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泰勒焦蟲(chóng)表面抗原TaSP、spag-1和Tams1基因片段克隆與序列分析

2014-06-05 09:48:15郭會(huì)玲艾尼瓦爾臺(tái)外庫(kù)力陶興洋斯馬依伊斯拉木達(dá)力夏孜乃提包拉提魏玉榮
草食家畜 2014年2期
關(guān)鍵詞:登錄號(hào)焦蟲(chóng)表面抗原

郭會(huì)玲,易 忠,艾尼瓦爾·臺(tái)外庫(kù)力,陶興洋,斯馬依·伊斯拉木,達(dá)力夏·孜乃提,包拉提,王 延,薛 英,魏玉榮*,黃 炯*

(1.新疆新疆畜牧科學(xué)院獸醫(yī)研究所,新疆 烏魯木齊 830000;2.新疆喀什地區(qū)動(dòng)物疾病控制與診斷中心,新疆 喀什 844000;3.新疆克拉瑪依綠成農(nóng)業(yè)開(kāi)發(fā)有限責(zé)任公司,新疆 克拉瑪依 834000;4.新疆塔什庫(kù)爾干縣畜牧獸醫(yī)站,新疆 塔什庫(kù)爾干 845250;5.新疆塔什庫(kù)爾干縣達(dá)布達(dá)爾鄉(xiāng)畜牧獸醫(yī)站,新疆 塔什庫(kù)爾干 845250;6.新疆昭蘇縣畜牧獸醫(yī)站,新疆 昭蘇 835600)

泰勒焦蟲(chóng)表面抗原TaSP、spag-1和Tams1基因片段克隆與序列分析

郭會(huì)玲1,易 忠1,艾尼瓦爾·臺(tái)外庫(kù)力2,陶興洋3,斯馬依·伊斯拉木4,達(dá)力夏·孜乃提5,包拉提6,王 延1,薛 英1,魏玉榮1*,黃 炯1*

(1.新疆新疆畜牧科學(xué)院獸醫(yī)研究所,新疆 烏魯木齊 830000;2.新疆喀什地區(qū)動(dòng)物疾病控制與診斷中心,新疆 喀什 844000;3.新疆克拉瑪依綠成農(nóng)業(yè)開(kāi)發(fā)有限責(zé)任公司,新疆 克拉瑪依 834000;4.新疆塔什庫(kù)爾干縣畜牧獸醫(yī)站,新疆 塔什庫(kù)爾干 845250;5.新疆塔什庫(kù)爾干縣達(dá)布達(dá)爾鄉(xiāng)畜牧獸醫(yī)站,新疆 塔什庫(kù)爾干 845250;6.新疆昭蘇縣畜牧獸醫(yī)站,新疆 昭蘇 835600)

為了解泰勒焦蟲(chóng)表面抗原基因特性,利用PCR方法對(duì)實(shí)驗(yàn)室保存的泰勒焦蟲(chóng)細(xì)胞表面抗原spag-1、Tams1和TaS部分基因片段進(jìn)行克隆與序列分析。PCR結(jié)果顯示所擴(kuò)增的spag-1、Tams1和TaSP部分基因長(zhǎng)度分別為372bp,324bp和321bp。系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析表明,與本次測(cè)序表面抗原TaSP和Tams1基因片段同源性最高的蟲(chóng)株登錄號(hào)分別為FJ895154和AF214797的泰勒焦蟲(chóng)株,同源性分別高達(dá)100%與99.69%;與spag-1基因片段同源性最高的蟲(chóng)株登錄號(hào)為X78188、XM949884和M63017,它們之間同源性為100%。

