羅明和,黃洪波,李沉紋,于彩平,馬俊英,盧來(lái)春*,鞠建華*
1 第三軍醫(yī)大學(xué)大坪醫(yī)院野戰(zhàn)外科研究所藥劑科,重慶 400042;2中國(guó)科學(xué)院熱帶海洋生物資源與生態(tài)
重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室中國(guó)科學(xué)院海洋微生物中心廣東省海洋藥物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所,廣州 510301
自上世紀(jì)50 年代從海洋來(lái)源的頭孢霉菌(Cephalosporium)分離得到頭孢菌素C 以來(lái)[1],海洋真菌天然產(chǎn)物研究越來(lái)越受到人們的關(guān)注。海洋所獨(dú)具的低溫、高壓、高鹽、寡營(yíng)養(yǎng)等特殊的環(huán)境,為海洋真菌產(chǎn)生結(jié)構(gòu)新穎、活性獨(dú)特的代謝產(chǎn)物提供了可能。目前從海洋真菌的發(fā)酵產(chǎn)物中分離鑒定的新化合物已經(jīng)超過(guò)1000 個(gè),并且數(shù)量還在不斷增加;其結(jié)構(gòu)類型主要是聚酮類和生物堿,其次是萜類、肽類。人們從這些數(shù)量眾多的海洋真菌次級(jí)代謝產(chǎn)物中篩選到有藥用價(jià)值的、具有抗腫瘤、抗菌、抗病毒等活性的抗生素[2-4]。其中,Diketopiperazine halimide 最具有代表性,是由加州大學(xué)圣地亞哥分校的Fenical 研究小組發(fā)現(xiàn)的,它能抑制微管蛋白聚合,在此基礎(chǔ)上研發(fā)的該化合物的結(jié)構(gòu)類似物plinabulin(NPI-2358)正在進(jìn)行治療非小細(xì)胞肺癌的臨床二期研究[5,6]。
本課題組在對(duì)南海海洋來(lái)源真菌活性次級(jí)代謝產(chǎn)物的持續(xù)研究中,發(fā)現(xiàn)了一些新的活性次級(jí)代謝產(chǎn)物:從海洋來(lái)源曲霉屬真菌Aspergillus sp.SCSIO F063 分離獲得了少見(jiàn)的氯代及溴代蒽醌[7],從蟲(chóng)草屬真菌Acremonium persicinum SCSIO 115 中分離獲得了具有細(xì)胞毒活性的環(huán)肽[8],從炭角屬真菌Xylaria sp.SCSIO 156 中分離得到具有細(xì)胞毒活性的細(xì)胞松弛素[9],從青霉屬真菌Penicillium sp.SOF 07中獲得了有免疫酶抑制劑活性的霉酚酸類化合物[10]。最近,我們發(fā)現(xiàn)一株南海海洋來(lái)源的真菌SCSIO 81-F2 的發(fā)酵產(chǎn)物對(duì)枯草芽孢桿菌Bacillus subtilis ATCC6633、蘇云金芽孢桿菌Bacillus thuringiensis ATCC10792、金黃色葡萄球菌Staphyloccocus aureus ATCC29213 和大腸桿菌 Escherichia coli ATCC25922 具有抑菌活性。隨后,我們通過(guò)18S rDNA 序列分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù),鑒定該菌株屬于曲霉屬真菌Aspergillus sp.。采用土豆培養(yǎng)基(PDB)發(fā)酵,利用抑菌活性追蹤與色譜層析技術(shù)相結(jié)合的方法從其發(fā)酵產(chǎn)物中分離獲得三個(gè)化合物,經(jīng)ESI-MS、1H/13C NMR 及X-單晶衍射分析鑒定為含異腈基的抗生素xanthocillin X dimethylether(1)、xanthocillin X monomethylether(2)、6',8'-dimethoxy xanthocillin X dimethylether(3)。本文報(bào)道該菌株的分子生物學(xué)及由該菌株產(chǎn)生的異腈基類化合物的分離和鑒定。
