廖承軍,鄭微,黃建峰,劉成龍,柳志強(qiáng),程新平,毛寶軍,陳德水
(1.浙江華康藥業(yè)有限公司,浙江 衢州 324302;2.浙江工業(yè)大學(xué)生物工程研究所,浙江 杭州 310014)
葡萄糖異構(gòu)酶基因的篩選、表達(dá)及酶學(xué)性質(zhì)研究
廖承軍1,鄭微2,黃建峰2,劉成龍2,柳志強(qiáng)2,程新平1,毛寶軍1,陳德水1
(1.浙江華康藥業(yè)有限公司,浙江 衢州 324302;2.浙江工業(yè)大學(xué)生物工程研究所,浙江 杭州 310014)
通過基因挖掘的方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中篩選得到一株嗜熱的葡萄糖異構(gòu)酶(GI)產(chǎn)生菌株Thermotoga petrophila RKU-1,化學(xué)合成該酶的基因并在大腸桿菌E.coli BL21(DE3)中進(jìn)行可溶性表達(dá)。重組葡萄糖異構(gòu)酶經(jīng)過Ni-NTA柱親和層析分離純化后,對(duì)純酶進(jìn)行SDSPAGE檢測(cè),結(jié)果顯示為單一條帶,其分子量大小為50.8 kDa。測(cè)定了該重組酶對(duì)底物D-葡萄糖的活力為19.8 U/mg,并對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了表征。該酶最適溫度和pH分別為85℃和7.0,Co2+對(duì)催化活力起著非常重要的作用,對(duì)底物D-葡萄糖的Km值和Vmax值分別為373 mmol/L和13.4 U/mg。在最適條件下,反應(yīng)在4 h內(nèi)達(dá)到平衡,果糖得率最高達(dá)到53.8%。
基因挖掘;葡萄糖異構(gòu)酶;表達(dá);酶學(xué)性質(zhì)
葡萄糖異構(gòu)酶(glucose isomerase,EC 5.3.1.5)又稱木糖異構(gòu)酶(xylose isomerase),在體內(nèi)催化D-木糖生成D-木酮糖,在體外催化D-葡萄糖生成D-果糖[1]。因此,該酶被廣泛用于高果糖漿(HFCS)的工業(yè)生產(chǎn)中[2-3]。
目前,工業(yè)化生產(chǎn)的HFCS均為42%HFCS,而55%HFCS因其口感和甜度等性能擁有最大的市場(chǎng)需求[4-5]。要得到55%HFCS,需要經(jīng)歷下游色譜純化和濃縮等步驟[6]。研究報(bào)道顯示,葡萄糖和果糖之間的異構(gòu)化反應(yīng)存在著熱動(dòng)力學(xué)平衡,隨著反應(yīng)溫度的升高,轉(zhuǎn)化率也逐漸升高,當(dāng)溫度大于等于85℃時(shí),理論轉(zhuǎn)化率可以達(dá)到55%以上[7-8]。因此,篩選構(gòu)建一株高活力且耐高溫的葡萄糖異構(gòu)酶,已成為實(shí)現(xiàn)一步法生產(chǎn)55%HFCS的迫切需求。
目前,基因挖掘作為一種快速、高效、便捷的篩選生物酶催化劑的新型手段,已經(jīng)越來越廣泛地被使用并代替?zhèn)鹘y(tǒng)的土樣篩選[9]。
本課題組通過基因挖掘的方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中篩選得到一株嗜熱的葡萄糖異構(gòu)酶(GI)產(chǎn)生菌株Thermotoga petrophila RKU-1,化學(xué)合成該酶的基因并實(shí)現(xiàn)其在大腸桿菌E.coli BL21(DE3)中的可溶性表達(dá)。利用親和層析實(shí)現(xiàn)了重組葡萄糖異構(gòu)酶TPGI的分離純化,并從最適反應(yīng)溫度、最適pH、最適金屬離子及酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)等方面研究了該酶的酶學(xué)性質(zhì)。
1.1 材料
1.1.1 菌株和載體
宿主大腸桿菌(E.coli BL21(DE3))為本實(shí)驗(yàn)室保存菌株,表達(dá)載體pET-28b(+)購自Takara公司。
1.1.2 試劑
