李亞丹,郭義東,劉逆夫,李三新,鄒 亮,龔 云
(1.株洲千金藥業(yè)股份有限公司,湖南株洲412007;2.四川抗菌素工業(yè)研究所,四川成都610051;3.成都大學(xué)生物產(chǎn)業(yè)學(xué)院,四川成都610106)
隨著人們對化學(xué)藥毒副作用認(rèn)識的加深以及“治未病”理念的逐步形成,具有悠久歷史的中藥產(chǎn)品備受矚目。隨著市場需求量的不斷上升,中藥材加工產(chǎn)生的中藥藥渣也越來越多,如何合理處理這些藥渣成為亟待解決的問題。
中藥藥渣成分以植物根莖組織為主,含有植物纖維、蛋白質(zhì)、多糖和殘留的藥物成分。而植物纖維含有大量纖維素、半纖維素、木質(zhì)素和果膠等成分,從而使得中藥藥渣難于被降解利用。近年來,以高產(chǎn)纖維素酶菌株的選育、纖維素酶合成的調(diào)控、復(fù)合纖維素酶降解機制以及單一或復(fù)合纖維素降解菌的應(yīng)用為研究方向的課題都取得了很大的進展[1]。目前,雖然已經(jīng)獲得了一批具有纖維素降解能力的菌種,但由于大部分菌種產(chǎn)生的酶受到纖維素分解產(chǎn)物的抑制作用以及培養(yǎng)過程中培養(yǎng)液pH 值過低抑制降解菌生長等問題,要依靠某一菌種徹底實現(xiàn)纖維素類物質(zhì)的轉(zhuǎn)化利用,仍然存在極大的難度[2]。因此,依靠微生物復(fù)合菌群的聯(lián)合降解作用,有望實現(xiàn)纖維素類物質(zhì)的降解利用。
鑒于此,作者對微生物復(fù)合菌群的來源及組成進行了簡單介紹,并對微生物復(fù)合菌群的協(xié)同作用機理進行了討論。
獲得降解木質(zhì)纖維素的微生物復(fù)合菌群的方法主要有兩種:從自然界中直接篩選、針對性選擇某些功能菌株進行重新組合。
直接從自然環(huán)境中篩選功能菌群的優(yōu)勢在于:能保持自然界中菌群成員之間的協(xié)同關(guān)系,有利于獲得穩(wěn)定的木質(zhì)纖維素降解復(fù)合菌群。針對天然木質(zhì)纖維素降解過程中材料去木質(zhì)素化問題,目前已發(fā)現(xiàn)了一類特殊厭氧環(huán)境下的微生物菌群——白蟻腸道微生物[3-4]。白蟻腸道內(nèi)存在多種具有木質(zhì)纖維素降解能力的厭氧細(xì)菌和厭氧真菌,可以產(chǎn)生多種纖維素降解酶和半纖維素降解酶,雖然目前還未發(fā)現(xiàn)這類微生物能產(chǎn)生針對木質(zhì)素的降解酶,但白蟻腸道內(nèi)的雞樅菌(Termitomyces)卻發(fā)揮了“梳子”的作用,通過菌絲生長來破壞降解底物的木質(zhì)素保護,將木質(zhì)素“松動”“預(yù)處理”后,暴露出材料的纖維素和半纖維素,使材料更容易被腸道內(nèi)其它微生物產(chǎn)生的復(fù)合酶系高效降解[3,5]。
從其它自然環(huán)境體系中篩選具有木質(zhì)纖維素降解能力復(fù)合菌群的研究報道層出不窮[6-8]。潘虎等[9]研究了紅樹林根際土壤中微生物菌群,從中篩選得到纖維素降解復(fù)合菌群,包含8個屬的好氧性細(xì)菌和3個屬的真菌;Feng等[10]從土壤中富集到木質(zhì)纖維素降解細(xì)菌菌群,包含瘡皰丙酸桿菌(Propionibacterium acnes)、梭菌屬細(xì)菌(Clostridiumsp.)、未培養(yǎng)厚壁菌門細(xì)菌(unculturedFirmicutes)、未培養(yǎng)β-變形桿菌(unculturedBetaproteobacterium)、泛桿菌屬細(xì)菌(Pantoeasp.)等6種細(xì)菌,以該菌群作用于玉米秸稈粉末,發(fā)現(xiàn)該復(fù)合菌群培養(yǎng)8d可降解51%的玉米秸稈粉末,主產(chǎn)物為醋酸;崔宗均等[11]以4種堆肥樣品為對象,篩選到4組纖維素降解復(fù)合菌群,后通過酸堿反應(yīng)互補原則馴化出復(fù)合菌系MC1,纖維素降解能力強且十分穩(wěn)定;Wang等[12]從腐熟堆肥中分離到了包括9種菌在內(nèi)的復(fù)合菌群,50 ℃培養(yǎng)3d可降解99%的濾紙、77%的棉花和81%的水稻秸稈。
