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葡萄皮DNA檢驗(yàn)

2014-04-24 15:30:02王鳳寬王傳海李湘秦
關(guān)鍵詞:盜竊案消化液硅膠

王鳳寬 杜 舟 王傳海 李湘秦 吳 勇

(深圳市公安局刑事科學(xué)技術(shù)研究所 廣東 深圳 518040)

葡萄皮DNA檢驗(yàn)

王鳳寬 杜 舟 王傳海 李湘秦 吳 勇

(深圳市公安局刑事科學(xué)技術(shù)研究所 廣東 深圳 518040)

葡萄皮作為較少見生物物證的一種,在犯罪現(xiàn)場時(shí)有發(fā)現(xiàn)并提取,由于葡萄皮上附有的人口腔脫落細(xì)胞DNA含量較低并存在多種PCR擴(kuò)增抑制因素,熒光STR檢測成功率較低。對在入室盜竊案現(xiàn)場發(fā)現(xiàn)的葡萄皮用骨骼裂解液裂解提取,并用QIAquickRPCR Purification Kit硅膠膜過柱法富集純化DNA,獲得理想STR分型結(jié)果并通過DNA數(shù)據(jù)庫比中嫌疑人,從而通過對葡萄皮DNA的成功檢驗(yàn)在案件偵破、訴訟中發(fā)揮重要作用。

葡萄皮 STR QIAquickRPCR Purification Kit硅膠膜過柱法

1 案例資料

1.1 簡要案情

2012年9月26日,居住在深圳市光明新區(qū)光明街道辦事處新陂頭村籃球場旁出租屋的廣西人覃××報(bào)案稱,當(dāng)日18時(shí)30分許下班回到住處發(fā)現(xiàn)被盜,現(xiàn)場勘查了解覃××家中冰箱內(nèi)的一串葡萄不見了,室內(nèi)地上有散在的懷疑為嫌疑人吃葡萄后丟棄的紫色葡萄皮,技術(shù)人員收集提取葡萄皮送檢。

1.2 DNA提取及檢驗(yàn)

取干凈剪刀、鑷子,將完整一個(gè)吃剩的葡萄皮剪碎,裝入1.5ml Eppendorf管,加入260ul骨骼裂解液(Bone Incubation Buffer,美國Promega公司),30ul 20mg/ml蛋白酶K,10ul 1M DTT,震蕩10sec充分混勻,56℃消化1h,期間震蕩1-2次,每次10sec。瞬時(shí)離心,取 3ul用 AmpFLSTRRIdentifilerRPlus試劑盒(AB公司,美國)直接擴(kuò)增,余消化液和載體通過吊籃式離心去除載體轉(zhuǎn)移收集消化液至新的1.5ml Eppendorf管中備用。

用德國QIAGEN公司QIAquickRPCR Purification Kit純化試劑盒進(jìn)行純化濃縮。

加入5倍體積的Buffer PB(Binding buffer) 至含消化液的1.5mlEppendorf管中,震蕩混勻;取一個(gè)新的帶有2ml收集管(2ml collection tube)的純化柱(QIAquickRSpin Column),吸取700ul混合液至純化柱,8000rmp離心1min,丟棄已濾過的液體(管不換);重復(fù)此操作直到混合液全部濾過;吸取700ul已配無水乙醇的Buffer PE(Wash buffer)至純化柱,13000rmp、1min離心洗滌1次,丟棄收集管中已濾過的液體;吸取80%乙醇700ul至純化柱,13000rmp、1min離心洗滌1次,丟棄收集管中已濾過的液體;再以13000rmp離心3min,甩干殘余液體后把純化柱放置于新的1.5ml Eppendorf管上,打開純化柱蓋子室溫?fù)]發(fā)2min;將已在65℃預(yù)熱的Buffer EB(Elution buffer) 30ul直接加入到純化柱的硅膠膜,65℃孵育2min,13000rmp離心2min,收集于1.5ml Eppendorf管,取3ul用AmpFLSTRRIdentifilerRPlus試劑盒擴(kuò)增(AB公司,美國),3130xl型遺傳分析儀(AB公司,美國)電泳,GeneMapperID V3.2分析判型。

1.3 數(shù)據(jù)庫比對和結(jié)果判定未純化濃縮前的樣品直接擴(kuò)增未檢出STR分型。用QIAquickRPCR Purification Kit純化試劑盒純化濃縮后樣品檢出STR分型。