限制性內(nèi)切酶Nde I和Eco RI、T4 DNA連接酶購自Fermentas公司;Pfu DNA聚合酶、Taq DNA聚合酶、dNTP購自上海申能博彩公司;質(zhì)粒DNA小量提取試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒購自Axygen公司;異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)購自Promega公司;酵母粉、蛋白胨購自O(shè)XOID公司;D-葡萄糖購自阿拉丁試劑有限公司;D-果糖購自Solarbio公司。除特別注明的試劑外,其他各種實(shí)驗(yàn)試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.1.3 引物
根據(jù)TPGI基因序列,設(shè)計(jì)引物(含限制性酶切位點(diǎn))上游引物:5'-CATGCCATGGTAAT GGAATTTTTCCCTG-3',(Nco I),下游引物:5'-CCGCTCGAGACGAAGTTCAGCGATTG-3',(Xho I),以上引物均由上海生工生物工程公司合成。
1.1.4 培養(yǎng)基
LB培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨10,酵母粉5,NaCl 10,pH 7.0,接種之前加入50μg/mL卡那霉素;固體LB培養(yǎng)基添加1.5%~2.0%瓊脂,用于大腸桿菌培養(yǎng)??敲顾乜股刭A存液的配制:用無菌水配制50mg/mL的抗生素母液,過濾除菌后,-20℃保存?zhèn)溆?,使用時(shí)終濃度為50μg/mL。
1.2 方法
1.2.1 基因挖掘方法篩選葡萄糖異構(gòu)酶
以最嗜熱的Thermotogamaritime來源和催化活力較高的商業(yè)化的Streptomycesmurinus來源的葡萄糖異構(gòu)酶(TMGI、SMGI)氨基酸序列為模板,從NCBI數(shù)據(jù)庫中(http://blast.ncbi.nlm.nih. gov/Blast.cgi),通過Blast X和Blast P比對(duì)搜索,最終選擇了一株與上述TMGI、SMGI同源性分別為98%、31%,且無研究報(bào)道的嗜熱Thermotoga petrophila RKU-1來源的葡萄糖異構(gòu)酶。
1.2.2 葡萄糖異構(gòu)酶基因的密碼子優(yōu)化及其合成
選取的葡萄糖異構(gòu)酶基因通過軟件Codon Adaptation Tool,以E.coli BL21(DE3)的密碼子偏好性為基準(zhǔn),進(jìn)行密碼子優(yōu)化,優(yōu)化后的基因由上海旭冠生物科技發(fā)展有限公司合成。
1.2.3 重組葡萄糖異構(gòu)酶的構(gòu)建
以合成的含有目的基因的質(zhì)粒為模板,PCR擴(kuò)增葡萄糖異構(gòu)酶基因,擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)熱變性5min,30個(gè)循環(huán)(94℃變性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸2min),72℃延伸10min。擴(kuò)增后的產(chǎn)物經(jīng)0.9%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)分析并回收,回收后的PCR產(chǎn)物純化后與表達(dá)載體pET-28b (+)連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化E.coli BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,經(jīng)菌落PCR驗(yàn)證為陽性克隆子的菌,送至上海桑尼生物技術(shù)有限公司測(cè)序驗(yàn)證,通過DNAMAN軟件分析測(cè)序序列是否為目的序列。
1.2.4 重組葡萄糖異構(gòu)酶的誘導(dǎo)表達(dá)及SDS
PAGE分析