泰勒焦蟲(chóng);TaSP;spag-1;Tams1;克?。恍蛄蟹治?/p>

泰勒焦蟲(chóng)病是蜱傳性血液原蟲(chóng)病。泰勒焦蟲(chóng)(Thei1eria annu1ata,T.annu1ata)表面抗原有子孢子表面抗原 (The sporozoite antigen,spag-1)、裂殖子/梨漿蟲(chóng)表面抗原 (The merozoite/pirop1asm surface antigen, Tams1)和裂殖體表面抗原(Thei1eria annu1ata surface protein,TaSP)等。Spag-1是病原入侵和被宿主細(xì)胞識(shí)別所必須的,可溶性的spag-1作為ELISA抗原檢測(cè)T.annu1ata感染抗體非常有效[1]。Tams1是蟲(chóng)體感染紅細(xì)胞時(shí)表面分泌的一種膜蛋白,具有較好的免疫原性,同樣存在抗原多樣性[2]。TaSP是一種免疫分子,感染宿主可以通過(guò)主要組織相容復(fù)合物(major histocompatibi1ity comp1ex,MHC)的遞呈產(chǎn)生抗TaSP的抗體[3]。TaSP、spag-1和Tams1在焦蟲(chóng)--機(jī)體免疫中起到重要作用,其蛋白內(nèi)部的高免疫原性區(qū)有可能成為研制亞單位疫苗的重要靶點(diǎn)。了解泰勒焦蟲(chóng)表面抗原SPAG1、Tams1和TaSP基因特性可為其亞單位疫苗或診斷試劑的制備奠定基礎(chǔ)。

1 材料和方法

1.1 樣品及主要試劑

DH5a宿主菌由本室保存,pMD18-T載體、Taq DNA聚合酶、限制性?xún)?nèi)切酶購(gòu)自TaKaRa公司,P1asmid Minipreps Kit、Wizard Genomic DNA Purification Kit、Ge1 Extraction Kit均購(gòu)自Promega公司。

1.2 焦蟲(chóng)基因組提取

懸浮培養(yǎng)泰勒焦蟲(chóng)細(xì)胞液3 mL,12 500 r/min離心30 s,加入300 μL PBS懸浮。使用Wizard Genomic DNA Purification Kit,參照試劑說(shuō)明提取焦蟲(chóng)基因組,4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3 引物設(shè)計(jì)與PCR擴(kuò)增

根據(jù)GenBank登錄的泰勒焦蟲(chóng)spag-1、Tams1、TaSP及全基因組序列,應(yīng)用軟件O1igo6.24進(jìn)行引物設(shè)計(jì),由北京捷瑞生物公司合成(表1)。以焦蟲(chóng)基因組為模板進(jìn)行PCR。

表1 擴(kuò)增Tams1、SPAG1、TaSP基因的引物

Tams1、spag-1及TaSP基因部分片段的擴(kuò)增:以提取的焦蟲(chóng)基因組為模板,分別以Tams1 F/R、SPAG1 F/R及TaSP F/R為引物通過(guò)PCR擴(kuò)增目的基因Tams1、spag-1及TaSP。反應(yīng)體系如0.2 mL PCR管中加入:10×Pfu DNA po1ymerase緩沖液5 μL,10 mM dNTP 2 μL,MgC12(2.5 mM)2 μL,上下游引物(20 pmo1)各1 μL,Pfu DNA po1ymerase(5U)0.5 μL,加入ddH2O使反應(yīng)總體積至50 μL。反應(yīng)參數(shù)為:94℃5 min;94℃45 s,50℃35 min,72℃45 s,30個(gè)循環(huán)后,72℃保溫10 min。 PCR擴(kuò)增結(jié)束后,取產(chǎn)物8 μL經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定。鑒定正確的目的條帶切膠回收,分別命名為基因Tams1、spag-1和TaSP。

1.4 PCR產(chǎn)物的克隆及序列測(cè)定

PCR產(chǎn)物回收與提取質(zhì)粒酶切鑒定、篩選陽(yáng)性克隆、pMD18-T載體連接,均按試劑盒說(shuō)明操作。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5a。挑取經(jīng)鑒定含相應(yīng)基因片段的各克隆送上海生工生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。測(cè)序正確的克隆分別命名為pMD-TaSP、pMD-spag-1和pMD-Tams1。

TaSP、spag-1和Tams1基因的序列分析 運(yùn)用DNAMAN及DNAStar軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析,并與Genbank中相關(guān)序列進(jìn)行同源性比對(duì),運(yùn)用MEGA5.0軟件繪制系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)。

