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實(shí)時(shí)熒光PCR用于流感病毒檢測(cè)的效果分析

2014-04-29 21:45:52陳燁
醫(yī)藥與保健 2014年3期
關(guān)鍵詞:流感病毒

陳燁

【摘 要】 目的 探討和研究實(shí)時(shí)熒光逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)在流感病毒檢測(cè)中的應(yīng)用效果。方法 采用實(shí)時(shí)熒光PCR對(duì)617例流感樣病例患者的咽拭子標(biāo)本進(jìn)行流感病毒核酸的測(cè)定,對(duì)檢測(cè)出的陽性標(biāo)本采用MDCK進(jìn)行培養(yǎng)并分離,對(duì)兩種方法的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行分析,對(duì)比特異性及靈敏度。結(jié)果 本組617例標(biāo)本中實(shí)時(shí)熒光PCR共檢測(cè)出陽性標(biāo)本152例,陽性率24.6%;細(xì)胞培養(yǎng)法在此152例陽性標(biāo)本中共分離出流感病毒79例,陽性率12.8%,實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)陽性率顯著高于細(xì)胞培養(yǎng)法,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。結(jié)論 實(shí)時(shí)熒光PCR能夠快速有效的檢測(cè)出流感病毒核酸,是實(shí)驗(yàn)室快速診斷的有效手段。

【關(guān)鍵詞】 實(shí)時(shí)熒光PCR;細(xì)胞培養(yǎng)法;;流感病毒

【中圖分類號(hào)】 R446.11+3 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】 B

流行性感冒是臨床上最為常見的急性呼吸道傳染病,主要是由A、B、C三種流感病毒所引起,其中A、B型病毒存在變異大、危害強(qiáng)的特點(diǎn),對(duì)患者的健康造成了很大的威脅[1]。筆者近年來采用實(shí)時(shí)熒光PCR對(duì)A、B型流感病毒進(jìn)行了檢測(cè),并與細(xì)胞培養(yǎng)法進(jìn)行了對(duì)比,現(xiàn)報(bào)道如下。

1 材料與方法

1.1 標(biāo)本、試劑及器材 標(biāo)本選取為湖南桃源縣監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院在流感爆發(fā)時(shí)就診的流感樣病例(體溫38℃以上,伴有咳嗽、咽痛等癥狀),共617例患者,取咽拭子標(biāo)本置于采樣液中,于24h內(nèi)送至實(shí)驗(yàn)室。選取7500實(shí)時(shí)熒光定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)檢測(cè)系統(tǒng),RNA提取試劑盒由QIAGEN公司提供,反應(yīng)試劑盒由北京北瑞達(dá)醫(yī)藥科技有限公司提供,狗腎傳代細(xì)胞(MDCK)由湖南省疾病預(yù)防控制中心提供,抗A、抗B系病毒血清均由國(guó)家流感中心提供。

1.2 實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè) 對(duì)所采集的617例標(biāo)本進(jìn)行病毒核酸檢測(cè),RNA提取及反應(yīng)體系均按照試劑盒說明進(jìn)行,采用SDS軟件進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR系統(tǒng)的操作并設(shè)置陽性、陰性對(duì)照,反應(yīng)程序包括:50℃(30min)、95℃(3min)、95℃(15s)、50℃(30min)、72℃(1min),設(shè)定5個(gè)循環(huán);95℃(10s)、55℃(40s),設(shè)定40個(gè)循環(huán)。熒光素設(shè)定為FAM,55℃時(shí)進(jìn)行熒光信號(hào)的收集。

1.3 細(xì)胞培養(yǎng)法檢測(cè) 對(duì)實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)到的陽性標(biāo)本采用細(xì)胞培養(yǎng)法進(jìn)行分離、接種及分型。每份標(biāo)本按25ml/瓶接種,2瓶/份,次日觀察是否出現(xiàn)細(xì)胞病變(CPE)。利用人O型紅細(xì)胞進(jìn)行血凝試驗(yàn),觀察血凝素(HA)及其滴度,將HA滴度<1:8或存在陰性培養(yǎng)物盲傳2代后仍存在陰性者棄去。HA滴度符合試驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)者采用國(guó)家流感中心提供的標(biāo)準(zhǔn)參照血清進(jìn)行HAI試驗(yàn),對(duì)病毒進(jìn)行分型。

1.4 敏感性及特異性檢測(cè) 對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)法檢測(cè)出的陽性菌株取細(xì)胞培養(yǎng)液,按照實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)步驟再次進(jìn)行檢驗(yàn)和分型。