陳耀寧[13]研究發(fā)現(xiàn),將一株黃孢原毛平革菌(Phanerochaetechrysosporium)和一株岐皺青霉菌(Penicilliumsteckii)混合培養(yǎng)可提高降解體系中纖維素、半纖維素和木質(zhì)素的降解率,分別比二者純培養(yǎng)體系提高52.7%、53.1%和54.9%;黃茜等[14]利用白腐真菌中木質(zhì)素降解能力較強的平菇HF(Pleurotus ostreatus)與纖維素降解能力較強的康氏木霉(Trichodermakoningii)混合發(fā)酵小麥秸稈,發(fā)現(xiàn)混合發(fā)酵的效果均優(yōu)于單獨發(fā)酵;Muhammad等[15]將綠色木霉(Trichodermaviride)MSK-10與黑曲霉(Aspergillus niger)MSK-7混合培養(yǎng),培養(yǎng)基中各種酶的含量較單獨培養(yǎng)增加了30%~50%。
通過上述研究不難發(fā)現(xiàn),具有較強纖維素、半纖維素降解作用的細(xì)菌多為嚴(yán)格厭氧的梭桿菌屬Clostridiumsp.[16-17],另外,嚴(yán)格厭氧菌擬桿菌屬Bacteriodessp.也是公認(rèn)的纖維素降解菌[18-20],真菌中白腐真菌、木霉、曲霉中的一些種類也能分泌多種木質(zhì)纖維素降解酶。
微生物復(fù)合菌群之所以能夠穩(wěn)定傳代并保持功能不變,是因為復(fù)合菌群成員間以一種互相影響、互相制衡的方式穩(wěn)定共存[21]。以往對復(fù)合菌群的研究主要著眼于微生物的代謝產(chǎn)物對整個體系的影響,對復(fù)合菌群成員協(xié)同關(guān)系研究相對較少,因此,深入研究復(fù)合菌群成員之間的相互影響(如菌群成員之間存在的互養(yǎng)關(guān)系、對營養(yǎng)成分的競爭關(guān)系以及某一種微生物對其它成員產(chǎn)生一定程度的促進作用或抑制作用)、綜合把握復(fù)合菌群的特點有助于更好地利用復(fù)合菌群。
Kato等[22]從堆肥中篩選出一組具有纖維素降解能力的細(xì)菌,經(jīng)鑒定其中包括具有降解纖維素能力的厭氧細(xì)菌S(ClostridiumstraminisolvensCSK1),具有利用多糖能力的F(Clostridiumsp.FG4),可利用多肽、醋酸鹽的好氧菌1-3(Pseudoxanthomonassp.M1-3),可利用多肽、葡萄糖、乙醇的好氧菌1-5(Brevibacillussp.M1-5)等4種菌。為了更進一步探討各菌株間的相互作用關(guān)系,將各菌株過濾后的培養(yǎng)液加入其它3種菌單一或兩兩組合或3種菌混合的培養(yǎng)基中,通過綜合分析各種菌在培養(yǎng)過程中的數(shù)量動態(tài)變化,發(fā)現(xiàn)菌株S依賴于菌株1-5而存在,而菌株1-5又受到菌株1-3的負(fù)調(diào)節(jié),菌株F 又會抑制菌株1-3的生長。因此,菌株F 對菌株1-5具有非直接的促進作用,同樣就促進了菌株S的生長,這種復(fù)合菌群間的相互影響,尤其是非直接作用的存在,維持了復(fù)合菌群的穩(wěn)定傳代。
Kato等[23]還篩選到一組纖維素降解復(fù)合菌群SF356,經(jīng)鑒定其中包含5種細(xì)菌,分別為Clostridium straminisolvensCSK1(厭氧纖維素降解菌)、Clostridiumsp.FG4(厭氧非纖維素降解菌)、Pseudoxanthomonassp.M1-3(兼性厭氧菌)、Brevibacillussp.M1-5(好氧菌)、Bordetellasp.M1-6(好氧菌)。采用依次培養(yǎng)減少某一種菌種的方法,研究種類減少后的復(fù)合菌群發(fā)酵產(chǎn)物種類、各種菌的生長速率、發(fā)酵產(chǎn)酶情況以及對底物的降解作用,綜合分析復(fù)合菌群成員之間的協(xié)同作用和對整個體系的作用,發(fā)現(xiàn)CSK1為纖維素降解菌,刪除了CSK1 后復(fù)合菌群中的FG4、M1-5、M1-3也會依次消失,說明后三者依賴于纖維素的降解才能生長;M1-5不能利用纖維素而只能利用葡萄糖為發(fā)酵底物,而FG4可實現(xiàn)多糖降解為葡萄糖的過程,從而維持了M1-5的生長;M1-6不受纖維素降解的制約,但受到M1-5的抑制作用,正是這一作用使得整個體系中各種菌的數(shù)量比例穩(wěn)定,未呈現(xiàn)出M1-6的絕對優(yōu)勢;M1-3、M1-5、M1-6在發(fā)酵過程中起到消耗氧氣、調(diào)節(jié)pH 值的作用。
通過微生物復(fù)合菌群的協(xié)同作用而實現(xiàn)的木質(zhì)纖維素的降解是完成地球生物圈碳循環(huán)的基礎(chǔ),也是成功實現(xiàn)生物質(zhì)能源開發(fā)的必經(jīng)步驟[24]。微生物種群的多樣性影響系統(tǒng)功能[25-26]。深入研究不同菌種間的協(xié)同作用,探明微生物復(fù)合菌群各成員在發(fā)酵反應(yīng)全過程中的作用,結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù)闡明菌群成員在降解過程中的動態(tài)變化,都將為高效降解木質(zhì)纖維素復(fù)合菌群的選育、優(yōu)化提供有力支持。另外,利用分子生物學(xué)技術(shù)對纖維素酶編碼基因進行改造、調(diào)控或修飾操縱基因達到減弱底物抑制作用是當(dāng)前提高纖維素降解菌產(chǎn)酶量和促進酶活力的有效方法[27-30]。
