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心肌纖維化的表觀遺傳調(diào)控進(jìn)展

2015-01-21 16:56:36李龍楊水祥
中國(guó)心血管病研究 2015年12期
關(guān)鍵詞:乙?;?/a>表觀纖維細(xì)胞

李龍 楊水祥

心肌纖維化的表觀遺傳調(diào)控進(jìn)展

李龍 楊水祥

1 引言

大多數(shù)心臟疾病都與心肌纖維化有關(guān)。心肌纖維化即心肌瘢痕形成的過程,它的特點(diǎn)是成纖維細(xì)胞的積累和細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)蛋白的過度沉積,從而導(dǎo)致器官的結(jié)構(gòu)畸形和功能改變[1]。值得注意的是,心肌成纖維細(xì)胞表達(dá)α-平滑肌肌動(dòng)蛋白(α-SMA),似乎能分泌大量細(xì)胞因子、生長(zhǎng)因子、ECM蛋白,從而在纖維化發(fā)病中起主要作用[2]。過量的膠原產(chǎn)生并沉積在心臟,導(dǎo)致了心肌纖維化。心肌成纖維細(xì)胞是心肌纖維化的主要決定因素,激活的心肌成纖維細(xì)胞是ECM的主要來源。目前認(rèn)為,一些調(diào)節(jié)因素也對(duì)纖維化有實(shí)質(zhì)性的影響。心肌纖維化同時(shí)影響心肌收縮和舒張,損害心肌細(xì)胞的電耦聯(lián),是導(dǎo)致心力衰竭、致死性心律失常和猝死的重要病理基礎(chǔ)。因此,心肌纖維化的防治是治療各種心臟疾病的重要目標(biāo)。然而現(xiàn)在并沒有治療心肌纖維化的有效方案,這很大程度上是因?yàn)樾募±w維化的潛在機(jī)制仍不清楚。

表觀遺傳學(xué)討論的是可遺傳的基因改變,這種改變不是歸結(jié)于DNA序列的改變,而是由于遺傳信息翻譯或組裝的改變所導(dǎo)致。這些基因表達(dá)的改變具體是通過DNA鏈三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化和影響基因表達(dá)分子的改變來實(shí)現(xiàn)的[3]。表觀遺傳學(xué)重要的改變包括DNA甲基化、組蛋白修飾和microRNA(miRNA)表達(dá)調(diào)控。這些基因修飾導(dǎo)致了相同基因的不同表達(dá),這是周圍的環(huán)境改變所導(dǎo)致的基因增強(qiáng)或沉默。

最近的證據(jù)表明,TGF-β1、血管緊張素Ⅱ可能同時(shí)在固有的成纖維細(xì)胞分化中起著關(guān)鍵的作用。人們已經(jīng)證實(shí)很多基因與心肌纖維化有關(guān)?;虮磉_(dá)的變化涉及到大量的基因,以及不同基因表達(dá)的順序改變等。表觀遺傳調(diào)控在心肌成纖維細(xì)胞的活化和增殖階段,和在轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別表觀遺傳調(diào)控信號(hào)并傳達(dá)基因表達(dá)信息的過程中發(fā)揮著重要作用。新的數(shù)據(jù)表明,這些表觀遺傳修飾同樣影響心肌纖維化的進(jìn)展。

但是,目前對(duì)引起心肌纖維化的表觀遺傳改變的機(jī)制和信號(hào)了解得還很少。本文主要介紹表觀遺傳改變機(jī)制(如DNA甲基化、組蛋白修飾和miRNA調(diào)控)與心肌纖維化的研究進(jìn)展。

