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植物熱激轉(zhuǎn)錄因子基因家族的研究進(jìn)展

2014-12-07 07:20黃小云李必元王五宏岳智臣雷娟利鐘新民
浙江農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年9期
關(guān)鍵詞:基序擬南芥結(jié)構(gòu)域

黃小云,陶 鵬,李必元,王五宏,岳智臣,雷娟利,鐘新民*

(1.浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所,浙江杭州 310021;2.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院,江蘇南京 210095)

1962年Rittoss研究發(fā)現(xiàn),果蠅經(jīng)熱激后其唾液腺多線染色體發(fā)生顯著變化“膨突”[1]。1974年Tissieres發(fā)現(xiàn)這種“膨突”是一組蛋白,并將其命名為熱激蛋白 (heat shock protein,Hsp),這種現(xiàn)象稱為熱激反應(yīng) (heat shock response,HSR)[2]。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)這種現(xiàn)象普遍存在于整個(gè)生物界,在受到各種環(huán)境脅迫時(shí),尤其是熱脅迫 (heat stress,HS)時(shí),會(huì)產(chǎn)生一系列的應(yīng)激反應(yīng),導(dǎo)致熱激蛋白在植物體內(nèi)迅速積累。熱激蛋白具備分子伴侶的功能,在細(xì)胞反應(yīng)中進(jìn)行蛋白的折疊、分配、運(yùn)輸和降解,修復(fù)受損的蛋白并維持細(xì)胞的存活,在植物抗逆過程中起著重要的作用[3-4]。植物熱激轉(zhuǎn)錄因子 (heat stress transcription factors,Hsfs)是存在于細(xì)胞內(nèi)調(diào)節(jié)熱激蛋白表達(dá)的一類轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)基因,在植物熱脅迫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和耐熱性的產(chǎn)生過程中具有重要作用[5]。熱激轉(zhuǎn)錄因子通過識(shí)別并特異性結(jié)合在熱激蛋白基因啟動(dòng)子區(qū)熱激元件(heat shock element,HSE)的保守基序上,從而調(diào)控?zé)峒さ鞍谆虻霓D(zhuǎn)錄和表達(dá),進(jìn)而提高植物的抗逆性。隨著環(huán)境惡化,許多植物生產(chǎn)面臨新挑戰(zhàn),抗逆品種的選育成為當(dāng)前研究的重要內(nèi)容。高溫對(duì)植物的生長和發(fā)育會(huì)造成嚴(yán)重影響,挖掘植物耐熱基因,了解植物耐熱機(jī)制,培育耐熱品種是應(yīng)對(duì)高溫脅迫的有效途徑。數(shù)年來熱激轉(zhuǎn)錄因子已得到廣泛研究,本文將對(duì)熱激轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)、功能、表達(dá)等方面的研究進(jìn)展作一概述。

1 植物熱激轉(zhuǎn)錄因子的基本結(jié)構(gòu)

盡管Hsfs在序列大小上存在一定的差異,但真核生物的Hsfs具有典型的結(jié)構(gòu),包括保守的N端DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域 (DNA-binding domain,DBD)、寡聚化結(jié)構(gòu)域 (oligomerization domain,OD或HRA/B)、核定位信號(hào) (nuclear localization signal,NLS)、核輸出信號(hào) (nuclear export signal,NES)和C端轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域 (C-terminal domain,CTD)(圖1)5個(gè)部分。

圖1 熱激轉(zhuǎn)錄因子的基本結(jié)構(gòu)

1.1 DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域 (DBD)

DBD結(jié)構(gòu)域位于Hsfs的N端,是一段高度保守的區(qū)域,由3個(gè)螺旋結(jié)構(gòu) (H1,H2,H3)和4個(gè)反相平行的 β 折疊 (β1,β2,β3和 β4)[6]。在DNA結(jié)合域疏水中心有一個(gè)序列高度保守的螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋 (H2-T-H3)結(jié)構(gòu),可以精確定位并識(shí)別HSE 序列 (5'-AGAAnnTTCT-3')[7]。

1.2 寡聚化結(jié)構(gòu)域 (OD或HR-A/B)

HR-A/B區(qū)域同樣位于Hsfs的N端,通過一段長度為15~80 aa的堿性氨基酸與DBD區(qū)域相連。HR-A/B區(qū)域是由2個(gè)疏水七肽重復(fù)區(qū)域A和B組成,HR-A包含5~6組疏水的七肽重復(fù)序列,而HR-B是由2個(gè)相互交疊的七肽重復(fù)序列組成,在空間上形成螺旋型卷曲螺旋結(jié)構(gòu) (helical coiled-coil structure)。Hsfs可通過卷曲結(jié)構(gòu)形成同源三聚體,從而高效地與Hsp基因啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)Hsp基因的轉(zhuǎn)錄[8]。根據(jù)HR-A/B區(qū)域的特點(diǎn),可以將植物Hsfs分為A類、B類和C類。其中A類和C類Hsfs在區(qū)域A和B之間分別插入21個(gè)和7個(gè)氨基酸,而B類Hsfs結(jié)構(gòu)相對(duì)簡單沒有氨基酸插入。

