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食品和飼料中轉(zhuǎn)基因植物FMV35S啟動(dòng)子環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)方法的建立

2014-04-29 23:16:09鄺筱珊胡松楠游淑珠等
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年16期
關(guān)鍵詞:飼料食品檢測(cè)

鄺筱珊 胡松楠 游淑珠等

摘要 [目的]建立FMV35S基因啟動(dòng)子環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增的檢測(cè)方法。[方法]建立一種檢測(cè)食品和飼料中FMV35S轉(zhuǎn)基因成分的環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增(LAMP)檢測(cè)方法,并利用實(shí)時(shí)濁度法對(duì)該LAMP檢測(cè)方法進(jìn)行靈敏度、特異性和穩(wěn)定性評(píng)價(jià)。[結(jié)果]該方法的檢測(cè)限為0.5%,特異性和穩(wěn)定性良好。采用LAMP法與熒光PCR方法進(jìn)行了實(shí)際樣品對(duì)比檢測(cè),結(jié)果一致可靠。[結(jié)論]可采用LAMP法對(duì)食品和飼料中FMV35S轉(zhuǎn)基因成分進(jìn)行檢測(cè)。

關(guān)鍵詞 食品;飼料;FMV35S基因;環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增;檢測(cè)

中圖分類號(hào) S188 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 0517-6611(2014)16-04999-03

截止到2012年,轉(zhuǎn)基因作物的種植面積已經(jīng)連續(xù)增長(zhǎng)17年,達(dá)到了420 000 000 hm2[1]。新型轉(zhuǎn)基因生物不斷涌現(xiàn)的同時(shí),有關(guān)轉(zhuǎn)基因作物在食品安全性、環(huán)境保護(hù)和倫理方面的爭(zhēng)論一直愈演愈烈。為了滿足消費(fèi)者的知情權(quán)和國(guó)際貿(mào)易的要求,越來(lái)越多的國(guó)家和地區(qū)要求對(duì)轉(zhuǎn)基因食品進(jìn)行標(biāo)示。不同的國(guó)家和地區(qū)也相應(yīng)的發(fā)布了檢測(cè)方法和判定標(biāo)準(zhǔn)。我國(guó)也于2002年7月開(kāi)始實(shí)施《轉(zhuǎn)基因食品衛(wèi)生管理?xiàng)l例》,對(duì)轉(zhuǎn)基因食品產(chǎn)品進(jìn)行標(biāo)識(shí)管理。

熒光PCR法是經(jīng)典的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)方法,同時(shí)也是目前采用較多的一種檢測(cè)方法。近年來(lái),越來(lái)越多的人將目光投向了非PCR檢測(cè)方法的研究,比如基于蛋白質(zhì)的ELISA、免疫層析試紙條方法;還有基于核酸的熒光交叉相關(guān)光譜法[2]、基于生物條形碼的電化學(xué)發(fā)光法[3]、基因芯片法[4]等。

環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)是一種新的、非PCR的核酸檢測(cè)方法[5],最少可利用4條引物,在Bst DNA poLymerase作用下檢測(cè)目的基因片段。LAMP反應(yīng)有以下幾個(gè)優(yōu)點(diǎn):不需要復(fù)雜的儀器裝置,僅靠水浴鍋或等溫孵育裝置即可達(dá)到反應(yīng)要求;擴(kuò)增產(chǎn)物肉眼可辨,不需要檢測(cè)裝置即可快速準(zhǔn)確的判斷;、LAMP檢測(cè)反應(yīng)時(shí)間短,1 h內(nèi)可出具檢測(cè)結(jié)果?;谝陨蟽?yōu)點(diǎn),近些年LAMP已經(jīng)廣泛應(yīng)用于病毒、食源性微生物、轉(zhuǎn)基因和肉類鑒定方面[6-10]。

