諸葛小菊,陳仁聘,黃燮林,陳超,盧的一,黃智銘,吳金明,吳建勝
(1.溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院 消化內(nèi)科,浙江 溫州 325015;2.溫州醫(yī)科大學(xué) 仁濟(jì)學(xué)院,浙江溫州 325035)
胃癌的發(fā)病率高居惡性腫瘤的前4位,其發(fā)病過程受到多基因、多因素的影響[1]。越來越多的證據(jù)表明抑癌基因的失活在腫瘤發(fā)生發(fā)展中起重要作用。在胃癌癌變早期,抑癌基因的表觀遺傳學(xué)改變占有重要的地位,尤其是抑癌基因啟動子的異常甲基化[2]。
Lactotransferrin(LTF)基因位于人類染色體3p21.3區(qū)域,其在鼻咽癌、肺癌、前列腺癌等多種腫瘤及相應(yīng)的腫瘤細(xì)胞株呈現(xiàn)表達(dá)降低或缺失的狀態(tài),有研究[3-6]顯示這與該基因啟動子區(qū)域的異常甲基化高度相關(guān)。5-Aza-2’-deoxycytidine(5-aza-CdR)能結(jié)合DNA甲基轉(zhuǎn)移酶I并使其失活,逆轉(zhuǎn)抑癌基因的高甲基化狀態(tài),重新激活基因表達(dá)。而目前對于LTF基因在胃癌內(nèi)的研究尚少,因此本研究選擇胃癌細(xì)胞株BGC823,觀察LTF基因的表達(dá)和其啟動子甲基化狀態(tài),旨在研究胃癌細(xì)胞株內(nèi)LTF基因表達(dá)水平和啟動子異常甲基化的相關(guān)性,為胃癌臨床診斷治療提供一個新的可能靶點(diǎn)。
1.1 材料 人胃腺癌細(xì)胞株BGC823購于中國上??茖W(xué)院細(xì)胞庫;胎牛血清購于杭州四季青生物工程材料有限公司;PRMI-1640、PBS、青/鏈霉素100 U/mL購于Gibco公司;5-aza-CdR(Sigma公司),用培養(yǎng)基充分溶解配成適量濃度的母液,分裝后存于-80 ℃?zhèn)溆?;TRIzol購于Invitrogen公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒、real-time PCR試劑盒(SYBR?Green Re altime PCR Master Mix)購于日本TOYOBO公司;亞硫酸氫鈉修飾試劑盒購于美國ZYMO公司;Ex Taq HS DNA聚合酶、pMD 19-T Vector購于日本TaKaRa公司;抗體anti-Lactoferrin購于美國Abcam公司(77 kDa,1:1 000#ab10110;Abcam,Cambridge,UK);β-actin antibody購于中國碧云天(42 kDa,1:1 000,Beyotime,中國上海)。熒光定量PCR儀為BIO-RAD(型號CFX96)。
1.2 方法
1.2.1 細(xì)胞的培養(yǎng)和5-aza-CdR藥物處理:BGC82 3細(xì)胞用含10%胎牛血清的PRMI-1640培養(yǎng)液放置在37 ℃,5% C02的細(xì)胞培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)。以1×105均勻鋪入六孔板內(nèi),生長過夜。饑餓處理16 h,然后給予0 μmol/L(對照組)、2 μmol/L、10 μmol/L的5-aza-CdR藥物處理,24 h換液一次,培養(yǎng)5 d后處理細(xì)胞。
1.2.2 real-time PCR檢測藥物干預(yù)前后LTF基因mRNA表達(dá):取對照組和藥物處理組的回收細(xì)胞,用TRIzol提取細(xì)胞總RNA。約取1 μg總RNA根據(jù)反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書反應(yīng)得到20 μL體系的cDNA。以得到cDNA為模板,進(jìn)行real-time PCR反應(yīng)。引物由上海生工公司設(shè)計(jì)并合成,用GAPDH作為內(nèi)參,引物序列分別為上游5’-GACTCATGACCACAGTCCATGC-3’,下游5’-AGAGGCAGGGATGATGTTCTG-3’,擴(kuò)增產(chǎn)物長度113 bp。LTF引物序列分別為:上游5’-TACAAATC CCAACAAAGCAGTG-3’,下游5’-CTTCCACAGGTCTATCC ACACA-3’,產(chǎn)物大小約58 bp。20 μL PCR體系包括:Realtime PCR Master Mix 10 μL,Plus solution 2 μL,PCR Forward Primer(10 μmol/L)1.2 μL,PCR Reverse Primer(10 μmol/L)1.2 μL,模板cDNA 2 μL,ddH2O 3.6 μL。反應(yīng)條件是95 ℃預(yù)變性30 s,95 ℃ 5 s、62 ℃ 10 s、72 ℃ 15 s進(jìn)行40個循環(huán)。擴(kuò)增結(jié)束進(jìn)行熔解曲線分析來辨別是否有非特異性擴(kuò)增。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。數(shù)據(jù) 用2-ΔΔCt法分析。
