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生物節(jié)律基因Timeless的生物學(xué)功能研究進(jìn)展

2014-10-27 09:04:46宋何煜張耀江紅
生物技術(shù)通訊 2014年3期
關(guān)鍵詞:檢測(cè)點(diǎn)節(jié)律細(xì)胞周期

宋何煜,張耀,江紅

北京交通大學(xué) 理學(xué)院生命科學(xué)與生物工程研究院,北京 100044

生物節(jié)律是生物體普遍存在的生命現(xiàn)象,參與多種生命活動(dòng)的調(diào)控。目前在哺乳動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)有10種節(jié)律基因,分別是Per1、Per2、Per3、Cry1、Cry2、Clock、Bmal1、Timeless、NPAS2和CK1ε。生物節(jié)律是由幾種核心節(jié)律基因通過(guò)轉(zhuǎn)錄-翻譯反饋環(huán)控制和維持的,反饋環(huán)由正激活因子(Clock和Bmal1)、負(fù)效應(yīng)因子(Per1、Per2、Per3、Cry1、Cry2和Timeless)和調(diào)節(jié)因子(CK1ε)組成[1]。Timeless是生物節(jié)律和細(xì)胞周期的直接連接者,同時(shí)參與ATR-Chk1和ATMChk2兩大DNA損傷修復(fù)通路[2],在肺和腎的胚胎發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用[3]。并且,在多種癌組織中檢測(cè)到Timeless表達(dá)水平與癌旁非癌組織相比明顯不同[4-10],提示它可能和癌癥的發(fā)生和預(yù)后密切相關(guān)。我們簡(jiǎn)要總結(jié)了Timeless在生物節(jié)律、細(xì)胞周期、胚胎發(fā)育、癌癥發(fā)生發(fā)展和診療中的生物學(xué)功能研究進(jìn)展。

1 Timeless基因的結(jié)構(gòu)

Timeless是Michael等在篩選影響果蠅生物節(jié)律的突變體時(shí)發(fā)現(xiàn)的,位于果蠅第2多線染色體的左臂,dpp和dp基因之間[11]。不同物種中都有Timeless同源基因的存在(表1)。人類的Timeless基因位于第12號(hào)染色體,全基因長(zhǎng)約43 kb,編碼由1208個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白TIMELESS,該蛋白在細(xì)胞質(zhì)中形成后,與PER家族成員形成二聚體入核[12]。

表1 不同生物Timeless基因的信息

2 Timeless在生物節(jié)律中的功能

生物節(jié)律是生物的一種生理和行為的周期性振蕩[19],大部分生物的節(jié)律周期為24 h;在不同物種的生物節(jié)律活動(dòng)中,Timeless的作用各不相同。

在果蠅中,當(dāng)CLOCK-CYCLE二聚體激活Per和Timeless的表達(dá)時(shí),新的節(jié)律周期開(kāi)始。在黑暗條件下,PER-TIMELESS二聚體入核后,抑制CLOCKCYCLE的活性,降低其表達(dá)水平,從而終止節(jié)律周期[20]。光照可以激活光受體CRY,它和Timeless結(jié)合后引起TIMELESS的泛素化降解,節(jié)律周期發(fā)生轉(zhuǎn)換[21]。蛋白激酶CK2可以對(duì)TIMELESS進(jìn)行磷酸化修飾,增加細(xì)胞質(zhì)中Timeless的表達(dá)水平,從而縮短節(jié)律周期[21]。在小鼠視交叉上核,下調(diào)Timeless表達(dá)水平會(huì)使Per1、Per2和Per3表達(dá)水平降低,而Cry1和Cry2表達(dá)水平升高[22],Per1和Per2表達(dá)水平降低可使節(jié)律周期的振幅降低[23],Cry是Per的負(fù)調(diào)控因子,缺失Cry1和Cry2的小鼠會(huì)出現(xiàn)節(jié)律紊亂[24]。細(xì)胞周期激酶CHEK1可以和Timeless及CK2發(fā)生相互作用,CHEK1表達(dá)水平降低可使小鼠的節(jié)律周期至少縮短1 h[25],而下調(diào)DNA解旋酶結(jié)合蛋白CDH4的表達(dá)水平可以延長(zhǎng)節(jié)律周期。

