焦 露, 蘇 新*, 黃 霞, 劉浩東, 何 浩, 蔣宏忱, 王永莉
1)中國地質大學(北京)生物地質與環(huán)境地質教育部重點實驗室, 北京 100083; 2)中國地質大學(北京)海洋學院, 北京 100083; 3)中國地質科學院礦產(chǎn)資源研究所, 北京 100037; 4)中國地質大學(武漢)生物地質與環(huán)境地質教育部重點實驗室, 湖北武漢 430000; 5)中國科學院地質與地球物理研究所氣體地球化學重點實驗室, 甘肅蘭州 730000
祁連山凍土區(qū)水合物DK3和DK6鉆孔中微生物脂肪酸特征及意義
焦 露1, 2), 蘇 新1, 2)*, 黃 霞3), 劉浩東1, 2), 何 浩2), 蔣宏忱4), 王永莉5)
1)中國地質大學(北京)生物地質與環(huán)境地質教育部重點實驗室, 北京 100083; 2)中國地質大學(北京)海洋學院, 北京 100083; 3)中國地質科學院礦產(chǎn)資源研究所, 北京 100037; 4)中國地質大學(武漢)生物地質與環(huán)境地質教育部重點實驗室, 湖北武漢 430000; 5)中國科學院地質與地球物理研究所氣體地球化學重點實驗室, 甘肅蘭州 730000
利用脂肪酸法分析祁連山凍土帶水合物區(qū) DK3(含水合物)與 DK6(不含水合物)鉆孔巖心中微生物多樣性。本研究獲得C12到C24二十六種脂肪酸(FA), 可以分成直鏈飽和脂肪酸(SSFA), 支鏈飽和脂肪酸(BSFA), 單鍵不飽和脂肪酸(MUFA), 環(huán)丙烷脂肪酸(CFA)和多鍵不飽和脂肪酸(PUFA)五大類型, 其中SSFA相對含量最高。由于特異性的脂肪酸指示特異性的微生物類群, 得出兩根巖心中微生物類群主要由革蘭氏陽性菌、革蘭氏陰性菌和真菌組成。運用PAST(Palaeontological statistics, version 1.21)軟件對已獲得的脂肪酸進行主成分分析和聚類分析, 得出DK3與DK6巖心的微生物組成并無顯著性差異, 但是DK3巖心中含水合物層位與不含水合物層位微生物組成有差異, DK6巖心中有水合物異常的層位與無異常的層位有差異。發(fā)現(xiàn)C16:1和C18:1這兩類脂肪酸與甲烷異常有很好的對應關系, 從另一方面證明了水合物異常影響微生物組成分布。本次研究首次獲得凍土沉積物中FA組成特征, 豐富了FA的分布范圍, 研究結果擴大了真菌的分布深度, 具體機理有待更多的實驗證明。
脂肪酸; 微生物多樣性; 天然氣水合物; 祁連山凍土帶
天然氣水合物通常賦存在海洋陸坡、深海、深湖以及永久冰土帶(Kvenvolden et al., 1980)。祁連山凍土區(qū)地處青藏高原北緣, 凍土面積約104km2, 連續(xù)凍土區(qū)內的年平均地溫為-1.5 ~ -2.4℃, 凍土層厚度為50~139 m(曹代勇等, 2009)。根據(jù)對祁連山凍土區(qū)內木里煤田33號鉆孔的氣體組分、年平均地表地溫、凍土層厚度、地溫梯度等資料綜合分析, 得出該區(qū)域基本具備形成天然氣水合物的溫壓條件(祝有海等, 2006)。2008年底至2009年初, 我國在木里煤田聚乎更礦區(qū)鉆獲天然氣水合物實物樣品,使我國成為世界上第一個在中低緯度高山凍土區(qū)發(fā)現(xiàn)天然氣水合物實物的國家(祝有海等, 2009)。
已有的研究表明海底沉積物中天然氣水合物礦藏的形成和保存與深部生物圈微生物活動密切相關(Battistuzzi et al., 2004; Boetius et al., 2004; Kotelnikova, 2002; 蘇新等, 2010)。然而到目前為止,我國對凍土帶水合物區(qū)的微生物研究僅有零星報道(韓路等, 2011), 尚在起步階段, 國際上相關研究也很薄弱。常用來研究微生物多樣性的方法大體上可分為兩類: 基于現(xiàn)代分子生物學技術的方法和基于生物化學的方法(Kirk et al., 2004), 前者包括基于分子雜交技術的分子標記法和基于 DNA序列測定的研究方法; 后者包括傳統(tǒng)的平板計數(shù)法、熒光染色法、Biolog微平板分析和生物標志化合物方法等(周桔等, 2007)。利用這些研究方法可以獲得土壤或沉積物樣品中微生物的數(shù)量, 微生物種群組成特征以及特征性微生物類群等信息(Elvert et al., 2005; Orcutt et al., 2005; Orphan et al., 2001)。
生物標志化合物的研究已涵蓋了主要四種生物化學組分: 蛋白質(包括核酸)、碳水化合物(包括幾丁質)、類脂物和木質素(謝樹成等, 2003), 本次研究的重點是微生物中的脂肪酸(FA)。脂肪酸分析方法原理如下: FA是微生物細胞膜的主要成分, 正常的生理條件下微生物 FA含量恒定, 不同的微生物能夠通過不同生化途徑形成不同的FA, 部分FA總是特異性出現(xiàn)在某一類群微生物中, 因此可根據(jù)不同微生物類群特定的FA組成來揭示環(huán)境中微生物的類群。在冷泉區(qū)或水合物賦存區(qū), 甲烷氧化菌參與了一個很重要的反應——甲烷厭氧氧化反應(Anaerobic Oxidation of Methane, AOM)(Hinrichs et al., 2002), 目前根據(jù) FA圖譜的不同特征已經(jīng)可以將甲烷氧化細菌區(qū)分為兩大類: 類型 I和類型 II, I型甲烷氧化細菌主要包含一系列 C16:1的酸(Bédard et al., 1989; Bodelier et al., 2009), II型甲烷氧化細菌則以C18:1酸為主(Bodelier et al., 2009),甲烷氧化菌的含量可以一定程度上反映該層位是否有甲烷異常。