玄參花葉病毒35S啟動(dòng)子(Figwort Mosaic Virus promoter)FMV35S基因是植物遺傳操作常用標(biāo)記基因,很多轉(zhuǎn)基因植物(如MON89034,RT73等)都含有FMV35S基因,是檢測(cè)轉(zhuǎn)基因生物的重要指標(biāo)。筆者建立一種檢測(cè)食品和飼料中FMV35S轉(zhuǎn)基因成分的LAMP方法,為轉(zhuǎn)基因的檢測(cè)擴(kuò)增提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 研究對(duì)象。豇豆、四季豆、大豆、玉米、花生、白云豆、豌豆、燕麥、蕎麥、馬鈴薯、扁豆、番茄、核桃、大杏仁、綠豆、蠶豆、轉(zhuǎn)基因油菜RT73、轉(zhuǎn)基因水稻KMD、轉(zhuǎn)基因小麥B73.6.1、轉(zhuǎn)基因大豆DP305423、轉(zhuǎn)基因大豆A5547.127、轉(zhuǎn)基因大豆GTS40.3.2、轉(zhuǎn)基因玉米MON89034、轉(zhuǎn)基因玉米MIR604、轉(zhuǎn)基因玉米EVENT98140、轉(zhuǎn)基因玉米BT176和轉(zhuǎn)基因玉米MON810,均由實(shí)驗(yàn)室提供。

1.1.2 主要儀器。PICO17高速臺(tái)式離心機(jī),購(gòu)自Thermo Fisher Scientific公司;LA.320CLAMP實(shí)時(shí)濁度儀,購(gòu)自日本榮研化學(xué)株式會(huì)社。

1.1.3 主要試劑。Bst DNA 聚合酶,購(gòu)自New England Biolabs(NEB)公司;甜菜堿(Betaine)和MgCl2,購(gòu)自Sigma公司;dNTPs,購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司;SYBR Green I 熒光染料,購(gòu)自廈門致善生物科技有限公司;LAMP引物,由生工生物工程(上海)有限公司合成;其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純,市售。

1.2 方法

1.2.1 基因組DNA 的提取。將樣品置于粉碎機(jī)中均質(zhì)碾磨成粉末狀,植物樣品基因組DNA提取采用CTAB法[11]。DNA提取完畢后,利用Thermo Fisher Nanodorp 測(cè)定核酸含量和質(zhì)量。當(dāng)OD260/OD280比值在1.7~1.9時(shí),濃度50~100 ng/μl適宜于LAMP檢測(cè)。

1.2.2 LAMP檢測(cè)體系和反應(yīng)條件。LAMP反應(yīng)體系總體積為25 μl,其成分包括:FIP和BIP各1.6 μmol/L,F(xiàn)3和B3各0.2 μmol/L,20 mmol/L Tris.HCl(pH8.8),10 mmol/L KCl,8 mmol/L MgSO4,10 mmol/L (NH4)2SO4,0.1% Tween20,1 mol/L甜菜堿,1.6 mmol/L dNTP,8 U Bst大片斷DNA聚合酶,2 μl DNA(50~100 ng/μl)。參照LAMP濁度儀使用說(shuō)明,將混合物置于反應(yīng)孔中,于63 ℃恒溫反應(yīng)60 min,最后于80 ℃下保溫5 min以結(jié)束反應(yīng)。

1.2.3 LAMP檢測(cè)法檢測(cè)FMV35S基因引物序列。通過(guò)GENEBANK下載FMV35S啟動(dòng)子序列,使用在線設(shè)計(jì)軟件Primer Explorer version 4 (http://primerexplorer.jp/e)和LAMP Designer軟件設(shè)計(jì)特異引物FMV.4。

1.2.4 FMV35S基因LAMP檢測(cè)法靈敏度試驗(yàn)。用均質(zhì)的100%轉(zhuǎn)基因玉米MON89034粉與均質(zhì)非轉(zhuǎn)基因大豆粉按比例配置成20%、10%、5%、1%、0.5%和0.1%(W/W)的標(biāo)準(zhǔn)樣品,每個(gè)稀釋度分別提取基因組DNA進(jìn)行LAMP試驗(yàn),以ddH2O代替DNA模板作為陰性對(duì)照,以FMV.4作為L(zhǎng)AMP引物,100%轉(zhuǎn)基因玉米MON89034作為陽(yáng)性對(duì)照,63 ℃運(yùn)行60 min以確定LAMP反應(yīng)的靈敏度。