制備種子液:用接種環(huán)從斜面上挑取鑒定正確的菌種,接種至50mL LB種子液培養(yǎng)基搖瓶(含50μg/mL Kan),37℃、150 r/min搖床培養(yǎng),一般培養(yǎng)時(shí)間10~12 h。制備發(fā)酵液:將培養(yǎng)好的種子液轉(zhuǎn)接至發(fā)酵培養(yǎng)基中,接種量為2%(V/ V),37℃、150 r/min搖床培養(yǎng)菌體濃度至OD600為0.6~0.8時(shí),添加濃度為0.1 mmol/L IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),28℃、150 r/min誘導(dǎo)12 h后離心收集菌體。粗酶液的制備:將離心收集到的菌體用純水溶解后進(jìn)行細(xì)胞破碎,破碎液于4℃下12 000 r/ min離心20min,取上清獲得粗酶液。純酶液的制備:將粗酶液過Ni-NTA柱分離純化獲得純酶液。最終得到的純酶液通過SDS-PAGE分析純化結(jié)果并測(cè)定蛋白濃度。
1.2.5 重組葡萄糖異構(gòu)酶的酶學(xué)性質(zhì)研究
以D-葡萄糖為底物,利用高效液相色譜測(cè)定葡萄糖異構(gòu)酶的活性。反應(yīng)體系如下:在50 mmol/ L Tris-HCl緩沖液(pH 7.0)與一定量酶液的10 mL反應(yīng)體系中,加入底物100 mg/mLD-葡萄糖,激活劑1mmol/LCo2+,10mmol/LMg2+。85℃、150 r/min反應(yīng)10 min,冰浴3 min終止反應(yīng)。
通過測(cè)定不同溫度(55~100℃)下TPGI的酶活確定最適溫度;通過測(cè)定不同pH緩沖液中TPGI的酶活確定最適pH,緩沖液體系分別為:HAc/NaAc(pH 4.0~6.0),PBS(pH 5.5~7.0),Tris/ HCl(pH 7.0~9.0),Gly/NaOH(8.5~10.0);通過測(cè)定80、85、90℃下保溫一定時(shí)間后的殘余酶活確定酶的熱穩(wěn)定性;分別考察添加5mmol/L不同二價(jià)金屬離子(Mg2+,Mn2+,Co2+,Zn2+,Cu2+,Ba2+,Ni2+,F(xiàn)e2+,Ca2+)對(duì)酶活的影響;在底物D-葡萄糖濃度為37.5~300mmol/L范圍內(nèi)測(cè)定酶促動(dòng)力學(xué)反應(yīng)常數(shù)。
測(cè)定催化進(jìn)程曲線,葡萄糖濃度10%(W/V),在最適溫度、pH以及最佳金屬離子濃度下反應(yīng)不同時(shí)間(0.5~10 h),取樣測(cè)定果糖得率。
HPLC檢測(cè)產(chǎn)物D-果糖條件如下:色譜柱為Hi-Plex Ca柱(300 mm×7.7 mm),柱溫為80℃,流動(dòng)相為超純水,流動(dòng)相流速為0.5 mL/min,檢測(cè)器為示差檢測(cè)器。在該條件下,D-葡萄糖的保留時(shí)間為15.7min,D-果糖的保留時(shí)間為20.2min。
葡萄糖異構(gòu)酶酶活單位(U)定義為:在85℃、pH 7.0條件下,每分鐘生成1μmol D-果糖所需的酶量定義為1 U。比酶活定義為:每毫克蛋白中所含的酶活單位,用U/mg表示。果糖得率定義為:異構(gòu)化轉(zhuǎn)化生成的D-果糖和初始底物D-葡萄糖的百分比。
2.1 重組葡萄糖異構(gòu)酶的表達(dá)及純化
合成的葡萄糖異構(gòu)酶基因經(jīng)PCR擴(kuò)增后,連接于表達(dá)載體pET-28b(+),重組質(zhì)粒pET-28b(+) -TPGI轉(zhuǎn)入宿主菌E.coli BL21(DE3),挑取單菌落培養(yǎng)并經(jīng)IPTG誘導(dǎo),重組葡萄糖異構(gòu)酶TPGI以可溶蛋白的形式表達(dá),將其通過Ni-NTA柱分離純化后,SDS-PAGE檢測(cè)到單一條帶,達(dá)到電泳純水平,如圖1所示。該重組葡萄糖異構(gòu)酶TPGI的分子量約為50.8 kDa,與預(yù)期相符。經(jīng)過蛋白濃度和酶活力測(cè)定,計(jì)算得到TPGI的比酶活為19.8 U/mg。
圖1 重組葡萄糖異構(gòu)酶TPG I的SDS-PAGE分析M—標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker;1—TPGI未經(jīng)過IPTG誘導(dǎo);2—TPGI經(jīng)過IPTG誘導(dǎo);3—TPGI經(jīng)過Ni-NTA柱分離純化