現(xiàn)有的報道絕大多數(shù)是研究現(xiàn)代土壤以及沉積物中 FA組成分布特征, 如利用磷脂脂肪酸分析方法研究湖泊沉積物中微生物多樣性(趙大勇等, 2009); 分析水稻根際土壤中微生物多樣性(劉波等, 2010); 以及分析白洋淀沉積物微生物特征(董黎明, 2011)等。目前無人對水合物區(qū)的FA進行研究, 我國凍土帶的FA研究也處于空白階段。本研究選取祁連山水合物區(qū)兩個鉆孔 DK3(含有水合物)與DK6(不含水合物), 對不同深度的樣品特別是含水合物或者有與水合物相關異常的深度樣品中微生物的 FA進行提取和分析, 旨在獲得該區(qū)域的微生物的 FA組成, 初步探討含水合物與不含水合物鉆孔中的微生物組成異同, 從而了解研究區(qū)微生物 FA特征并探討其與甲烷和水合物對應關系。
1.1 樣品與資料
樣品來源于青藏高原祁連山凍土帶天然氣水合物區(qū)鉆孔(圖 1), DK3鉆孔(東經(jīng) 99°10.16′, 北緯38°05.34′)鉆于 2009年, 進尺 765.01 m(祝有海等, 2010), 在 133.0—156.0 m, 225.1—240.0 m 和367.7—396.0 m三個層段采到天然氣水合物實物樣(盧振權等, 2010)。DK6鉆孔(東經(jīng) 99°11.7′, 北緯38°04.8′)鉆于2010年, 井深356.15 m, 該鉆孔僅局部層位可見裂隙中冒氣泡、紅外低溫、井口涌氣及偶見重烴跡象等異常(龐守吉, 2012), 未采到水合物實物樣(武淑嬌, 2012)。
兩個鉆孔最頂部均為第四系冰磧沉積或坡積物, 其下伏地層主體為中侏羅統(tǒng)江倉組和木里組。由于構造作用結果, 研究區(qū)中部為三疊系組成的一個復式背斜, 南、北兩側為侏羅系含煤地層組成的兩個向斜。鉆孔區(qū)位于南向斜, 并受到復雜斷層作用, 多數(shù)鉆井頂部有下伏地層的重復出露, 如 DK3孔頂部有江倉組和木里組部分層段出現(xiàn), 而DK6孔有上三疊統(tǒng)部分地層出露(龐守吉, 2012)。
兩個鉆孔均處于沼澤區(qū), 淺表層(<50 cm)土壤樣品會受到部分上覆草根影響, 但是本研究選取樣品均較深(最淺樣品深度為 2 m), 一定程度上可以忽略草根對此次實驗結果的影響。根據(jù)野外測井資料(郭星旺, 2011), DK3孔的簡易測溫結果顯示, 鉆探區(qū)內的凍土層厚度約95 m, 研究區(qū)凍土最大季節(jié)融化深度達 4.5 m, 季節(jié)融化層地面年平均地溫-1.2~3.6℃(龐守吉, 2012)。
1.2 鉆孔巖心氣體樣中烴類氣體組分測試
由于缺少DK3鉆孔巖心氣體數(shù)據(jù), 而DK2與DK3兩個鉆孔地理位置接近(龐守吉, 2012), 并且打鉆深度與產(chǎn)出水合物層位深度接近(祝有海等, 2010), 因此將已發(fā)表的DK2巖心中烴類數(shù)據(jù)(黃霞等, 2011), 作為本研究DK3巖心的參考。
測試DK6孔110.5—274.9 m間15個氣體樣品中的CH4濃度和其碳同位素, 具體實驗方法見文獻黃霞等(2011)。
1.3 脂肪酸提取和測試
脂肪酸的提取和分析在中國科學院地質與地球物理研究所氣體地球化學重點實驗室完成。
選取的樣品經(jīng)過冷凍干燥以后, 研碎至大于80 目, 用二氯甲烷與甲醇溶液(3:1, 體積比)浸泡24 h,超聲萃取 3次(15 min/次), 將三次萃取液過濾后濃縮至約 5 mL, 然后用 1 mol/L的 KOH的甲醇-水 (5:1, 體積比)溶液65℃皂化4 h, 冷卻后用正己烷-乙醚(9:1, 體積比)溶液萃取(3次), 萃取液為非皂化中性類脂物。下層堿液用10%的鹽酸酸化至pH為2, 然后用正己烷-乙醚(7:3, 體積比)溶液萃取(3次),將萃取液濃縮至約5 mL, 加20%的BF3甲醇溶液(60% BF3:甲醇=1:3), 70℃酯化1.5 h, 用正己烷-乙醚(9:1, 體積比)溶液萃取(3次), 萃取液自然干燥后用GC-MS分析(Garcette-Lepecq et al., 2004)。
圖1 祁連山凍土區(qū)采樣點分布(據(jù)祝有海等, 2010修改)Fig. 1 Location of two sampling drill holes (DK3 and DK6 ) in the Qilian Mountain permafrost (modified after ZHU et al., 2010)
氣相色譜-質譜聯(lián)用儀型號為HP 6890/HP 5973 NGC-MS。色譜分析條件: DB-5毛細管柱(50 m× 0.25 mm×0.25 μm), 初始溫度80℃, 以3℃/min程序升溫至300℃, 終溫恒定20 min, 進樣口溫度300℃,載氣為氦氣。質譜分析條件: 電離方式 EI, 電離能量 70 eV, 離子源溫度 230℃, GC-MS接口溫度280℃(王永莉等, 2007)。
1.4 脂類命名法則
脂肪酸(FA)分子式用“X:YωZ(c/t)”表示。其中: X表示脂肪酸分子的總碳原子數(shù); Y表示烯鍵的數(shù)目; ω表示雙鍵的位置(從分子的羧基端記數(shù)); Z表示烯鍵或環(huán)丙烷鏈的位置; c和t分別表示順式和反式同分異構體。