1.2.5 FMV35S基因LAMP檢測(cè)法特異性試驗(yàn)。用轉(zhuǎn)基因油菜RT73、豇豆、四季豆、大豆、玉米、花生、白云豆、豌豆、燕麥、蕎麥、馬鈴薯、扁豆、番茄、核桃、大杏仁、綠豆、蠶豆、轉(zhuǎn)基因水稻KMD、轉(zhuǎn)基因小麥B73-6-1轉(zhuǎn)基因大豆DP305423、A5547-127、GTS40-3-2、轉(zhuǎn)基因玉米MON89034、MIR604、EVENT98140、BT176、MON810的DNA作為L(zhǎng)AMP反應(yīng)的模板,用FMV-4作為L(zhǎng)AMP引物進(jìn)行反應(yīng),63 ℃反應(yīng)60 min,驗(yàn)證LAMP反應(yīng)的特異性,利用LAMP濁度儀觀察反應(yīng)結(jié)果。

1.2.6 FMV35S基因LAMP檢測(cè)法穩(wěn)定性試驗(yàn)。利用建立的LAMP檢測(cè)法,分別對(duì)3個(gè)不同濃度(空白樣品0%和添加水平0.5%、1%的MON89034陽(yáng)性模擬樣品)及MON89034標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行檢測(cè),每個(gè)樣品重復(fù)20次,驗(yàn)證LAMP反應(yīng)的穩(wěn)定性,反應(yīng)結(jié)束后向反應(yīng)管加入SYBR Green I觀察顏色變化,沒(méi)有擴(kuò)增產(chǎn)物的陰性管呈橙色,有擴(kuò)增產(chǎn)物的陽(yáng)性管為綠色。利用LAMP濁度儀和肉眼直接觀察反應(yīng)結(jié)果。

1.2.7 FMV35S基因LAMP檢測(cè)法的應(yīng)用。采用試驗(yàn)方法對(duì)市售的食品和飼料等20份樣進(jìn)行LAMP 檢測(cè)。采用熒光 PCR法驗(yàn)證檢測(cè)結(jié)果,熒光 PCR 檢測(cè)所用引物探針參考檢驗(yàn)檢疫行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)SN/T 1204-2003。

2 結(jié)果與分析

2.1 FMV35S基因LAMP檢測(cè)法的特異性評(píng)價(jià) 以27種不同植物DNA作為L(zhǎng)AMP反應(yīng)的模板,用試驗(yàn)設(shè)計(jì)的FMV.4引物作為L(zhǎng)AMP引物,進(jìn)行LAMP檢測(cè)。圖1表明,F(xiàn)MV.4引物只對(duì)含有FMV35S啟動(dòng)子的模板(MON89034,轉(zhuǎn)基因油菜RT73)特異性檢出,對(duì)其他不含F(xiàn)MV35S啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)基因品系和非轉(zhuǎn)基因物種均無(wú)擴(kuò)增,未出現(xiàn)假陰性或假陽(yáng)性結(jié)果,表現(xiàn)出良好的特異性。

2.2 LAMP靈敏度測(cè)定 圖2表明,LAMP實(shí)時(shí)濁度法結(jié)果顯示,不同濃度陽(yáng)性模擬樣品的出峰時(shí)間和樣品濃度呈明顯梯度變化,LAMP實(shí)時(shí)濁度法檢測(cè)靈敏度可達(dá)0.5%。最低檢出限0.5%出峰時(shí)間約41 min,可以將反應(yīng)時(shí)間確定為60 min。

2.3 LAMP穩(wěn)定性評(píng)價(jià) 采用以FMV4為引物,對(duì)3種不同濃度樣品進(jìn)行LAMP檢測(cè),每種樣品重復(fù)20次。由表2可知,1%、0.5%及陰性樣品穩(wěn)定性試驗(yàn)結(jié)果與預(yù)期一致,顯示該方法重復(fù)性和穩(wěn)定性良好。

