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胞質(zhì)型磷脂酶A2基因克隆及其表達(dá)量隨大黃魚仔稚魚生長(zhǎng)發(fā)育的變化

2014-09-20 02:18:56馮碩恒謝奉軍蔡佐楠麥康森艾慶輝
關(guān)鍵詞:稚魚磷脂酶大黃魚

馮碩恒 謝奉軍 蔡佐楠 麥康森 艾慶輝

(中國(guó)海洋大學(xué),農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)與飼料重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海水養(yǎng)殖教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,青島 266003)

磷脂是分子中含有磷酸的復(fù)合極性脂,在仔稚魚發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。首先,磷脂是細(xì)胞膜的重要組成成分[1],對(duì)維持細(xì)胞膜功能的完善起著重要作用;其次,魚類利用極性脂的能力要高于中性脂,因此,磷脂在胚胎發(fā)育階段和仔稚魚早期階段發(fā)揮著重要的供能作用[2-4];此外,磷脂分解代謝還能產(chǎn)生類二十烷酸、二脂酰甘油和肌醇磷酸等生物活性物質(zhì),對(duì)維持魚類正常的生理活動(dòng)具有重要意義[5]。目前,在水產(chǎn)動(dòng)物上的研究表明,微顆粒飼料中添加磷脂可顯著提高仔稚魚的生長(zhǎng)、存活、抗應(yīng)激能力、脂肪吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)以及飼料的適口性[6-13]。然而,在魚類上對(duì)磷脂代謝的研究卻較少。

目前,諸多學(xué)者認(rèn)為魚類磷脂分解代謝機(jī)制與哺乳動(dòng)物是一致的,即在腸道內(nèi)由胰腺分泌的磷脂酶A2(PLA2)水解產(chǎn)生游離的脂肪酸和溶血磷脂,再被腸細(xì)胞吸收[14]。根據(jù)磷脂酶起作用的酯鍵不同,磷脂酶分為 A1、A2、C和 D型。由于PLA2能特異性水解磷脂sn-2位的脂肪酸,產(chǎn)生溶血磷脂和游離脂肪酸,溶血磷脂和游離的脂肪酸分別在高等動(dòng)物膜磷脂更新[15]和炎性反應(yīng)[16]過(guò)程中發(fā)揮重要作用,因此對(duì)PLA2的研究在哺乳動(dòng)物中已成為焦點(diǎn)。Zambonino等[17]的研究發(fā)現(xiàn),在海水仔稚魚開(kāi)口后幾天就能檢測(cè)到PLA2。早期在真鯛肝胰腺中的研究發(fā)現(xiàn)PLA2有2種亞型,且其分子質(zhì)量較低的屬于Ca2+依賴型酶[18]。此外,Saele等[19]在大西洋鮭上確定了 PLA2-ⅠB 的序列,并在基因和蛋白質(zhì)水平上闡述了其隨大西洋鮭生長(zhǎng)發(fā)育的變化。隨后,F(xiàn)ujikawa等[20]在真鯛上也發(fā)現(xiàn)了PLA2的新亞型PLA2-ⅠB,并對(duì)其在消化器官中的組織分布做了詳細(xì)闡述。在魚類上,已克隆到斑馬魚(Danio rerio,GenBank登錄號(hào):AAA53229.1)、尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus,GenBank 登錄號(hào):XP_003445168.2)、青鳉(Oryziaslatipes,GenBank登 錄 號(hào):XP_004068057.1)和紅鰭東方鲀(Takifugu rubripes,GenBank登錄號(hào):XP_003978485.1)等胞質(zhì)型磷脂酶A2(cPLA2)的cDNA全長(zhǎng)或部分序列。但是,cPLA2基因表達(dá)與仔稚魚生長(zhǎng)發(fā)育之間的關(guān)系鮮有報(bào)道。