通常得到的脂肪酸可以分為直鏈飽和脂肪酸(SSFA), 支鏈飽和脂肪酸(BSFA), 單鍵不飽和脂肪酸(MUFA), 環(huán)丙烷脂肪酸(CFA), 羥基脂肪酸(OHFA)和多鍵不飽和脂肪酸(PUFA)6種(董黎明, 2011)。微生物除含有在其他生物中常見的SSFA以外, 一些脂肪酸類型可以作為特定功能微生物的生物標記物(顏慧等, 2006)。在現(xiàn)有的研究中, FA一般只能粗略地區(qū)分革蘭氏陽性、陰性菌, 好氧細菌、厭氧細菌、真菌等。i15:0, a15:0, 16:0, 16:1, i17:0, a17:0, 18:1, cy17:0, cy19:0(i表示異構支鏈脂肪酸; a表示反異構支鏈脂肪酸; cy表示環(huán)丙烷基)的含量總和代表細菌含量; 好氧細菌(Aerobic bacteria)的特征 FA為: MUFA; 厭氧細菌(Anaerobic bacteria)的特征FA為: CFA(Bernard et al., 1991); 革蘭氏陽性細菌(Gram-positive bacteria)的特征性FA為: BSFA (Liu et al., 2009); 革蘭氏陰性細菌(Gram-negative bacteria)的特征性FA為: MUFA, CFA (Zelles, 1999);真菌(Fungi)的特征性FA為: PUFA(Kendrick et al., 1992)。
1.5 數(shù)據(jù)分析
運用 PAST(Palaeontological statistics, version 1.21)軟件對鉆孔不同深度樣品中不同類型脂肪酸相對含量進行主成分分析(Principal components analysis, PCA), 提取PC1和PC2并作圖, 探討微生物的群落結構。分別對每一鉆孔不同深度微生物群落進行聚類分析(Cluster analysis), 探討同一鉆孔中微生物群落的差異性(Hammer et al., 2008)。
2.1 微生物FA特征及變化
2.1.1 DK3和DK6鉆孔中微生物FA特征組成
對DK3和DK6鉆孔中FA的組成分析結果表明, FA組成具有一定共性: 兩個鉆孔均檢測到C12 到 C24二十六種 FA, 有明顯的偶碳優(yōu)勢, 并且C16:0相對含量最高。
本研究中獲得的 FA可以分成 BSFA, MUFA, CFA, PUFA, SSFA五大類型(圖2)。SSFA包括: C12:0, C13:0, C14:0, C15:0, C16:0, C17:0, C18:0, C19:0, C20:0, C21:0, C22:0, C23:0, C24:0。從各深度樣FA變化來看, SSFA相對含量均較高, 約占FA總含量的87%~97%, 其余幾種類型脂肪酸相對含量較低。
MUFA包括: C16:1ω9c, C16:1ω7c, C16:1ω5c, C18:1ω9c, C18:1ω9t, C18:1ω7c, C18:1ω7t, C20:1ω9c, C22:1ω9c。該類 FA也都出現(xiàn)于兩個鉆孔的所分析樣中, 其在 DK3鉆孔中相對含量(1%~12%)低于DK6鉆孔(3%~21%)。
本研究檢測到的PUFA為: C18:2ω6c。DK3鉆孔中 PUFA 約占總含量的 0.4%~1.2%, 且在147—241.7 m深度范圍內未出現(xiàn)該類脂肪酸; DK6鉆孔PUFA約占總含量的0.4%~2%。
BSFA包括: a15:0, i16:0。在DK3鉆孔該類FA僅出現(xiàn)于223.1 m樣品中。而在DK6鉆孔中BSFA分布深度范圍相對較廣, 出現(xiàn)在2 m, 175 m, 203.7 m, 274.9 m, 330.5 m深度, 相對含量為0.5%~5%, 有明顯隨深度加深相對含量減少的趨勢。
僅檢測到一類FA屬于CFA: cy17:0, 且只出現(xiàn)在DK3鉆孔231.5 m深度, 該深度獲得天然氣水合物。
2.1.2 微生物群落組成特征及垂直變化
根據(jù)特征性FA對微生物的指示作用分析得出,兩個鉆孔中微生物均由革蘭氏陽性菌(G+)、革蘭氏陰性菌(G-)和真菌(Fungi)組成, 并且革蘭氏陰性菌均占最大比例(圖2), 革蘭氏陽性菌所占比例最少。
圖2 DK3(a)、DK6(b)鉆孔巖性、FA及微生物組成隨深度的變化趨勢圖(據(jù)龐守吉, 2012改編)Fig. 2 Depth patterns of the lithology, FA and microbial communities from Drill Hole DK3(a) and DK6(b) (modified after PANG, 2012)
革蘭氏陽性菌僅出現(xiàn)于在DK3鉆孔223 m深度中, 相對含量為 0.45%, 該深度未獲得水合物實物樣。該類細菌在DK6鉆孔含量也較少, 除了175 m,203.7 m兩個深度以外, 其余革蘭氏陽性菌出現(xiàn)的深度均無甲烷異常。
革蘭氏陰性菌在DK3鉆孔(142—390 m)中相對含量為0.8%~11.2%。在DK6鉆孔(96—213 m)該類群相對含量為3%~12%。
2.2 微生物群落的統(tǒng)計學分析
2.2.1 微生物群落的主成分分析
