張旦旦,余園,張曉梅,李恒,許正宏,2,史勁松
1(江南大學(xué)藥學(xué)院生物制藥系,江蘇無錫,214122)
2(江南大學(xué)工業(yè)生物技術(shù)教育部重點實驗室,江蘇無錫,214122)
角蛋白是一種廣泛存在于自然界中的硬性蛋白,普通的溶劑和一般的蛋白酶(如胰蛋白酶、胃蛋白酶、木瓜蛋白酶等)都難以令其溶解,因此利用傳統(tǒng)的物理或化學(xué)方法降解角蛋白存在提取效率低、耗能高、污染大、產(chǎn)物分子質(zhì)量較小等缺陷[1-2]。角蛋白酶(Keratinase)是一類可特異性降解不溶性角蛋白的蛋白酶類,生產(chǎn)菌株多篩選自角蛋白含量豐富的家禽廢棄物、毛發(fā)堆放地、羊圈土壤等,常見產(chǎn)角蛋白酶的細(xì)菌為鏈霉菌屬和芽孢桿菌屬,如地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)、短小芽孢桿菌(Bacillus pumilus)、弗氏鏈霉菌(Streptomyces fradiae)、密旋鏈霉菌(Streptomyces pactum)等[3-4]。不同來源的角蛋白酶的理化特性各有不同,但除部分高溫嗜堿微生物來源的角蛋白酶外,大部分角蛋白酶為中性至堿性蛋白酶,最適作用溫度在40 ~60℃[5]。
本文經(jīng)過多次分離篩選,從7個不同來源的土壤樣品中篩選到32株微生物,并對其中產(chǎn)酶較高的3株微生物進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定,其中1株為金色鏈霉菌(Streptomyces aureus),目前尚無該菌株產(chǎn)角蛋白酶的相關(guān)報道。
1.1.1 出發(fā)菌株
金色鏈霉菌(Streptomyces aureus)K13,保藏號為CGMCC No.8047,本實驗室篩選。
1.1.2 培養(yǎng)基
初篩固體培養(yǎng)基(g/L):羊毛粉 5,K2HPO41,NaCl 0.5,瓊脂粉 20。
察氏/種子培養(yǎng)基(g/L):蔗糖 30,NaNO33,K2HPO41,MgSO4·7H2O 0.5,KCl 0.5,F(xiàn)eSO4·7 H2O 0.01。
初始發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):羊毛粉10,K2HPO40.4,NaCl 0.5。自然pH值,1×105Pa滅菌20 min。
自制羊毛粉:將羊毛浸泡于0.1 mol/L NaOH溶液中3 d后,用自來水沖洗干凈,1×105Pa滅菌20 min,105℃烘干后,用粉碎機粉碎后經(jīng)研缽研磨制成羊毛粉。
1.2.1 角蛋白酶產(chǎn)生菌土樣采集地點
土樣1:農(nóng)村多年無耕作的土壤
土樣2:羊圈表層土壤
土樣3:羊群活動頻繁地區(qū)的表層土壤
土樣4:樹林深處濕潤的土壤層
土樣5:竹林深處的土壤層
土樣6:家禽活動頻繁地區(qū)的表層土壤
土樣7:家禽活動頻繁地區(qū)的深層土壤
1.2.2 菌株篩選方法
分別取上述土樣1 g溶于10 mL無菌生理鹽水中,搖勻制成土壤懸液;將土壤懸液稀釋不同倍數(shù)后取200 μL涂布于上述篩選培養(yǎng)基的固體平板,30℃培養(yǎng)72 h;挑取較大的菌落,在初篩平板上反復(fù)劃線分離,直至分離到單菌落進(jìn)行搖瓶復(fù)篩,復(fù)篩培養(yǎng)基為上述的初始發(fā)酵培養(yǎng)基,220 r/min,30℃恒溫培養(yǎng)72h后測定發(fā)酵上清液中的角蛋白酶活力。
1.2.3 菌株培養(yǎng)方法
種子制備方法:取平板單菌落1環(huán)接種于裝有25 mL種子培養(yǎng)基的250 mL三角瓶中,置于恒溫振蕩搖床220 r/min,30℃培養(yǎng)48 h。