2 結(jié) 果

2.1 泰勒焦蟲(chóng)表面抗原TaSP、spag-1及Tams1基因片段的PCR擴(kuò)增結(jié)果

分別使用TaSP、spag-1和Tams1基因特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物的電泳結(jié)果顯示TaSP、spag-1 和Tams1基因片段擴(kuò)增大小分別是372bp,324bp,321bp,與預(yù)期條帶大小一致(見(jiàn)圖1)。

圖1 TaSP、spag-1及Tams1基因片段PCR產(chǎn)物

2.2 TaSP、spag-1及Tams1基因片段序列測(cè)定結(jié)果與系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的建立

經(jīng)上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)公司測(cè)序后,所得TaSP、spag-1和Tams1片段序列()與Genbank中相關(guān)序列進(jìn)行同源性比對(duì),運(yùn)用MEGA5.0軟件繪制系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(見(jiàn)圖2、3、4)。

TaSP基因片段:gaagatcaacagcctttggaccctaatcaacttataga tcaagctgaacaatctcaagaacctatt caacctactgatgaatctccacagg aacaggaacagatagaaactcaagaatctgaagagttagagccagaaactgttacagtagaagttccagaacccgttacatcagaagaatctaaggaatctactcaa actgaacaaaaaccagaacaacctgaaccagttgatgaacctccagttcaacctactgaatctactcctactaaggcaagttctagtggtgatggagcagcccctt gtcatgggaaacaccatgatgatgactctgacgggaaagaatctaaatcc

spag-1基因片段:gaagttttgaaagttctggatgaactagtgaaggatgtaagcgaagaacatgttggaatagg agatt taagtgacccaagtagcagaac accaaatgcaaaaccagccgaact tggaccttcactagtgatacaaaatgta ccgtcagacccctcaaaagtgacaccaacacagccttcaaatttgccacaag taccaacaacagggccggggaacggg acggatggaacaacaacaggaccaggtggaaacggggaaggaggcaaagatttgaaggaaggagaaaagaaagaa ggattatttcaaaagatcaaaaacaaactc

TamsI基因片段:ttcaaaccttccaaagttctcttcgaaaagaaagaagtcggaaaaccaaacaatgccaagta tcttgatgttttcgtctttgtcagtgctgat tccaagaaggtcgtcagactcgactacttctataccggtgactcaaggttaaaggagacctacttcgagcttaaggacgataagtgggttcaaatgtcacaggcagatg caaacaaggccttgaacgccatggactcatcatggtcatccgattacaaaccagttgtcgacaagttctctccccttgcagtcttcgcctcagtactcatcgtcttctc atcagtcctt

將測(cè)序獲得的基因序列 (以Thei1eria annu1ata XJ標(biāo)注)與Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)中其他泰勒焦蟲(chóng)進(jìn)行比較。比對(duì)所用序列的登錄號(hào)見(jiàn)表2。

表2 本文所用到的Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)中的泰勒焦蟲(chóng)序列

從圖2可見(jiàn)本次測(cè)序獲得Tasp基因序列與Genbank登錄號(hào)為FJ895154的泰勒焦蟲(chóng)株在同一進(jìn)化分支,且序列同源性最高達(dá)100%,由此可以推測(cè)二者來(lái)源相同或?qū)儆谕幌x(chóng)株。從進(jìn)化樹(shù)可見(jiàn),本文比對(duì)的8條序列明顯聚類(lèi)為兩大分支:中國(guó)新疆泰勒焦蟲(chóng)蟲(chóng)株與蘇丹蟲(chóng)株(登錄號(hào)為EU032559、EU032559),它們的親緣關(guān)系更近,同源性達(dá)90%;中國(guó)寧夏、內(nèi)蒙古及中國(guó)某地蟲(chóng)株處在另一進(jìn)化分支,同源性為95.5%,該進(jìn)化分支與本次測(cè)序序列同源性約為85%。