3 Timeless在細(xì)胞周期中的功能

細(xì)胞周期的順利進(jìn)行依賴于細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)機(jī)制的存在,其中的DNA損傷檢測(cè)點(diǎn)能夠延遲和阻止細(xì)胞分裂,主要有ATM(ataxia telangiectasia mutat?ed)依賴的 Chk2和 ATR(ataxia telangiectasia and Rad3-related)依賴的Chk1等2條DNA損傷信號(hào)通路[2]。出芽酵母Tof1基因和裂殖酵母Swi1基因可以激活DNA損傷檢測(cè)點(diǎn),同時(shí),Swi1可以阻止復(fù)制叉解體[19]。Tim-1是線蟲(chóng)染色體凝聚的必需因子,在DNA復(fù)制中扮演著重要的角色,它的缺失會(huì)引起線蟲(chóng)胚胎死亡?;趯?duì)線蟲(chóng)、果蠅和小鼠的TIMELESS同源物的比較,Barbara等[26]認(rèn)為T(mén)IMELESS樣蛋白保守的功能不僅僅是生物節(jié)律調(diào)節(jié),同時(shí)調(diào)控染色體的凝聚。在小鼠和人類細(xì)胞中,Timeless和復(fù)制叉共同移動(dòng),它是復(fù)制子復(fù)合體的成員之一,它和Tip?in的相互作用可以穩(wěn)定復(fù)制叉和促進(jìn)姊妹染色單體凝聚[27]。Timeless或一些蛋白(如Hus1、claspin、Chk1和Tipin)的失活可以逆轉(zhuǎn)紫外線(UV)對(duì)DNA合成的抑制作用[28]。當(dāng)DNA損傷發(fā)生時(shí),Tim-Tipin復(fù)合體啟動(dòng)UV介導(dǎo)的S期細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn),下調(diào)Time?less會(huì)抑制S期細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)的激活,這些正好說(shuō)明在小鼠Timeless缺失會(huì)引起胚胎致死現(xiàn)象[29]。雖然端粒長(zhǎng)度的維護(hù)依賴于端粒酶,但Timeless和Shelterin家族成員TRF1和TRF2相互作用,在端粒的DNA重復(fù)區(qū)域阻止復(fù)制叉降解,促進(jìn)DNA復(fù)制,進(jìn)而維護(hù)端粒長(zhǎng)度,保證染色體完整性的維持[30]。

當(dāng)DNA復(fù)制被UV或羥基脲(HU)干擾后,抑制ATR-Chk1通路中蛋白的表達(dá),促進(jìn)早熟染色質(zhì)凝聚(prematurechromosomecondensation,PCC)[19]。小鼠[31]和人類[2]的Timeless和Chk1相互作用,介導(dǎo)復(fù)制檢測(cè)點(diǎn)信號(hào)從ATR向Chk1傳遞,而Timeless的缺失也會(huì)引起PCC,提示Timeless參與了ATR-Chk1依賴的復(fù)制檢測(cè)點(diǎn)調(diào)控。阿霉素(doxorubicin,Dox)是一種治療癌癥的常用藥物,能夠激活A(yù)TM-Chk2反應(yīng)通路,使細(xì)胞周期阻滯在G2/M期。人類Time?less不能激活A(yù)TM,但能激活A(yù)TM依賴的Chk2,下調(diào)Timeless使腫瘤細(xì)胞對(duì)Dox的細(xì)胞毒性更敏感[2],提示降低Timeless表達(dá)水平的藥物可以作為提高Dox抗瘤效果的增敏劑。

