胡見飛等
摘要[目的]利用傅里葉變換紅外光譜技術(shù)結(jié)合主成分(PCA)和偏最小二乘法判別分析(PLSDA), 研究了紅地球和皇家秋天葡萄苗葉片的紅外光譜圖
中圖分類號S11+1文獻(xiàn)標(biāo)識碼A文章編號0517-6611(2014)21-06918-02
Identification of Two Grapes Seedlings by FTIR Combined with Chemometrics
HU Jianfei, LIU Gang et al(School of Physics and Electronic Information, Yunnan Normal University, Kunming,Yunnan 650500)
Abstract[Objective] Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy combined with principal component analysis (PCA) and partial least squares discriminant analysis (PLSDA) was used to study Red Globe and Autumn Royal grapes seedlings. [Method] FTIR spectra of 60 samples of 2 species of grapes were obtained, and significant differences were observed in second derivative FTIR spectra in the range of 1 800-750 cm-1. PCA and PLSDA were performed on the second derivative infrared spectra in this range. [Result] The PCA and PLSDA could be used to distinguish two kinds of grapes. PCA provided about 100% of classification accuracy, and classification accuracy of PLSDA yield was 100% for Red Globe and Autumn Royal. [Conclusion] FTIR spectroscopy combined with PCA and PLSDA could be used to discriminate Red Globe and Autumn Royal, and supply a fast and accuracy method to discriminate different grapevine cultivars seedlings.
Key wordsFTIR; PCA; PLSDA; Grapevine seedlings
基金項目國家自然科學(xué)基金項目(30960179)。
作者簡介胡見飛(1989- ),男,云南曲靖人,碩士研究生,研究方向:紅外光譜研究。*通訊作者,教授,博士,從事生物醫(yī)學(xué)光譜學(xué)方面的研究。
收稿日期20140618葡萄屬落葉藤本植物,掌狀葉,葉互生,基部心形,兩側(cè)靠攏,邊緣粗齒3~5缺裂,復(fù)總狀花序,通常成圓錐形,也叫圓錐花序,花小,黃綠色,漿果多為圓球形或橢圓球形,色澤隨品種而異。人類在很早以前就開始栽培這種果樹,產(chǎn)量幾乎占全世界水果的1/4[1]。營養(yǎng)價值很高,可制成葡萄汁、葡萄干和葡萄酒。另外,葡萄還具有抗貧血、抗毒殺菌、抗衰老、美容養(yǎng)顏等多種功效,很受消費者的喜愛。
葡萄種類繁多,種質(zhì)資源豐富。有些葡萄在外觀上沒有明顯的特征,難以分辨。常規(guī)鑒別葡萄品種的方法如葡萄葉形結(jié)構(gòu)參數(shù)測量方法[2]、微衛(wèi)星DNA標(biāo)記(SSR)[3]、SRAP技術(shù)[4]、RAPD標(biāo)記技術(shù)[5]等雖然準(zhǔn)確,但操作復(fù)雜,程序繁瑣,成本高。因此,很有必要尋找一種準(zhǔn)確、方便、快速的鑒別方法。
紅地球和皇家秋天2種果苗在市場上很普遍。紅地球果苗比皇家秋天果苗更抗病,生命力更強,所結(jié)果實味道更好,因此很受果農(nóng)和果苗經(jīng)銷商的青睞。然而,二者外觀相似,很不容易鑒別。筆者應(yīng)用FTIR技術(shù)結(jié)合主成分分析(PCA)和偏最小二乘法判別分析(PLSDA)對紅地球和皇家秋天果苗進(jìn)行品種鑒別,而應(yīng)用FTIR技術(shù)結(jié)合化學(xué)計量學(xué)對果苗進(jìn)行品種鑒別的研究尚未見報道。
1材料與方法
1.1儀器設(shè)備紅外光譜儀為PerkinElmer公司的Frontier傅里葉變換紅外光譜儀,掃描范圍4 000~400 cm-1,分辨率4 cm-1,掃描次數(shù)16次。光譜均扣除溴化鉀背景,光譜數(shù)據(jù)用Omnic8.0軟件處理,經(jīng)過基線校正、9點平滑、歸一化處理。使用Matlab 7.10.0軟件進(jìn)行主成分分析(PCA)和偏最小二乘法判別分析(PLSDA)。
1.2樣品的制備與測定供試2個葡萄品種均采自云南陸良果樹種質(zhì)葡萄苗圃。紅地球(Red Globe)30個樣品葉片編號a1~a30,皇家秋天(Autumn Royal)30個樣品葉片編號b1~b30,樣品葉片共60個。樣品用水清洗干凈后晾干。將磨細(xì)的樣品與適量溴化鉀混合后研磨,壓片測試。
2結(jié)果與分析
圖4偏最小二乘法隱不同含潛變量的識別正確率圖5偏最小二乘法隨不同含潛變量的主成分貢獻(xiàn)率3結(jié)論
該研究利用傅里葉變換紅外光譜技術(shù)結(jié)合主成分和偏最小二乘法判別分析研究了紅地球和皇家秋天,發(fā)現(xiàn)樣品的原始紅外光譜存在細(xì)微的差異。選取指紋區(qū)1 800~750 cm-1范圍內(nèi)紅外光譜進(jìn)行二階導(dǎo)數(shù),發(fā)現(xiàn)在該區(qū)間內(nèi)存在明顯的差異。利用該區(qū)間二階導(dǎo)數(shù)進(jìn)行Morlet小波主成分分析,能完全將紅地球與皇家秋天分開;而利用該區(qū)間連續(xù)小波變換做偏最小二乘法判別分析,當(dāng)潛含變量為9個時正確率最高,紅地球與皇家秋天的正確率均為100%。結(jié)果表明,主成分和偏最小二乘法判別分析應(yīng)用于傅里葉變換紅外光譜技術(shù)中能夠識別紅地球和皇家秋天,有望發(fā)展為鑒別不同品種物種提供一種方便、快捷的方法。
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