1.3 核定位信號(hào) (NLS)和核輸出信號(hào) (NES)結(jié)構(gòu)域

NLS位于OD區(qū)的C端,由一簇單組分或雙組分堿性氨基酸殘基組成。B類Hsfs的NLS包含高度保守的四肽阻遏基序-LFGV-。在植物某些HSF的C端區(qū)域中還存在一個(gè)富含亮氨酸的疏水NES區(qū)域。正是NLS和NES的協(xié)同作用維持了細(xì)胞平衡,植物Hsfs才能在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中自由分布[9]。

1.4 C端激活結(jié)構(gòu)域 (CTD)

CTD結(jié)構(gòu)域是最不保守的區(qū)域,以芳香族的(W,F(xiàn),Y)、大的疏水的 (L,I,V)及酸性(E,D)的氨基酸激活基序 (activator motif,AHA)為特征,并具有轉(zhuǎn)錄激活功能。然而并不是所有的Hsfs都具有AHA基序,只有A類植物Hsfs含有,B類和C類Hsfs不含有AHA基序,而B類和C類Hsfs通常被認(rèn)為不具備轉(zhuǎn)錄激活功能[10]。然而A類Hsfs中HsfA3的CTD區(qū)域不包含AHA基序,但是所包含的色氨酸殘基使HsfA3具有激活功能[11]。

1.5 B類Hsfs的阻遏功能域

除了HsfA5外,所有的B類Hsfs在C端區(qū)域均包含一個(gè)四肽氨基酸-LFGV-,而這個(gè)四肽氨基酸通常被認(rèn)為是阻遏基序的核心,但它在轉(zhuǎn)錄過程中怎樣和其他區(qū)域相互作用而起到的輔助阻遏功能尚不清楚[12-13]。在其他植物中也有類似的研究[13]。

1.6 Hsfs的功能區(qū)域和標(biāo)志序列

無論是必不可少的DBD,OD區(qū)域,還是部分存在的 NES,NLS區(qū)域,以及區(qū)組特異性的AHA基序,Hsfs的功能區(qū)域和基序在前文中已有描述。高度保守3D結(jié)構(gòu)的DBD,識(shí)別HSE的H2-T-H3中心基序以及OD結(jié)構(gòu)是所有真核Hsfs的標(biāo)志。另外,在進(jìn)化上連接HTH基序的序列內(nèi)含子在DBD中的位置也是高度保守的。具有卷曲結(jié)構(gòu)的OD不僅存在于所有真核Hsfs,它還是區(qū)分植物Hsfs種類的重要標(biāo)志,通過OD結(jié)構(gòu)的特征,可將 Hsfs分為A,B,C等3類。然而 NLS,NES,AHA的存在與否,位置以及序列大小等為A類Hsfs的亞類區(qū)分提供了依據(jù)。功能性結(jié)構(gòu)域通常以相當(dāng)短的基序?yàn)樘卣鳎瑹o論這樣的基序是否發(fā)揮其相應(yīng)的功能,它都可能依賴其獨(dú)特的分子構(gòu)造。在植物中還存在一些非功能NLS,AHA氨基酸殘基,如HsfA5[14]。值得一提的是,一些和功能區(qū)域相連接的保守序列或單獨(dú)存在的保守序列也能為Hsfs的分類提供依據(jù)。總的來說,功能域、功能基序及一些功能不明確的保守序列均是Hsfs的標(biāo)志性序列,而且它們的位置和特征是Hsfs所共有的。這些標(biāo)志序列的作用在于使Hsfs類型具有豐富性,如 HsfA1,A2,A3,B2a,B2b,A4a,A4b等Hsfs類型。

2 植物熱激轉(zhuǎn)錄因子的多樣性

植物中的熱激轉(zhuǎn)錄基因家族在模式植物擬南芥和水稻中已有詳細(xì)的描述[15-17]。根據(jù)研究表明,擬南芥、水稻、番茄、玉米、蘋果、大豆、楊樹、苜蓿以及黃瓜中的Hsf家族成員已得到鑒定和分析[15-22]。作為模式植物,擬南芥具有21個(gè)Hsf家族成員,其中15個(gè)屬于A類Hsfs,5個(gè)屬于B類,1個(gè)屬于C類。然而其他物種中Hsf家族成員的分析表明,其大小和組成分布與植物進(jìn)化密切相關(guān)。目前,擬南芥是被子植物中最小的Hsf家族,而最大的Hsf家族是大豆,含有52個(gè)Hsf家族成員。植物在進(jìn)化的不同時(shí)期中通常會(huì)發(fā)生全基因組重復(fù)和基因重復(fù),并伴隨著廣泛的基因缺失,這就是被子植物Hsfs具有多樣性的原因。

