腐霉猝倒和根腐病引起大豆出苗率嚴重減少,因此造成減產。有報道認為大豆品種Archer對由腐霉菌引起的苗期病害具有抗性,并描述了與之相關的Rps1k基因對疫霉菌具有抗逆性。為了描述大豆品種Archer抗腐霉猝倒病的遺傳特性,并且確定該抗性是否與Rps1k基因相關,Archer和Hutcheson(感病親本)進行雜交,F(xiàn)2:4群體(子二代)產生。親本和F2:4利用下胚軸接種技術,篩除瓜果腐霉。接種5 d后,標記存活植株。F2:4群體和親本同樣被接種上7種疫霉菌來評價該基因與腐霉菌抗逆性的關聯(lián)性。從F2:4群體的數(shù)據(jù)顯示Archer抗瓜果腐霉的基因是單獨顯性基因?;蜻B鎖研究顯示Archer抗瓜果腐霉基因是Rps1k獨立基因。為確定抗瓜果腐霉的基因位點,F(xiàn)2:4群體從基因連鎖群(MLGs)中進行簡單的分子標記(SSR)篩選,2個SSR標記Satt510和Satt114都在MLGF連鎖群中。該基因在親本和抗性和感病品種之間較為多樣化,并且與腐霉抗逆性相關聯(lián)。該腐霉抗性基因被命名為Rpa1距離Satt510有10.6 cm,距離Satt114有26.6 cm。