2.2 葡萄糖異構(gòu)酶突變體催化生產(chǎn)HFCS的條件優(yōu)化
2.2.1 最適溫度和最適pH
不同溫度下的酶活力測(cè)得結(jié)果如圖2所示,從圖中可以看出,TPGI最適催化溫度為85℃,在低于55℃時(shí),TPGI幾乎無催化活力;70℃以下,其酶活力也相對(duì)較低;溫度達(dá)到100℃時(shí),TPGI的酶活力仍較高,顯示出較好的嗜熱性能。不同pH下酶活力結(jié)果分析如圖3所示,TPGI的最適催化pH為7.0(Tris-HCl緩沖液),其在酸性條件下,酶活損失較大。
圖2 溫度對(duì)重組葡萄糖異構(gòu)酶活力的影響
圖3 pH對(duì)重組葡萄糖異構(gòu)酶活力的影響
2.2.2 熱穩(wěn)定性
以0小時(shí)即未保溫時(shí)的酶活力定義為100%,其他保溫不同時(shí)間的酶活力與其對(duì)比求取相對(duì)酶活力,不同溫度下保溫不同時(shí)間,求得的酶活力結(jié)果如圖4所示。從圖中可以看出,隨著溫度的升高,TPGI的熱穩(wěn)定性有所下降,在80℃時(shí),其半衰期為9 h,在最適溫度85℃時(shí),1 h后其酶活力是初始的80%。
圖4 重組葡萄糖異構(gòu)酶的熱穩(wěn)定性
2.2.3 不同二價(jià)金屬離子對(duì)酶活的影響
葡萄糖異構(gòu)酶是金屬酶,在催化異構(gòu)化的過程中,需要金屬離子的輔助催化,而且不同金屬離子對(duì)葡萄糖異構(gòu)酶的活力和穩(wěn)定性起著非常重要的作用。目前所報(bào)道的大多數(shù)葡萄糖異構(gòu)酶主要以Mg2+、Mn2+、Co2+或者以其中兩種金屬離子作為助催化劑[10]。以最高的酶活力設(shè)為100%,其他金屬離子對(duì)酶活力影響與最高酶活力對(duì)比,其結(jié)果如圖5所示。圖中N對(duì)應(yīng)的是未加任何金屬離子,幾乎無任何催化活力,表明TPGI在高溫催化下,需要金屬離子才能維持其催化活力;Co2+對(duì)TPGI的催化活力起著非常重要作用,Zn2+、Cu2+、Ni2+對(duì)酶的催化不起作用,其活力幾乎為零;Mg2+、Mn2+在TPGI的催化當(dāng)中起到輔助作用,Ba2+、Ni2+、Fe2+、Ca2+單獨(dú)存在對(duì)酶催化起著微弱作用。
圖5 金屬離子對(duì)重組葡萄糖異構(gòu)酶活力的影響
2.2.4 酶促動(dòng)力學(xué)參數(shù)測(cè)定
測(cè)定不同底物濃度下的反應(yīng)速度,根據(jù)測(cè)定結(jié)果進(jìn)行雙倒數(shù)曲線擬合作圖(圖6)。曲線擬合度R2=0.99395,擬合方程為y=27.95786x+ 74.91392。根據(jù)擬合曲線計(jì)算得到Km和Vmax分別為373mmol/L和13.4 U/mg。
圖6 重組葡萄糖異構(gòu)酶的動(dòng)力學(xué)曲線
2.2.5重組葡萄糖異構(gòu)酶催化葡萄糖反應(yīng)進(jìn)程
重組葡萄糖異構(gòu)酶TPGI催化葡萄糖生成高果糖漿的反應(yīng)進(jìn)程研究表明(圖7),果糖得率隨著時(shí)間的增加快速上升,反應(yīng)1 h,果糖得率就能達(dá)到42%,2 h得率能夠達(dá)到50%,且在4 h達(dá)到最大值53.8%,之后反應(yīng)達(dá)到平衡,得率趨于穩(wěn)定。
圖7 重組葡萄糖異構(gòu)酶的催化葡萄糖的反應(yīng)進(jìn)程
本文通過基因挖掘的方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中篩選得到一株嗜熱的葡萄糖異構(gòu)酶(GI)產(chǎn)生菌株Thermotoga petrophila RKU-1,化學(xué)合成該酶的基因并在宿主大腸桿菌E.coli BL21(DE3)中進(jìn)行可溶性表達(dá)。重組葡萄糖異構(gòu)酶TPGI經(jīng)過Ni-NTA柱親和層析分離純化后,對(duì)純酶進(jìn)行SDSPAGE檢測(cè),結(jié)果顯示為單一條帶,其分子量大小為50.8 kDa。測(cè)定了該重組酶對(duì)底物D-葡萄糖的活力為19.8 U/mg,并對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了表征。