Mai等[21]從組織學(xué)的角度系統(tǒng)分析了大黃魚仔稚魚到幼魚早期階段消化系統(tǒng)的變化情況。近年來(lái),Zhao 等[13]、Xie 等[22]和 Li等[23]的研究均發(fā)現(xiàn)消化酶活力的大小在一定程度上能反映大黃魚仔稚魚消化系統(tǒng)的完善與否。然而,在轉(zhuǎn)錄水平上cPLA2的基因表達(dá)與大黃魚仔稚魚消化系統(tǒng)發(fā)育之間的關(guān)系卻未見(jiàn)報(bào)道。

大黃魚是我國(guó)特有的養(yǎng)殖種類,因其具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值,在我國(guó)東南沿海地區(qū)大黃魚的人工養(yǎng)殖得到廣泛推廣[24-26]。因此,本試驗(yàn)旨在克隆大黃魚磷脂分解代謝關(guān)鍵酶cPLA2基因的cDNA全長(zhǎng),并分析cPLA2基因表達(dá)量隨大黃魚仔稚魚生長(zhǎng)發(fā)育的變化趨勢(shì),同時(shí)探究大黃魚消化系統(tǒng)發(fā)育與cPLA2基因表達(dá)變化之間的關(guān)系。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)用魚與飼養(yǎng)管理

試驗(yàn)在福建省寧德水產(chǎn)技術(shù)推廣站進(jìn)行。試驗(yàn)用魚為該推廣站2012年3月份人工繁育的大黃魚魚苗。試驗(yàn)期間所用海水經(jīng)室外蓄水池沉淀,2級(jí)砂濾池濾過(guò),進(jìn)育苗池前再經(jīng)過(guò)濾袋過(guò)濾。試驗(yàn)期間,水溫(23±1)℃,pH 8.0±0.2,鹽度(23±2)‰。每桶內(nèi)設(shè)1個(gè)氣石,桶內(nèi)海水每天的換水量為150%~300%。白天水表面的光強(qiáng)度為100 lx左右。每天用聚乙烯管將漂浮在水面的污物及時(shí)去除,用虹吸管將桶底的殘余飼料、糞便和死苗及時(shí)吸出。從3~8日齡投喂輪蟲(Brachionus plicatilis),6~11日齡投喂鹵蟲無(wú)節(jié)幼體,10~16日齡投喂鮮活橈足類,之后到40日齡投喂冷藏橈足類,每天飽食投喂 5 次(06:00、08:30、12:00、14:30和 17:00)。

1.2 取樣

魚苗孵化出來(lái)后,從1日齡開(kāi)始取樣,隨后在3、7、11、15日齡時(shí)直接從育苗池中取樣。每個(gè)時(shí)間點(diǎn)隨機(jī)取3組,每組50尾魚。15日齡時(shí)隨機(jī)挑選規(guī)格整齊、體質(zhì)健壯、活力好的初始體重為(4.08±0.11)mg魚苗9 000尾,隨機(jī)放養(yǎng)于3個(gè)藍(lán)色塑料桶(180 L)內(nèi),每桶3 000尾。在19、25、30、35和40日齡分別從3個(gè)養(yǎng)殖桶內(nèi)隨機(jī)取50尾魚,樣品保存在-80℃,用來(lái)分析cPLA2基因的表達(dá)。40日齡時(shí),隨機(jī)取6尾大黃魚仔稚魚的肝臟,取后馬上置于液氮中,并儲(chǔ)存于-80℃中,用于cPLA2基因的克隆。