發(fā)酵方法:取2%種子液接種于裝有50 mL發(fā)酵培養(yǎng)基的500 mL三角瓶中,置于恒溫振蕩搖床220 r/min,30℃培養(yǎng) 72 h。
測定體系:取10 mL試管,依次加入2.0 mL 0.05 mol/L的Tris-HCl緩沖液(緩沖液具體pH值隨實驗而定),10 mg自制羊毛粉底物,37℃預(yù)熱10 min后加入1.0 mL粗酶液,混勻,37℃恒溫振蕩水浴鍋反應(yīng)1 h(具體預(yù)熱與反應(yīng)溫度隨實驗而定)。加入2.0 mL 0.4 mol/L的三氯乙酸終止反應(yīng),10 000 r/min離心10 min,取上清液于280 nm測定其吸光度值,采用37℃恒溫振蕩前添加三氯乙酸的反應(yīng)管作對照。酶活計算公式如下:
X=△A280×100×n
式中:△A為反應(yīng)液的吸光度值-對照液的吸光度值;X為樣品的酶活力,U/mL;n為樣品的稀釋倍數(shù)。
酶活力單位定義:1 mL液體酶,在一定的溫度和pH條件下轉(zhuǎn)化羊毛粉底物,1 h使A280增加0.01個單位即為1個酶活力單位,以U/mL表示。
1.4.1 菌株形態(tài)學(xué)特征與生理生化特征鑒定[6]
將菌株接種察氏培養(yǎng)基平板中,30℃培養(yǎng)2~3d,觀察其菌落特征、菌體形態(tài)和革蘭氏染色特征,生理生化鑒定參照《伯杰細(xì)菌鑒定手冊》。
1.4.2 菌株16S rDNA鑒定[3]
取對數(shù)生長期的菌液,提取其基因組DNA,以細(xì)菌16S rDNA通用引物(正向引物:5'-GAG AGT TTG ATC CTG GCT CAG-3’,反向引物:5'-CTA CGG CTA CCT TGT TAC GA-3’)擴增其16S rDNA。
細(xì)菌DNA的提取參照上海捷瑞生物工程有限公司細(xì)菌基因組提取試劑盒說明;PCR擴增產(chǎn)物的純化參照上海捷瑞生物工程有限公司PCR產(chǎn)物純化試劑盒說明;測序由上海生工生物工程有限公司完成。測序后,在GenBank中通過BLAST比對進(jìn)行菌種鑒定。
1.5.1 粗酶液的制備
將發(fā)酵液于10 000 r/min離心10 min,上清液即為粗酶液。
1.5.2 粗酶的最適作用溫度、pH
維持其他條件不變,分別在不同溫度(30、40、45、50、55、60、70、80℃)、不同 pH 值(pH 3.0 ~10.0,其中pH 3.0~7.0采用檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液,pH 7.0~9.0采用Tris-HCl緩沖液,pH 9.0~10.0采用甘氨酸-氫氧化鈉緩沖液)條件下,按1.3中方法測酶活力,以酶活最高者為100%繪制曲線,以確定該角蛋白酶的最適反應(yīng)溫度和pH。
1.5.3 角蛋白酶的SDS-keratin-PAGE電泳[7]
分別做2種蛋白膠,以普通蛋白膠做目標(biāo)蛋白的還原性電泳(A);在普通蛋白分離膠中加入1%的角蛋白溶液,使其最終濃度為0.2%,在該蛋白膠上做目標(biāo)蛋白的非還原性電泳(B),電泳條件均為:4℃,150 V恒壓約50 min。蛋白膠A直接染色后脫色;B置于1%的TritonX-100中洗滌3次以去除SDS,每次10 min,然后置于pH 8.5的Tris-HCl緩沖液中55℃恒溫反應(yīng)10 h,將膠取出用考馬斯亮藍(lán)(R250)染色30 min后脫色。
1.6.1 菌株生長曲線和產(chǎn)酶曲線的測定
按1.2.3的培養(yǎng)方法進(jìn)行菌株K13的發(fā)酵,每隔8 h取2 mL發(fā)酵液,置于5 mL離心管中,4 000 r/min離心5 min,沉淀置于鼓風(fēng)干燥箱中80℃以上干燥至恒重;上清液于10 000 r/min離心10 min,取上清液按1.3的方法測角蛋白酶酶活。
1.6.2 培養(yǎng)基的單因素優(yōu)化