2 DNA甲基化和心肌纖維化

DNA甲基化在表觀遺傳中起著重要的作用,它包括基因組印記、X染色體失活、基因沉默等。哺乳動(dòng)物的DNA中胞嘧啶及胞嘧啶鳥嘌呤(CpG)二核苷酸的5號(hào)碳原子可以甲基化。CpG二核苷酸遍及整個(gè)基因組,大量的甲基化可妨礙這些位點(diǎn)的基因轉(zhuǎn)錄。這些CpGs往往集中在基因組中300~3000堿基的DNA片段內(nèi),稱CpG島[4]。大多數(shù)CpG島都是轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)。CpG島估計(jì)占人類基因啟動(dòng)子的50%~70%,基因啟動(dòng)子CpG島甲基化與基因沉默相關(guān)。CpG島也存在于基因之外,主要是在相對(duì)保守的基因區(qū)間。這些CpG島的功能沒有得到很好的發(fā)現(xiàn)[5]。因?yàn)閮煞NCpG島啟動(dòng)子的甲基化模式相似,人們懷疑它們可能是遠(yuǎn)端調(diào)控區(qū)及增強(qiáng)子的一部分。

DNA甲基化由至少三種不同的DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)催化:DNMT1、DNMT3A和DNMT3B?,F(xiàn)主要認(rèn)為DNMT1是一個(gè)維持性DNMT,對(duì)半甲基化DNA具有巨大的特異性,維持復(fù)制過程中的DNA甲基化模式[6];認(rèn)為DNMT3A和DNMT3B是從頭甲基轉(zhuǎn)移酶[7]。盡管DNA甲基化酶已經(jīng)被廣泛認(rèn)識(shí),人們卻很少了解DNA甲基化的過程。DNA甲基化酶介導(dǎo)胞嘧啶的甲基化,使甲基基團(tuán)從甲基供體S-腺苷甲硫氨酸轉(zhuǎn)移到胞嘧啶的五號(hào)碳原子上。CpG島胞嘧啶的甲基化,通過阻止轉(zhuǎn)錄因子到DNA順式元件與基因啟動(dòng)子結(jié)合區(qū)域的結(jié)合,來抑制轉(zhuǎn)錄。在這一過程中,甲基化CpG二核苷酸的甲基基團(tuán)插入DNA雙螺旋間溝內(nèi)[8]。正常組織中CpG島甲基化允許基因轉(zhuǎn)錄的發(fā)生,然而在纖維化過程中,CpG島DNA異常甲基化的出現(xiàn)阻礙了重要基因的翻譯。DNA的甲基化會(huì)干預(yù)轉(zhuǎn)錄因子接近和招募它們的DNA結(jié)合區(qū),這種機(jī)制導(dǎo)致了甲基化基因的轉(zhuǎn)錄沉默[9]。最近發(fā)現(xiàn)一種甲基CpG結(jié)合蛋白家族能特異性地結(jié)合甲基化標(biāo)志物,通過招募組蛋白修飾蛋白從而抑制轉(zhuǎn)錄。這些甲基CpG結(jié)合蛋白能夠招募大量蛋白復(fù)合物,這些復(fù)合物又通過改變?nèi)旧w結(jié)構(gòu)來控制DNA轉(zhuǎn)錄[10]。

心肌成纖維細(xì)胞增殖的表型改變和表型特征可以用暴露于惡劣環(huán)境條件來解釋。硒缺乏導(dǎo)致了反應(yīng)性心肌纖維化和收縮功能障礙,并伴隨著心肌氧耗的增加。而補(bǔ)充硒會(huì)顯著降低DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的活性和DNA甲基化的發(fā)生。這些結(jié)果表明,硒缺乏和適度補(bǔ)硒通過影響DNA甲基化平衡來調(diào)節(jié)心肌纖維化[11]。這表明激活的DNA甲基化過程可能有助于心肌纖維化。

3 組蛋白修飾和心肌纖維化

在DNA轉(zhuǎn)錄期,組蛋白修飾使基因組處于“激活狀態(tài)”或稱常染色質(zhì),此時(shí)DNA可轉(zhuǎn)錄,而處于“非激活狀態(tài)”或異染色質(zhì)時(shí)DNA不可轉(zhuǎn)錄[12]。組蛋白修飾是通過不同的酶催化的,包括甲基化酶、乙?;浮⒘姿峄傅?。雖然有許多不同類型的翻譯后修飾,但這里將重點(diǎn)討論研究最多的兩個(gè)組蛋白修飾,即組蛋白乙?;徒M蛋白甲基化。

