王歡歡, 呂雅瑤, 彭 博, 錢小紅, 張養(yǎng)軍*
(1. 廣西醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院,廣西 南寧530021;2. 軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射與輻射醫(yī)學(xué)研究所,北京蛋白質(zhì)組研究中心,蛋白質(zhì)組學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京102206)
細(xì)胞色素P450 (CYP)酶和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基轉(zhuǎn)移(UGT)酶在內(nèi)源或外源化合物的Ⅰ相代謝和Ⅱ相代謝中起著重要作用。人肝微粒體中的Ⅰ相藥物代謝酶主要包括CYP1A2、CYP2A6、CYP2B6、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1 和CYP3A4 等;Ⅱ相藥物代謝酶主要包括UGT1A1、UGT1A2、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A6、UGT2B4、UGT2B7、UGT2B10、UGT2B11、UGT2B15等。已有很多文獻(xiàn)[1,2]報(bào)道CYP 和UGT 酶的表達(dá)水平具有較大的個(gè)體差異性。這些藥物代謝酶含量的不同導(dǎo)致藥物對(duì)不同個(gè)體具有不同的藥代動(dòng)力學(xué)和毒理學(xué)行為,直接影響藥效和藥物的安全性。例如,波立維(氯吡格雷)是一種用于治療動(dòng)脈粥樣硬化血栓形成的藥物,該藥只有經(jīng)過肝臟中CYP2C19藥物代謝酶的代謝才具有活性。由于不同病人中CYP2C19 藥物代謝酶表達(dá)量不同,波立維對(duì)不同病人的治療效果迥異,即對(duì)一些病人效果良好,但對(duì)其他人沒有療效。另外,不僅在化學(xué)合成藥物研究領(lǐng)域,在中藥研究領(lǐng)域也有許多研究者開展了藥物代謝酶的相關(guān)研究[3-6]。正是由于藥物代謝酶表達(dá)量對(duì)藥物研發(fā)和臨床應(yīng)用的極端重要性,已發(fā)展了多種用于藥物代謝酶含量的測定方法,主要包括:蛋白質(zhì)印跡(Western blot)方法、逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)綌U(kuò)增反應(yīng)(RT-PCR)方法、探針?biāo)幬锓ê透咝б合嗌V-多反應(yīng)監(jiān)測質(zhì)譜(HPLC-MRM MS)方法。
1979 年,Towbin 等[7]發(fā)展了Western blot 方法,并將其用于復(fù)雜生物樣本中特定蛋白質(zhì)的鑒定。該方法已經(jīng)在生物化學(xué)研究中發(fā)揮了重要作用。例如,Western blot 方法被用于人類免疫缺陷病毒(HIV)、萊姆病(Lyme disease)、乙型肝炎(Hepatitis B)等疾病的檢測。另外,Western blot 方法也被較早用于藥物代謝酶含量的測定。雖然Western blot 方法具有較高的靈敏度和較大的應(yīng)用范圍,但用于藥物代謝酶定量時(shí)存在4 個(gè)關(guān)鍵性的問題:(1)藥物代謝酶具有高序列同源性,難以制備特異性抗體;(2)具有半定量的特點(diǎn);(3)線性范圍較窄;(4)分析通量低,即分析樣本數(shù)量有限。這些缺點(diǎn)限制了該方法的廣泛使用。例如,Shimada 等[8]在1994 年應(yīng)用該方法對(duì)60 例樣本的CYP 藥物代謝酶進(jìn)行定量時(shí),由于缺乏特異性抗體,只能得到3A 和2C 家族的總量,無法分別獲得3A4、3A5 和2C9、2C19 的含量信息。
RT-PCR 是一種可迅速且準(zhǔn)確地對(duì)多種生物系統(tǒng)的基因表達(dá)進(jìn)行定量的方法,廣泛應(yīng)用于遺傳病的診斷,并且可以用于定量監(jiān)測某種RNA 的含量[9]。這種方法定量結(jié)果的準(zhǔn)確性主要決定于:(1)RNA 的完整性;(2)cDNA 的合成效率;(3)內(nèi)參基因[10-12]。隨著分子生物學(xué)、克隆技術(shù)和基因組學(xué)的發(fā)展,一些藥物代謝酶的表達(dá)水平可以通過mRNA 的水平進(jìn)行測定[13-16]。RT-PCR 方法的優(yōu)點(diǎn)是具有高選擇性和高靈敏度,但由于其檢測對(duì)象是mRNA,而mRNA 翻譯到蛋白質(zhì)的表達(dá)過程還受多種因素調(diào)控。因此,對(duì)mRNA 定量并不能準(zhǔn)確表示mRNA 翻譯到蛋白質(zhì)的表達(dá)水平。