為了更好地了解植物熱激因子家族的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,我們列舉了8種植物的Hsf家族成員 (表1),并將其進(jìn)行聚類分析 (圖2)。我們會(huì)發(fā)現(xiàn)雙子葉和單子葉植物中的Hsfs存在很高的相似性,大多數(shù)Hsfs類型均存在于雙子葉和單子葉植物中,但HsfA9,HsfB3,HsfB5只存在于雙子葉植物中,這些類型或許是在單子葉和雙子葉植物分化后出現(xiàn)的。單子葉植物和雙子葉植物Hsfs之間最顯著的區(qū)別表現(xiàn)在,單子葉植物中C類Hsfs更具復(fù)雜性。單子葉植物中的基因重復(fù)使其Hsfs具有單子葉植物特異區(qū)組,如C1a,C1b,C2a和C2b,但是這些擴(kuò)展的Hsfs功能尚未確定。同時(shí)為了全面地了解植物中的Hsf家族成員,下文分別介紹其中幾種植物熱激轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展。

表1 植物Hsfs

2.1 番茄

模式植物中熱激轉(zhuǎn)錄因子的研究有助于其他作物相關(guān)研究的順利開展,番茄是最早進(jìn)行熱激轉(zhuǎn)錄因子研究的植物,并最早在番茄中克隆獲得3個(gè)Hsfs基因,其中一個(gè)是組成型表達(dá),2個(gè)是熱脅迫誘導(dǎo)基因[23]?,F(xiàn)有的研究表明[5],番茄中至少含有24個(gè)Hsf家族成員,其中15個(gè)屬于A類Hsfs,8個(gè)屬于B類,1個(gè)屬于C類,另外還有3個(gè)類似的家族成員 (S l02g072060,S l02g0790180,S l11g008410)。在番茄熱激反應(yīng)中,HsfA1的組成型表達(dá)占主導(dǎo)作用[24]。番茄HsfA2在熱激反應(yīng)和恢復(fù)中進(jìn)行不斷積累,具有潛在的激活功能[25]。亞細(xì)胞定位研究表明[26],正常條件下番茄HsfA3位于細(xì)胞質(zhì),熱脅迫時(shí)則在細(xì)胞核內(nèi),和HsfA1的表達(dá)相似也是組成型表達(dá);而作為轉(zhuǎn)錄共激活子HsfB1在脅迫和非脅迫條件下都位于細(xì)胞核中;HsfA2則相對(duì)復(fù)雜,經(jīng)過短暫熱激后,HsfA2逐漸合成并位于細(xì)胞質(zhì)中,再次熱激后,大部分HsfA2分布在細(xì)胞核,在這個(gè)熱激和恢復(fù)的過程中,HsfA2不斷積累,在細(xì)胞質(zhì)中又可以重新檢測(cè)。李振軍等[27]從耐熱番茄中克隆得到Hsf24基因,并對(duì)該基因及編碼蛋白質(zhì)進(jìn)行同源性分析,結(jié)果表明該基因和普通番茄中的Hsf24基因高度同源,但是多出16個(gè)堿基。這些表明植物Hsf s本身具有復(fù)雜性和差異性,這也就決定了它的多樣性。

2.2 擬南芥

擬南芥也是植物熱激轉(zhuǎn)錄因子研究很多的模式植物,其家族成員已得到鑒定,擬南芥具有21個(gè)Hsf家族成員,A,B,C類Hsfs分別有15個(gè)、5個(gè)和1個(gè),不均勻地分布在其5條染色體上。其中一對(duì)旁系同源基因 (At3g51910和At3g6350)位于同一條染體色上,另外有4對(duì)旁系同源基因分別位于不同的染色體上,這表明擬南芥熱激轉(zhuǎn)錄因子可能在進(jìn)化過程中發(fā)生了基因重復(fù)和基因組重復(fù)。擬南芥HsfA1a和HsfA1b調(diào)控一些熱激后表達(dá)的基因,如WRKY,MYB,AP2/EREBP等轉(zhuǎn)錄因子。擬南芥中表達(dá)最明顯的是HsfA2,并響應(yīng)多種脅迫反應(yīng),而受熱激誘導(dǎo)最明顯的基因是HsfB1,但不能提高植物的耐熱性。HsfA3同樣有助于保持耐熱性,并受DREB2A和 DREB2C的控制進(jìn)行轉(zhuǎn)錄[28],而HsfA9則是在ABI3的控制下參與種子發(fā)育[29]。

2.3 水稻

作為單子葉植物的模式植物,水稻的熱激轉(zhuǎn)錄因子也有一定的研究。水稻全基因組測(cè)序后,Guo等[17]從水稻中鑒定得到了25個(gè)Hsf家族成員,其中13個(gè)屬于A類,8個(gè)屬于B類,4個(gè)屬于C類;染色體定位發(fā)現(xiàn),25個(gè)成員不均勻地分布在水稻的1至10號(hào)染色體上,在11,12號(hào)染色體上沒有分布;8對(duì)旁系同源基因中,1對(duì)位于同1條染色上 (Os01g43590和Os01g53220),另外有7對(duì)旁系同源基因分別位于不同的染色體上,這和擬南芥具有相似性。水稻HsfA2在調(diào)控逆境脅迫中具有重要作用,其中HsfA2a,HsfA2e在熱誘導(dǎo)下產(chǎn)生,而HsfA2b在熱誘導(dǎo)和H2O2中均可產(chǎn)生。在擬南芥中轉(zhuǎn)入水稻 HsfA2e,可提高其耐熱耐鹽的水平[30]。在冷誘導(dǎo)中3類Hsfs的表達(dá)有明顯差異:A類中的HsfA3,HsfA4d,HsfA9轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平提高;B類中除HsfB4a和HsfB4b外,其他的B類Hsfs均降低;C類Hsfs均能在冷誘導(dǎo)中產(chǎn)生,且HsfC1表達(dá)量最高,這表明C類Hsfs可能在冷脅迫中具有關(guān)鍵的作用;另外,水稻中的Hsfs在其所有器官中均有表達(dá)但其表達(dá)水平存在一定的差異:HsfA1a,HsfA2e,HsfA4d,HsfB1,HsfB4b分別在花、花序、葉片、根和種子、雌蕊中表達(dá)量最高[31]。