在初始發(fā)酵培養(yǎng)基的基礎(chǔ)上,保持其他條件不變,分別添加2%的碳源(葡萄糖、乳糖、蔗糖、可溶性淀粉、酵母粉)、0.2%無機氮源(NaNO3、NH4Cl、NH4HCO3)、1%有機氮源(牛肉膏、蛋白胨、酪蛋白、豆餅粉),進(jìn)行搖瓶發(fā)酵(分別設(shè)置3組平行實驗,取平均水平),以發(fā)酵64 h上清液的角蛋白酶活力為考核指標(biāo)探索各因素對金色鏈霉菌K13發(fā)酵產(chǎn)酶的影響。
1.6.3 培養(yǎng)基的正交實驗優(yōu)化
根據(jù)單因素實驗結(jié)果,選取葡萄糖(A)、蛋白胨(B)、NaNO3(C)、羊毛粉(D)4個影響角蛋白酶活力的主要因素,每個因素選取3個水平,進(jìn)行L9(34)正交實驗設(shè)計(表1),根據(jù)實驗結(jié)果確定最佳培養(yǎng)基成分及水平,進(jìn)行驗證實驗。
表1 正交實驗設(shè)計因素水平表Table 1 Experimental variables and levels for orthogonal design
2.1.1 產(chǎn)角蛋白酶微生物的初篩
從7個土壤樣品中分離篩選角蛋白酶產(chǎn)生菌,經(jīng)初步分離純化共分離得到32株菌,菌株來源如表2所示。
表2 產(chǎn)角蛋白酶菌株的土壤初篩結(jié)果Table 2 Screening results of keratinase-producing strains
有羊毛存在的土壤中能利用角蛋白的微生物相對較豐富,其他土壤中也存在能利用羊毛角蛋白生長的微生物,但數(shù)量較少,表明微生物角蛋白酶為底物誘導(dǎo)型蛋白酶。根據(jù)鏡檢及菌落形態(tài)初步判斷32株菌中有13株放線菌,18株細(xì)菌,1株真菌,選擇生長良好的菌株繼續(xù)分離培養(yǎng),共得到18株菌的純培養(yǎng)物。
2.1.2 產(chǎn)角蛋白酶微生物的復(fù)篩
將初篩得到的18株菌進(jìn)行搖瓶發(fā)酵測其產(chǎn)酶活力,其中13號菌株(放線菌)產(chǎn)酶活力最高達(dá)3.9 U/mL,4號(放線菌)和22號(細(xì)菌)菌株次之,其他菌株產(chǎn)酶均較低,且穩(wěn)定性不高(表3),選取13號菌株進(jìn)行后續(xù)研究。
2.1.3 產(chǎn)酶菌株的鑒定
2.1.3.1 13號菌株形態(tài)學(xué)特征與生理生化特征鑒定
該菌株菌落形態(tài)為圓形,質(zhì)地致密,表面干燥而多皺,無光澤,具有發(fā)達(dá)的基內(nèi)菌絲和黃色孢子。革蘭氏染色陽性,鏡檢有分枝的菌絲,孢子成鏈狀生長。根據(jù)菌株生理生化特征(表4),并參照《伯杰細(xì)菌鑒定手冊》初步鑒定該菌株為放線菌目鏈霉菌科鏈霉菌屬。
表3 各菌株酶活力測定結(jié)果Table 3 Keratinase activities of strains
表4 菌株K13的生理生化特征Table 4 Physiological and biochemical characters of strain K13
2.1.3.2 菌株的16S rDNA鑒定
按1.4.2所述實驗方法獲得13號菌株的16S rDNA,約1 600bp(圖1A),經(jīng)測序比對,該菌株16S rDNA與金色鏈霉菌(Streptomyces aureus)16S rDNA的同源性為99%,菌株系統(tǒng)進(jìn)化樹如圖1B所示,結(jié)合菌株生理生化特征,將該菌株鑒定為金色鏈霉菌,命名為K13。文獻(xiàn)報道,金色鏈霉菌通常作為抗生素產(chǎn)生菌被廣泛研究,工業(yè)上作為一種四環(huán)類抗生素——金霉素的主要生產(chǎn)菌株[8],目前尚無該菌株產(chǎn)角蛋白酶的相關(guān)報道,本文將對其展開研究。
2.2.1 粗酶的最適作用溫度和pH的測定
