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FP-Growth 算法在藥物相互作用系統(tǒng)中的應(yīng)用

2015-04-25 11:31:18王殿君邵宗凱
關(guān)鍵詞:置信度類(lèi)藥物數(shù)據(jù)挖掘

王殿君 ,邵宗凱

1.昆明理工大學(xué)信息工程與自動(dòng)化學(xué)院,云南 昆明 650500 2.云南省第一人民醫(yī)院云南省藥學(xué)服務(wù)質(zhì)量管理研究中心,云南 昆明 650500

0 引 言

如今,伴隨著靜脈藥物治療中藥品種類(lèi)的不斷增加以及新品種藥物的出現(xiàn),聯(lián)合用藥得到了廣泛使用,同時(shí)所產(chǎn)生的藥物之間相互作用也受到了人們?cè)絹?lái)越多的關(guān)注.目前,在靜脈用藥當(dāng)中,對(duì)病人進(jìn)行治療的過(guò)程中幾乎不存在一次只使用單一種類(lèi)藥物的情況,聯(lián)合用藥是為了增強(qiáng)藥物的治療效果,同時(shí)又減少藥物的不良反應(yīng)和用藥量,隨著當(dāng)前聯(lián)合用藥數(shù)量越來(lái)越多,藥物之間的不良反應(yīng)的頻率也在不斷的上升,聯(lián)合給藥中藥物相互作用是導(dǎo)致藥物不良反應(yīng)的一個(gè)非常重要的因素.因此,對(duì)藥物相互作用的研究具有重要的指導(dǎo)意義和實(shí)踐意義[1-2].數(shù)據(jù)挖掘是最近幾年里發(fā)展起來(lái)的一種信息處理技術(shù),它是通過(guò)相關(guān)的算法搜索出隱藏于其中有價(jià)值信息的過(guò)程.本文對(duì)關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘中的FP-Growth算法進(jìn)行了有關(guān)研究,利用的藥物數(shù)據(jù)是相關(guān)文獻(xiàn)[3-4]中的抗感染類(lèi)藥物數(shù)據(jù),探討各藥物之間潛在、有價(jià)值的關(guān)系.

1 藥物相互作用的相關(guān)概念

藥物相互作用是指在相同的時(shí)間或同一段時(shí)間2種或2種以上的藥物聯(lián)合使用時(shí)所導(dǎo)致藥物療效所產(chǎn)生的變化,可能加強(qiáng)療效或減少藥物的不利影響,也可能是藥物的藥效減弱或者出現(xiàn)本來(lái)不應(yīng)該有的副作用,有時(shí)候甚至可能發(fā)生一些罕見(jiàn)的不良反應(yīng),進(jìn)而危害患者的身體健康[1].比如:當(dāng)去甲腎上腺素與全麻藥同時(shí)使用時(shí),會(huì)使心肌對(duì)擬交感胺類(lèi)藥反應(yīng)更加的敏感,容易發(fā)生室性心律失常,不適宜一同使用,必須一同使用時(shí)應(yīng)減少用量;當(dāng)甲苯磺丁脲與磺胺類(lèi)藥物同時(shí)使用時(shí),會(huì)致使人體出現(xiàn)低血糖的癥狀.

2 數(shù)據(jù)挖掘概述

2.1 數(shù)據(jù)挖掘概念

在最近幾十年中,伴隨著計(jì)算機(jī)、數(shù)據(jù)庫(kù)及其相關(guān)技術(shù)的快速發(fā)展的同時(shí),數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)也變的越來(lái)越簡(jiǎn)單和低廉.如何對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理成為我們必須面對(duì)的問(wèn)題,所以數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,數(shù)據(jù)挖掘是指從海量的數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)潛在的、有用的,最終可轉(zhuǎn)換成可被理解的形式的過(guò)程.受多個(gè)學(xué)科影響,比如:統(tǒng)計(jì)學(xué)、數(shù)據(jù)庫(kù)、機(jī)器學(xué)習(xí)、信息科學(xué)、可視化和其它學(xué)科等[5-6].