1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 16.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,計(jì)量資料用x±s表示,計(jì)數(shù)資料對(duì)比用X2檢驗(yàn),P<0.05視為對(duì)比具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,617份疑似病例中共檢測(cè)出152例陽性病例,陽性率24.6%,對(duì)A、B型流感病毒的分型檢測(cè)分別得到133例和19例,分別占87.5%和12.5%。

2.2 細(xì)胞培養(yǎng)法檢測(cè)結(jié)果顯示,在實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)得到的152例陽性菌株中,獲得79份流感病毒,總體陽性率12.8%,A、B流感病毒分型結(jié)果分別為66例和13例,分別占83.5%和16.5%。

2.3 檢測(cè)結(jié)果對(duì)比顯示,實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)陽性率要顯著高于細(xì)胞培養(yǎng)法,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);在分型檢測(cè)對(duì)比上,兩組并無顯著性差異(P>0.05)。

3 討論

目前流感病毒的實(shí)驗(yàn)室診斷經(jīng)典方法即為病毒的分離與鑒定,采用細(xì)胞培養(yǎng)法分離的流感病毒能夠保證其抗原性與原始標(biāo)本的一致,便于長(zhǎng)期保存,在對(duì)該病毒抗原性和基因分析上有著較好的應(yīng)用,但MDCK細(xì)胞分離的病毒不能用于疫苗的生產(chǎn),從目前臨床研究結(jié)果來看[2],細(xì)胞培養(yǎng)法的檢出率和病毒載量、被檢樣品質(zhì)量等存在一定相關(guān),一旦被檢樣品質(zhì)量較少或病毒載量不足時(shí)就容易導(dǎo)致假陰性的產(chǎn)生。另外,細(xì)胞培養(yǎng)法僅針對(duì)活體病毒有效,在標(biāo)本的采集、保存過程中要注意保持病毒活性。

實(shí)時(shí)熒光PCR能夠快速、準(zhǔn)確的對(duì)流感病毒進(jìn)行檢測(cè),在2009年發(fā)生的甲型H1N1疫情中有著重要的作用。雖然細(xì)胞培養(yǎng)法是目前流感試驗(yàn)中最可靠的方案之一[3],但此種方法對(duì)標(biāo)本質(zhì)量要求過高,操作復(fù)雜且試驗(yàn)周期較長(zhǎng),在流感疫情爆發(fā),需要快速進(jìn)行診斷時(shí)存在較大弊端[4,5]。從本文數(shù)據(jù)來看,實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)陽性率顯著高于細(xì)胞培養(yǎng)法,且對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)法獲得的79株流感病毒進(jìn)行PCR分型結(jié)果與HAI實(shí)驗(yàn)結(jié)果相吻合,這說明實(shí)時(shí)熒光PCR的特異性值得肯定,同時(shí)具有方便快捷、高通量的特點(diǎn),能夠適用于流感病毒爆發(fā)期的快速、大面積檢查,能夠在3h內(nèi)提供詳細(xì)檢測(cè)結(jié)果,為臨床提供必要依據(jù)。

綜上所述,實(shí)時(shí)熒光PCR能夠快速有效的檢測(cè)出流感病毒核酸,具有簡(jiǎn)單快捷、高通量、高特異性的特點(diǎn),是流感疫情爆發(fā)時(shí)實(shí)驗(yàn)室快速診斷的有效手段。

參考文獻(xiàn)

[1] 中華人民共和國(guó)衛(wèi)生部.甲型H1N1流感病毒實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)方案[S],2009.

[2] 徐苗,羅永艾,黎友倫,等.重組結(jié)核分枝桿菌11000蛋白對(duì)結(jié)核結(jié)核分枝桿菌感染的鑒別作用[J].中華結(jié)核和呼吸雜志,2006,29(11):762-765.

[3] 中華人民共和國(guó)衛(wèi)生部.全國(guó)流感/人禽流感監(jiān)測(cè)實(shí)施方案 (2005-2010年度)[s].2005.

[4] 中華人民共和國(guó)衛(wèi)生部.流行性感冒病毒診斷標(biāo)準(zhǔn)及處理原則 [S].GB15994-1995.

[5] 程小雯,吳春利,呂星,等.熒光定量RT-PCR技術(shù)快速檢測(cè)A、B型流感病毒的研究[J].中國(guó)熱帶醫(yī)學(xué)雜志,2005,9(5):1782-1785.

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