1.2.3 Western blot法檢測藥物干預(yù)前后LTF基因蛋白表達(dá):回收對照組和藥物處理組細(xì)胞,加入適量的蛋白抽提cell lysis buffer(每孔50μg)裂解細(xì)胞,然后用BCA法測定蛋白質(zhì)的濃度。用12% SDS-聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行電泳,將蛋白用半干式電轉(zhuǎn)移法轉(zhuǎn)至硝酸纖維膜上,用5%脫脂牛奶TBST封閉硝酸纖維膜,室溫下?lián)u2 h。與一抗anti-Lactoferrin(77 kDa)結(jié)合(以TBS稀釋,濃度依抗體而定),4 ℃搖過夜,TBST洗4次,每次5 min,用β-actin antibody(42 kDa)作為內(nèi)參。加入二抗(以TBS稀釋,濃度依抗體而定),室溫?fù)u1 h,TBST洗4次,每次5 min。用ECL試劑盒進(jìn)行化學(xué)發(fā)光檢測。X線片壓片、顯影、定影。
1.2.4 亞硫酸氫鹽修飾DNA和BSP反應(yīng):取對照組和藥物處理組的回收細(xì)胞,按DNA提取試劑盒提取胃癌細(xì)胞株的基因組DNA。然后按甲基化修飾試劑盒進(jìn)行亞硫酸氫鈉修飾,使未甲基化的胞嘧啶(C)轉(zhuǎn)化成胸腺嘧啶(T),而甲基化的Cm不變。以修飾后基因組DNA為模板,用Ex Taq HS DNA聚合酶進(jìn)行LTF基因啟動子擴(kuò)增。LTF特異性引物參考文獻(xiàn)[5],分別是上游5’-TTGAGATTAGAGTTGGGATAGGG-3’,下游5’-CCCCCAAACACCTACACTCA-3’,產(chǎn)物長度為397 bp。其反應(yīng)體系為50 μL,包括:TaKaRa Taq HS 0.25 μL,10×PCR Buffer 5 μL,dNTP Mixture 4 μL,上游引物(10 μmol/L)1 μL,下游引物(10 μmol/L)1μL,模板DNA 1 μL(≤50 ng),ddH2O 37.75 μL。反應(yīng)條件為95 ℃變性15 min,94 ℃ 30 s、56℃ 30 s、72 ℃ 30 s進(jìn)行35次循環(huán),然后72 ℃延伸7 min。將獲得的PCR產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳,凝膠圖像分析系統(tǒng)記錄數(shù)據(jù)。
1.2.5 挑選陽性克隆和測序:于紫外燈下切取含目的DNA的條帶,按DNA凝膠回收試劑盒說明書對PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收純化。取回收純 化的DNA 4.5 μL,與pMD 19-T Vector 0.5 μL、solution I 5 μL配成10 μL體系,輕輕混勻后16 ℃連T載體12 h。取2.5 μL連接產(chǎn)物與25 μL的大腸桿菌感受態(tài)冰浴30 min,42 ℃水浴90 s,冰上放置3 min,加入不含氨芐青霉素的LB培養(yǎng)基600 μL,37 ℃,250 r/min振搖45 min,離心將菌液濃縮為15 μL,并涂于氨芐(100 μg/mL)抗性的LB平板上,先正面向上放置平板1 h風(fēng)干,翻轉(zhuǎn)倒置平板37 ℃培養(yǎng)過夜,12~16 h后即可長出菌落。隨機(jī)挑選15個單克隆菌落,放在500 μL LB液體培養(yǎng)基(含有氨芐青霉素100 μg/mL),搖渾濁菌液。用普通PCR鑒定陽性重組子,取1 μL搖渾的菌液做PCR模板,2×Taq酶Mix 5 μL,上下游通用引物各0.2 μL,ddH2O 3.6 μL構(gòu)成10 μL PCR體系進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)。用1.5%瓊脂糖凝膠電泳鑒定結(jié)果。最后送檢10個克隆于上海生工公司測序。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法 采用SPSS13.0統(tǒng)計(jì)軟件。real-time PCR結(jié)果和總體甲基化率組間比較采用單因素方差分析,組間兩兩比較采用t檢驗(yàn)。