確定了該酶的最適溫度和pH分別為85℃和7.0,與之前一些文獻(xiàn)報(bào)道的葡萄糖異構(gòu)酶相比,擁有較高的催化最適溫度和不依賴堿性條件催化[11-12]。金屬離子中Co2+對(duì)該酶的催化活力起著非常重要的作用,對(duì)底物D-葡萄糖的Km值和Vmax值分別為373mmol/L和13.4 U/mg。在最適條件下,反應(yīng)在4 h內(nèi)達(dá)到平衡,果糖得率最高達(dá)到53.8%。后續(xù)可通過計(jì)算機(jī)軟件模擬和分子改造技術(shù)進(jìn)一步改變?cè)摰鞍椎奶匦?,提高與底物的親和力和催化效率,并尋找一種合適的固定化方法穩(wěn)定酶的使用率,將使工業(yè)化大規(guī)模一步酶法生產(chǎn)55%HFCS成為可能。
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(責(zé)任編輯:朱小惠)
Genomem ining,expression and characterization of a hyperthermophilic glucose isom erase from Thermotoga petrophila RKU-1
LIAO Chengjun1,ZHENGWei2,HUANG Jianfeng2,LIU Chenglong2,LIU Zhiqiang2,CHENG Xinping1,MAO Baojun1,CHEN Deshui1
(1.Zhejiang Huakang Pharmaceutical Co.,Ltd.,Quzhou 324302,China;2.Institute of Bioengineering,Zhejiang University of Technology,Hangzhou 310014,China)
A hyperthermophilic glucose isomerase from Thermotoga petrophila RKU-1(TPGI)was screened by genomemining from NCBIdatabase.The gene of TPGIwas synthesized and expressed as a soluble protein in E.coli BL21(DE3).The recombinant enzyme was purified by Ni-NTA affinity chromatography.The SDS-PAGE analysis of the purified TPGI revealed a single band with a molecular weight of around 50.8 kDa.The specific activity of the recombinant TPGI to D-glucose was 19.8 U/mg.The enzyme exhibited itsmaximum activity at 85℃,pH 7.0 and showed significant dependence on Co2+.The Kmand Vmaxto substrate D-glucosewere 373 mmol/L and 13.4 U/ mg,respectively.The yield of D-fructose reached 53.8%and the isomerization graduallymaintained equilibrium after 4 h under the optimum conditions.
genomemining;glucose isomerase;expression;enzymatic properties
Q814
A
1674-2214(2015)04-0019-05
2015-05-28
國家自然科學(xué)基金(31401527);浙江省重大科技攻關(guān)項(xiàng)目(2013C02027)
廖承軍(1976—),男,浙江開化人,工程師,主要從事功能性糖和糖醇生產(chǎn)工藝技術(shù)開發(fā)和應(yīng)用,E-mail:liaochengjun@huakangpharma.com.