圖2 基于Tasp基因的進(jìn)化樹(shù)分析

從圖3可見(jiàn),基于Tams1基因與Genbank其它泰勒焦蟲(chóng)做遺傳進(jìn)化分析也具有明顯的兩大進(jìn)化分支。本次測(cè)序獲得Tams1基因與來(lái)自印度(登錄號(hào)AF21 4840)和蘇丹(登錄號(hào)AF214797)的蟲(chóng)株親緣關(guān)系最近,同源性分別為99.38%和99.69%。中國(guó)甘肅株與突尼斯蟲(chóng)株親緣關(guān)系較近,它們之間的同源性高達(dá)98.34%。測(cè)序的新疆株與甘肅株間的同源性為96.57%。

圖3 基于Tams1基因的進(jìn)化樹(shù)分析

從圖4可以看出,基于spag-1基因所建立的進(jìn)化樹(shù)聚類(lèi)為兩大分支。本次測(cè)序獲得spag-1基因序列與土耳其(登錄號(hào)X78188、XM949884)及印度(登錄號(hào)M63017)蟲(chóng)株親緣關(guān)系最近,它們之間同源性為100%,可見(jiàn)其來(lái)源相同或?qū)儆谕幌x(chóng)株。本次測(cè)序基因spag-1與蘇丹蟲(chóng)株序列(登錄號(hào)AF128526)同源性為77.78%,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

圖4 基于spag-1基因的進(jìn)化樹(shù)分析

3 討 論

近年來(lái),T.annu1ata流行區(qū)域在逐漸擴(kuò)大。簡(jiǎn)子健等人利用間接ELISA血清學(xué)診斷方法,對(duì)2006-2008年期間新疆14地州市監(jiān)測(cè)點(diǎn)牛群進(jìn)行T.annu1ata流行病學(xué)調(diào)查,發(fā)現(xiàn)新疆T.annu1ata感染的特點(diǎn)是疫區(qū)分布廣,感染率在11%以上,且有上升趨勢(shì)[4]。巴音查汗等人的調(diào)查表明新疆牛泰勒焦蟲(chóng)病發(fā)病率和死亡率可達(dá)40%或更高[5]。鑒于T.annu1ata對(duì)養(yǎng)殖業(yè)的危害,筆者從分子生物學(xué)方面對(duì)T.annu1ata基因組片段進(jìn)行了擴(kuò)增并進(jìn)行了遺傳進(jìn)化分析。

本試驗(yàn)對(duì)所保存的新疆泰勒焦蟲(chóng)株表面抗原TaSP、spag-1和Tams1基因片段進(jìn)行了克隆,并對(duì)序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明:擴(kuò)增的新疆株泰勒焦蟲(chóng)TaS基因序列與登錄號(hào)FJ895154中國(guó)新疆株親緣關(guān)系最近達(dá)100%,可能為同一起源或同一蟲(chóng)株,同時(shí)該蟲(chóng)株與蘇丹(登錄號(hào)為EU032559、EU032559)蟲(chóng)株同源性也很高;Tams1基因序列與蘇丹(登錄號(hào)AF214797)及印度(登錄號(hào)AF214840)蟲(chóng)株同源性高達(dá)99%以上;spag-1基因序列與土耳其 (登錄號(hào)X78188、XM949884)及印度 (登錄號(hào)M63017)蟲(chóng)株同源性高達(dá)100%,但與蘇丹(登錄號(hào)AF128526)同源性較低。由于寄生蟲(chóng)基因組龐大,Genbank中泰勒焦蟲(chóng)全基因組序列信息非常有限,本次只是表面抗原基因片段測(cè)序,還不能推測(cè)所測(cè)序蟲(chóng)株的準(zhǔn)確起源。

綜上所述,本次對(duì)泰勒焦蟲(chóng)表面抗原SPAG1、Tams1和TaSP基因片段進(jìn)行克隆及測(cè)序,旨在了解測(cè)序蟲(chóng)株的基因特性,為其亞單位疫苗或診斷試劑的制備奠定基礎(chǔ)。

[1]katzer F.,Carrington M.,Knight P.,et a1.Po1ymorphism of SPAG-1,a candidate antigen for inc1usion in a subunit vaccine against Thei1eria annu1ata[J].Mo1 Biochem parasito1,1994,(67):1-10.

