熊國蓮,陳驥,范陵,石菡,袁媛,鄒愚,楊軍,胡章勇
(成都醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院感染科,成都 610500)
乙型肝炎病毒(HBV)感染人體后主要表現(xiàn)為急性乙型肝炎、慢性乙型肝炎、乙肝肝硬化及乙肝相關(guān)性肝癌等不同臨床疾病譜。HBV主要受機(jī)體遺傳、病毒及環(huán)境因素的交互作用影響,其中人體免疫因素起主要作用,某些與機(jī)體免疫應(yīng)答相關(guān)的關(guān)鍵基因的單核苷酸多態(tài)性(SNP)影響HBV感染后結(jié)局[1,2]。近年來,不同地域?qū)W者證實(shí)了 HLA-DPB1基因3'非編碼區(qū)的rs9277535、rs9277542及 HLADPA1基因rs3077等位點(diǎn)與亞洲人群對(duì)HBV易感性及慢性HBV感染者表面抗原的血清學(xué)轉(zhuǎn)換密切相關(guān)[3-7],但是這些位點(diǎn)多態(tài)性是否影響慢性 HBV感染者的疾病進(jìn)展仍存在較大的分歧。本研究擬對(duì)成都地區(qū)漢族人群中rs9277542位點(diǎn)的基因多態(tài)性與HBV感染后表現(xiàn)為不同臨床疾病譜的相關(guān)性進(jìn)行探討,現(xiàn)報(bào)道如下。
參照2005年中華醫(yī)學(xué)會(huì)《慢性乙型肝炎防治指南》,收集成都醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院2009年4月~2013年4月期間579例無血緣關(guān)系的慢性HBV感染者作為病例組,包括慢性HBV攜帶者222例,其中男136例,女86例,平均(35.9±11.5)歲;慢性乙型肝炎患者231例,其中男157例,女74例,平均(40.8±13.6)歲;乙肝肝硬化126例,其中男102例,女24例,平均(50.4±10.6)歲。另選取 HBV自限性感染者344例(簡(jiǎn)稱自限性感染組)作為對(duì)照組,其中男167例,女177例,平均(41.59±14.43)歲。對(duì)照組均無肝病史,具有曾感染HBV證據(jù)(HBsAb、HBeAb和HBcAb 3種抗體至少2種陽性,HBsAg、HBeAg和 HBV DNA均為陰性)且未經(jīng)治療而恢復(fù)者。
1.2.1 白細(xì)胞DNA的提取 抽取患者靜脈血3 mL,采用TIANamp blood DNA kit血液基因組DNA提取試劑盒提取DNA,Nanodrop分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度和純度,每份標(biāo)本稀釋至終濃度10 ng/mL,放入-20℃冰箱備用。
1.2.2 PCR 擴(kuò)增及純化 Primer Premier 5.0 設(shè)計(jì) PCR 引 物,序 列:5′-CAAATCAAGTTTAGT GCCCTCA-3′(上 游 引 物 ),5′-GCTGCTGTGCA CTGATTGTGTG-3′(下 游 引 物),產(chǎn) 物 575bp。PCR反應(yīng)條件:95℃2min預(yù)變性,然后94℃變性20s,65℃退火40s,72℃延伸1.5min,共11個(gè)循環(huán);94℃ 20s,59 ℃ 30s,72 ℃ 1.5min,72 ℃ 2 min,共24個(gè)循環(huán)。PCR產(chǎn)物用蝦堿酶及外切酶Ⅰ(ExoⅠ)純化。
1.2.3 SNapshot技術(shù)進(jìn)行rs9277542基因分型采用美國ABI公司的SNaPshot試劑盒進(jìn)行單堿基延伸反應(yīng)。SNapshot PCR反應(yīng)體系10μL,其中純化PCR產(chǎn)物2μL,SNapshot Multiplex Kit 5μL,引物1μL,雙蒸水2μL。反應(yīng)條件:96℃10s,52℃5 s,60℃30s,共28個(gè)循環(huán)。SNaPshot引物序列:TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTTTTGCGT CTCATATTGACACCTTT。取0.5μL SNapshot純化產(chǎn)物上樣于ABI 3130XL測(cè)序儀測(cè)序,利用GeneMapper 4.1軟件進(jìn)行分析。所有檢測(cè)樣本在完成第1次檢測(cè)后隨機(jī)抽取5%樣本進(jìn)行重測(cè),一致性100%。
用在線軟件 DeFinetti program (http://ihg.gsf.de/cgi-bin/hw/hwa1.pl)作 病 例 組 和 對(duì) 照 組Hardy-Weinberg平衡檢測(cè)。采用SPSS 18.0統(tǒng)計(jì)軟件包進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,各組樣品的基因型及等位基因頻率比較采用χ2檢驗(yàn)。二分類logistic回歸分析計(jì)算經(jīng)年齡和性別矯正的相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度的比值比(OR)及其95%可信區(qū)間(CI),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
利用χ2檢驗(yàn)對(duì)579例慢性HBV感染者和344例HBV自限性感染者HLA-DPB1基因rs9277542位點(diǎn)多態(tài)性作Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),結(jié)果均符合 Hardy-Weinberg遺傳平衡(P>0.05)。
CC、CT、TT及C、T等位基因頻率在兩組間比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.0001)。對(duì)照組T等位基因及CT、TT基因型頻率明顯高于病例組。以C等位基因、CC基因型為對(duì)照,T等位基因、XT基因型為保護(hù)基因型(見表1)。
CC、CT、TT 3種基因型在慢性HBV攜帶者組和慢性乙型肝炎組間分布無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(見表2)。CC、TT基因型頻率在慢性HBV攜帶者組、慢性乙型肝炎組與乙肝肝硬化組間的分布經(jīng)性別和年齡校正后有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(見表3、表4)。