分別考察該角蛋白酶粗酶的最適溫度和pH,結(jié)果如圖2所示:過高或過低的溫度均對該酶活力有較大的抑制作用,中溫(50~60℃)條件下該酶相對酶活力保持在90%以上,表明該酶為中溫酶,最適作用溫度為55℃;該酶在酸性條件(pH 3.0~6.0)下相對酶活力低于20%,堿性條件(pH 7.5~10.0)下相對酶活力均保持在80%以上,表明該酶為堿性角蛋白酶,最適作用pH為8.5,且在堿性條件下的pH適應(yīng)范圍較寬。
圖1 菌株16S rDNA和系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.1 16S rDNA and phylogenetic tree of strain K13
圖2 金色鏈霉菌角蛋白酶粗酶性質(zhì)Fig.2 The crude enzymatic characteristics of keratinase produced by Streptomyces aureus K13
2.2.2 角蛋白酶的SDS-keratin-PAGE電泳
將發(fā)酵所得上清液用離心濃縮儀濃縮5~6倍,按1.5.3的方法進(jìn)行分析,結(jié)果如圖3所示,對比還原性電泳條帶(A)與非還原性活性電泳條帶(B),可知該菌株所產(chǎn)角蛋白酶分子質(zhì)量約為46 kDa。
圖3 角蛋白酶的SDS-keratin-PAGE電泳Fig.3 SDS-keratin-PAGE electrophoresis of keratinase
綜合以上結(jié)論,金色鏈霉菌K13所產(chǎn)角蛋白酶為中溫堿性角蛋白酶,分子質(zhì)量約為46 kDa,最適溫度為55℃,最適pH為8.5。比較目前已報道的角蛋白酶特性[5],菌株K13所產(chǎn)角蛋白酶與菌株Streptomyces gulbagensis DAS 131(分子質(zhì)量46 kDa,最適溫度45℃,最適pH 9.0)[9]的理化性質(zhì)相似,后者在添加了3%淀粉的培養(yǎng)基中液態(tài)發(fā)酵7d,產(chǎn)酶活力達(dá)到最高14.3 U/mL。
2.3.1 菌株產(chǎn)酶曲線的測定
考察金色鏈霉菌K13的生長及產(chǎn)酶曲線,如圖4所示:菌株經(jīng)過16 h的生長延滯期后進(jìn)入對數(shù)生長期,并于64 h進(jìn)入平穩(wěn)期;該菌株產(chǎn)酶屬于生長偶聯(lián)型,酶合成伴隨菌株生長而開始,并在菌株進(jìn)入生長穩(wěn)定期時(64 h)達(dá)到最高產(chǎn)酶4.15 U/mL;酶活力在80 h后迅速下降,可能是發(fā)酵后期,培養(yǎng)基營養(yǎng)匱乏,菌株利用自身合成的角蛋白酶以維持生長。
圖4 金色鏈霉菌K13生長及產(chǎn)酶曲線Fig.4 Growth and keratinase-producing curve of Streptomyces aureus K13
2.3.2 發(fā)酵培養(yǎng)基的碳氮源優(yōu)化
考察不同碳氮源對菌株產(chǎn)酶的影響,如圖5所示。乳糖和酵母粉的添加一定程度抑制了產(chǎn)酶,而葡萄糖、蔗糖、可溶性淀粉均對產(chǎn)酶有促進(jìn)作用,其中葡萄糖的促進(jìn)效果最為明顯,酶活力提高了110%;有機氮源蛋白胨和無機氮源NaNO3對產(chǎn)酶有促進(jìn)作用,酶活力分別提高了63%和71%,其余氮源對產(chǎn)酶均有不同程度的抑制。以上結(jié)果表明,以羊毛角蛋白為底物發(fā)酵產(chǎn)角蛋白酶時添加合適的碳源或氮源對產(chǎn)酶有明顯的促進(jìn)作用。
圖5 不同碳氮源對金色鏈霉菌K13發(fā)酵產(chǎn)角蛋白酶的影響Fig.5 Effects of different carbon and nitrogen sources on keratinase production by Streptomyces aureus K13