鉆孔中FA相對含量的PCA結果表明, 前兩個主成分(PC1, PC2)解釋了微生物群落結構總變異的82.6%, 其中第一主成分的貢獻值為 69.9%(圖 3)。兩根鉆孔不同深度樣品比較均勻地分布在PC1坐標軸的左右端, DK3鉆孔含水合物層位主要分布在PC1的右側。第二主成分對微生物群落結構變異的貢獻值為12.7%, DK6鉆孔中有水合物異常的層位,主要分布在PC2的下側。
2.2.2 微生物群落的聚類分析
分別將DK3、DK6鉆孔不同深度樣品中FA相對含量運用 PAST軟件做聚類分析, 距離系數(shù)采用Bray-Curtis(圖4)。
DK3鉆孔分析結果得出, 不同深度的樣品明顯分為兩大類, 147.8 m, 231.5 m, 389 m, 144.9 m為一類, 這 4個深度樣均獲得了水合物樣品, 說明同一根巖心中含水合物的層位與不含水合物層位的 FA組成是有差異的。
對DK6鉆孔進行分析, 不同深度的樣品也分為兩類, 167.5 m, 267.5 m為一類, 這兩個深度樣有甲烷異常, 說明同一根巖心有水合物的存在或者有甲烷異常在一定程度上會影響FA的分布。
3.1 鉆孔沉積物FA分布與甲烷和水合物分布對比
測試結果顯示, DK2鉆孔中 CH4濃度在120~380 mL/L范圍內; 其碳同位素分布范圍為-24.5‰ ~ -47.2‰, 平均值為-39.6‰。DK6鉆孔中CH4濃度在20~870 mL/L范圍內; 甲烷碳同位素分布范圍為-39.3‰ ~ -58.1‰, 平均值為-48.7‰。前人研究表明在甲烷富集的環(huán)境如有孔蟲殼體碳酸巖(Kennett et al., 2000)和自生碳酸巖(Peckmann et al., 2004)中,13C強烈負偏, 并且生物成因的甲烷有極負的13C值(狄永軍等, 2003)。此次研究的兩個鉆孔中, 甲烷濃度在水合物產(chǎn)出層位和水合物異常層位均增高, 其甲烷碳同位素都強烈偏負(圖5)。
在天然氣水合物賦存區(qū)或甲烷異常區(qū), 沉積物中會特異性地出現(xiàn)與甲烷相關的微生物, 比如參與AOM 這一重要生物地球化學反應的厭氧甲烷氧化古菌(Blair et al., 1995; Iversen et al., 1985; Boetius et al., 2004; Knittel et al., 2005)。除此之外, 還有另一部分好氧甲烷菌也會特異性存在(McDonald et al., 2008), 該類菌又被劃分為I型和II型, I型甲烷氧化菌中 C16:1是最主要的脂類化合物(Bédard et al., 1989; Murrell et al., 1998), II型甲烷氧化細菌則以C18:1酸為主(Bodelier et al., 2009)。雖然這兩種脂肪酸并不是甲烷氧化菌的特異性脂肪酸, 但是它們是甲烷氧化菌類脂物中最主要成分, 所以 C16:1和C18:1的相對含量一定程度上可以反映甲烷氧化菌所占的比例(Bodelier et al., 2009; Nichols et al., 1987)。
圖3 DK3、DK6不同深度FA的主成分分析Fig. 3 Principal components analysis (PCA) of FA in different depths of DK3 and DK6
圖4 DK3、DK6孔不同深度樣品的聚類分析Fig. 4 Cluster analysis of FA in the different depths of Drill Hole DK3(a) and DK6(b)
兩個鉆孔中, MUFA相對含量均較低, 其中主要為C16:1, C18:1這兩類脂肪酸。DK3鉆孔C16:1的相對含量平均值為0.56%; C18:1相對含量平均值為 5.92%, 圖 5陰影部分顯示了鉆孔有水合物異常的層位和水合物產(chǎn)出層位, 在這幾個深度范圍內, C16:1與 C18:1的相對含量較高, 與甲烷濃度有很好的對應關系。雖然在DK6鉆孔未獲得天然氣水合物實物樣品, 但是在有甲烷異常的深度范圍內C16:1和C18:1兩種FA也明顯增多, 可以大致說明這兩種 FA與甲烷的異常也存在著較好的對應關系。
圖5 DK3、DK6巖心柱沉積物中與甲烷有關的特征FA隨深度分布圖Fig. 5 Depth patterns of the characteristic FA related to methane from Drill Hole DK3 and DK6
目前國內外對水合物區(qū)微生物多樣性的研究重點集中在海洋環(huán)境水合物, 凍土帶水合物區(qū)微生并且較多地出現(xiàn)在DK6鉆孔無水合物異常中, 這一現(xiàn)象是否具有特異性, 以及是否可以用來區(qū)分含水合物和不含水合物鉆孔中的 FA組成, 需要更多的后續(xù)研究進行驗證。
3.2 凍土層微生物組成特征
根據(jù)測井資料顯示, 研究區(qū)的凍土厚度為95 m(龐守吉, 2012)。本研究DK6鉆孔有4個深度樣屬于凍土層沉積物, 分析凍土層沉積物樣品中 FA的組成特征對拓寬 FA及微生物的研究載體具有重要意義。
在凍土層4個深度樣品中SSFA均占有最優(yōu)勢地位, 并且隨著深度的增加其相對含量減少; MUFA是第二大優(yōu)勢 FA, 也出現(xiàn)在每一個所分析的深度樣中, 并且隨著深度的增加其相對含量增加; PUFA未出現(xiàn)于15.5 m深度樣中; 而BSFA只出現(xiàn)在最表層樣品中(圖6)。
