紐約時報
你在地鐵上有沒有見到過某種你不太認識的東西——某種神秘的無法辨認的東西?
呃,科學家們很可能也不知道它是什么。
周四,韋爾·康奈爾醫(yī)學院(Weill Cornell Medical College)的研究者們公布了一項研究,他們繪制了紐約地鐵系統(tǒng)的DNA圖譜。這個擁擠的地下龐然大物每個工作日平均運送550萬乘客,這里有上千種細菌(大多是無害的),偶爾還能找到腺鼠疫的痕跡,這是個謎一般的世界。在紐約地鐵系統(tǒng)中發(fā)現(xiàn)的DNA中,有近一半與已知的所有微生物都不匹配,只有 0.2%與人類的基因組匹配。
“人們看著地鐵上的扶手柱,原本不會心想, ‘這上面滿是生命,” 這項研究的主要作者、韋爾·康奈爾醫(yī)學院的遺傳學家克里斯托弗·E·梅森博士(Christopher E. Mason)說,“看完這項研究后,他們可能會開始這樣想。但是我想讓他們以看待雨林的眼光看待地鐵,這里有這么多物種,但是并沒有影響你的健康,簡直令人敬畏和驚嘆?!?/p>
梅森說,大約四年前,他產(chǎn)生了進行這項研究的想法。當時他把女兒送去日托所。他發(fā)現(xiàn),她探索新環(huán)境的方式是高興地把東西丟到嘴里品嘗。小孩子的友誼都是在地板上建立起來的,來回交換玩具,你啃完我啃。
“我忍不住想,‘他們之間究竟傳遞了哪些東西,又傳遞了多少?”梅森說。所以他想到了一個地方,一個成年人可能靠得太近的地方——地鐵。
于是,這個被稱為PathoMap的項目就誕生了。在過去的17個月中,一個主要由醫(yī)學院學生、畢業(yè)生和志愿者組成的團隊在城里四散開來,他們用尼龍簽子從木板凳、樓梯扶手、座位、門、柱子和旋轉(zhuǎn)門等各種物體表面收集一式三份的DNA。
除了大量神秘的DNA——這并不令人意外,因為科學家們僅繪制出了幾千個基因組——這項研究的其他發(fā)現(xiàn)還反映出紐約在人種和微生物方面著名的多樣性。
結(jié)果發(fā)現(xiàn),從微生物種類角度講,布朗克斯區(qū)最多樣化。布魯克林區(qū)排第二,接下來是曼哈頓區(qū)、皇后區(qū)和斯塔滕島(研究者是在斯塔滕島的火車上收集樣本的)。
梅森博士說,從人的角度講,在某些情況下,在某些地鐵站找到的DNA與其周圍的人口情況相符。比如,曼哈頓中國城附近有個西班牙裔聚居區(qū),這里的地鐵站里有大量西班牙和亞洲基因。
布魯克林區(qū)展望公園(Prospect Park)南部主要包括肯辛頓和溫莎,這附近收集的DNA大多被解讀為英國后裔、托斯卡納后裔和芬蘭后裔,人們通常不會把這三個人群與這個區(qū)聯(lián)系在一起。梅森對這個發(fā)現(xiàn)的解釋是:科學家們還沒有建立起值得信賴的愛爾蘭基因數(shù)據(jù)庫,所以住在這里的愛爾蘭后裔的DNA可能被誤認為是其他歐洲人群的,因為他們的 DNA有很多相似之處。這項研究還發(fā)現(xiàn)了一些不那么令人愉快的情況。在收集到的樣本中,有27%是活性耐藥細菌,雖然在收集到的所有細菌中,只有12%與疾病相關(guān)。研究者還發(fā)現(xiàn)了三個與腺鼠疫相關(guān)的樣本和兩個與炭疽的DNA片段相關(guān)的樣本,不過他們指出,這些樣本都沒有活性,有很長一段時間,紐約都沒有出現(xiàn)過這兩種疾病的確診案例。梅森說,“紐約州和東海岸有很多記錄在案的牲畜炭疽病例”,在紐約地鐵上發(fā)現(xiàn)炭疽樣本“與這一情況吻合”。
這項研究的作者們說,進行這項研究的目的不僅是為了滿足科學家們的好奇心。研究者們現(xiàn)在把這些物種歸類,將來就可以把它們用作對照樣本,以確定某些疾病甚至某些用作生物恐怖主義武器的物質(zhì)是否已擴散。
城市和交通官員們似乎并不歡迎這項研究。
“就像這項研究清楚表明的那樣,在物體表面發(fā)現(xiàn)的那些微生物對人的生命和健康毫無危害,”紐約大都會運輸署發(fā)言人凱文·奧爾蒂斯(Kevin Ortiz)在郵件中說。紐約衛(wèi)生部稱這項研究“有重大缺陷”,具有誤導性。
梅森對此的回復是,他和他的團隊只是呈現(xiàn)出他們的全部研究結(jié)果。
“對我們來說,在全面分析的情況下,不報告炭疽DNA片段和黑死病是不負責任的,”他說,“我們的發(fā)現(xiàn)展示了一個正常、健康的微生物群,我們歡迎其他人復核這些公開發(fā)布的數(shù)據(jù),進行同樣的分析。”