2.4 大豆

大豆是目前植物中熱激轉(zhuǎn)錄因子被鑒定家族成員最多的植物[20],含有52個(gè)Hsf家族成員,其中28個(gè)屬于A類Hsfs,22個(gè)屬于B類,2個(gè)屬于C類,所有成員不均勻地分布在所有染色體上。最早在大豆中分離得到的6個(gè)熱激轉(zhuǎn)錄因子,其中2個(gè)是組成型表達(dá),其余4個(gè)受熱脅迫誘導(dǎo)表達(dá),其中2個(gè)熱脅迫誘導(dǎo)基因還對(duì)鎘脅迫有響應(yīng)[32]。張利明等[33]利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將GmHsfA1轉(zhuǎn)入大豆品種科新3號(hào),GmHsfA1的過量表達(dá)激活了轉(zhuǎn)基因大豆植株中熱激蛋白基因GmHsp22在非誘導(dǎo)條件下的轉(zhuǎn)錄,并加強(qiáng)了高溫脅迫下GmHsp23和GmHsp70的表達(dá)。吳廣錫等[34]研究表明,轉(zhuǎn)熱激轉(zhuǎn)錄因子GmHsfA1大豆品系黑農(nóng)53在高溫和干旱誘導(dǎo)條件下,大豆葉片中 GmHsfA1,GmHSP70,GmHSP22和GmHSP17.9基因的表達(dá)量明顯高于非轉(zhuǎn)基因植株,生理性狀和產(chǎn)量性狀均優(yōu)于非轉(zhuǎn)基因植株,結(jié)果表明過量表達(dá)的熱激轉(zhuǎn)錄因子GmHsFA1在大豆植株的耐熱性和抗旱性方面具有重要作用。大豆HSFs還受其他脅迫誘導(dǎo),實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果表明[20]:在 熱 脅 迫 下, HsfA2c, HsfA6b,HsfB2b,HsfB1c,HsfB2d這 5個(gè)基因的表達(dá)量都很高;HsfA2,HsfB2b,HsfB1c,HsfB2d在干旱脅迫下反應(yīng)也很明顯;在冷誘導(dǎo)中只有HsfB1c表達(dá)水平顯著上調(diào);在鹽脅迫中HsfA2c表達(dá)水平明顯上升,其他的沒有變化。

2.5 玉米

早在1995年,Gagliardi等[35]就分析了熱激轉(zhuǎn)錄因子和HSP70在玉米花粉發(fā)育中的表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)3個(gè)熱激轉(zhuǎn)錄因子在玉米中均有表達(dá),其中2個(gè)在玉米營養(yǎng)組織中表現(xiàn)為熱脅迫誘導(dǎo)。目前,玉米中已鑒定出25個(gè)Hsf家族成員[18],其中15個(gè)屬于A類,7個(gè)屬于B類,3個(gè)屬于C類;而且其中受熱脅迫誘導(dǎo)的基因有17個(gè),不受其誘導(dǎo)的有3個(gè),還有5個(gè)受熱脅迫抑制;其中有9對(duì)旁系同源基因,一對(duì)位于同一染色體上,其余的分別位于不同的染色體上。

2.6 蘋果

蘋果不僅是木本植物,更是一種經(jīng)濟(jì)植物。蘋果全基因組測(cè)序完成以后[36],Giorno等[19]從蘋果中鑒定得到25個(gè)熱激轉(zhuǎn)錄因子,其中16個(gè)屬于A類,7個(gè)屬于B類,2個(gè)屬于C類;這些基因不均勻地分布在蘋果17條染色體中的12條上,并發(fā)生了12對(duì)基因重復(fù),其中在不同染色體之間有11對(duì)片段重復(fù),同一染色體上有一對(duì)串聯(lián)重復(fù)(MdHsfA3b和MdHsfA3c);在聚類中發(fā)現(xiàn),與擬南芥相比,蘋果和楊樹的親緣關(guān)系更近,這可能是因?yàn)樗鼈兌际悄颈局参?,在長期的進(jìn)化過程中更為相似。這些基因在所有的組織中幾乎都有表達(dá),包括一些特異性表達(dá),如MdHsfA9a只在葉片中表達(dá),而MdHsfA9b只在種子中表達(dá);MdHsfA2b和MdHsfA2b則在花中表達(dá)。