探針?biāo)幬锓ㄊ峭ㄟ^比較探針?biāo)幬锱c經(jīng)藥物代謝酶代謝的產(chǎn)物的濃度比或探針?biāo)幬锏那宄蕘砗饬棵傅拇x能力,實(shí)現(xiàn)對(duì)體內(nèi)藥物代謝酶的活性進(jìn)行定量測定的一種方法。通過HPLC 及LC-MS 的方法可以測定藥物探針的代謝物,探針?biāo)幬锓ㄒ呀?jīng)廣泛用于藥物代謝酶活性的測定[17-21]。為了增加分析通量,多種探針?biāo)幬镌趩未卧囼?yàn)中可同時(shí)用于多種藥物代謝酶的活性測定,并稱之為雞尾酒法(cocktail approach)[22]。探針?biāo)幬锓ǖ膬?yōu)點(diǎn)是既考慮了基因因素又考慮了環(huán)境因素對(duì)藥物代謝酶活性的影響,但其缺點(diǎn)是操作復(fù)雜,分析周期長,底物有交叉現(xiàn)象,很難找到專一性化學(xué)探針?biāo)幬铩?/p>
HPLC-MRM MS 方法是一種用于生物樣本中蛋白質(zhì)絕對(duì)定量的常用技術(shù)。在應(yīng)用這種技術(shù)時(shí),首先將樣本中所有目標(biāo)蛋白質(zhì)水解成肽段,然后通過液相色譜對(duì)酶切肽段進(jìn)行分離,再通過離子源將分離的餾分離子化后進(jìn)行質(zhì)譜分析。進(jìn)入質(zhì)譜的離子具有不同的質(zhì)荷比,經(jīng)過第一級(jí)質(zhì)量過濾器Q1選擇具有特定質(zhì)荷比的母離子,被選擇的母離子進(jìn)入碰撞誘導(dǎo)池(CID)中,并在CID 中通過碰撞誘導(dǎo)碎裂形成碎片離子,碎片離子經(jīng)過第二級(jí)質(zhì)量過濾器Q3 后,被選擇的子離子到達(dá)質(zhì)譜檢測器[23]。目前,HPLC-MRM MS 方法因其高靈敏度、高選擇性和高通量的特點(diǎn),加之不需要特異性的抗體,已經(jīng)成為藥物代謝酶定量分析的常用方法[24-27]。為此,我們重點(diǎn)評(píng)述該方法的研究進(jìn)展。
采用化學(xué)合成方法合成穩(wěn)定同位素標(biāo)記肽段,是基于液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用的藥物代謝酶絕對(duì)定量方法中較早采用的一種制備內(nèi)標(biāo)肽段的方法。這種方法是在化學(xué)合成過程中,將穩(wěn)定同位素標(biāo)記氨基酸作為原料引入到內(nèi)標(biāo)肽段,然后將這些穩(wěn)定同位素標(biāo)記的肽段加入到待測樣本酶切液中作為內(nèi)標(biāo),通過這些輕標(biāo)肽段與相應(yīng)的重標(biāo)肽段的峰面積比進(jìn)行定量。例如,F(xiàn)allon 等[26]采用穩(wěn)定同位素稀釋-多反應(yīng)監(jiān)測質(zhì)譜(SID-MRM MS)方法對(duì)9 例人肝微粒體樣本中的UGT1A1 和UGT1A6 兩種藥物代謝酶進(jìn)行絕對(duì)定量時(shí),首先化學(xué)合成了這兩種藥物代謝酶的特異性肽段,其中化學(xué)合成的肽段T78YPVPF(13C9,15N)QR85和D70GAF (13C9,15N)YTLK77用于對(duì)UGT1A1 酶進(jìn)行定量;化學(xué)合成的肽段D44IVEV(13C5,15N)LSDR52、S103FLTAP(13C5,15N)QTEYR113和I77YPVP(13C5,15N)YDQEELK88用于對(duì)UGT1A3 酶進(jìn)行定量,基于這種方法對(duì)UGT1A1 酶的定量結(jié)果與Western blot 方法的定量結(jié)果具有良好的相關(guān)性(相關(guān)系數(shù)r =0.988);Kawakami 等[27]也采用化學(xué)合成法制備了重標(biāo)肽段作為內(nèi)標(biāo),用SID-MRM MS 方法對(duì)10 例人肝微粒體樣本中的11 種CYP 酶進(jìn)行了絕對(duì)定量,發(fā)現(xiàn)CYP1A2、2A6、2C19 和3A4 的表達(dá)水平具有20 多倍的個(gè)體差異性;Ohtsuki 等[28]采用相同的內(nèi)標(biāo)制備方法,用SID-MRM MS 