1.3 總RNA提取、cDNA合成和cPLA2基因的克隆

采用Trizol Reagent提取大黃魚幼魚(體重在20 g左右)肝臟總RNA,經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳、GoldView染色顯示28S、18S和5S以檢測(cè)RNA的完整性,并用分光光度計(jì)檢測(cè)總RNA的濃度及純度。采用TaKaRa反轉(zhuǎn)錄用PrimerScript RT Reagent Kit合成cDNA第1鏈。以GenBank中斑馬魚、大西洋鮭、尼羅羅非魚、青鳉、紅鰭東方鲀、人和鼠等物種的氨基酸序列為模板,利用CODHOP(http://bioinformatics.weizmann.ac.il/blocks/codehop.html)設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物cPLA21F和cPLA21R(表1)。然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),克隆大黃魚cPLA2基因的部分片段。cPLA25'端和3'端非編碼區(qū)的擴(kuò)增采用Clonetech SMARTTMRACE cDNA擴(kuò)增試劑盒,按照說(shuō)明書進(jìn)行操作,采用的特異性引物分別為cPLA22F和cPLA22R(表1)。將獲得的PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后克隆到pEASY-T1載體上,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞上,挑選陽(yáng)性克隆送往上海博尚生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序。

1.4 序列分析和進(jìn)化樹構(gòu)建

應(yīng)用NCBI上的BLAST工具(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)將克隆的基因進(jìn)行同源性比對(duì)分析,并推斷其開(kāi)放閱讀框(ORF)和編碼的氨基酸序列。使用軟件TMHMM(http:www.cbs.dtu.dk/services)來(lái)預(yù)測(cè)基因的跨膜域。使用SMART(http://smart.emblheidelberg.de/)和PROSITE軟件(http://kr.expasy.org/prosite/)來(lái)預(yù)測(cè)氨基酸序列中的功能位點(diǎn)或氨基酸結(jié)構(gòu)域。使用ProtParam程序(http://www.expasy.ch/tools/protparam.html)來(lái)計(jì)算氨基酸序列的物理和化學(xué)參數(shù)。根據(jù)選擇的相關(guān)基因序列使用CLUSTAL X1.83[27]和 MEGA 4.0[28]軟 件 來(lái) 構(gòu) 建 物 種 間cPLA2基因的物種系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。使用鄰位相連(neighbor-joining)法構(gòu)建進(jìn)化樹[29]。

表1 本試驗(yàn)中用到的引物序列Table 1 Sequences of primers used in this experiment

1.5 cPLA2基因的定量表達(dá)

采用實(shí)時(shí)定量PCR法來(lái)檢測(cè)cPLA2基因的表達(dá)量隨大黃魚仔稚魚生長(zhǎng)發(fā)育的變化。實(shí)時(shí)定量PCR引物為PLA23F和PLA23R(表1)。

實(shí)時(shí)定量PCR體系為25 μL,其中上、下游引物(10 μmol/L)各 1 μL,第 1 鏈 cDNA 1 μL,2×SYBR Premix Ex TaqTMⅡ (TaKaRa,日 本)12.5 μL和9.5 μL的無(wú)菌水。定量?jī)x器為實(shí)時(shí)定量 PCR 儀 (Mastercyclereprealplex,Eppendorf,德國(guó))。實(shí)時(shí)定量的程序?yàn)?5℃持續(xù)2 min,1個(gè)循環(huán);95℃持續(xù)10 s,58.7℃持續(xù)10 s,72℃持續(xù)20 s,共計(jì)40個(gè)循環(huán)。之后,進(jìn)行熔解曲線以檢驗(yàn)每個(gè)PCR反應(yīng)只有1個(gè)PCR產(chǎn)物。通過(guò)4倍梯度稀釋得到5個(gè)不同濃度的cDNA模板,以每個(gè)濃度cDNA為模板,通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR得出每對(duì)引物每個(gè)濃度cDNA的循環(huán)數(shù)(Ct)值,以Ct值為縱坐標(biāo),模板拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)為橫坐標(biāo),擬合得到一條隨拷貝數(shù)變化的Ct值的直線,根據(jù)擬合得到的直線斜率和擴(kuò)增效率的計(jì)算公式E=10(-1/Slope)-1(式中:E為擴(kuò)增效率;Slope為斜率),得出每對(duì)引物的擴(kuò)增效率。在本試驗(yàn)中,目的基因cPLA2的擴(kuò)增效率為0.909 8,內(nèi)參基因β-actin的擴(kuò)增效率為 0.978 3。由于 ΔCt(ΔCt=Ct目的基因-Ct內(nèi)參基因)的絕對(duì)值為0.041,約等于0,表明目的基因和內(nèi)參基因擴(kuò)增效率基本一致,采用2-ΔΔCt方法測(cè)定目的基因的表達(dá)量[30]。