2.7 小麥

在小麥中,Qin等[37]通過研究小麥熱脅迫下基因表達(dá)譜,得到了7個(gè)熱激轉(zhuǎn)錄因子,其中一個(gè)在熱脅迫后表達(dá)水平顯著上調(diào),表現(xiàn)出很強(qiáng)的耐熱性;Shim等[38]研究表明,小麥中與水稻直系同源的HsfA4a對(duì)鎘具有一定的抗性并受金屬硫蛋白MT的表達(dá)調(diào)控。Chauhan等[39]對(duì)不同生育時(shí)期小麥材料進(jìn)行37℃和42℃進(jìn)行熱脅迫2 h,并通過PCR選擇減法技術(shù)鑒定響應(yīng)基因,獲得了3 516個(gè)高質(zhì)量的EST;表達(dá)分析表明苗期小麥在熱脅迫后1~4 d表現(xiàn)快速恢復(fù);而利用10個(gè)響應(yīng)基因?qū)?5份材料進(jìn)行熒光定量分析發(fā)現(xiàn),小麥在主要生長階段對(duì)不同的脅迫均有一定的響應(yīng)并存在組織特異性表達(dá)。Chauhan等[40]從小麥中分離得到與水稻OsHsfA2d相似的A類熱休克蛋白基因TaHsfA2d,擬南芥轉(zhuǎn)TaHsfA2d植株過表達(dá)不僅對(duì)高溫耐受性較高,也表現(xiàn)出相當(dāng)大的耐鹽性和抗旱性。Zhang等[41]從小麥中分離得到一個(gè)B類的熱休克蛋白基因TaHSF3,在小麥穗中高度表達(dá);另外,小麥苗期在熱脅迫、冷誘導(dǎo)、NaCl和ABA處理下表達(dá)均表現(xiàn)出高度上調(diào);擬南芥轉(zhuǎn)TaHSF3植株過表達(dá)還耐極端溫度。

3 植物熱激轉(zhuǎn)錄因子的功能多樣化

3.1 HsfA1a:番茄中主要調(diào)節(jié)因子

番茄HsfA1是組成型表達(dá),是調(diào)節(jié)耐熱的主要Hsfs,在番茄耐熱中它的功能是無可取代的。在正常條件下,HsfA1分布于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中。HsfA1通過和HsfA2,HsfB1形成異源寡聚超級(jí)激活因子復(fù)合體共同響應(yīng)熱激反應(yīng)并起到修復(fù)作用。HsfA1調(diào)節(jié)HsfA2,HsfB1的表達(dá),與其形成寡聚體并維持在細(xì)胞核內(nèi),保持耐熱功能。轉(zhuǎn)基因植株中HsfA1的過度表達(dá),會(huì)加強(qiáng)HsfA2,HsfB1及其他相關(guān)基因的熱誘導(dǎo)反應(yīng),但是HsfA1轉(zhuǎn)錄后基因沉默,也會(huì)降低這些基因的表達(dá)。這些HsfA1a沉默植株生長參數(shù)與野生植株很相似,但是在其各個(gè)生長發(fā)育階段沉默植株對(duì)高溫更加敏感。這是因?yàn)镠sfA1a的沉默表達(dá)消除了同樣作為分子伴侶HsfA2和B1的誘導(dǎo)功能。然而,HsfA2和HsfB1表達(dá)的減少或是缺失對(duì)轉(zhuǎn)基因植株響應(yīng)熱脅迫影響不大。

番茄和擬南芥的Hsf家族成員組成基本上是一致的 (表1),但是作為主要調(diào)節(jié)因子,番茄和擬南芥HsfA1具有明顯差異。擬南芥4個(gè)HsfA1中沒有一個(gè)具有主要調(diào)節(jié)功能。無論是單基因突變的發(fā)生,還是雙突變體甚至是三突變體的發(fā)生,擬南芥HsfA1a,HsfA1b,HsfA1d,HsfA1e在誘導(dǎo)熱激反應(yīng)和耐熱水平上效果均不顯著[42]。然而雙重突變轉(zhuǎn)錄組分析表明,這些熱激轉(zhuǎn)錄因子對(duì)某類基因具有一定的功能,如 sHsp,HSP70和 HSP101,還有HsfA2,HsfA7a,HsfB1和HsfB2a,以及一些編碼代謝酶的基因。

3.2 HsfA2:熱激誘導(dǎo)的耐熱因子

HsfA2在結(jié)構(gòu)和功能上都與HsfA1很相似,但是HsfA2只在脅迫植株中表達(dá)。然而,當(dāng)番茄,擬南芥和水稻在持續(xù)熱脅迫或是恢復(fù)階段,HsfA2可以誘導(dǎo)高水平耐熱蛋白的形成并不斷積累[43]。脅迫植株中所含有的豐富HSFs以及HsfA1和HsfA2的互作,都有助于HsfA2誘導(dǎo)高水平耐熱蛋白??傊琀sfA1和HsfA2互作誘導(dǎo)蛋白形成的水平均高于二者單獨(dú)進(jìn)行誘導(dǎo)的水平[43]。然而,番茄HsfA1/A2互作的功能很可能反映了2種不同類型的結(jié)構(gòu)域和AHA基序。由于擬南芥4個(gè)HsfA1具有各不相同的C端結(jié)構(gòu)域,其成員間的相互作用和番茄這種效應(yīng)可能具有相似之處。