分型結(jié)果錄入全國DNA數(shù)據(jù)庫后與2011年12月9日光明新區(qū)公明街道塘尾面前嶺1排8棟的潘××被盜竊案的現(xiàn)場煙頭通過DNA串并案,并比中廣西壯族自治區(qū)河池市羅城仫佬族自治縣東門鎮(zhèn)的前科人員吳×福。

2 討論

由于葡萄皮本身面積太小,為吸附性載體,上面附有的少量口腔上皮脫落細(xì)胞不宜用棉簽、紗布等擦拭轉(zhuǎn)移,直接消化應(yīng)為較好選擇。葡萄皮的主要成分為纖維素、果膠質(zhì)、鐵等,葡萄皮呈紫色是因?yàn)槠咸哑ず谢ㄇ嗨?。?jīng)骨骼裂解液的消化裂解后,葡萄皮成為糊狀,釋放出有機(jī)酸等物質(zhì)抑制PCR反應(yīng),消化液顏色變?yōu)榱俗仙?,需要濃縮富集DNA。直接取裂解后的3ul DNA溶液用AmpFLSTRRIdentifilerRPlus試劑盒擴(kuò)增未檢出結(jié)果,說明葡萄皮含有的色素、經(jīng)骨骼裂解液消化裂解后產(chǎn)生的有機(jī)酸及其他成分對擴(kuò)增有抑制作用。故選擇合適的純化濃縮方法成為葡萄皮上DNA檢驗(yàn)?zāi)芊癯晒Φ年P(guān)鍵因素。

德國QIAGEN公司的QIAquickRPCR Purification Kit純化試劑盒原用于純化片段大小在100bp-10kb之間的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,最大處理量為10ug以便于后期測序。通過法醫(yī)DNA檢驗(yàn)測試,該純化試劑盒在PCR擴(kuò)增前對疑難微量檢材、陳舊骨骼牙齒樣本等的擴(kuò)增前純化濃縮也取得了很好的效果,由于該純化試劑盒完全手工操作,不需要大型昂貴儀器設(shè)備,在全國公安法醫(yī)DNA實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用廣泛。通過方便的結(jié)合-洗滌-洗脫步驟可快速純化目標(biāo)DNA片段,先將已消化裂解的DNA樣本加入5倍體積的Buffer PB、混勻,以增強(qiáng)濾過時(shí)目標(biāo)DNA與純化柱硅膠膜的充分完全結(jié)合,通過離心初步去除DNA樣本中的雜質(zhì)、抑制劑,再通過Buffer PE(試劑瓶中55ml的Buffer PE使用前預(yù)先加入220ml的無水乙醇并混勻后方可使用)、80%乙醇洗滌去除附在硅膠膜上的少量殘余雜質(zhì)、抑制劑,此時(shí)硅膠膜上只結(jié)合有純凈的目標(biāo)DNA,然后再通過已在65℃預(yù)熱的30ul Buffer EB從硅膠膜柱上充分完全洗脫下來擴(kuò)增備用。

葡萄皮作為非傳統(tǒng)生物物證在犯罪現(xiàn)場由于體量小較少有被發(fā)現(xiàn)和提取,而且因?yàn)镾TR檢出成功率較低,國內(nèi)外報(bào)道不多,本文由于現(xiàn)場勘查時(shí)及時(shí)發(fā)現(xiàn)并提取送檢,采用了純化濃縮DNA效果較好的QIAquickRPCR Purification Kit硅膠膜過柱法處理檢材,得到正確STR分型結(jié)果,并通過DNA數(shù)據(jù)庫串并案件和直接比中犯罪嫌疑人,發(fā)揮了重要作用。

2012.9.26深圳市光明新區(qū)新陂頭村入室盜竊案葡萄皮STR分型結(jié)果

[1] 凃政,劉志芳,陳松,等.牙齒的DNA提取及STR分型研究[J].刑事技術(shù),2007,(5).

[2]百度百科[EB/OL].http://baike.baidu.com/view/ 1624883.htm,2013-6-20.

[3]郭麗萍,劉建興,李楨,等.復(fù)合擴(kuò)增云南明朝古尸DNA分析[J].昆明醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào),2009,(3).

(責(zé)任編輯:于 萍)

D919

A

2013-11-22

王鳳寬(1975-),男,河南臺(tái)前人,深圳市公安局刑事科學(xué)技術(shù)研究所副主任法醫(yī)師,碩士,主要從事法醫(yī)學(xué)研究。

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