圖6 DK6鉆孔巖心凍土沉積物中FA隨深度分布圖Fig. 6 Depth patterns of all FA fractions and characteristic FA related to methane from permafrost of Drill Hole DK6
根據(jù)特征性 FA與微生物類群的對應性關系可以看出, 在DK6鉆孔的淺表層(2 m), 微生物類群最豐富, 包含 G+、G-以及少量的 Fungi, 推測由于該處較接近地表, 有機質較于巖心深部含量豐富, 所以微生物所需營養(yǎng)物質較為充足。并且隨著深度的增加, 微生物多樣性明顯降低, 在凍土層的較深部(33.5 m), 僅能識別出少量的G-。
DK6鉆孔表層樣品中, 兩種與甲烷有關的微生物脂類(C16:1, C18:1)的含量均較高, 推測由于DK6鉆孔上部斷層發(fā)育(圖 2b), 下覆地層中甲烷氣體大量向上運移, 給以甲烷為生的微生物提供充足的養(yǎng)分, 因此與甲烷有關的微生物含量較高。
本次研究首次獲得凍土沉積物中FA組成特征,更豐富了 FA的分布范圍, 具體機理有待更多的實驗進行證明。
3.3 鉆孔中真菌分布特征
真菌幾乎出現(xiàn)在兩個鉆孔的各深度樣中, 相對含量為 0.5%~2%, 并且鉆孔深部(300 m)仍然能檢測到與真菌有關的FA。為了最大化獲取生長所需的營養(yǎng)物質, 真菌通常生長在固體基質的表層及其內部, 或作為單細胞生活在水生環(huán)境中(Moss, 1986)。并且在目前現(xiàn)有的研究, 絕大多數(shù)是分析
10—50 cm 深度范圍內沉積物中真菌的分布特征(Damare et al., 2006; Kabir et al., 1998; Neville et al., 2002)。
本次結果擴大了真菌的分布深度, 初步推測有以下兩點原因: 真菌可存活于較深的巖石裂隙中;另一種原因是, 鉆探過程中, 上部泥漿流入下部,但是由于巖石堅硬, 實驗預處理階段無法將巖心表層切除, 因此將鉆孔上部代表真菌的FA帶入下部。如圖 2所示, 兩個鉆孔較淺深度和底部的微生物組成結構上有很大差異, 尤其是DK6極為明顯, 這種現(xiàn)象一定程度上可以排除鉆孔上部樣品帶入下部造成污染。在今后的研究中將進行改進方法, 以更準確地排除該部分誤差。
綜上所述, 本研究初次運用脂肪酸的分析方法對凍土帶天然氣水合物區(qū)巖心中的微生物群落的結構組成進行探討, 所得結果豐富了凍土帶中 FA數(shù)據(jù), 發(fā)現(xiàn)C16:1和C18:1這兩類脂肪酸與甲烷的異常有很好的對應關系, 并很難得的獲得了凍土層沉積物中微生物FA組成記錄。從另一方面證明了水合物異常影響了微生物組成分布。本次研究首次獲得凍土沉積物中FA組成特征, 更豐富了FA的分布范圍, 擴大了真菌的分布深度, 具體機理有待更多的實驗進行證明。
曹代勇, 劉天績, 王丹, 王佟, 文懷軍, 潘語錄. 2009. 青海木里地區(qū)天然氣水合物形成條件分析[J]. 中國煤炭地質, 21(9): 3-6.
狄永軍, 郭正府, 李凱明, 于開寧. 2003. 天然氣水合物成因探討[J]. 地球科學進展, 18(1): 138-143.
董黎明. 2011. 利用磷脂脂肪酸表征白洋淀沉積物微生物特征[J]. 中國環(huán)境科學, 31(11): 1875-1880.
郭星旺. 2011. 祁連山凍土區(qū)天然氣水合物測井響應特征及評價[D]. 北京: 中國地質科學院.
韓路, 武淑嬌, 李建華, 呂杰, 祝有海. 2011. 祁連山凍土區(qū)天然氣水合物DK-2鉆孔微生物群落[J]. 地質通報, 12: 11.
黃霞, 祝有海, 王平康, 郭星旺. 2011. 祁連山凍土區(qū)天然氣水合物烴類氣體組分的特征和成因[J]. 地質通報, 12: 7.
劉波, 胡桂萍, 鄭雪芳, 張建福, 謝華安. 2010. 利用磷脂脂肪酸(PLFAs)生物標記法分析水稻根際土壤微生物多樣性[J].中國水稻科學, 24(3): 278-288.
盧振權, 祝有海, 張永勤, 文懷軍, 李永紅, 王平康. 2010. 青海祁連山凍土區(qū)天然氣水合物資源量的估算方法[J]. 地質通報, 29(9): 1310-1318.
龐守吉. 2012. 祁連山木里天然氣水合物鉆孔沉積構造特征及與水合物分布關系研究[D]. 北京: 中國地質大學(北京).
蘇新, 陳芳, 張勇, 王媛媛, 焦露, 蔣宏忱, 董海良. 2010. 海洋天然氣水合物勘查和識別新技術:地質微生物技術[J]. 現(xiàn)代地質, 24(3): 409-423.
王永莉, 方小敏, 艷白, 奚曉霞, 張璽正, 王有孝. 2007. 中國氣候(水熱)連續(xù)變化區(qū)域現(xiàn)代土壤中類脂物分子分布特征及其氣候意義[J]. 中國科學(D輯)地球科學, 37(3): 286-396.
武淑嬌. 2012. 祁連山凍土區(qū)天然氣水合物可培養(yǎng)微生物研究及一株新種細菌的鑒定[D]. 北京: 北京化工大學.
謝樹成, 梁斌, 郭建秋, 易軼, EVERSHED R, MADDY D, CHAMBERS F. 2003. 生物標志化合物與相關的全球變化[J]. 第四紀研究, 23(5): 521-528.
顏慧, 蔡祖聰, 鐘文輝. 2006. 磷脂脂肪酸分析方法及其在土壤微生物多樣性研究中的應用[J]. 土壤學報, 43(5): 851-859.