對(duì)17 例樣本中的20 種CYP 和UGT 酶進(jìn)行絕對(duì)定量,揭示了CYP2C9、CYP2E1、CYP3A4、CYP2A6、UGT1A6、UGT2B7 和UGT2B15 的表達(dá)水平大于50 fmol/μg,并且分析了藥物代謝酶的表達(dá)水平與藥物代謝酶的活性以及mRNA 的表達(dá)水平的相關(guān)性;Liu 等[29]采用化學(xué)合成制備內(nèi)標(biāo)肽段結(jié)合液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用方法和藥物探針法對(duì)12 例人肝微粒體樣本的7 種CYP 藥物代謝酶進(jìn)行了定量,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明CYP3A4 酶的表達(dá)水平與酶活性具有較高相關(guān)性(相關(guān)系數(shù)r =0.943,p<0.000 1);Gr?er 等[30]采用以上方法對(duì)25 例人肝微粒體樣本中的9 種CYP 酶和4 種UGT酶進(jìn)行了絕對(duì)定量,揭示了藥物代謝酶表達(dá)水平之間的相關(guān)性。雖然基于化學(xué)合成法制備內(nèi)標(biāo)肽段結(jié)合液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用方法可以對(duì)藥物代謝酶含量進(jìn)行準(zhǔn)確測定,但由于通過化學(xué)合成方法制備內(nèi)標(biāo)肽段過程復(fù)雜、耗時(shí)耗力且需要對(duì)每條內(nèi)標(biāo)肽段進(jìn)行準(zhǔn)確定量,不適合用于藥物代謝酶的高通量、規(guī)?;糠治?。因此,迫切需要發(fā)展一種規(guī)?;苽鋬?nèi)標(biāo)肽段的方法。
規(guī)模化制備內(nèi)標(biāo)肽段對(duì)于藥物代謝酶含量的高通量測定至關(guān)重要,為此,Beynon 等[31]在2005 年成功設(shè)計(jì)、表達(dá)了一種人工合成蛋白質(zhì),這種人工合成蛋白質(zhì)是多個(gè)目標(biāo)蛋白質(zhì)酶切后的特異性肽段的串聯(lián)體,即將編碼QconCAT 蛋白質(zhì)的基因序列插入到高表達(dá)的質(zhì)粒中,然后轉(zhuǎn)染到大腸桿菌體內(nèi)進(jìn)行表達(dá),制備QconCAT 蛋白質(zhì)。由于在QconCAT蛋白質(zhì)中所有目標(biāo)蛋白質(zhì)的特異性肽段都以等摩爾比關(guān)系存在,因此只要QconCAT 蛋白質(zhì)中一條特異性肽段被準(zhǔn)確定量,便可知其他特異性肽段的含量。鑒于QconCAT 技術(shù)制備內(nèi)標(biāo)肽段的優(yōu)點(diǎn),Achour 等[32]首次將QconCAT 制備技術(shù)應(yīng)用到藥物代謝酶的定量中,通過與MRM MS 方法結(jié)合對(duì)24 例樣本中的13 種CYP 酶和8 種UGT 酶同時(shí)進(jìn)行含量測定,揭示了藥物代謝酶表達(dá)水平之間的相關(guān)性,并分析了年齡、吸煙、酒精對(duì)藥物代謝酶表達(dá)水平的影響,為藥物代謝酶的規(guī)?;块_辟了新的途徑。另外,我們課題組的Li 等[33]也將Qcon-CAT 技術(shù)與18O 酶促反應(yīng)標(biāo)記結(jié)合制備內(nèi)標(biāo)肽段并應(yīng)用到藥物代謝酶的含量測定,這種方法縮短了制備樣品的時(shí)間,可對(duì)人肝微粒體中的21 種藥物代謝酶進(jìn)行同時(shí)定量。盡管如此,QconCAT 技術(shù)制備內(nèi)標(biāo)肽段也存在一些問題,例如部分內(nèi)標(biāo)肽段不完全標(biāo)記,以及QconCAT 制備的內(nèi)標(biāo)肽段以相同的物質(zhì)的量加入到待測樣本中,對(duì)樣本中豐度差異較低的藥物代謝酶準(zhǔn)確定量產(chǎn)生不利的影響。