CpG位點(diǎn)甲基化率比較用行×列表卡方檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 胃癌細(xì)胞株BGC823 LTF基因的mRNA 表達(dá) 不同濃度5-aza-CdR處理胃癌細(xì)胞株BGC823后,藥物處理的兩組其mRNA表達(dá)較對照組明顯增加,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),但藥物處理組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。結(jié)果如圖1A所示。我們用Western blot方法檢測藥物干預(yù)前后LTF基因蛋白表達(dá),結(jié)果如圖2所示,對照組LTF表達(dá)低,兩個不同濃度的藥物組較對照組表達(dá)明顯增加。
圖2 5-aza-CdR藥物處理前后LTF的蛋白表達(dá)
2.2 胃癌細(xì)胞株BGC823藥物處理前后LTF基因甲基化情況 BSP結(jié)果電泳圖如圖3所示,目的條帶397 bp清晰。LTF基因連接T載體后挑選陽性克隆電泳結(jié)果如圖4所示,表明所選陽性單克隆概率高,達(dá)83.3%(5/6)。
圖3 LTF基因的BSP法電泳圖結(jié)果
圖4 LTF甲基化后目的DNA連T載體挑選陽性克隆電泳圖
BGC823被不同濃度5-aza-CdR處理后LTF其總體甲基化率統(tǒng)計(jì)見圖1B,其中對照組表明胃癌 細(xì)胞株BGC823明顯高甲基化,而藥物處理后的兩組啟動子甲基化情況被逆轉(zhuǎn),且兩個藥物處理組和對照組比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(甲基化率對照組為53.6%,藥物濃度2μmol/L組為27.9%,濃度10μmol/L組為35.0%)(P<0.05),但藥物處理組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。LTF基因啟動子區(qū)14個CpG位點(diǎn)甲基化情況如圖5顯示,其中3、4、5、8、10、11、12、13、14號CpG位點(diǎn)甲基化程度超過50%,呈高甲基化狀態(tài)。而用5-aza-CdR處理后,與對照組相比,14號位點(diǎn)甲基化情況幾乎沒有變化,3、8這兩個CpG位點(diǎn)甲基化率較對照組明顯降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。
胃癌的發(fā)生機(jī)制是涉及多因素多步驟的一個過程,主要包括遺傳性因素和表觀遺傳學(xué)因素改變的堆積,而后者主要包括啟動子區(qū)甲基化、雜合性丟失、組蛋白修飾三方面。越來越多的研究表明DNA啟動子區(qū)甲基化在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中占有重要的地位。Lund等[7]認(rèn)為DNA甲基化在某種時候甚至超越基因缺失和基因突變,是抑癌基因失活的唯一機(jī)制。DNA甲基化是一可逆過程,5-aza-CdR作為一種甲基化轉(zhuǎn)移酶,可以成功逆轉(zhuǎn)DNA的甲基化程度,使得原先因甲基化而失活的基因能夠重新表達(dá)或表達(dá)增強(qiáng),恢復(fù)正常的細(xì)胞調(diào)控功能。這提示去甲基化劑治療能夠逆轉(zhuǎn)基因的甲基化狀態(tài),具有一定的應(yīng)用前景。
圖5 5-aza-CdR藥物處理前后LTF基因啟動子區(qū)14個CpG位點(diǎn)甲基化情況
研究發(fā)現(xiàn)人體染色體3p21.3區(qū)域存在一群高密度分布的腫瘤抑制基因簇(TSGs),該區(qū)域的抑癌基因在肺癌、乳腺癌、腎癌和其他腫瘤中常常表達(dá)缺失[8]。LTF基因,亦是其中重要一員,編碼乳鐵蛋白(lactoferrin,LF),其主要存在于哺乳動物的乳液、唾液、淚液、精液等外分泌物中,能參與體內(nèi)鐵代謝、抗菌、細(xì)胞生長和分化、免疫調(diào)節(jié)和抗炎癥反應(yīng)、抗氧化反應(yīng)等多種生物學(xué)效應(yīng)[9-10]。近來研究發(fā)現(xiàn),LF在抑制腫瘤生長、轉(zhuǎn)移,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡方面也有重要作用[11]。