Bruker DRX 500 核磁共振儀(500/125 MHz,TMS 為內(nèi)標(biāo));Bruker amazon SL 離子肼質(zhì)譜儀;Oxford Gemini A Ultra X-單晶衍射儀;Varian ProStar 210 高效液相色譜儀(配PDA 檢測(cè)器);YMC-pack ODS-A 色譜柱(250×10 mm,5 μm);HS-GF254硅膠薄層板(煙臺(tái)江友硅膠開(kāi)發(fā)有限公司);色譜純乙腈(安徽時(shí)聯(lián)公司),其它試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
海洋真菌SCSIO 81-F2 是從中國(guó)南海北部深海沉積土中分離純化而來(lái),菌種保存于中國(guó)科學(xué)院海洋微生物研究中心。
PDA 培養(yǎng)基:去皮馬鈴薯(200 g/L),切成小塊,加水煮沸30 min,砂布過(guò)濾,取濾液加葡萄糖(20 g/L),海鹽(30 g/L),2 % 瓊脂粉,115 ℃滅菌30 min,冷卻后備用。
PDB 培養(yǎng)基:PDA 培養(yǎng)基配方中不加瓊脂粉,115 ℃滅菌30 min,冷卻后備用。
1.2.1 海洋真菌81-F2 的分子生物學(xué)鑒定
1.2.1.1 18S rDNA 序列PCR 擴(kuò)增
用真菌18S 通用引物,ITS1:(5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3')和ITS4:(5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3')[11],進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。PCR 反應(yīng)體系(20 μL):DNA 模板1 μL,10×Buffer 2 μL,dNTPs(2.5 mmol/L)1.6 μL,ITS1 primer(10 μmol/L)0.4 μL,ITS4 primer(10 μmol/L)0.4 μL,HiFi(5U/μL)0.2 μL,ddH2O 14.4 μL。PCR 反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性1 min,58 ℃退火45 s,72℃延伸40 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min;4 ℃保溫。
1.2.1.2 擴(kuò)增產(chǎn)物的序列測(cè)定
用凝膠回收試劑盒(OMEGA)純化PCR 產(chǎn)物,克隆至pCR2.1 載體(INVITROGEN)上,18S rDNA序列由美吉生物技術(shù)有限公司測(cè)定。將測(cè)得的18S rDNA 序列進(jìn)行BLAST 分析(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)。
1.2.1.3 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建
通過(guò)CLUSTAL X 軟件對(duì)海洋真菌菌株SCSIO 81-F2 及真菌中最相似菌株的18S rDNA 序列進(jìn)行比對(duì),使用軟件MEGA4.0 中的Neighbor-joining 法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)[12,13]。
1.2.2 菌株的發(fā)酵培養(yǎng)
用250 mL 錐形瓶,每瓶加入50 mL PDB 培養(yǎng)基,從平板上接入海洋真菌81-F2 的菌絲體,于28℃、200 rpm 搖床上培養(yǎng)2 d 后分別轉(zhuǎn)入含200 mL PDB 培養(yǎng)基的1 L 錐形瓶中,于28 ℃、200 rpm 培養(yǎng)8 d。
1.2.3 抗菌活性檢測(cè)
取5 mg/mL 的樣品提取物DMSO 溶液5 μL,加到直徑為0.6 cm 無(wú)菌濾紙片上,置于生長(zhǎng)有枯草芽孢桿菌Bacillus subtilis ATCC6633、蘇云金芽孢桿菌Bacillus thuringiensis ATCC10792、金黃色葡萄球菌Staphyloccocus aureus ATCC29213 和大腸桿菌Escherichia coli ATCC25922 的LB 檢測(cè)平板,37 ℃培養(yǎng)24 h,測(cè)量抑菌活性。