[2]Knighta,P.,Musokeb,A.J.,Gachanjab,J.N.,et a1.Conservation of neutra1izing determinants between thesporozoite surface Antigens of Thei1eria annu1ata and Thei1eria parva[J].Exp Parasito1,1996,82(3):229-241.

[3]Seitzer,U.,Bakheit,M..A.,Sa1ih,D.A.,et a1.From mo1ecu1e to diagnostic too1:Thei1eria annu1ata surface proteinTaSP[J].Parasito1 Res,2007,101(Supp1 2):S217-S223.

[4]簡(jiǎn)子健,馬素貞,孫其喆,等.新疆牛環(huán)形泰勒蟲(chóng)蟲(chóng)病的流行病學(xué)調(diào)查[J].新疆農(nóng)業(yè)科學(xué),2011,48(8):1509-1513.

[5]曹雯麗,陳亮,劉啟生,巴音查汗.新疆牛環(huán)形泰勒蟲(chóng)病的流行現(xiàn)狀和防治[J].草食家畜,2011,152(3):76-78.

Cloning and Sequence Analysis of TaSP,Spag-1 and Tams1 Gene Fragments of Theileria Annulata Surface Antigen

GUO Hui-1ing1,YI Zhong1,AINIWAERO·Taiwaiku1i2,TAO Xing-yang3,SIMAYIO·Yisi1amu4, DALIXIAO·Zimaiti5,BAO La-ti6,WANG Yan1,XUE Yin1,WEI Yu-rong1*,HUANG Jiong1*
(1.Institute of Veterinary Medicine,Xinjiang Academy ofAnima1 Sciences,Urumqi 830000,China;2.Contro1 and Diagnosis Center of the Anima1 Disease from Kashgar Region,Kashgar 844000,China;3.Ka1amayi Lucheng Agricu1tura1 Exp1oiture Co,.LTD,Ka1amayi 8340000,China;4.Tashkurgan Anima1 Husbandry and Veterinary Station in Xinjiang,Tashkurgan Xinjiang 845250,China; 5.Dabudar country Anima1 Husbandry and Veterinary Station in Tashkurgan, Tashkurgan Xinjiang 845250,China; 6.Zhaosu Anima1 Husbandry and Veterinary Station in Yi1i Region,Zhaosu Xinjiang 835600,China)

To study the genes characteristics of Thei1eria annu1ata surface antigen,gene fragments of spag-1 and Tams1 and Tasp were c1oned by PCR and sequenced.The resu1t showed that PCR products of genes fragment of TaSP,spag-1 and Tams1 were 372bp,324bp and 321bp,respective1y.After sequenced,phy1ogenetic tree was drew using genes fragment TaSP,Tams1 and spag-1.The ana1ysis of Phy1ogenetic tree revea1ed that he highest homo1ogy is 100%with the stain of accession number FJ895154 based on Tasp gene sequences of Thei1eria annu1ata,and it has a high homo1ogy with the stain of accession number AF214797 of 99.69%based on Tasp gene sequences of Thei1eria annu1ata.The sequence of spag-1 genes fragment is most simi1ar to the stain of accession number X78188,XM949884 and M63017 with 100%,respective1y.

thei1eria annu1ata;TaSP;spag-1;Tams1;c1one;sequence ana1ysis

S855.9

:A

:1003-6377(2014)02-0055-05

2014-01-11

國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31160505),十二五"國(guó)家科技支撐計(jì)劃(2013BAD2B04)

郭會(huì)玲(1973-),女,獸醫(yī)師,碩士,主要從事動(dòng)物傳染病研究。

魏玉榮(1978-),女,高級(jí)實(shí)驗(yàn)師,主要從事動(dòng)物傳染病研究。

黃炯(1963-),男,研究員,博士生導(dǎo)師,主要從事動(dòng)物傳染病研究與生物制品研發(fā)。

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