微生物復(fù)合菌群的培養(yǎng)已在實際應(yīng)用方面進行了有效的嘗試[31-32],今后關(guān)于復(fù)合菌群中各菌種之間的相互作用以及對木質(zhì)纖維素聯(lián)合降解作用的研究將有助于更好地認(rèn)識并利用這類復(fù)雜的微生物體系。利用微生物復(fù)合菌群聯(lián)合降解中藥藥渣,可將木質(zhì)纖維素轉(zhuǎn)化為小分子的單糖,釋放出中藥藥渣中的藥物活性物質(zhì),產(chǎn)生的豐富代謝產(chǎn)物對動植物生長發(fā)育具有一定的促進作用。因此,微生物復(fù)合菌群聯(lián)合降解中藥藥渣有助于實現(xiàn)中藥藥渣的循環(huán)利用,是減輕環(huán)境污染、發(fā)展循環(huán)經(jīng)濟的創(chuàng)新技術(shù)。
[1]王小娟,袁旭峰,王慧,等.木質(zhì)纖維素分解復(fù)合菌系WSD-5組成菌株的分離及其產(chǎn)酶特性[J].微生物學(xué)通報,2011,38(4):508-515.
[2]WYMAN C E,DALE B E,ELANDER R T,et al.Coordinated development of leading biomass pretreatment technologies[J].Bioresource Technology,2005,96(18):1959-1966.
[3]BRUNE A.Symbiotic Associations Between Termites and Prokaryotes.In:DWORKIN M,F(xiàn)ALKOW S,ROSENBERG E,et al.The Prokaryotes[M].New York:Springer,2006:439-474.
[4]CHAFFRON S,von MERING C.Termites in the woodwork[J].Genome Biology,2007,8(11):229.
[5]ROULAN-LEFEVRE C,BIGNELL D E.Cultivation of symbiotic fungi by termites of the subfamily Macrotermitinae[J].Symbiosis,2004,4:731-756.
[6]GUEVARA C,ZAMBRANO M M.Sugarcane cellulose utilization by a defined microbial consortium[J].FEMS Microbiology Letters,2006,255(1):52-58.
[7]FISCHER C R,KLEIN-MARCUSCHAMER D,STEPHANOPOULOS G.Selection and optimization of microbial hosts for biofuels production[J].Metabolic Engineering,2008,10(6):295-304.
[8]LESCHINE S B.Cellulose degradation in anaerobic environments[J].Annual Review of Microbiology,1995,49:399-426.
[9]潘虎,董俊德,盧向陽,等.高效纖維素降解菌群的構(gòu)建及其生物多樣性分析[J].湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版),2012,38(2):139-145.
[10]FENG Y,YU Y,WANG X,et al.Degradation of raw corn stover powder(RCSP)by an enriched microbial consortium and its community structure[J].Bioresource Technology,2011,102(2):742-747.
[11]崔宗均,黃志勇,樸哲,等.一組高效穩(wěn)定纖維素分解復(fù)合系MC1的篩選及功能[J].環(huán)境科學(xué),2002,23(3):36-39.