組蛋白乙?;且粋€(gè)動(dòng)態(tài)過程,調(diào)節(jié)組蛋白乙?;福℉ATs)和組蛋白去乙?;福℉DAC)兩大家族的拮抗活性,達(dá)到動(dòng)態(tài)平衡[13]。HDACs分為四類:Ⅰ類(HDAC1-3、HDAC8)、Ⅱ類(HDAC4-7、HDAC 9-10)、Ⅲ類去乙酰化酶(SIRT1-7)和Ⅳ類(HDAC11)。一般說來,組蛋白的乙?;c基因的轉(zhuǎn)錄激活有關(guān),而組蛋白去乙?;c基因阻遏和沉默有關(guān)[14]。

不同的是,賴氨酸甲基化可歷經(jīng)多次的修飾出現(xiàn)三種不同的狀態(tài)(一甲基化、二甲基化和三甲基化的賴氨酸)。不同組蛋白的甲基化、組蛋白賴氨酸甲基化或精氨酸殘基甲基化對(duì)基因表達(dá)有不同的影響結(jié)果[15]。例如,組蛋白H3(H3K4me3)上的三甲基化通常與轉(zhuǎn)錄激活有關(guān),而 H3K9me3和H3K27me3與異染色質(zhì)介導(dǎo)的基因沉默有關(guān)。這些修飾是由組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶(HMTS)來介導(dǎo)的,它動(dòng)態(tài)地充當(dāng)組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶和組蛋白去甲基化酶[16]。

為了進(jìn)一步研究組蛋白修飾對(duì)心肌纖維化的反應(yīng),可使用化學(xué)抑制劑單獨(dú)抑制組蛋白乙?;福℉AT)或組蛋白去乙?;福℉DAC)活性。HDAC對(duì)心肌纖維化模型的炎性損害作用已被發(fā)現(xiàn)[17]。自發(fā)性高血壓大鼠,使用丙戊酸治療20周會(huì)減少LED IL-1β和TNF-α的表達(dá),這與心肌肥厚和纖維化的抑制和心臟功能的改善有關(guān)。HDAC抑制劑對(duì)病理性心肌纖維化有較大的抑制作用:HDAC抑制劑會(huì)抑制其他信號(hào)介質(zhì)(例如,ERK、Akt、PI3K)來影響膠原合成,TSA阻斷了TGF-β1介導(dǎo)的體外培養(yǎng)大鼠心室成纖維細(xì)胞的膠原合成。HDAC抑制劑通過抑制α-SMA的表達(dá)阻斷分化的成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)為收縮的肌成纖維細(xì)胞[18]。

據(jù)報(bào)道,組蛋白乙?;茿ngⅡ誘導(dǎo)的IGF-ⅡR基因表達(dá)所必需的。此外,染色質(zhì)免疫沉淀分析表明,乙?;M蛋白H3和H4與AngⅡ誘導(dǎo)的IGF-ⅡR啟動(dòng)子增強(qiáng)有關(guān)??傊@項(xiàng)研究表明,組蛋白乙?;诓±硇孕募±w維化IGF-ⅡR的上調(diào)方面起著關(guān)鍵作用[19]。

染色質(zhì)免疫沉淀分析表明,TGF-β1β的治療增加了Smad2/3、Smad4和組蛋白去乙?;?的結(jié)合,還增加了乙?;M蛋白3和心肌成纖維細(xì)胞中PPARγ啟動(dòng)子的結(jié)合[20]。這些數(shù)據(jù)強(qiáng)有力地證明,TGF-β1β通過轉(zhuǎn)錄機(jī)制直接抑制了心肌成纖維細(xì)胞中PPARγ的表達(dá)。一項(xiàng)有關(guān)利鈉肽受體a介導(dǎo)的心肌肥厚纖維化的研究中,Ellmers等[21]證實(shí),利鈉肽受體a基因敲除小鼠晚期HDAC7a mRNA的表達(dá)增加。