1.2.4 發(fā)酵產(chǎn)物的提取和分離
發(fā)酵產(chǎn)物(6 L)于4000 rpm 離心10 min,分離得到上清液和菌絲體。取上清液及菌絲體分別用乙酸乙酯和丙酮萃取得少量粗提物進(jìn)行抑菌活性檢測(cè),結(jié)果顯示菌絲體的萃取物有活性,上清液萃取物無(wú)活性。同時(shí),HPLC 檢測(cè)發(fā)現(xiàn)菌絲體的提取物有次級(jí)代謝產(chǎn)物色譜峰,而上清液中未見(jiàn)。于是棄去上清液,將菌絲體用丙酮萃取3 次,經(jīng)減壓濃縮后得菌絲體粗提物總浸膏6 g。采用正相柱層析,氯仿-甲醇體系梯度(100∶0,98∶2,96∶4,94∶6,92∶8,90∶10,8∶2,5∶5,V/V)洗脫,得到Fr.1~Fr.8 共8 個(gè)餾份,餾份Fr.1,F(xiàn)r.2 有抑菌活性。對(duì)餾份Fr.1 用常壓正相硅膠柱層析,乙酸乙酯-石油醚梯度(10∶90,20∶80,30∶70,40∶60,50∶50,V/V)洗脫,反復(fù)純化3次,最后用二氯甲烷對(duì)較純產(chǎn)物重結(jié)晶得到化合物1。Fr.2 采用正相柱層析,氯仿-甲醇梯度(100∶0,98∶2,96∶4,94∶6,92∶8,9∶1,V/V)洗脫,經(jīng)HPLC 檢測(cè)分析合并Fr.2-(2-5),再對(duì)Fr.2-(2-5)用半制備高效液相色譜(CH3CN/H2O 30%~100% 梯度洗脫20 min,流速2.5 mL/min)純化,得到化合物2(tR=15.5 min)、3(tR=19.4 min)。
18S rDNA 序列分析表明菌株SCSIO 81-F2 與曲霉菌屬Aspergillus unguis DFFSCS009 及Aspergillus sp.SCSIOF063 菌株的18S rDNA 序列相似性較高,所以鑒定為Aspergillus sp.81-F2,其菌落形態(tài)見(jiàn)圖1,系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)見(jiàn)圖2。
圖1 菌株SCSIO 81-F2 在PDA 培養(yǎng)基上的形態(tài)圖Fig.1 Phenotype of strain SCSIO 81-F2 on PDA-medium plate
圖2 基于18S rDNA 序列構(gòu)建的SCSIO 81-F2 與其他真菌菌種NJ 分子系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.2 Neighbour-joining tree based on 18S rDNA sequences showing relationships between strain SCSIO 81-F2 and closely related members of fungi
化合物1 黃色塊狀晶體,(+)ESI-MS 給出分子準(zhǔn)離子峰m/z 317.1[M+H]+、339.0[M+Na]+及655.3[2M+Na]+,據(jù)此推測(cè)化合物1 的分子量為316。13C NMR 譜僅顯示8 個(gè)C 信號(hào),含一個(gè)低場(chǎng)區(qū)信號(hào)δC173.3,一個(gè)連氧芳碳信號(hào)δC161.1,五個(gè)芳碳信號(hào),一個(gè)連氧脂肪碳信號(hào)δC55.4,提示該化合物存在對(duì)稱結(jié)構(gòu)。1H NMR 譜揭示4 處質(zhì)子信號(hào)δH7.79、6.99、6.98、3.86,其積分比為2∶1∶2∶3,因此,推測(cè)其分子式為C20H16N2O2。進(jìn)而推斷13C NMR 譜中低場(chǎng)區(qū)碳信號(hào)δC173.3 可能為異腈基碳信號(hào)。