心10 min,取上清液作為粗酶液。酶活單位采用國際定義方法:以1 mL酶液在1 min內(nèi)分解底物生成1 μg葡萄糖的酶量定義為1個酶活單位(U)。
(1)葡萄糖標準溶液的配制:分別加入0、0.2mL、0.4 mL、0.6 mL、0.8 mL、1.0 mL、1.2 mL葡萄糖標準液(1 mg/mL),加入3 mL配制好的DNS試劑混合均勻,在沸水浴中加熱10 min,取出后立即用冷水冷卻到室溫,每管稀釋到15 mL,搖勻。在波長540 nm處測定OD值并記錄結(jié)果,以葡萄糖含量為橫坐標,以對應(yīng)的OD值為縱坐標,作標準曲線。
(2)羧甲基纖維素酶活力(CMCA)測定:分別向4支管中(1支空白管,3支樣品管),加入用pH值為5.0醋酸-醋酸鈉緩沖溶液配制的CMC-Na溶液2.00 mL,然后加入一定稀釋比例的酶液0.50 mL(空白管不加),混勻。將4支試管置于(50±0.1)℃水浴中反應(yīng)30 min,迅速向各管加入DNS試劑3.0 mL,再于空白管中加入稀釋好的酶液0.5 mL。將4支管同時放入沸水浴中,加熱10 min取出。冷卻至室溫,定容至15 mL,搖勻,以空白管(對照液)調(diào)零,在波長540 nm條件下測OD值。
(3)濾紙酶活力(FPA)的測定:分別向4支管中(1支空白管,3支樣品管),加入(50±0.5)mg濾紙和pH值為5.0的醋酸-醋酸鈉緩沖溶液1.5 mL,然后加入一定稀釋比例的酶液0.50 mL(空白管不加),使管內(nèi)溶液浸沒濾紙,蓋塞。將4支試管同時置于(50±0.1)℃水浴中反應(yīng)60 min。立即向各管加入DNS試劑3.0 mL。再于空白管中加入稀釋好的酶液0.50 mL。后續(xù)操作同上。
(4)β-葡萄糖苷酶酶活的測定:取0.5 mL適當倍數(shù)稀釋的酶液,加入0.5 mL 1.0%的水楊苷溶液,55 ℃保溫20 min后,加入3 mL DNS試劑,充分混合在沸水中煮沸5 min,冷卻后,定容至15 mL,搖勻。在波長540 nm處測OD值,另取一支試管加入滅活的酶液作為對照。
1.3.4 菌株鑒定
(1)形態(tài)學(xué)特征初步鑒定[14-15]
將菌株接種到PDA平板上培養(yǎng)7 d后觀察菌落的特征,在平板上挑菌體少許,涂于載玻片上,置于顯微鏡下觀察。
(2)分子生物學(xué)鑒定
將目的菌送于華大基因科技公司測序,進行18S rRNA基因序列比對分析。
以葡萄糖質(zhì)量濃度為橫坐標,吸光值為縱坐標,繪制標準曲線,結(jié)果見圖1,回歸系數(shù)R2=0.999 7,線性關(guān)系良好。
圖1 葡萄糖標準曲線Fig.1 Standard curve of glucose
將樣品處理所得196株單菌落點種于剛果紅纖維素瓊脂平板上進行初篩,以培養(yǎng)4 d后透明圈直徑和菌落直徑比值≥2.0作為篩選的標準,滿足條件的菌株有20株,實驗結(jié)果見表1,平板上生長的菌株經(jīng)剛果紅染色后結(jié)果如圖2所示,同時將這20株菌株接種到濾紙條培養(yǎng)基中,測定濾紙失重率,結(jié)果見表2。
表1 剛果紅平板水解圈篩選結(jié)果Table 1 Screening results of hydrolyzed circle by Congo red plate
圖2 霉菌在剛果紅平板上染色后結(jié)果Fig.2 Result of moulds after dying in Congo red plate
表2 濾紙失重率結(jié)果Table 2 Results of filter paper weight loss ratio
根據(jù)表2結(jié)果,以濾紙失重率>15%為標準,篩選出的菌株作為下步復(fù)篩的目的菌株,分別是3-2、5-3、11-1、16-7。
將初篩出來的4株菌制成菌懸液,按2%的接種量接種到CMC-Na液體發(fā)酵培養(yǎng)基中,在28 ℃,120 r/min的條件下,培養(yǎng)6 d后測定不同的酶組分活力,結(jié)果見表3。
表3 不同菌種產(chǎn)酶能力的比較Table 3 Enzyme production capacity comparison of different strains
由表3可知,經(jīng)酶活測定,菌株16-7的各個酶活最大。相對另外的3株菌而言,無論是透明圈直徑與菌落直徑比值,濾紙失重率,還是各個酶活值相較之都有優(yōu)勢,因此選擇16-7號菌作為目的菌進行后續(xù)實驗。
2.4.1 形態(tài)鑒定
(1)菌落形態(tài)觀察:菌株16-7在PDA平板上培養(yǎng)7 d后,菌落顏色為灰綠色,菌絲質(zhì)地呈地毯狀(半絨毛狀),背面呈灰色,無滲出液,周邊以白色絮狀擴散,呈同心圓狀,菌落形態(tài)見圖3。
(2)顯微鏡觀察:營養(yǎng)菌絲具有橫隔,子實體為掃帚狀,表面產(chǎn)生許多小梗,小梗上著生成串的球狀或圓形分生孢子,單個孢子較光滑,見圖4。
依據(jù)菌落形態(tài)和顯微鏡觀察,結(jié)合真菌鑒定手冊:初步鑒定為半知菌亞門,絲孢綱,絲孢目,叢梗孢科,青霉屬(Penicillium)。
圖3 16-7菌落形態(tài)Fig.3 Colonial morphology of strain 16-7
圖4 16-7顯微鏡下菌株形態(tài)特征Fig.4 Morphological characteristics of strain 16-7 under microscope
2.4.2 分子生物學(xué)鑒定[16]