此外,組蛋白修飾可能導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄激活或抑制最近的研究證實(shí),HDAC過度表達(dá)也會(huì)引起心房纖維化、縫隙連接蛋白40表達(dá)下調(diào)和轉(zhuǎn)基因小鼠的房性心律失常易感性增加,證實(shí)HDAC抑制有害的心房重構(gòu)。經(jīng)TSA處理后減少了心房纖維化,恢復(fù)了連接蛋白40的表達(dá)和分布。目前,組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶(EZH2)編碼H3K27 HMT,在心臟前體,EZH2表達(dá)缺失導(dǎo)致心肌肥厚和纖維化[22]??傊?,這些結(jié)果清楚地表明,組蛋白修飾在心肌纖維化中發(fā)揮關(guān)鍵作用。

4 M icroRNA和心肌纖維化

MiRNA是一種非編碼小RNA(約22個(gè)核苷酸),通過轉(zhuǎn)錄后mRNA的降解或者抑制蛋白質(zhì)翻譯來抑制基因的表達(dá)。MiRNA為基礎(chǔ)的機(jī)制與其他表觀遺傳修飾構(gòu)成了非編碼RNA的協(xié)調(diào)性活動(dòng),如DNA甲基化和轉(zhuǎn)錄后組蛋白修飾。MiRNA分子調(diào)控大量的生物學(xué)過程,如發(fā)育、細(xì)胞存活、增殖等等[23]。多種病理過程已經(jīng)發(fā)現(xiàn)miRNA的異常表達(dá),如心肌纖維化。MiRNA在衰竭的心肌中有不同的表達(dá),通過靶向支配心臟重塑的基因影響心衰的進(jìn)程。所以miRNAs從根本上參與和影響心肌纖維化,另外,miRNA已被證實(shí)能控制心肌成纖維細(xì)胞的分化。

最近的研究表明,來源于內(nèi)皮間質(zhì)轉(zhuǎn)移體(EndMT)的成纖維細(xì)胞樣細(xì)胞,通過合成miR-24前體上調(diào)miR-24,減少了纖維化和心肌成纖維細(xì)胞的分化和遷移。TGF-β增加了miR-24的表達(dá),過表達(dá)的miR-24進(jìn)一步減少了TGF-β的分泌和心肌成纖維細(xì)胞Smad2/3的磷酸化。此外,Shyu等認(rèn)為,添加外源TGF-β1增加了大鼠心肌成纖維細(xì)胞miR-208a的表達(dá)。過表達(dá)的miR-208a上調(diào)了內(nèi)皮素和Ⅰ型膠原蛋白的表達(dá),相反,通過心肌拉伸,miR-208a和Smad3/4的減少抑制了內(nèi)皮素和Ⅰ型膠原蛋白的表達(dá)[24]。Castoldi等[25]認(rèn)為,下調(diào)的miR-133a和miR-29b通過調(diào)控Ⅰ型膠原的表達(dá)調(diào)節(jié)血管緊張素Ⅱ依賴性高血壓的心肌纖維化。慢性房顫間質(zhì)纖維化中miR-30和miR-133表達(dá)下調(diào)。另外,mir-18/19調(diào)控改變了ECM蛋白CTGF、TSP-1和Ⅰ、Ⅲ型膠原蛋白的水平。在心臟老化的過程中,mir-18/19的減少、CTGF和TSP-1水平的增加提示有心衰的可能。