4 Timeless在小鼠組織胚胎的發(fā)育中的作用

Timeless對(duì)小鼠胚胎發(fā)育至關(guān)重要,它在器官發(fā)生的初期廣泛表達(dá)于大腦、肺、心臟、肝、胃和尿生殖嵴等[3],如果缺失可導(dǎo)致胚胎死亡率升高[32]。在胚胎的肺、肝、腎及神經(jīng)上皮的發(fā)育過(guò)程中,Timeless表達(dá)水平較高,對(duì)上皮形成具有重要作用[33]。在9.5 d的胚胎,肺開(kāi)始形成,Timeless存在于上皮細(xì)胞和間充質(zhì)細(xì)胞中;在15 d胚胎的呼吸道上皮中Timeless仍維持較高的表達(dá)水平,但在間充質(zhì)中的表達(dá)水平降低。Northern印跡結(jié)果也提示與18 d的小鼠胚胎和成體小鼠相比,Timeless在15 d的小鼠胚胎中表達(dá)水平最高。在肺發(fā)育過(guò)程中,Timeless表達(dá)水平的動(dòng)態(tài)變化對(duì)肺的發(fā)育是至關(guān)重要的[3]。

在分支形成的器官中,Timeless基因的功能高度保守[3]。在腎發(fā)育過(guò)程中,輸尿管芽分支形成時(shí),Timeless是一種分化表達(dá)序列,在胚胎中的表達(dá)方式與其在成體中的表達(dá)不同。Timeless表達(dá)水平降低會(huì)抑制腎的胚胎發(fā)育,提示在腎發(fā)生和其他上皮器官形成中有重要作用[33]。

5 Timeless在腫瘤發(fā)生、發(fā)展和診療中作用的研究進(jìn)展

5.1 腫瘤的發(fā)生和發(fā)展

惡性腫瘤的形成是一個(gè)涉及多因素多步驟的復(fù)雜過(guò)程。多項(xiàng)研究表明,大鼠和人類腫瘤可能是一種節(jié)律失調(diào)相關(guān)疾病。已經(jīng)在多種腫瘤(如乳腺癌、卵巢癌、子宮內(nèi)膜癌、前列腺癌和血液系統(tǒng)腫瘤等)中發(fā)現(xiàn)生物節(jié)律分子的遺傳或功能性異常,這種異常的表現(xiàn)可能與癌癥或其他疾病的發(fā)生有重要的相關(guān)性。與對(duì)應(yīng)的癌旁非癌組織相比,Timeless在不同癌組織中的表達(dá)水平明顯不同。Timeless在肺癌中mRNA和蛋白表達(dá)水平[7]以及結(jié)直腸癌中的mRNA表達(dá)水平[9]均升高,而腎癌和胰腺癌中mRNA表達(dá)水平降低,肝癌中的mRNA和蛋白水平表達(dá)也同樣下降[4,6,10](表2)。不同文獻(xiàn)對(duì)乳腺癌中Timeless表達(dá)水平的報(bào)道不一致,Yong等的研究提示乳腺癌組織中Timeless的mRNA表達(dá)水平升高[8],而Jan-Gowth等則認(rèn)為乳腺癌組織中Timeless蛋白表達(dá)水平降低[5],結(jié)果不一致的原因可能與樣品來(lái)源和檢測(cè)方法不同有關(guān),同時(shí)基因的表達(dá)受不同水平的諸多因素調(diào)控。

Timeless在癌組織和癌旁非癌組織中的差異表達(dá)和腫瘤的預(yù)后具有相關(guān)性。肝癌中Timeless表達(dá)水平的降低和腫瘤的分級(jí)相關(guān)[4]。肺癌中Timeless高表達(dá)的患者整體生存時(shí)間明顯縮短,但與腫瘤分期和組織學(xué)分型無(wú)關(guān),Yoshida認(rèn)為T(mén)imeless可以作為肺癌診斷和預(yù)后的標(biāo)記物,對(duì)肺癌的治療效果有提示價(jià)值[7]。在結(jié)直腸癌中Timeless的mRNA表達(dá)水平和TNM分期關(guān)聯(lián)密切,在TNM的Ⅲ~Ⅳ階段,Time?less的mRNA表達(dá)水平達(dá)到最高,這種升高可能和結(jié)直腸癌的發(fā)生有關(guān),也可能與對(duì)輔助化療反應(yīng)的減弱有關(guān)[9]。Yong等在80例乳腺癌組織和80例癌旁非癌組織中發(fā)現(xiàn)Timless啟動(dòng)子發(fā)生甲基化,并且甲基化程度在乳腺癌的Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期顯著降低,這和Timeless在乳腺癌組織中高表達(dá)是一致的[8];而Jan-Gowth等在乳腺癌組織中未發(fā)現(xiàn)Timeless的啟動(dòng)子甲基化現(xiàn)象[5],同樣,在子宮內(nèi)膜癌[34]、肝癌[4]中也得到相似的結(jié)果。在肺癌細(xì)胞NCI-H157和NCIH460中,如果下調(diào)Timeless的表達(dá)水平,可以抑制細(xì)胞增殖和克隆形成,同時(shí)誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[7],提示它可以作為肺癌診斷和預(yù)防的標(biāo)志物,同時(shí)也是具有較高治療價(jià)值的靶分子。