再仔細(xì)分析1H NMR 譜信號(hào),在低場(chǎng)區(qū)存在芳環(huán)的鄰位偶合系統(tǒng)δH7.79(d,J=8.5 Hz)、6.98(d,J=8.5 Hz),推斷分子中可能含有對(duì)位取代的苯環(huán)結(jié)構(gòu);δH6.99(s)為孤立烯鍵質(zhì)子信號(hào),說(shuō)明分子中存在雙鍵;δH3.86(s)結(jié)合δC55.4 碳信號(hào),推斷分子中存在甲氧基。經(jīng)查閱文獻(xiàn)[14],與報(bào)道的xanthocillin X dimethylether 的波譜數(shù)據(jù)一致,故化合物1 鑒定為xanthocillin X dimethylether。經(jīng)培養(yǎng)獲得了化合物1 的單晶,進(jìn)一步運(yùn)用X-單晶衍射驗(yàn)證了化合物1 的結(jié)構(gòu)(圖4)。
1H NMR(CDCl3,500 MHz)δ:7.79(4H,d,J=8.8 Hz,H-5,5';9,9'),6.99(2H,s,H-3,3'),6.98(4H,d,J=8.8 Hz,H-6,6';8,8'),3.86(6H,s,H-10,10');13C NMR(CDCl3,125 MHz)δ:173.3(C-1,1'),161.1(C-7,7'),131.7(C-5,5';9,9'),127.4(C-3,3'),124.8(C-4,4'),116.1(C-2,2'),114.4(C-6,6';8,8'),55.4(C-10,10')。
圖3 化合物1 的X-單晶衍射結(jié)構(gòu)圖Fig.3 The X-ray structure of compound 1
化合物2 黃色粉末,(+)ESI-MS 給出分子準(zhǔn)離子峰m/z 303.0[M+H]+、325.0[M+Na]+、655.3[2M+Na]+,推測(cè)化合物2 的分子量為302,較化合物1 少14 個(gè)質(zhì)量數(shù),推斷其分子式為C19H14N2O2?;衔? 的1H NMR 譜在低場(chǎng)區(qū)有δH7.78與6.99(J=8.9 Hz),7.71 與6.92(J=8.7 Hz)兩對(duì)典型的苯環(huán)鄰位質(zhì)子偶合系統(tǒng),δH6.98 處有一個(gè)呈單峰的烯氫信號(hào),δH3.89 存在一個(gè)甲氧基質(zhì)子信號(hào)。13C NMR 給出15 個(gè)碳信號(hào):低場(chǎng)區(qū)δC172.6,172.4 兩個(gè)碳信號(hào),兩個(gè)連氧芳碳信號(hào)δC161.3 及159.5,10 個(gè)芳碳信號(hào),以及一個(gè)連氧脂肪碳信號(hào)δC55.1。推斷化合物2 存在兩個(gè)對(duì)位取代苯環(huán),兩個(gè)雙鍵,兩個(gè)異腈基,以及一個(gè)甲氧基,與化合物1 比較,少了一個(gè)甲氧基。經(jīng)查閱文獻(xiàn)[15],與報(bào)道的波譜數(shù)據(jù)一致,故鑒定為Xanthocillin X monomethylether。
1H NMR(CD3OD,500 MHz)δ:7.78(2H,d,J=8.9 Hz,H-5,9),7.71(2H,d,J=8.7 Hz,H-5',9'),6.99(2H,d,J=8.9 Hz,H-6,8),6.98(2H,s,H-3,3'),6.92(2H,d,J=8.7 Hz,H-6',8'),3.89(3H,s,H-10);13C NMR(CD3OD,125 MHz)δ:172.6(C-1),172.4(C-1'),161.3(C-7),159.5(C-7'),132.2(C-5',9'),131.9(C-5,9),128.3(C-3'),127.5(C-3),125.1(C-4),123.9(C-4'),116.4(C-2),116.2(C-6',8'),115.5(C-2'),114.7(C-6,8),55.1(C-10)。