2.4 應(yīng)用LAMP法檢測(cè)食品中FMV35S轉(zhuǎn)基因成分 對(duì)市售燕麥片、小麥粉玉米球和菜籽粕20份食品和飼料樣品分別采用LAMP顯色法和實(shí)時(shí)熒光PCR法進(jìn)行對(duì)比檢測(cè)。由表3可知,2種方法檢測(cè)結(jié)果一致,表明可以采用LAMP法檢測(cè)食品和飼料中FMV35S轉(zhuǎn)基因成分。

3 結(jié)論與討論

生物技術(shù)的不斷發(fā)展使新轉(zhuǎn)基因植物的種類在不斷增加。圍繞轉(zhuǎn)基因植物的爭(zhēng)議也是層出不窮。建立簡(jiǎn)單、快速,成本低廉的檢測(cè)方法能夠更好保證相關(guān)貿(mào)易的順利進(jìn)行,也可以更加高效的阻止非法轉(zhuǎn)基因植物流入我國(guó)。 注:1為轉(zhuǎn)基因玉米MON89034,2為四季豆,3為大豆,4為玉米,5為花生,6為白云豆,7為豌豆,8為燕麥,9為蕎麥,10為馬鈴薯,11為扁豆,12為番茄,13為核桃,14為大杏仁,15為綠豆,16為蠶豆,17為轉(zhuǎn)基因水稻KMD,18為轉(zhuǎn)基因大豆DP305423,19為基因大豆DP305423,20為轉(zhuǎn)基因油菜RT73,21為轉(zhuǎn)基因大豆GTS-40-3-2,22為豇豆,23為轉(zhuǎn)基因玉米MIR604,24為轉(zhuǎn)基因玉米EVENT98140,25為轉(zhuǎn)基因玉米BT176,26為轉(zhuǎn)基因玉米MON810,27為轉(zhuǎn)基因大豆A5547-127,28為H2O。自從PCR于1985年發(fā)明以來(lái),有關(guān)核酸(DNA)的檢測(cè)多采用PCR法。目前檢測(cè)轉(zhuǎn)基因成分的主要方法是熒光PCR法。然而,需要昂貴的熒光PCR儀也是熒光PCR法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因成分的缺點(diǎn)[12]。近幾年,盡管有很多非PCR方法檢測(cè)目的基因的方法被報(bào)道。但是,能夠達(dá)到與PCR法相同檢測(cè)限的方法很少[3]。該方法檢測(cè)限為0.5%,能夠滿足日常檢測(cè)的限量要求(歐盟和英國(guó)0.9%,巴西4%,澳大利亞和新西蘭1%,俄羅斯、中國(guó)香港、日本、中國(guó)臺(tái)灣5%,韓國(guó)和馬來(lái)西亞3%)。

已經(jīng)有報(bào)道采用LAMP法檢測(cè)不同品系的轉(zhuǎn)基因植物如轉(zhuǎn)基因大米BT63,KMD和KF6[13],轉(zhuǎn)基因大豆GTS 40-3-2[14],轉(zhuǎn)基因玉米Bt176[15]。但是,對(duì)于含有多種原料的食品(餅干、面包、),很難逐一品系進(jìn)行檢測(cè)。這時(shí)篩選檢測(cè)則是較好的選擇。轉(zhuǎn)基因篩選檢測(cè)常用的目的基因包括:CaMV35S、NOS、NPTII和FMV35S等。FMV35S基因是植物遺傳操作常用標(biāo)記基因,可以作為一個(gè)重要的指標(biāo)判定食品和飼料中是否含有轉(zhuǎn)基因成分。

試驗(yàn)建立了一種檢測(cè)食品和飼料中FMV35S轉(zhuǎn)基因成分的LAMP方法。與經(jīng)典PCR法相比,LAMP法更加快速、易操作,檢測(cè)結(jié)果肉眼可見(jiàn),不需要復(fù)雜的檢測(cè)儀器。該方法的檢測(cè)限為0.5%,特異性和穩(wěn)定性滿足日常檢測(cè)要求,對(duì)食品和飼料中日常的快速篩檢轉(zhuǎn)基因成分有重要的意義。

食品和飼料中轉(zhuǎn)基因植物FMV35S啟動(dòng)子環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)方法的建立參考文獻(xiàn)

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責(zé)任編輯 李占東 責(zé)任校對(duì) 況玲玲

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