表1 自限性感染組與慢性HBV感染組rs9277542基因型和等位基因頻率分布
表2 慢性HBV攜帶者組與慢性乙型肝炎組rs9277542基因型分布
表3 慢性HBV攜帶者組與乙肝肝硬化組rs9277542基因型分布
表4 慢性乙型肝炎組與乙肝肝硬化組rs9277542基因型分布
有研究表明,HLA-DP基因多態(tài)性與中國漢族人群慢性 HBV 感染及乙型肝炎重癥化有關(guān)[5,8,9]。O'Brien等[10]證實(shí),在分子水平上,HLA-DP mRNA低水平表達(dá)是發(fā)生HBV持續(xù)感染的重要原因。Thomas等[11]報(bào) 道,與 rs9277542 緊 密 連 鎖 的HLA-DPB1基因 rs9277534(G/A)多態(tài)性影響HLA-DP蛋白表達(dá),攜帶主要基因型(G/G)人群外周血單核細(xì)胞表面HLA-DP蛋白表達(dá)水平和細(xì)胞內(nèi)mRNA轉(zhuǎn)錄水平明顯高于變異基因型(A/A)人群,并認(rèn)為低水平 HLA-DP表達(dá)促進(jìn) HBV自發(fā)清除。
本研究結(jié)果提示:成都地區(qū)漢族人群 HLADPB1基因rs9277542位點(diǎn)多態(tài)性與感染HBV后自發(fā)清除HBV密切相關(guān),其中攜帶T等位基因和CT、TT基因型者有更高概率發(fā)生HBV自發(fā)清除,與Nishida等[7]在日本人和韓國人中所作的全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)結(jié)論一致。考慮HLA-DP分子在乙肝病毒抗原提呈、病毒清除過程中發(fā)揮重要作用,并可能參與了慢性乙型肝炎的發(fā)生、發(fā)展過程,本研究對(duì)病例組按不同疾病狀態(tài)進(jìn)行分析,結(jié)果顯示:與慢性HBV攜帶者組和慢性乙型肝炎組比較,乙肝肝硬化組患者的CC、TT基因型的分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝硬化組的TT及TT+CT基因型頻率顯著高于慢性HBV攜帶者組和慢性乙型肝炎組,提示在成都地區(qū)漢族人群中,HLA-DPB1基因不僅參與HBV感染后自發(fā)清除的過程,還可能與慢性HBV感染者進(jìn)展到肝硬化有關(guān)。
[1]Wright TL.Introduction to chronic hepatitis B infection[J].American Journal of Gastroenterology,2006,101(Suppl 1):S1-S6.
[2]Ganem D,Prince AM.Hepatitis B virus infection-natural history and clinical consequences[J].New England Journal of Medicine,2004,350(11):1118-1129.
[3]Mbarek H,Ochi H,Urabe Y,et al.A genome-wide association study of chronic hepatitis B identified novel risk locus in a Japanese population[J].Hum Mol Genet,2011,20(19):3884-3892.
[4]Hu L,Zhai X,Liu J,et al.Genetic variants in human leukocyte antigen/DP-DQ influence both hepatitis B virus clearance and hepatocellular carcinoma development[J].Hepatology,2012,55(5):1426-1431.
[5]Li J,Yang D,He Y,et al.Associations of HLA-DP variants with hepatitis B virus infection in southern and northern Han Chinese populations:a multicenter case-control study[J].PLoS One,2011,6(8):e24221.
[6]Cheng HR,Liu CJ,Tseng TC,et al.Host genetic factors affecting spontaneous HBsAg seroclearance in chronic hepatitis B patients[J].PLoS One,2013,8(1):e53008.
[7]Nishida N,Sawai H,Matsuura K,et al.Genome-wide association study confirming association of HLA-DP with protection against chronic hepatitis B and viral clearance in Japanese and Korean[J].PLoS One,2012,7(6):e39175.
[8]Guo X,Zhang Y,Li J,et al.Strong Influence of HLA-DP Gene Variants on Development of Persistent Chronic HBV Carriers in the Han Chinese Population[J].Hepatology,2011,53(2):422-428.
[9]姚津劍,余金玲,里進(jìn),等.HLA-DP基因多態(tài)性與乙型肝炎重癥化的關(guān)聯(lián)性[J].世界華人消化雜志,2013,21(22):2206-2211.
[10]O'Brien TR,Kohaar I,Pfeiffer RM,et al.Risk alleles for chronic hepatitis B are associated with decreased mRNA expression of HLA-DPA1and HLA-DPB1in normal human liver[J].Genes and Immunity,2011,12(6):428-433.
[11]Thomas R,Thio CL,Apps R,et al.A novel variant marking HLA-DP expression levels predicts recovery from hepatitis B virus infection[J].J Virol,2012,86(12):6979-6985.