Bernardo等[26]研究表明,整個(gè)miR-34家族的沉默可以保護(hù)心臟從而對(duì)抗病理性心肌重塑和纖維化形成,這與Akt活性上調(diào)有關(guān)。抑制miR-34a能減少急性心梗后心肌纖維化,并促進(jìn)心肌功能的恢復(fù)。生物信息學(xué)分析表明,MMP9是miR-132的靶標(biāo),MMP16是mir-146b的靶標(biāo),TIMP3是miR-181b的靶標(biāo),這些miRNAs在心肌纖維化中可能發(fā)揮潛在的作用[27]。

事實(shí)上,體外和體內(nèi)下調(diào)miR-29或拮抗miRNAs會(huì)減少膠原蛋白的表達(dá),隨后發(fā)現(xiàn)MMP-2是miR-29a體外的唯一靶標(biāo)。過表達(dá)的TGFβRⅢ能抑制miR-21的表達(dá),從而減少心肌成纖維細(xì)胞膠原的產(chǎn)生。小鼠心肌過表達(dá)miR-21與壓力負(fù)荷引起的心肌纖維化有關(guān)。這項(xiàng)研究支持miR-21作為纖維化過程的調(diào)節(jié)點(diǎn),并強(qiáng)調(diào)循環(huán)中miR-21作為心肌纖維化標(biāo)志物的價(jià)值[28]。在體內(nèi),小鼠壓力負(fù)荷引起的心臟疾病模型中沉默miR-21降低了ERK-MAPK活性,抑制了間質(zhì)纖維化。TGF-β介導(dǎo)的EndMT至少部分由miR-21介導(dǎo)的PTEN/Akt信號(hào)通路調(diào)節(jié)。在病理性心肌肥大中,增強(qiáng)的PI3Kα信號(hào)保護(hù)轉(zhuǎn)錄組的識(shí)別,同時(shí)TGF-β/miR-21的調(diào)控增強(qiáng)了PI3K信號(hào)防止心肌纖維化[29]。MiR-21促進(jìn)心外膜間皮細(xì)胞向上皮的轉(zhuǎn)變,miR-21通過下調(diào)sprouty-1(一種抑制成纖維細(xì)胞增殖的蛋白質(zhì))從而導(dǎo)致心室纖維化性重構(gòu)。心房敲除miR-21能抑制心房纖維化和房顫的發(fā)生。MiR-22的過表達(dá)促進(jìn)細(xì)胞衰老和心臟成纖維細(xì)胞的遷移,衰老的心臟miR-22的下調(diào)至少加速了心肌成纖維細(xì)胞的衰老和抑制了它們的遷移。這種機(jī)制也可能在抑制心肌纖維化方面發(fā)揮關(guān)鍵作用[30]。

5 總結(jié)和展望

心肌纖維化過程中基因表達(dá)的表觀遺傳調(diào)控的證據(jù)仍不很充分。表觀遺傳介導(dǎo)的DNA甲基化、組蛋白修飾和miRNA作為有害環(huán)境刺激中產(chǎn)生的分子底物會(huì)導(dǎo)致心肌纖維化。未來表觀遺傳改變可成為藥物或基因手段所干預(yù)的靶點(diǎn)。如甲基化劑5-氮-2-脫氧胞苷和組蛋白去乙?;敢种苿㏕SA已被用于這方面的研究[31]。此外,未來的研究將會(huì)在分子水平上提供更詳細(xì)的信息,為表觀遺傳修飾直接影響心肌纖維化提供更確切的證據(jù)。

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Research progress on epigenetic regulation ofmyocardial fibrosis

心肌纖維化; 表觀遺傳調(diào)控; miRNAs

Myocardial fibrosis; Epigenetic regulation; MiRNAs

100038 北京市,北京大學(xué)第九臨床醫(yī)學(xué)院北京世紀(jì)壇醫(yī)院心內(nèi)科

楊水祥,E-mail:sxyang68@163.com

10.3969/j.issn.1672-5301.2015.12.003

R542.2+3

A

1672-5301(2015)12-1066-04

2015-08-26)

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兩種制備大鼠胚胎成纖維細(xì)胞的方法比較
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