趙大勇, 燕文明, 馮景偉, 袁守軍. 2009. 磷脂脂肪酸分析在湖泊沉積物微生物生態(tài)學研究中的應用[J]. 化學與生物工程, 26(12): 17-20.
周桔, 雷霆. 2007. 土壤微生物多樣性影響因素及研究方法的現(xiàn)狀與展望[J]. 生物多樣性, 15(3): 306-311.
祝有海, 劉亞玲, 張永勤. 2006. 祁連山多年凍土區(qū)天然氣水合物的形成條件[J]. 地質通報, 25(1-2): 58-63.
祝有海, 張永勤, 文懷軍, 盧振權, 賈志耀, 李永紅, 李清海,劉昌嶺, 王平康, 郭星旺. 2009. 青海祁連山凍土區(qū)發(fā)現(xiàn)天然氣水合物[J]. 地質學報, 83(11): 1762-1771.
祝有海, 張永勤, 文懷軍, 盧振權, 王平康. 2010. 祁連山凍土區(qū)天然氣水合物及其基本特征[J]. 地球學報, 31(1): 7-16.
References:
BATTISTUZZI F, FEIJAO A, HEDGES S B. 2004. A genomic timescale of prokaryote evolution: insights into the origin of methanogenesis, phototrophy, and the colonization of land[J]. BMC Evolutionary Biology, 4(1): 44.
BéDARD C, KNOWLES R. 1989. Physiology, biochemistry, and specific inhibitors of CH4, NH4+, and CO oxidation bymethanotrophs and nitrifiers[J]. Microbiological Reviews, 53(1): 68-84.
BERNARD K A, BELLEFEUILLE M, EWAN E P. 1991. Cellular fatty acid composition as an adjunct to the identification of asporogenous, aerobic gram-positive rods[J]. Journal of Clinical Microbiology, 29(1): 83-89.
BLAIR N E, ALLER R C. 1995. Anaerobic methane oxidation on the Amazon shelf[J]. Geochimica et Cosmochimica Acta, 59(18): 3707-3715.
BODELIER P L, GILLISEN M-J B, HORDIJK K, DAMSTé J S S, RIJPSTRA W I C, GEENEVASEN J A, DUNFIELD P F. 2009. A reanalysis of phospholipid fatty acids as ecological biomarkers for methanotrophic bacteria[J]. The ISME Journal, 3(5): 606-617.
BOETIUS A, SUESS E. 2004. Hydrate Ridge: a natural laboratory for the study of microbial life fueled by methane from near-surface gas hydrates[J]. Chemical Geology, 205(3): 291-310.
CAO Dai-yong, LIU Tian-ji, WANG Dan, WANG Tong, WEN Hai-jun, PANG Yu-lu. 2009. Analysis of Formation Conditions of Natural Gas Hydrate in Muli Coalfield, Qinghai Province[J]. Coal Geology of China, 21(9): 3-6(in Chinese with English abstract).
DAMARE S, RAGHUKUMAR C, RAGHUKUMAR S. 2006. Fungi in deep-sea sediments of the Central Indian Basin[J]. Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 53(1): 14-27.
DI Yong-jun, GUO Zheng-fu, LI Kai-ming, YU Kai-ning. 2003. Disscussion of the origin of gas hydrate[J]. Advance in Earth Sciences, 18(1): 138-143(in Chinese with English abstract).
DONG Li-ming. 2011. Microbial characteristics in the sediments of Baiyangdian Lake utilizing phospholipid fatty acids analysis[J]. China Environmental Science, 31(11): 1875-1880(in Chinese with English abstract).
ELVERT M, HOPMANS E, TREUDE T, BOETIUS A, SUESS E. 2005. Spatial variations of methanotrophic consortia at cold methane seeps: implications from a high-resolution molecular and isotopic approach[J]. Geobiology, 3(3): 195-209.
GARCETTE-LEPECQ A, LARGEAU C, BOULOUBASSI I, DERENNE S, SALIOT A, LORRE A, POINT V. 2004. Lipids and their modes of occurrence in two surface sediments from the Danube delta and northwestern Black Sea: implications for sources and early diagenetic alteration: I. Carboxylic acids[J]. Organic Geochemistry, 35(8): 959-980.
GUO Xing-wang. 2011. Well Logging Response Characteristics and Evaluation of Gas Hydratein Qilian Mountain Permafrost[D]. Beijing: Chinese Academy of Geological Sciences(in Chinese with English abstract).
HAMMER ?, HARPER D, RYAN P. 2008. PAST—Palaeontological STatistics, ver. 1.87, Zuerich[S]. PAST.
HAN Lu, WU Shu-jiao, LI Jian-hua, Lü Jie, ZHU You-hao. 2011. Microbial community in DK-2 gas hydrate borehole, Qilian Mountain permafrost[J]. Geological Bulletin of China, 30(12): 1874-1882(in Chinese with English abstract).
HINRICHS K, BOETIUS A. 2002. The anaerobic oxidation of methane: new insights in microbial ecology and biogeochemistry[J]. Ocean Margin Systems: 457-477.
HUANG Xia, ZHU You-hai, WANG Ping-kang, GUO Xing-wang. 2011. Hydrocarbon gas composition and origin of core gas from the gas hydrate reservoir in Qilian Mountain permafrost[J]. Geological Bulletin of China, 30(12): 1851-1856(in Chinese with English abstract).
INAGAKI F, NUNOURA T, NAKAGAWA S, TESKE A, LEVER M, LAUER A, SUZUKI M, TAKAI K, DELWICHE M, COLWELL F S. 2006. Biogeographical distribution and diversity of microbes in methane hydrate-bearing deep marine sediments on the Pacific Ocean Margin[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 103(8): 2815-2820.
IVERSEN N, J?RGENSEN B. 1985. Anaerobic methane oxidation rates at the sulfate-methane transition in marine sediments from Kattegat and Skagerrak (Denmark)[J]. Limnol. Oceanogr, 30(5): 944-955.