2.2 關(guān)聯(lián)規(guī)則概念

當(dāng)前在醫(yī)藥學(xué)領(lǐng)域中數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)應(yīng)用也十分廣泛與成功[7].將數(shù)據(jù)挖掘中的關(guān)聯(lián)規(guī)則應(yīng)用到醫(yī)院靜脈注射藥物相互作用分析中,促進(jìn)了合理用藥,從而對(duì)靜配中心的藥物分析工作起到一定的指導(dǎo)作用.

關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘用來(lái)找出海量數(shù)據(jù)中各項(xiàng)集之間潛在的相關(guān)聯(lián)系,它是數(shù)據(jù)挖據(jù)中的一類(lèi)重要算法.最近幾年廣泛應(yīng)用于各個(gè)行業(yè)中.

FP-Growth 算法[8-9]作為關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘中的經(jīng)典算法,F(xiàn)P-Growth算法利用了特殊的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),解決了APRIORI算法挖掘過(guò)程中需要不斷掃描數(shù)據(jù)庫(kù)的缺點(diǎn),它不需要不斷的生成候選項(xiàng)集和不斷的掃描數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)進(jìn)行對(duì)比.為了能夠達(dá)到這種效果,它采用了一種特殊的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)形式,稱(chēng)為頻繁模式樹(shù)(FP-tree).

采用FP-Growth算法的步驟如下:

(1)為每一個(gè)頻繁項(xiàng),構(gòu)建它的條件模式基,然后再構(gòu)建它的條件頻繁模式樹(shù).

(2)為每個(gè)新創(chuàng)建的條件頻繁模式樹(shù)重復(fù)上述過(guò)程.

(3)當(dāng)構(gòu)建的頻繁模式樹(shù)為NULL時(shí),它的前綴就是頻繁模式;當(dāng)頻繁模式樹(shù)只包含1條路徑時(shí),列出所有可能的組合,然后與FP-tree的前綴連結(jié)就可以獲取頻繁模式.

通過(guò)最小置信度對(duì)每個(gè)頻繁項(xiàng)集進(jìn)行篩選,選出置信度大于或等于最小置信度的頻繁項(xiàng)集,形成強(qiáng)關(guān)聯(lián)規(guī)則,成為有效關(guān)聯(lián)規(guī)則.

3 以關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘開(kāi)發(fā)的靜脈注射藥物相互作用的分析系統(tǒng)

靜脈藥物配置中心,簡(jiǎn)稱(chēng)靜配中心,英文縮寫(xiě)為PIVAS,是指依照國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的要求和藥物的特點(diǎn)來(lái)設(shè)計(jì)配藥環(huán)境,并由接受過(guò)嚴(yán)格訓(xùn)練的藥學(xué)技術(shù)人員來(lái)依照操作流程對(duì)包括細(xì)胞毒性藥物在內(nèi)的一些藥物進(jìn)行集中科學(xué)配置的醫(yī)藥機(jī)構(gòu)[10],它是為合理用藥和臨床治療服務(wù)的.靜脈藥物配置中心可為臨床治療提供安全、可靠、經(jīng)濟(jì)的靜脈用藥,對(duì)臨床治療中的合理用藥起到重要的促進(jìn)作用.所以將數(shù)據(jù)挖掘中的關(guān)聯(lián)規(guī)則算法應(yīng)用到醫(yī)院靜配中心靜脈注射藥物相互作用中有非常重要的實(shí)際和指導(dǎo)意義.

藥物相互作用的關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘流程圖如圖1所示.

圖1 藥物相互作用分析關(guān)聯(lián)規(guī)則流程圖Fig.1 Flowchartof association rules of drug interaction analysis

3.1 數(shù)據(jù)處理

數(shù)據(jù)處理過(guò)程可以用來(lái)改善數(shù)據(jù)的質(zhì)量,從而有利于后續(xù)的數(shù)據(jù)挖掘工作,提供高質(zhì)量的數(shù)據(jù),從而提高了數(shù)據(jù)挖掘的準(zhǔn)確度和性能.本文主要對(duì)《藥物相互作用基礎(chǔ)與臨床》和《靜脈用藥物調(diào)配技術(shù)》兩本書(shū)中的抗感染類(lèi)藥物分別為41種、137種藥物數(shù)據(jù)進(jìn)行處理.