Iijima等[5]報道LTF基因在59%(16/27)小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株,77%(33/43)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株,54%(7/33)原發(fā)性非小細(xì)胞肺癌內(nèi)表達(dá)缺失,且與DNA甲基化高度相關(guān)。研究[6]發(fā)現(xiàn)LTF基因mRNA在74%前列腺癌患者中呈低表達(dá),而且LTF相對高表達(dá)的前列腺癌患者有更好的預(yù)后,這反映LTF在前列腺癌患者中有保護(hù)性的功能。DNA去甲基化劑地西他濱(decitabine)能使LTF基因在前列腺癌細(xì)胞株LAPC4中被強(qiáng)激活表達(dá)。LTF基因在多種腫瘤內(nèi)表現(xiàn)為一種有潛力的抑癌基因,其失活機(jī)制和DNA啟動子區(qū)高度甲基化相關(guān)。本研究觀察藥物處理組和對照組發(fā)現(xiàn),隨著藥物處理組DNA甲基化率的下降,其LTF mRNA表達(dá)增加,這說明LTF基因在胃癌里的表達(dá)是可以被逆轉(zhuǎn)的,而且其機(jī)制和DNA甲基化高度相關(guān)。但是兩個藥物處理組間的甲基化率和mRNA表達(dá)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,這可能和5-aza-CdR對BGC823的去甲基化作用達(dá)到平臺期相關(guān)。重亞硫酸鹽修飾DNA測序法,是公認(rèn)的DNA甲基化分析的金標(biāo)準(zhǔn)。本研究用該方法檢測發(fā)現(xiàn),低分化型胃癌細(xì)胞株BGC823啟動子區(qū)甲基化程度高達(dá)53.6%,該段DNA啟動子區(qū)含有14個CpG島,CpG島是一段長約1 kb的富含飾CpG和GpC序列的DNA結(jié)構(gòu)。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)3、4、5、8、10、11、12、13、14號CpG位點(diǎn)甲基化程度超過50%,呈高甲基化狀態(tài),而用5-aza-CdR處理后,14號位點(diǎn)甲基化率幾乎沒有變化,而3、8這兩個CpG位點(diǎn)甲基化率較對照組下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),猜測這兩個位點(diǎn)和LTF基因在胃癌中的表達(dá)缺失及逆轉(zhuǎn)其表達(dá)可能相關(guān)。
大量研究證明LF在體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)中有抗腫瘤作用[12-14],但是其機(jī)制目前并不明確。LF能以影響細(xì)胞周期的正常運(yùn)轉(zhuǎn)來抑制腫瘤細(xì)胞的增殖,Zhang等[4]用LTF轉(zhuǎn)染鼻咽癌細(xì)胞株后,發(fā)現(xiàn),細(xì)胞停滯在G1期,而S期、G2-M期細(xì)胞減少。有研究[15]認(rèn)為LF能以調(diào)節(jié)細(xì)胞周期相關(guān)蛋白和抑癌基因(p53和Rb)的表達(dá)來影響細(xì)胞周期的整個進(jìn)程。但是亦有報道持不同意見,認(rèn)為LF補(bǔ)給治療能調(diào)節(jié)MAPK(mitogenactivated protein kinase)通路卻不會影響p53的表達(dá)[14]。體外實(shí)驗(yàn)證明注射LF能抑制小鼠體內(nèi)移植實(shí)體瘤的大小,F(xiàn)ujita等[16]發(fā)現(xiàn)LF在小鼠結(jié)腸癌發(fā)展過程中,激活Fas信號通路導(dǎo)致結(jié)腸癌細(xì)胞的凋亡。當(dāng)然,對于LTF基因在胃癌內(nèi)的抑癌機(jī)制是否涉及以上幾種,需更多的實(shí)驗(yàn)研究。
DNA甲基化作為表觀遺傳學(xué)重要機(jī)制之一,其本身優(yōu)勢在于不涉及基因序列的改變就可以調(diào)控基因的表達(dá),并且能夠被甲基化轉(zhuǎn)移酶抑制劑逆轉(zhuǎn)。5-aza-CdR,作為一種甲基化轉(zhuǎn)移酶,已成功應(yīng)用于白血病的臨床治療[17],這對抑癌基因甲基化異常相關(guān)的腫瘤來說是個成功的例子。針對LTF基因在胃癌內(nèi)表達(dá)和基因甲基化機(jī)制的關(guān)聯(lián),提示我們未來可能通過甲基化轉(zhuǎn)移酶抑制劑來進(jìn)行腫瘤的預(yù)防和早期治療,當(dāng)然這還需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)及臨床研究。
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