KABIR Z, O'HALLORAN I, WIDDEN P, HAMEL C. 1998. Vertical distribution of arbuscular mycorrhizal fungi under corn (Zea mays L.) in no-till and conventional tillage systems[J]. Mycorrhiza, 8(1): 53-55.
KENDRICK A, RATLEDGE C. 1992. Lipids of selected molds grown for production of n-3 and n-6 polyunsaturated fatty acids[J]. Lipids, 27(1): 15-20.
KENNETT J P, CANNARIATO K G, HENDY I L, BEHL R J. 2000. Carbon isotopic evidence for methane hydrate instability during Quaternary interstadials[J]. Science, 288(5463): 128-133.
KIRK J L, BEAUDETTE L A, HART M, MOUTOGLIS P, KLIRONOMOS J N, LEE H, TREVORS J T. 2004. Methods of studying soil microbial diversity[J]. Journal of microbiological methods, 58(2): 169-188.
KNITTEL K, L?SEKANN T, BOETIUS A, KORT R, AMANN R. 2005. Diversity and distribution of methanotrophic archaea at cold seeps[J]. Applied and Environment Microbiology, 71(1): 467-479.
KOTELNIKOVA S. 2002. Microbial production and oxidation of methane in deep subsurface[J]. Earth-Science Reviews, 58(3): 367-395.
KVENVOLDEN K A, MCMENAMIN M A. 1980. Hydrates of natural gas: a review of their geologic occurrence[M]. US Department of the Interior, Geological Survey Circular: 825.
LIU Bo, HU Gui-ping, ZHENG Xue-fang, ZHANG Jian-fu, XIE Hua-an. 2010. Analysis on microbial diversity in the rhizosphere of rice by phospholipid fatty acids biomarkers[J]. Chinese Journal of Rice Science, 24(3): 278-288(in Chinese with English abstract).
LIU Y, YAO H, HUANG C. 2009. Assessing the effect of air-drying and storage on microbial biomass and community structure in paddy soils[J]. Plant and Soil, 317(1-2): 213-221.
LU Zheng-quan, ZHU You-hai, ZHANG Yong-qin, WEN Hai-jun, LI Yong-hong, WANG Ping-kang. 2010. Estimation method of gas hydrate resource in the Qilian Mountain permafrost area, Qinghai, China—a case of the drilling area[J]. Geological Bulletin of China, 29(9):1310-1318(in Chinese with English abstract).
MCDONALD I R, BODROSSY L, CHEN Y, MURRELL J C. 2008. Molecular ecology techniques for the study of aerobic methanotrophs[J]. Applied and Environmental Microbiology, 74(5): 1305-1315.
MILLS H J, HODGES C, WILSON K, MACDONALD I R, SOBECKY P A. 2003. Microbial diversity in sediments associated with surface-breaching gas hydrate mounds in the Gulf of Mexico[J]. FEMS Microbiology Ecology, 46(1): 39-52.
MOSS S T. 1986. The biology of marine fungi[M]. Great Britain: Press Syndicate of the University of Cambirge.
MURRELL J C, MCDONALD I R, BOURNE D G. 1998. Molecular methods for the study of methanotroph ecology[J]. FEMS Microbiology Ecology, 27(2): 103-114.
NEVILLE J, TESSIER J, MORRISON I, SCARRATT J, CANNING B, KLIRONOMOS J. 2002. Soil depth distribution of ecto-and arbuscular mycorrhizal fungi associated with Populus tremuloides within a 3-year-old boreal forest clear-cut[J]. Applied Soil Ecology, 19(3): 209-216.
NICHOLS P D, ANTWORTH C P, PARSONS J, WHITE D C, HENSON J M, WILSON J T. 1987. Detection of a microbial consortium, including type II methanotrophs, by use of phospholipid fatty acids in an aerobic halogenated hydrocarbon-degrading soil column enriched with natural gas[J]. Environmental toxicology and chemistry, 6(2): 89-97.
ORCUTT B, BOETIUS A, ELVERT M, SAMARKIN V, JOYE S B. 2005. Molecular biogeochemistry of sulfate reduction, methanogenesis and the anaerobic oxidation of methane at Gulf of Mexico cold seeps[J]. Geochimica et Cosmochimica Acta, 69(17): 4267-4281.
ORPHAN V J, HOUSE C H, HINRICHS K-U, MCKEEGAN K D, DELONG E F. 2001. Methane-consuming archaea revealed by directly coupled isotopic and phylogenetic analysis[J]. Science, 293(5529): 484-487.
PANG Shou-ji. 2012. Relationship between tectonic, sedimentation characteristics and distribution of gas hydrate in Muli Coalfield of Qilian Mountain[D]. China University of Geosciences(Beijing)(in Chinese with English abstract).
PECKMANN J, THIEL V. 2004. Carbon cycling at ancient methane-seeps[J]. Chemical Geology, 205(3): 443-467.
REED D W, FUJITA Y, DELWICHE M E, BLACKWELDER D B, SHERIDAN P P, UCHIDA T, COLWELL F S. 2002. Microbial communities from methane hydrate-bearing deep marine sediments in a forearc basin[J]. Applied and Environmental Microbiology, 68(8): 3759-3770.
SU Xin, CHEN Fang, ZHANG Yong, WANG Yuan-yuan, JIAO Lu, JIANG Hong-chen, DONG Hai-liang. 2010. Geomicrobiology as a New Tool for Exploration of Marine Gas Hydrates[J]. Geoscience, 24(3): 409-423(in Chinese with English abstract). WANG Yong-li, FANG Xiao-min, YAN Bai, XI Xiao-xia, ZHANG Xu-zheng, WANG You-xiao. 2007. Lipid distribution and its climatic significancein in modern soil sample from continuous climate change area of China[J]. Science China Earth Sciences, 37(3): 286-396(in Chinese).