根據(jù)以上的藥物數(shù)據(jù),將相關(guān)文獻(xiàn)中的抗感染類(lèi)藥物信息進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,以此建立藥物事務(wù)的數(shù)據(jù)庫(kù)表.此事務(wù)數(shù)據(jù)庫(kù)表包括七個(gè)欄目:審核項(xiàng)目、藥物名稱(chēng)、異常藥物名稱(chēng)、提示、異常藥物編碼、異常藥物類(lèi)別和注意事項(xiàng)描述.其中提示信息可以分為:

1)禁止與其配伍;

2)與其配伍需謹(jǐn)慎;

3)需要關(guān)注;

4)調(diào)低用藥劑量;

5)調(diào)高用藥劑量.

3.2 關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘結(jié)果及分析

通過(guò)多次試驗(yàn),最終將最小置信度設(shè)為40%,而避免合用藥物最小支持度設(shè)為8%,謹(jǐn)慎合用藥物最小支持度設(shè)為10%,可以合用藥物數(shù)據(jù)庫(kù)的最小支持度設(shè)為 10%[11].

對(duì)產(chǎn)生的關(guān)聯(lián)規(guī)則作分析,從而得出其中的一些規(guī)律,取其中的幾條強(qiáng)關(guān)聯(lián)規(guī)則進(jìn)行說(shuō)明.

由避免合用藥物生成規(guī)則說(shuō)明與慶大霉素需避免合用的抗感染類(lèi)藥物有92.5%與卡那霉素也需避免合用.

慶大霉素?卡那霉素 0.925

這條規(guī)則的置信度為92.5%,說(shuō)明:當(dāng)有一種抗感染類(lèi)藥物與慶大霉素避免合用時(shí),這種藥物同時(shí)與卡那霉素避免合用的概率為92.5%.

由謹(jǐn)慎合用藥物生成規(guī)則說(shuō)明與妥布霉素需謹(jǐn)慎合用的抗感染類(lèi)藥物有41.4%與多黏菌素B與需謹(jǐn)慎合用.

妥布霉素?多黏菌素B 0.414

這條規(guī)則的置信度為41.4%,說(shuō)明:當(dāng)有一種抗感染類(lèi)藥物與妥布霉素謹(jǐn)慎合用時(shí),這種藥物同時(shí)與多黏菌素B謹(jǐn)慎合用的概率為41.4%.

對(duì)于其它規(guī)則也可以得到同樣的結(jié)果.由可以合用藥物生成規(guī)則:

阿苯達(dá)唑?氯喹+伏立康唑 0.50

這條規(guī)則的置信度為50%,說(shuō)明當(dāng)有一種抗感染類(lèi)藥物與阿苯達(dá)唑可以合用時(shí),這種藥物同時(shí)與氯喹和福利康唑可以合用的概率為50%.

將關(guān)聯(lián)規(guī)則應(yīng)用到靜脈注射藥物相互作用分析中,系統(tǒng)經(jīng)過(guò)一段時(shí)間實(shí)際測(cè)試,效果良好.部分結(jié)果顯示結(jié)果如圖2所示.

圖2 關(guān)聯(lián)規(guī)則在靜配中心藥物相互作用系統(tǒng)中的應(yīng)用Fig.2 Application of association rules in drug-interaction system at the center of the static distribution

4 結(jié) 語(yǔ)

結(jié)合以上分析,對(duì)于藥物的相互作用案例進(jìn)行關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘是可行的.通過(guò)設(shè)置合理的最小置信度和支持度閾值能夠挖掘出有意義的規(guī)則.通過(guò)分析這些強(qiáng)關(guān)聯(lián)規(guī)則集有利于揭示數(shù)據(jù)之間潛在的、有價(jià)值的聯(lián)系.

對(duì)關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘中的FP-Growth算法進(jìn)行了相關(guān)研究,并對(duì)藥物數(shù)據(jù)進(jìn)行了挖掘,初步探討了各個(gè)藥物各因素值間的聯(lián)系.實(shí)際并實(shí)現(xiàn)了靜脈注射藥物相互作用分析系統(tǒng),促進(jìn)了合理用藥和用藥安全.

致 謝

感謝昆明理工大學(xué)信息工程與自動(dòng)化學(xué)院、云南省第一人民醫(yī)院藥劑科靜配中心提供的幫助與支持!

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