1.6 統(tǒng)計(jì)分析

結(jié)果采用SPSS 16.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,在單因素方差分析(one-way ANOVA)達(dá)到顯著水平(P<0.05)時(shí),采用Tukey’s檢驗(yàn)進(jìn)行多重比較,數(shù)據(jù)表示為平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤。

2 結(jié)果與分析

2.1 基因序列特征分析

通過(guò)序列分析可知,cPLA2基因cDNA全長(zhǎng)共計(jì)2 550 bp,其中5'端非編碼區(qū)176 bp,開(kāi)放閱讀框 2 169 bp,3'端非編碼區(qū) 205 bp,共編碼 723 個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)所編碼的蛋白質(zhì)的分子質(zhì)量為81.98 ku,理論等電點(diǎn)為5.21,將該序列提交至GenBank,獲得登錄號(hào)為 KF006240.1。軟件分析預(yù)測(cè)該蛋白質(zhì)可能含有42個(gè)磷酸化位點(diǎn),包括24個(gè)絲氨酸位點(diǎn)、9個(gè)蘇氨酸位點(diǎn)和9個(gè)酪氨酸位點(diǎn)(圖 1)。

2.2 序列比對(duì)和進(jìn)化樹分析

推導(dǎo)的大黃魚cPLA2基因的氨基酸序列與斑馬魚、紅鰭東方鲀、尼羅羅非魚和青鳉的cPLA2基因的氨基酸序列分別有75.80%、89.35%、87.96%和86.31%的相似性(圖2)。系統(tǒng)進(jìn)化樹也顯示克隆到的大黃魚cPLA2基因與上述這幾種魚類的親緣關(guān)系較近,與其他物種的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖3)。

圖1 大黃魚cPLA2基因的cDNA全長(zhǎng)核苷酸序列及其推導(dǎo)的氨基酸序列Fig.1 cDNA full long nucleotide sequence and deduced amino acid sequence of cPLA2gene of large yellow croaker

圖2 大黃魚與其他9種生物cPLA2基因氨基酸序列比對(duì)結(jié)果*Fig.2 Alignment results of cPLA2gene amino acid sequence between large yellow croaker and other 9 species

* 因像素較低,排版后圖片顯示不清,如有需要,可與作者聯(lián)系索取。

圖3 大黃魚與其他物種cPLA2基因氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹聚類分析Fig.3 Cluster analysis of phylogenetic tree of cPLA2gene amino acid sequence between large yellow croaker and other species

2.3 cPLA2基因表達(dá)量隨大黃魚仔稚魚生長(zhǎng)發(fā)育的變化

由圖4可知,孵化后,大黃魚仔稚魚cPLA2基因的表達(dá)量隨日齡的增加先顯著升高(1、3、7日齡vs.15日齡,P<0.05),在15日齡時(shí)達(dá)到最高值,隨后顯著下降(15日齡vs.19日齡,P<0.05),之后趨于平穩(wěn)。

圖4 大黃魚仔稚魚cPLA2基因表達(dá)量隨日齡增加的變化Fig.4 Change of expression level of cPLA2gene with days of age increasing of large yellow croaker larvae