WU Shu-jiao. 2012. The qilian permafrost zone of gas hydrate culture microbial analysis and identification of a new species of bacteria[D]. Beijing: Beijing University of Chemical Technology(in Chinese with English abstract).
XIE Shu-cheng, LIANG Bin, GUO Jian-qiu, YI Yi, EVERSHED R, MADDY D, CHAMBERS F. 2003. Biomarkers and the related global change[J]. Quaternary Sciences, 23(5): 521-528(in Chinese with English abstract).
YAN Hui, CAI Zu-cong, ZHONG Wen-hui. 2006. PLFA analysis and its applications in the study of soil microbial diversity[J]. Acta Pedologica Sinica, 43(5): 851-859(in Chinese with English abstract).
ZELLES L. 1999. Fatty acid patterns of phospholipids and lipopolysaccharides in the characterisation of microbial communities in soil: a review[J]. Biology and Fertility of Soils, 29(2): 111-129.
ZHAO Da-yong, YAN Wen-ming, FENG Jing-wei, YUAN Shou-jun. 2009. Appl ications of Phosphol ipid Fatty Acid Analysis in the Microbial Ecology Studies of Lake Sediment[J]. Chemistry & Bioengineering, 26(012): 17-20(in Chinese with English abstract).
ZHOU Jue, LEI Ting. 2007. Review and prospects on methodology and affecting factors of soil microbial diversity[J]. Biodiversity Science, 15(3): 306-311(in Chinese with English abstract).
ZHU You-hai, LIU Ya-ling, ZHANG Yong-qin. 2006. Formation conditions of gas hydrate in permafrost of the Qilian Moutains, Northwest China[J]. Geological Bulletin of China, 25(1-2): 58-63(in Chinese with English abstract).
ZHU You-hai, ZHANG Yong-qin, WEN Huai-jun, LU Zhen-quan, JIA Zhi-yao, LI Yong-hong, LI Qing-hai, LIU Chang-ling, WANG Ping-kang, GUO Xing-wang. 2009. Gas Hydrates in the Qil ian Mountain Permafrost, Qinghai, Northwest China[J]. Acta Geologica Sinica, 83(11): 1762-1771(in Chinese with English abstract).
ZHU You-hai, ZHANG Yong-qin, WEN Huai-jun, LU Zhen-quan, WANG Ping-kang. 2010. Gas Hydrates in the Qilian Mountain Permafrost and Their Basic Characteristics[J]. Acta Geoscientica Sinica, 31(1): 7-16(in Chinese with English abstract).
Discrimination of Microbial Diversity by Fatty Acid in Drill Hole DK3 and DK6 in a Gas Hydrate Area, Qilian Mountain Permafrost
JIAO Lu1, 2), SU Xin1, 2)*, HUANG Xia3), LIU Hao-dong1, 2), HE Hao2), JIANG Hong-chen4), WANG Yong-li5)
1) State Key Laboratory of Biogeology and Environmental Geology, China University of Geosciences(Beijing), Beijing 100083; 2) School of Ocean Sciences, China University of Geosciences(Beijing), Beijing 100083; 3) Institute of Mineral Resources, Chinese Academy of Geological Sciences, Beijing 100037; 4) State Key Laboratory of Biogeology and Environmental Geology, China University of Geosciences(Wuhan), Wuhan, Hubei 430000; 5) Key Laboratory of Gas Geochemistry, Institute of Geology and Geophysics, Chinese Academy of Sciences, Lanzhou, Gansu 730000
The fatty acid (FA) method was used to evaluate microbial community diversity in (gas hydrate-bearing) Drill Hole DK3 and (hydrate-absent) Drill Hole DK6 in Qilian Mountain permafrost. 26 kinds of FA obtained in this study were divided into five types: BSFA, MUFA, CFA, PUFA and SSFA, with SFA being the dominantcomponent. Microbial community of the cores from the two drill holes contain gram positive bacteria, gram negative bacteria and fungi classified from specificity FA. Principal component analysis and cluster analyses of FA from the two cores were performed using the PAST (palaeontological statistics, version 1.21) program. No significant difference of microbial components was observed between DK3 and DK6, but there did exist obvious difference of microbial components between gas hydrate-bearing (or methane anomaly) layer and hydrate-absent (or methane anomaly-absent) layer. The authors found that C16:1, C18:1 and methane anomaly have very good corresponding relationship. These phenomena prove from another side that methane concentration and gas hydrate may affect microbial habitats in Drill Hole DK3 and DK6. This is the first study of FA composition characteristics in permafrost sediments, and the results enrich the distribution range of FA and also expand the distribution depth of fungi; nevertheless, more experiments are needed to prove the specific mechanism.
fatty acid; microbial diversity; gas hydrate; Qilian Mountain permafrost
Q547; Q938
A
10.3975/cagsb.2014.05.10
本文由天然氣水合物勘查與試采工程國家專項項目“陸域天然氣水合物環(huán)境監(jiān)測及效應研究”(編號: GZHL20110327)和中國地質大學(北京)基本科研業(yè)務費專項資金項目“祁連山凍土區(qū)天然氣水合物區(qū)沉積物中微生物多樣性研究”(編號: 2011PY0195)聯(lián)合資助。
2014-04-02; 改回日期: 2014-05-22。責任編輯: 魏樂軍。
焦露, 女, 1987年生。博士研究生。主要從事水合物區(qū)地質微生物研究。通訊地址: 100083, 北京市海淀區(qū)學院路29號。電話: 010-82334651。E-mail: littlebunny7@163.com。
*通訊作者: 蘇新, 女, 1957年生。教授, 博士生導師。主要從事微體古生物、海洋地質和天然氣水合物調查與研究。通訊地址: 100083,北京市海淀區(qū)學院路29號。電話: 010-82335403。E-mail: xsu@cugb.edu.cn。