將測得的有效序列提交GenBank數(shù)據(jù)庫,進行Blasten檢索。分析結(jié)果表明,菌株16-7的18S rRNA基因序列與小刺青霉(Penicillium spinulosum)的18S rRNA基因序列同源性高達99%,初步確定該真菌為小刺青霉。16-7的18S rDNA序列長度為452 bp,全序列如下:
GCCGGGGGGCTTCTGCCCCCGGGTCCGCG CGCACC GGAGACACCATTGAACTCTGTCTGAAGATTGCAGT CTGAGCATAAACTAAATAAGTTAAAACTTTCAACA ACGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGC AGCGAAATGCGATAACTAATGTGAATTGCAGAATT CAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCACATTGCGC CCCCTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTCCGAGCG TCATTGCTGCCCTCAAGCACGGCTTGTGTGTTGGGC TCCGTCCCCCCGGGGACGGGTCCGAAAGGCAGCGG GCGGCACCGAGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCT TTGTCACCCGCTCTGTAGGCCCGGCCGGCGCCAGCC GACAACCAATCATCCTTTTCAGGTTGACCTCGGATC AGGTAGGGATACCGCTGAACTTAAGCATA
實驗結(jié)果表明,利用剛果紅纖維素水解及濾紙條分解初篩,液體產(chǎn)酶復(fù)篩的方法篩選高產(chǎn)纖維素酶菌株是可行的,將多種方法綜合應(yīng)用可得到更為準確可靠的實驗結(jié)果。剛果紅纖維素平板透明圈篩選法明顯優(yōu)于傳統(tǒng)的篩選法,該法除了可用于識別產(chǎn)纖維素酶的菌株外,還可根據(jù)透明圈大小、透明圈出現(xiàn)早晚,粗略估計每株菌產(chǎn)酶能力,大幅度減少了篩選工作量。同時考慮濾紙是天然結(jié)晶類纖維素,且濾紙酶活力是纖維素酶組分的重要組成,因此可以通過觀察濾紙培養(yǎng)基中濾紙分解程度進行二次初篩。最后對CMC酶活,濾紙酶活和β-葡萄糖苷酶活進行測定,綜合反映了3類酶組分的協(xié)同作用,更加真實準確地反映了纖維素酶的活力。本研究對目的菌進行形態(tài)學(xué)觀察和分子生物學(xué)鑒定(18S rRNA基因序列分析)相結(jié)合的方法,能夠快速、準確地對微生物種屬進行鑒定。
[1]薛橋麗,王 煒,胡永金,等.堆肥中高溫纖維素酶菌株的篩選及其酶性質(zhì)研究[J].中國釀造,2012,31(1):30-33.
[2]鄧天福,杜開書,李廣領(lǐng).纖維素酶及其在釀造業(yè)中的應(yīng)用[J].中國釀造,2011,30(12):17-19.
[3]武林芝.纖維素酶以及應(yīng)用行業(yè)的研究進展[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,41(26):10570-10574.
[4]傅 力,涂正東,葉 凱.里氏木霉高產(chǎn)纖維素酶菌株的選育及產(chǎn)酶培養(yǎng)基的優(yōu)化[J].食品與機械,2009,25(3):10-13.
[5]武香玉,徐海燕,辛國芹,等.纖維素酶及其研究進展[J].飼料博覽,2013(10):27-29.
[6]胡格華,蘇香萍,潘 虹,等.纖維素酶產(chǎn)生菌的篩選及產(chǎn)酶條件的研究[J].三峽大學(xué)學(xué)報:自然科學(xué)版,2013,35(4):100-102.
[7]徐 昶,龍敏南,鄔小兵,等.高產(chǎn)纖維素酶菌株的篩選及產(chǎn)酶條件研究[J].廈門大學(xué)學(xué)報,2005,44(1):107-111.
[8]王美珠,曹月坤,陳文藝,等.纖維素酶產(chǎn)生菌的誘變與篩選[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2012,40(34):16510-16512.
[9]劉海波,王義強,陳介南.一株高產(chǎn)纖維素酶菌的篩選與鑒定[J].生物學(xué)雜志,2008,25(3):16-20.
[10]葉姜瑜.快速識別纖維素分解菌的新方法[J].生物學(xué)通報,1997,32(12):34.
[11]TEATHER R M,WOOD P J.Use of congo red polysaccaride interaction in enumeration and characterization of cellulytic bacteria from the bovine rumen[J].Appl Environ Microbial,1982,43(4):148-158.
[12]張瑞萍.纖維素酶的濾紙酶活和CMC 酶活的測定[J].印染助劑,2002,19(5):51-53.
[13]MANDELS M,ANEREOTTI R E.Enzymatic hydrolysis of waste cellulose[J].Biotech Bioeng Symp,1976,16(11):17-21.
[14]劉 慧.現(xiàn)代食品微生物學(xué)實驗技術(shù)[M].北京:中國輕工業(yè)出版社,2006.
[15]魏景超.真菌鑒定手冊[M].上海:上海科技出版社,1979.
[16]王 衛(wèi),王新惠,李再新.甜酒曲中霉菌18S rRNA 序列分析及分子鑒定[J].釀酒科技,2008(11):33-35.