3 討論

采用同源克隆和cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)克隆到大黃魚cPLA2基因的cDNA全長(zhǎng)。首先通過(guò)分子質(zhì)量大小確定本試驗(yàn)中克隆到的PLA2屬于胞質(zhì)型的,多序列比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)克隆到的基因與cPLA2基因相似度較高。序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)大黃魚cPLA2基因與其他魚類親緣關(guān)系較近,與哺乳動(dòng)物親緣較遠(yuǎn),符合進(jìn)化規(guī)律。在鼠上的研究發(fā)現(xiàn),cPLA2基因包括脂質(zhì)結(jié)合的Ca2+依賴的C2結(jié)構(gòu)域和起催化作用的α/β水解酶結(jié)構(gòu)域[31]。這 2 個(gè)結(jié)構(gòu)域影響 cPLA2的催化活性[32]。C2結(jié)構(gòu)域與內(nèi)膜結(jié)合是由神經(jīng)酰胺-1-磷酸的作用決定的,C2結(jié)構(gòu)域包含一段精氨酸、精氨酸和組氨酸高度保守序列(RxRH),而RxRH可以調(diào)節(jié)神經(jīng)酰胺-1磷酸的特異性[33]。通過(guò)多序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),只有斑馬魚的cPLA2基因存在RxRH,而其他幾種魚類的保守序列是精氨酸、蘇氨酸、賴氨酸和組氨酸(RTKH)。這說(shuō)明大黃魚cPLA2與膜結(jié)合的調(diào)節(jié)機(jī)制可能與哺乳動(dòng)物的不太一致,需要進(jìn)一步的研究。此外,脂肪酶的保守序列甘氨酸、絲氨酸、甘氨酸和絲氨酸(GxSGS)存在大黃魚的cPLA2基因中,且與其他物種高度保守。GxSGS還是區(qū)別cPLA2與其他類型PLA2的標(biāo)志[34]。

磷脂是魚類胚胎發(fā)育和早期發(fā)育階段重要的供能物質(zhì)[5]。3日齡以前大黃魚仔魚生長(zhǎng)主要依靠卵黃囊營(yíng)養(yǎng),在這個(gè)階段磷脂被磷脂酶水解,進(jìn)而發(fā)揮其供能作用,因此在剛孵化出(1日齡)的大黃魚仔魚可中檢測(cè)到cPLA2基因的表達(dá)。Zambonino等[17]發(fā)現(xiàn)海鱸仔稚魚開(kāi)口覓食后幾天就能檢測(cè)到PLA2,這與本試驗(yàn)的結(jié)果一致。盡管從3日齡起大黃魚已經(jīng)開(kāi)口攝食,開(kāi)始接受外源性營(yíng)養(yǎng)(輪蟲),但是在7日齡之前卵黃囊內(nèi)營(yíng)養(yǎng)成分并未完全消耗掉[21]。從 3~7日齡,PLA2基因的表達(dá)量開(kāi)始升高,但是并沒(méi)有出現(xiàn)顯著性差異,這可能因?yàn)樯镳D料體內(nèi)磷脂酶存在的緣故。隨著生長(zhǎng)發(fā)育的繼續(xù),7日齡時(shí)大黃魚稚魚的食道延長(zhǎng),分為明顯的黏液分泌部位和起運(yùn)輸功能的部位[21],消化機(jī)能逐漸增強(qiáng),開(kāi)始投喂不同種類的生物餌料。15日齡(投喂鮮活橈足類)時(shí)cPLA2基因的表達(dá)量到最大值,這可能是大黃魚保持機(jī)體磷脂動(dòng)態(tài)平衡的一種機(jī)制。19日齡時(shí),cPLA2基因的表達(dá)量出現(xiàn)顯著下降,之后變得平穩(wěn)。21日齡時(shí)大黃魚稚魚形成胃腺[21],胃腺的形成減輕了胰腺的負(fù)擔(dān),進(jìn)而使cPLA2基因的表達(dá)量下降,cPLA2的分泌也下降。

4 結(jié) 論

大黃魚從仔稚魚到幼魚早期的變形過(guò)程中,磷脂分解代謝的關(guān)鍵酶cPLA2基因的表達(dá)量呈現(xiàn)有規(guī)律的變化,這可能對(duì)機(jī)體保持體內(nèi)磷脂的動(dòng)態(tài)平衡、維護(hù)細(xì)胞膜的流動(dòng)性具有重要的意義。大黃魚仔稚魚cPLA2基因表達(dá)量的變化趨勢(shì)在一定程度上可以衡量大黃魚消化系統(tǒng)的發(fā)育情況。

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