穩(wěn)定同位素代謝標(biāo)記技術(shù)(stable isotope labeling by amino acids in cell culture,SILAC)是蛋白質(zhì)組學(xué)中一種常用的代謝標(biāo)記技術(shù),即在含有重標(biāo)氨基酸的培養(yǎng)液中,通過代謝途徑對(duì)細(xì)胞或動(dòng)物體中的蛋白質(zhì)進(jìn)行穩(wěn)定同位素標(biāo)記的技術(shù)[34]。由于該方法具有高準(zhǔn)確度,MacLeod 等[35]在傳統(tǒng)SILAC 標(biāo)記技術(shù)的基礎(chǔ)上,通過同步配體介導(dǎo)的多個(gè)上游核受體的激活誘導(dǎo)藥物代謝酶的表達(dá),使用目標(biāo)高分辨-選擇性監(jiān)測質(zhì)譜(tHR-SIM MS)方法對(duì)鼠肝中68 種Ⅰ相代謝酶和30 種Ⅱ相代謝酶進(jìn)行了相對(duì)定量。特別是在這種方法中,通過同步配體介導(dǎo)方法誘導(dǎo)藥物代謝酶高表達(dá),實(shí)現(xiàn)了對(duì)Cyps 1a、2a、2b、2c 和3a 等表達(dá)水平較低的藥物代謝酶準(zhǔn)確定量,這種方法為接近檢出限或定量限的低表達(dá)藥物代謝酶的準(zhǔn)確定量,提供了一種新的研究思路。
HPLC-MRM MS 方法應(yīng)用于小分子的定量分析中,被分析物與基體是容易分離的[36,37]。但當(dāng)這些方法用于復(fù)雜生物大分子樣本中藥物代謝酶(蛋白質(zhì))的定量時(shí),首先需要對(duì)生物樣本中所有蛋白質(zhì)進(jìn)行酶切,然后通過對(duì)不同藥物代謝酶特異性的肽段進(jìn)行定量,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)對(duì)該藥物代謝酶的定量。因此,這些方法面臨的一個(gè)共同挑戰(zhàn)是,由于不同肽段構(gòu)成的基體與被分析物肽段的化學(xué)性質(zhì)相近,使得分析物難以分離,這些基體將與目標(biāo)肽段共同通過ESI 離子源進(jìn)入質(zhì)譜,影響被分析物的檢出限、定量限、線性范圍以及定量準(zhǔn)確度[38]。另外,一些藥物代謝酶,如CYP2C19、UGT1A3,以及UGT2B11等含量較低的藥物代謝酶在質(zhì)譜中的信號(hào)較低,且受到基質(zhì)干擾的影響而無法檢測。因此,在HPLCMRM MS 方法建立和性能評(píng)價(jià)時(shí)應(yīng)充分考慮基體干擾問題。常用的方法是采用空白基體消除其對(duì)分析結(jié)果的影響,但在一種樣本中定量多種分析物時(shí),難以獲得空白基體。雖然有文獻(xiàn)[39-42]報(bào)道采用外源基體作為空白基體降低基體干擾的影響,但由于與實(shí)際樣本基體有較大差異,因此,這種方法的作用影響有限。為此,發(fā)展了一些新的降低基體干擾影響的方法。我們課題組的Zhao 等[43]將樣本中存在的高濃度蛋白質(zhì)的混合物作為空白基體,盡管與真實(shí)樣本基體較接近,但仍有一定差距。Wang 等[44]采用金屬元素多重標(biāo)記合成肽段作為內(nèi)標(biāo),采用實(shí)際樣本作為基體,可解決基體干擾問題。但是由于該方法標(biāo)記過程復(fù)雜,不利于實(shí)際應(yīng)用。Kuzyk等[45]將樣本溶液進(jìn)行一系列的稀釋,配制成不同濃度的樣本,然后加入等量的標(biāo)記肽段,經(jīng)過HPLCMRM MS 分析,根據(jù)樣本中被分析物與標(biāo)記肽段的質(zhì)譜信號(hào)強(qiáng)度計(jì)算出樣本中待測物的濃度。雖然該方法考慮了基體干擾,但采用單點(diǎn)校正法計(jì)算樣本中藥物代謝酶的濃度,不僅計(jì)算方法會(huì)導(dǎo)致分析物濃度測定值與真實(shí)值之間的偏差,且經(jīng)稀釋的不同濃度點(diǎn)的樣本基體濃度不同,也會(huì)使分析結(jié)果的精密度變差。綜上所述,雖然用于復(fù)雜生物樣本中藥物代謝酶含量測定的方法研究取得了很大的進(jìn)展,但更高靈敏度、更高準(zhǔn)確度和更高通量的藥物代謝酶定量新方法仍然需要進(jìn)一步探索。
綜上所述,在藥物代謝酶含量測定的方法中,HPLC-MRM MS 方法具有高靈敏度、高選擇性和高通量的特點(diǎn),加之不需要特異性的抗體,與其他經(jīng)典方法相比具有更多優(yōu)勢;但這種方法的應(yīng)用也面臨一些問題,如低濃度的藥物代謝酶因受基體干擾影響定量準(zhǔn)確性和空白樣本基體制備問題、規(guī)模化內(nèi)標(biāo)制備問題以及如何進(jìn)一步提高液相色譜分離度、質(zhì)譜的檢測靈敏度和通量的問題。這些問題都對(duì)HPLC-MRM MS 方法在藥物代謝酶定量中的應(yīng)用造成困難,需要逐步解決并開發(fā)出藥物代謝酶定量的新方法。
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