2.3.3 培養(yǎng)基組份的正交實驗優(yōu)化
根據(jù)單因素實驗結(jié)果,選擇葡萄糖、蛋白胨、硝酸鈉和羊毛粉4個對產(chǎn)酶影響較為顯著的因素,以角蛋白酶酶活(U/mL)作為響應(yīng)值,進(jìn)行正交試驗優(yōu)化,結(jié)果如表5所示。
表5根據(jù)極差(R)分析,4個因素的主次順序為羊毛粉(D)>葡萄糖(A)>蛋白胨(B)>NaNO3(C),羊毛粉對酶活力的影響最大;由均值分析所得,最優(yōu)組合方案為A3B3C3D1,即葡萄糖4%,蛋白胨3%,NaNO30.3%,羊毛粉0.5%,在最佳條件下進(jìn)行3批次發(fā)酵實驗,平均酶活力為(44.2±1.7)U/mL,較優(yōu)化前(3.9 U/mL)提高了10.3倍。
表5 正交實驗表Table 5 Results and analysis of orthogonal design
試驗號因素A(葡萄糖)/(g·L-1)B(蛋白胨)/(g·L-1)C(NaNO3)/(g·L-1)D(羊毛粉)/(g·L-1)響應(yīng)值酶活/(U·mL-1)7 40 10 3 10 33.6±1.30 8 40 20 1 20 16.7±0.86 9 40 30 2 5 39.4±0.97 k1 22.2 26.1 27.6 34.7 k2 27.0 22.7 23.5 28.8 k3 29.9 30.3 28.1 15.6 R 7.8 7.5 4.6 19.2因素主次關(guān)系 D>A>B>C最優(yōu)組合水平 A3B3C3D1
本文以羊毛角蛋白為底物,從7個土壤樣品中篩選獲得1株角蛋白酶活性較高的菌株,經(jīng)生理生化和分子生物學(xué)鑒定為金色鏈霉菌(Streptomyces aureus),命名為K13,對該菌株粗酶性質(zhì)的研究發(fā)現(xiàn):菌株K13所產(chǎn)角蛋白酶為中溫堿性角蛋白酶,分子質(zhì)量約為46 kDa,最適溫度為55℃,最適pH為8.5,且在堿性條件下的pH適應(yīng)范圍較寬。從分子質(zhì)量大小分析,菌株K13所產(chǎn)角蛋白酶與菌株Streptomyces sp.S7(44 kDa),Streptomyces gulbagensis DAS 131(46 kDa)極其相近,上述菌株均為鏈霉菌屬,對羽毛有一定的降解能力,且EDTA對酶活性有一定的抑制作用[9-12];從最適pH與溫度分析,相同或不同菌株來源的角蛋白酶均表現(xiàn)出不同性質(zhì),本文所述角蛋白酶的最適pH/溫度與菌株Bacillus subtilis KD-N2(pH8.5,T55)相同,與Bacillus cereus DCUW(pH8.5,T50),Bacillus licheniformis K-508(pH8.5,T52),Chryseobacteriumsp.kr6(pH8.5,T50),Streptomyces thermoviolaceus(pH 8,T55)等菌株相似[5]。
筆者通過傳統(tǒng)的菌種選育手段篩選到1株產(chǎn)角蛋白酶的金色鏈霉菌K13,經(jīng)4因素3水平的正交實驗優(yōu)化,其產(chǎn)酶活性達(dá)到44.2 U/mL,該產(chǎn)酶水平較已報道的基因工程菌株[13-14]相去甚遠(yuǎn),但在野生菌株[13-14]中仍有一定的優(yōu)勢,且目前尚無該菌株產(chǎn)角蛋白酶的相關(guān)報道。對該菌株產(chǎn)酶特性與代謝途徑、酶蛋白分子結(jié)構(gòu)及編碼基因等的進(jìn)一步研究,將有望獲得新的角蛋白酶,并對探討和完善金色鏈霉菌代謝產(chǎn)物及基因組結(jié)構(gòu)意義重大。
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