[12]WANG W,YAN L,CUI Z,et al.Characterization of a microbial consortium capable of degrading lignocellulose[J].Bioresource Technology,2011,102(19):9321-9324.
[13]陳耀寧.堆肥化中協(xié)同降解木質(zhì)纖維素的混合菌篩選及其培養(yǎng)[C].湖南:湖南大學(xué),2007.
[14]黃茜,黃鳳洪,江木蘭,等.木質(zhì)素降解菌的篩選及混合菌發(fā)酵降解秸稈的研究[J].中國生物工程雜志,2008,28(2):66-70.
[15]MUHAMMAD M J,TEHMINA S K.An innovative approach for hyperproduction of cellulolytic and hemicellulolytic enzymes by consortium ofAspergillusnigerMSK-7andTrichoderma virideMSK-10[J].African Journal of Biotechnology,2006,5:609-614.
[16]BRODA D M,SAUL D J,BELL R G,et al.Clostridiumalgidixylanolyticumsp.nov.,apsychrotolerant,xylan-degrading,sporeforming bacterium[J].International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,2000,50(2):623-631.
[17]ROGERS G M.Clostridiumxylanolyticumsp.nov.,an anaerobic xylanolytic bacterium from decayedPinuspatulawood chips[J].International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,1991,41:140-143.
[18]FORSBERG C W,BEVERIDGE T J,HELLSTROM A.Cellulase and xylanase release fromBacteroidessuccinogenesand its importance in the rumen environment[J].Applied and Environmental Microbiology,1981,42(5):886-896.
[19]KATO S,HARUTA S,CUI Z J,et al.Network relationships of bacteria in a stable mixed culture[J].Microbial Ecology,2008,56(3):403-411.
[20]NISHIYAMA T,UEKI A,KAKU N,et al.Bacteroidesgraminisolvenssp.nov.,a xylanolytic anaerobe isolated from a methanogenic reactor treating cattle waste[J].InternationalJournal of Systematic and Evolutionary Microbiology,2009,59(8):1901-1907.
[21]ZUROFF T R,CURTIS W R.Developing symbiotic consortia for lignocellulosic biofuel production[J].Applied Microbiology and Biotechnology,2012,93(4):1423-1435.
[22]KATO S,HARUTA S,CUI Z J,et al.Effective cellulose degradation by a mixed-culture system composed of a cellulolyticClostridiumand aerobic non-cellulolytic bacteria[J].FEMS Microbiology Ecology,2004,51(1):133-142.
[23]KATO S,HARUTA S,CUI Z J,et al.Stable coexistence of five bacterial strains as a cellulose-degrading community[J].Applied and Environmental Microbiology,2005,71(11):7099-7106.
[24]WONGWILAIWALIN S,RATTANACHOMSRI U,LAOTHANA CHAREON T,et al.Analysis of a thermophilic lignocellulose degrading microbial consortium and multi-species lignocellulolytic enzyme system[J].Enzyme Microbial Technology,2010,47(6):283-290.
[25]BELL T,NEWMAN J A,SILVERMAN B W,et al.The contribution of species richness and composition to bacterial services[J].Nature,2005,436(7054):1157-1160.
[26]LOREAU M,NAEEM S,INCHAUSTI P,et al.Biodiversity and ecosystem functioning:Current knowledge and future challenges[J].Science,2001,294(5543):804-808.
[27]LEMOS M A,TEIXEIRA J A,DOMINGUES M R M,et al.The enhancement of the cellulolytic activity of cellobiohydrolase I and endoglucanase by the addition of cellulose binding domains derived fromTrichodermareesei[J].Enzyme and Microbial Technology,2003,32(1):35-40.
[28]OLSON D G,McBRIDE J E,SHAW A J,et al.Recent progress in consolidated bioprocessing[J].Current Opinion Biotechnology,2012,23(3):396-405.
[29]PARAWIRA W,TEKERE M.Biotechnological strategies to overcome inhibitors in lignocellulose hydrolysates for ethanol production:Review[J].Critical Reviews in Biotechnology,2011,31(1):20-31.
[30]沈雪亮,夏黎明,劉晶晶.纖維素酶E5基因在E.coli中的克隆與表達[J].浙江大學(xué)學(xué)報(工學(xué)版),2001,35(6):35-40.
[31]FANG H H,LIU H.Effect of pH on hydrogen production from glucose by a mixed culture[J].Bioresource Technology,2002,82(1):87-93.
[32]GARCIA-KIRCHNER O,MUNOZ-AGUILAR M,PEREZ-VILLALVA R,et al.Mixed submerged fermentation with two filamentous fungi for cellulolytic and xylanolytic enzyme production[J].Applied Biochemistry and Biotechnology,2002,98-100:1105-1114.