化合物3(+)ESI-MS 給出分子準(zhǔn)離子峰m/z 399.2[M+Na]+及775.2[2M+Na]+,因此化合物3 的分子量為376,推斷其分子式為C22H20N2O4。1H NMR 譜低場(chǎng)區(qū)給出苯環(huán)鄰位偶合體系的特征信號(hào)δH7.81(d,J=8.5 Hz)、6.99(d,J=8.5 Hz),說(shuō)明分子中存在對(duì)位取代苯環(huán)。1H NMR譜還給出呈單峰的烯氫信號(hào)δH7.08、7.06、7.00,積分比為2∶1∶1,提示分子中存在兩個(gè)雙鍵,以及一個(gè)1,3,4,5-四取代苯環(huán);另外還有甲氧基質(zhì)子信號(hào)δH3.93 和3.88,積分比為3∶1,推斷分子中存在4 個(gè)甲氧基。13C NMR 譜低場(chǎng)區(qū)δC173.9 和δC173.4 對(duì)應(yīng)兩個(gè)異腈基碳,高場(chǎng)區(qū)在δC61.0、56.3、55.5 有三個(gè)甲氧基碳信號(hào),其中56.3 處的信號(hào)顯著偏高,為兩個(gè)碳原子。經(jīng)比對(duì)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)[16],發(fā)現(xiàn)與6',8'-dimethoxy xanthocillin X dimethylether 的波譜數(shù)據(jù)一致,因此,化合物3 為6',8'-dimethoxy xanthocillin X dimethylether。
1H NMR(CD3OD 500 MHz)δ:7.81(2H,d,J=8.5 Hz,H-5,9),7.08(2H,s,H-5',9'),7.06(1H,s,H-3),7.00(1H,s,H-3'),6.99(2H,d,J=8.5 Hz,H-6,8),3.88(3H,s,H-10),3.93(9H,s,H-10',11',12');13C NMR(CDCl3125 MHz)δ:173.9(C-1),173.4(C-1'),161.3(C-7),153.3(C-6',8'),140.0(C-7'),131.9(C-5,9),131.8(C-3'),131.4(C-3),128.2(C-4'),127.8(C-4),127.4(C-2'),124.7(C-2),114.5(C-6,8),107.3(C-5',9'),61.0(C-10'),56.3(C-11',12'),55.5(C-10)。
圖4 化合物1、2、3 的化學(xué)結(jié)構(gòu)式Fig.4 Chemical structures of compounds 1,2 and 3
Xanthocillin 最早于1950 從一株青霉Penicillium notatum Westling 的發(fā)酵產(chǎn)物中得到,并于1957年由Hagedorn 和Tonjes 確定其化學(xué)結(jié)構(gòu)[17]。它們都帶有一個(gè)異腈基,具有很強(qiáng)的生物活性,是一類廣譜抗生素,能抑制大部分革蘭氏陰性和陽(yáng)性菌以及部分真菌如大腸桿菌、枯草芽胞桿菌、金黃色葡萄球菌、白色念珠菌、酵母菌等的生長(zhǎng),并能抑制耐青霉素和磺胺類藥物的耐藥菌的生長(zhǎng)。但是由于它在哺乳動(dòng)物的胃腸中吸收很差,所以只能做成軟膏作為外用制劑使用。Xanthocillin 類化合物不具有溶血效應(yīng),但是在劑量過(guò)大時(shí)會(huì)有神經(jīng)毒活性。報(bào)道最多的Xanthocillin X monomethylether 還能特異性的抑制花生四烯酸到前列腺素H2 的生物合成,它的衍生物對(duì)實(shí)體瘤也有很好的抑制活性,其成果已被日本的Hiroshi Kurihara 等申請(qǐng)專利保護(hù)[18,19]。另外有報(bào)道顯示Xanthocillin 作為促血小板生成素模仿物,能選擇性誘導(dǎo)c-Mpl-expressed UT-7 細(xì)胞的生長(zhǎng),極有可能開(kāi)發(fā)成促血小板生成的新藥物,Xanthocillin X monomethylether 同時(shí)還能誘導(dǎo)一些蛋白的磷?;?6]。本研究從一株海洋來(lái)源的真菌中分離獲得了Xanthocillin 類化合物,為該類化合物提供了新的來(lái)源,為其結(jié)構(gòu)改造和藥理藥效研究提供了物質(zhì)基礎(chǔ)。
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