5.2 腫瘤的診療

鑒于Timeless連接了生物節(jié)律和細(xì)胞周期兩大調(diào)控系統(tǒng),一些關(guān)于Timeless與癌癥易感性的遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究成為當(dāng)下熱門(mén)課題。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)在人類基因組中廣泛存在,且分布具有高密度性和高保守性。研究發(fā)現(xiàn),一些基因的SNP與腫瘤發(fā)生、預(yù)后和藥物敏感性相關(guān),是一種便于利用的生物標(biāo)志物。在441例乳腺癌組織和479例癌旁非癌組織中,Timeless的2個(gè)SNP位點(diǎn)(rs2291738和rs7302060)與乳腺癌的發(fā)生密切相關(guān)[8]。而Kristan[35]和Yong等[1]分別發(fā)現(xiàn),在乳腺癌組織和前列腺癌組織中所檢測(cè)的Timeless SNP位點(diǎn)與腫瘤的易感性和惡性程度無(wú)關(guān)。

表2 Timeless在各種癌組織中的差異表達(dá)及其預(yù)后相關(guān)性

節(jié)律調(diào)節(jié)是人類抵制癌癥的重要先決條件。在小鼠和大鼠的實(shí)驗(yàn)?zāi)P椭校盟帟r(shí)間的變化會(huì)給30多種抗癌藥物的毒性和功效帶來(lái)約百分之五十的差異[36]。雌激素受體α(ERα)的表達(dá)水平可用來(lái)篩選對(duì)激素類藥物(如它莫西芬,tamoxifen)反應(yīng)的乳腺癌患者,在體外實(shí)驗(yàn)中,Timeless的表達(dá)水平受17β雌二醇調(diào)控,并且可以在耐它莫西芬細(xì)胞株中過(guò)表達(dá)。Timeless有望成為篩選對(duì)它莫西芬耐藥的ERα陽(yáng)性乳腺癌患者的標(biāo)記物[37]。通過(guò)檢測(cè)腫瘤中Timeless基因的突變,可以預(yù)測(cè)藥物敏感性的變化[9];同時(shí),減低Timeless的表達(dá)水平可以增強(qiáng)一些化療藥物的活性,這些藥物能夠激活腫瘤細(xì)胞的DNA損傷通路,提示Timeless可能是一種新的治療癌癥的藥物靶分子[2]。

6 結(jié)語(yǔ)

Timeless是重要的生物節(jié)律基因,在生物節(jié)律、細(xì)胞周期、胚胎發(fā)育、癌癥發(fā)生發(fā)展和診療中發(fā)揮重要的生物學(xué)作用,如何將這些生物學(xué)功能用于臨床尚有許多問(wèn)題需要解決。Timeless在癌組織和癌旁非癌組織中的差異表達(dá)特點(diǎn)是否與癌癥的組織類型和發(fā)病地區(qū)有關(guān)?是否在體外和體內(nèi)降低Timeless的表達(dá)水平都能夠抑制腫瘤細(xì)胞增殖、并誘導(dǎo)其凋亡?Timeless的SNP位點(diǎn)對(duì)于腫瘤易感性和治療效果的預(yù)測(cè)是否具有實(shí)用性?隨著研究數(shù)據(jù)的不斷累積和豐富,期望能夠闡明Timeless表達(dá)水平與腫瘤發(fā)生發(fā)展和預(yù)后的聯(lián)系,明確其中的作用機(jī)制,充分發(fā)揮Timeless作為腫瘤診斷和治療的靶分子的作用。

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