另外有研究表明,HsfA2不僅對(duì)耐熱性水平有顯著作用,還對(duì)一些與脅迫相關(guān)的非伴侶編碼基因如GOLS1或APX2的表達(dá)具有一定的作用[44]。突變體植株一般對(duì)熱脅迫、強(qiáng)光、氧化和缺氧脅迫很敏感,而擬南芥HsfA2的過表達(dá)不僅提高了耐熱性,同時(shí)提高了對(duì)鹽脅迫、氧化和缺氧脅迫的抗性[45]??傊琀sfA2對(duì)植物防止細(xì)胞器的氧化性損傷和細(xì)胞死亡具有重要作用,是植物應(yīng)激反應(yīng)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)劑[44]。最后,值得注意的是,在番茄中HsfA2連同分子伴侶Hsp90,Hsp70和Hsp17-CII的表達(dá)對(duì)于促進(jìn)番茄花藥發(fā)育具有不可或缺的作用,同時(shí)表明伴侶表達(dá)對(duì)抵御熱損傷以保護(hù)花粉正常萌發(fā)和成熟具有重要作用[46]。

3.3 HsfA3:干旱信號(hào)

HsfA3除了在C端有一個(gè)色氨酸殘基保守區(qū)域外,在結(jié)構(gòu)功能上與HsfA1和HsfA2基本相似。擬南芥HsfA3在干旱脅迫下的表達(dá)依賴于DREB2A轉(zhuǎn)錄因子,這也同樣適用于 Hsp18.1-CI,Hsp26.5-MII和Hsp70[28]。DREB2A或DREB2C的過度表達(dá)都會(huì)加強(qiáng)HsfA3或其他相關(guān)基因的誘導(dǎo)功能,耐熱性也隨之加強(qiáng),而DREB2A突變體表現(xiàn)耐熱性降低[47]。

3.4 HsfA5:HsfA4表達(dá)特異抑制因子

HsfA5和 HsfA4雖然在結(jié)構(gòu)上很相似,但是HsfA4能夠有效激活熱激蛋白的表達(dá),HsfA5卻能抑制HsfA4的激活功能。研究表明,這是因?yàn)镠sfA5的DNA結(jié)合能力可以對(duì)HsfA4的寡聚態(tài)進(jìn)行特異干擾[14]。不管是HsfA5還是HsfA4,都不會(huì)與HsfA1或HsfA2相互作用,反之亦然。然而,HsfA5的OD結(jié)構(gòu)域的分子結(jié)構(gòu)特異性尚不明確。

3.5 HsfA9調(diào)控種子發(fā)育中Hsp表達(dá)

HsfA9在種子發(fā)育過程中的獨(dú)特作用充分表現(xiàn)了Hsf功能多樣化。HsfA9是擬南芥和向日葵胚胎發(fā)育和種子成熟中的特異因子[48]。在擬南芥種子發(fā)育過程中HsfA9的表達(dá)受轉(zhuǎn)錄因子ABI3的調(diào)控[29]。在非脅迫條件下,HsfA9的異位表達(dá)可促使葉片中形成sHsps和Hsp101[29]。向日葵 HsfA9的單獨(dú)過度表達(dá)或是煙草中HsfA9和HaDREB2共表達(dá)都會(huì)提高Hsp的積累水平進(jìn)而延長種子壽命[48]。另外,一方面HsfA9在種子成熟過程的調(diào)控表達(dá)依賴于ABI3或DREB2等類似的轉(zhuǎn)錄因子相互作用[29,48];另一方面,向日葵HsfA9與響應(yīng)生長素的阻遏因子IAA27相互作用,這表明在種子成熟中HsfA9與脫落酸和生長素的功能一樣占主導(dǎo)作用[49]。在種子萌發(fā)和成熟中,煙草 HaHsfA9的負(fù)表達(dá)使具有種子特異性的sHsps表達(dá)水平降低[50]。后來的研究結(jié)果表明,在干燥條件下HsfA9在種子的發(fā)育中并不占主導(dǎo)作用。單子葉植物缺乏HsfA9,僅在種子中發(fā)現(xiàn)高含量水平的OsHsfA1a。

3.6 番茄HsfB1:共激活因子

與A類Hsfs所不同的是,B類的Hsfs并不具備轉(zhuǎn)錄激活功能。B類Hsfs的氨基酸序列比較表明,以-LFGV-為核心的保守的阻遏域廣泛存在于其他的植物轉(zhuǎn)錄因子中,如ABI3/VP1,AP2/ERF,MYB和GRAS[13]。目前保守的四肽基序的作用尚不清楚。然而,擬南芥雙突變植株hsfB1/hsfB2b表達(dá)分析表明,在B類熱激轉(zhuǎn)錄因子不僅在脅迫后恢復(fù)過程中抑制熱激蛋白的表達(dá),而且通過控制防御基因抑制抗病基因的表達(dá)。然而,在適當(dāng)?shù)臈l件下番茄HsfB1可與A類Hsfs協(xié)同作用,如HsfA1a。2種Hsfs組合在一起形成具有加強(qiáng)功能的復(fù)合物,并有助于吸收植物CREB結(jié)合蛋白 (CBP)的直向同源物的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶HAC1,形成三元復(fù)合物,進(jìn)而有效協(xié)同激活報(bào)告基因的表達(dá)[51]。此外,HsfB1也和其他轉(zhuǎn)錄激活因子相結(jié)合控制管家基因的表達(dá),HsfB1可能有助于維持或恢復(fù)管家基因在熱脅迫過程中的表達(dá)。

3.7 表達(dá)的多樣化

目前個(gè)別植物熱激轉(zhuǎn)錄因子功能的詳細(xì)分析僅限于以上,然而Hsfs表達(dá)的多樣化來自于不同生長階段不同脅迫下的表達(dá)模式,根據(jù)擬南芥在生物和非生物脅迫中的反應(yīng)[52-54],植物Hsfs的表達(dá)模式顯著表現(xiàn)為:①不同器官Hsfs表達(dá)模式表明:HsfA1四個(gè)成員組成型表達(dá)在大多數(shù)器官的表達(dá)水平低;HsfA9一般種子成熟過程中表達(dá),而HsfA1a,HsfA4c和HsfA5主要在花藥或花粉發(fā)育中表達(dá);HsfA4c,HsfA7a,HsfB1和 HsfC1在根部表達(dá),而HsfA4c,HsfA8和Hsf B2a在葉片中的表達(dá)量更高。②相對(duì)于HsfA1d,HsfA4a,HsfA4c,HsfA7a,HsfA7b,HsfA8,HsfB1,HsfB2a,HsfB2b,HsfB4 及HsfC1,在不同組織中進(jìn)行不同的非生物脅迫誘導(dǎo),HsfA2只在根中表達(dá)。③HsfA1e,HsfA3,HsfA4A,HsfA4C,HsfA6b,HsfA8,HsfB2a和 HsfC1,在滲透脅迫、鹽脅迫和冷脅迫中的表達(dá)尤為突出。④HsfA2,HsfA4a,HsfA8和HsfB1在多種生物脅迫中均有表達(dá)。

4 植物Hsfs的調(diào)控

Hsfs在熱脅迫下與HSE識(shí)別并結(jié)合,從而激活下游熱激基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。在哺乳動(dòng)物和酵母中關(guān)于Hsfs與HSE的結(jié)合機(jī)制的研究比較深入[55]。以脊椎動(dòng)物的Hsf1為例:正常溫度下,Hsf1與包含Hsp的蛋白復(fù)合物結(jié)合,且不具備激活Hsp表達(dá)的能力;熱脅迫時(shí),Hsp70作為分子伴侶與大量變性蛋白相結(jié)合,Hsf1就從蛋白復(fù)合物中釋放出來,游離的Hsf1發(fā)生磷酸化從鈍化的單體形成有活性的三聚體,并與HSE相結(jié)合,激活熱激基因的表達(dá);熱激后恢復(fù),Hsf1和高水平Hsp70相結(jié)合形成蛋白復(fù)合物,并失去轉(zhuǎn)錄激活功能。在植物中,擬南芥AtHsf1的組成型表達(dá)與以上表達(dá)調(diào)控相似,AtHsf1在正常條件下不能激活Hsp的表達(dá),而在HSF1-GUS的過表達(dá)株系具有激活Hsp表達(dá)的功能[56]。植物Hsfs基因的表達(dá)模式有組成型表達(dá)和脅迫誘導(dǎo)型表達(dá)2種[15]。植物Hsfs在轉(zhuǎn)錄水平上對(duì)Hsp的調(diào)控有2方面:一方面是不同Hsfs的協(xié)同調(diào)控;另一方面是Hsfs和分子伴侶的相互作用[57]。

不同Hsfs的協(xié)同調(diào)控在番茄中的表現(xiàn)尤為突出,番茄 HsfA1的組成型表達(dá),通過與 HsfA2,HsfB1特異互作形成異源寡聚復(fù)合體,進(jìn)而激活熱激基因的表達(dá);進(jìn)一步研究表明CTAD和OD區(qū)域?qū)sfA1和HsfA2的協(xié)同激活具有重要作用,而且只有完整的OD結(jié)構(gòu)域才能形成異源寡聚復(fù)合體。與A類Hsfs相比,B類和C類Hsfs不具備這樣的功能,只有HsfB1作為共激活因子協(xié)同表達(dá),另外擬南芥HsfA1的表達(dá)和番茄存在差異。

研究表明,分子伴侶Hsp70和Hsp90可以和Hsfs相互作用來調(diào)控?zé)峒せ虻谋磉_(dá)[57]。在通常條件下,Hsp70和Hsp90的相互作用維持HsfA1的主要調(diào)控功能;熱激條件下,Hsp70和Hsp90誘導(dǎo)HsfA1激活,并促使HsfB1快速積累,同時(shí)HsfA2熱激后積累,三者協(xié)同促進(jìn)熱激基因的表達(dá);熱激后恢復(fù)時(shí),Hsp70和 Hsp90恢復(fù)自由構(gòu)象,使HsfA1失活。此外,sHsp可以控制 HsfA2的活性,HsfA2和Hsp17及其他分子伴侶相互作用形成復(fù)合物,并積累大量蛋白,不具備活性。Hsp17和HSP101和Hsp70相互作用,使得HsfA2從復(fù)合物上釋放,進(jìn)而具有激活功能[58]。在擬南芥中HsfA2的功能被證明依賴于ROF1/FKBP62和ROF2/FKBP65,這歸結(jié)于Hsp90分子伴侶的功能[59]。

人類Hsf1中的Hsf結(jié)合蛋白 (HSBP1)是負(fù)調(diào)節(jié)因子,在植物中也存在類似功能的蛋白。實(shí)際上,玉米胚中致死突變EMP2來源于玉米的2個(gè)直系同源HSBPs中的一個(gè),因此玉米胚胎發(fā)育過程中HSF的功能受EMP2(HSBP1)的直接調(diào)控。在此過程中 EMP2還與 HsfA2a,HsfA3,HsfA4d和HsfA5相互作用,但是EMP2還沒有發(fā)現(xiàn)與B類或C類熱激轉(zhuǎn)錄因子相互作用[60]。擬南芥HSBP是HSF活動(dòng)的負(fù)調(diào)控因子,與 HsfA1a,HsfA1b和HsfA2相互作用,影響種子發(fā)育。

另外,熱脅迫下細(xì)胞質(zhì)中變性蛋白質(zhì)的積累(細(xì)胞質(zhì)蛋白反應(yīng))也會(huì)影響HSF的活性。在真核生物中蛋白折疊應(yīng)答可以在蛋白加工過程中調(diào)整分子伴侶的水平。研究表明,轉(zhuǎn)錄因子bZIP與蛋白裂解和運(yùn)輸有關(guān)。然而,染色質(zhì)狀態(tài)的修飾是基因差異表達(dá)的一個(gè)原因。在所有真核生物中,組蛋白修飾模式在基因的激活和轉(zhuǎn)錄過程中迅速改變,這也是植物應(yīng)激反應(yīng)的一種[61]。此外,核小體通過結(jié)合組蛋白變體而變得多元化,如H2A.Z,這是染色質(zhì)表觀遺傳記憶的重要標(biāo)志[62]。研究表明,含有核小體的H2A.Z與擬南芥冷和熱響應(yīng)基因相關(guān),而且脅迫誘導(dǎo)后,H2A.Z可以被釋放出來。

在植物應(yīng)對(duì)環(huán)境脅迫時(shí),除了熱激轉(zhuǎn)錄因子,還有其他的轉(zhuǎn)錄因子,脅迫誘導(dǎo)的蛋白質(zhì)和代謝產(chǎn)物,小的非編碼RNA以及應(yīng)激激素如乙烯(ETH),脫落酸 (ABA),水楊酸 (SA)和茉莉酸 (JA)[63-65]都會(huì)參與響應(yīng)過程。Ca2+信號(hào)與蛋白質(zhì)磷酸化緊密相關(guān),鈣離子結(jié)合蛋白CAM3在提高擬南芥耐熱方面具有關(guān)鍵作用[66]。MBF1c是真核生物中高度保守的轉(zhuǎn)錄輔激活因子,在擬南芥中MBF1c響應(yīng)乙烯合成和熱激表達(dá)。MBF1c和轉(zhuǎn)錄因子WRKY39的相互作用在SA和JA信號(hào)途徑中具有顯著作用。熱激轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控?zé)峒せ虻谋磉_(dá)與這些因素緊密相關(guān)。

5 展望

隨著生物信息技術(shù)的快速發(fā)展,許多植物基因組測(cè)序已經(jīng)完成,這為熱激轉(zhuǎn)錄因子家族的分析提供了豐富的資源,并為基因的鑒定分析和克隆提供基礎(chǔ)。通過基因工程的途徑提高植物的耐熱性已成為當(dāng)今研究趨勢(shì)。目前大量植物的熱激轉(zhuǎn)錄因子家族成員已得到鑒定和分析。A類熱激轉(zhuǎn)錄因子是熱激基因表達(dá)的激活劑,在不同的植物中具有不同的應(yīng)激反應(yīng);B類熱激轉(zhuǎn)錄因子大多沒有激活功能,而是阻遏基因的表達(dá);C類熱激轉(zhuǎn)錄因子在單子葉植物中可能存在一些未知功能。由于植物基因組的復(fù)雜性,目前Hsfs的研究只限于一些模式植物上,對(duì)于一些尚未進(jìn)行基因組測(cè)序的植物研究甚少,一些重要基因的克隆比較緩慢,功能研究也只限于少數(shù)基因。另外,Hsfs作為植物對(duì)逆境反應(yīng)的一個(gè)成員,在整個(gè)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的信號(hào)傳導(dǎo)中的作用,自身的調(diào)控機(jī)制及上游調(diào)控基因有待進(jìn)一步研究。隨著植物功能基因組學(xué)和蛋白組學(xué)研究的不斷深入,將更加清楚地闡明植物熱激轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)控逆境反應(yīng)中的作用,這對(duì)植物耐熱性及抗逆性具有重要意義。

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