黃龍全,張劍韻
維生素B6(VB6)是一組可相互轉(zhuǎn)換的吡啶衍生物的總稱,包括吡哆醇(pyridoxine,PN)、吡哆胺(pyridoxamine,PM)、吡哆醛(pyridoxal,PL)、磷酸吡哆醇(pyridoxine 5′-phosphate,PNP)、磷酸吡哆胺(pyridoxamine 5′-phosphate,PMP)和磷酸吡哆醛(pyridoxal 5′-phosphate,PLP)。其 中,PLP 是140多種細(xì)胞酶的輔酶,在生物體內(nèi)發(fā)揮廣泛、重要的作用。植物和微生物是自然界VB6的制造者,動(dòng)物從食物中獲得VB6。在植物體內(nèi),PLP作為胱硫醚合成酶[1]、氨基環(huán)丙烷羧化物合成酶[2]、絲氨酸棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶[3]、蘇氨酸合成酶[4]、胱硫醚裂合酶[5]等的輔酶有詳細(xì)研究;PLP 也是乙烯、葉綠素和生長(zhǎng)素 合 成 所 必 需 的[6-7];PLP 還 涉 及 亞 油 酸 和 淀 粉 的合成[8]。近年來(lái)發(fā)現(xiàn)VB6也是抗氧化劑,可有效淬滅單線態(tài)氧和超氧陰離子自由基[9-10];它作為細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)的調(diào)節(jié)分子,對(duì)細(xì)胞膜上的離子通道具有調(diào)節(jié)作用[11];它發(fā)揮抗逆作用,保護(hù)植物免受低溫、紫外線、氧化、滲透壓等環(huán)境脅迫的影響[12-13]。無(wú)論是闡明VB6參與調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育和環(huán)境反應(yīng)的機(jī)理,通過(guò)遺傳改良提高食源性植物的VB6含量,還是利用VB6的特殊生理功能提高植物的逆境適應(yīng)能力,都依賴于對(duì)VB6代謝的研究。植物VB6代謝包括VB6的從頭合成和合成后的代謝轉(zhuǎn)換。本文綜述了植物VB6從頭合成與代謝轉(zhuǎn)換的研究進(jìn)展。
至今發(fā)現(xiàn)兩種VB6從頭合成途徑(de novo synthetic pathway),兩者的底物、產(chǎn)物和作用酶均不相同。首先發(fā)現(xiàn)的DXP依賴途徑(DXP dependent pathway)在大腸桿菌有詳細(xì)研究,利用1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸(DXP)和4-磷酸羥基-蘇氨酸首先合成PNP,再經(jīng)PNP氧化酶的作用,轉(zhuǎn)變?yōu)镻LP后用于細(xì)胞代謝過(guò)程[14]。
另外一條途徑DXP 非依賴途徑(DXP independent pathway)于1999年發(fā)現(xiàn)。該途徑以谷氨酰胺、3-磷酸甘油醛(或磷酸二羥丙酮)和5-磷酸核糖(或5-磷酸核酮糖)為底物直接合成PLP[15-17](圖1)。Ehrenshaft等[15]在研究尾孢菌(C.nicotianae)對(duì)自身毒素的抗性中發(fā)現(xiàn)了涉及VB6代謝的新基因,最初指定為單線態(tài)氧抗性基因SOR1,后來(lái)鑒定為PDX1。2001年又從尾孢菌鑒定出涉及VB6合成的第2 個(gè)基因PDX2[16]。目前已經(jīng)明確PDX1和PDX2構(gòu)成PLP合酶復(fù)合體(PLP synthase complex),PDX2發(fā)揮谷氨酰胺酶的作用,催化從谷氨酰胺產(chǎn)生氨;PDX1發(fā)揮閉環(huán)蛋白的作用,催化5-磷酸核糖、3-磷酸甘油醛和氨的縮合,完成PLP 的合成[17]。DXP非依賴途徑的產(chǎn)物直接用于細(xì)胞代謝,生物效率高于DXP依賴途徑,是自然界VB6的主要合成途徑。DXP 非依賴途徑通過(guò)谷氨酰胺將VB6和氨基酸代謝聯(lián)系起來(lái),通過(guò)丙糖和戊糖磷酸代謝池又將VB6與細(xì)胞能量途徑聯(lián)系起來(lái)。
VB6合成途徑作用酶及其編碼基因的鑒定是極為重要的一歩。學(xué)術(shù)界很長(zhǎng)時(shí)間認(rèn)為植物通過(guò)DXP依賴途徑合成VB6,但始終沒(méi)有找到實(shí)驗(yàn)依據(jù)。作為植物逆境應(yīng)答中VB6作用研究的一部分,2005年Denslow 等[18]從煙草鑒定出PDX1 和PDX2同源序列。使用兼并引物的基因擴(kuò)增獲得2個(gè)PDX1序列,彼此相差15個(gè)堿基,編碼相同氨基酸序列,可能是2 個(gè)等位基因或者2 個(gè)拷貝。PDX2為單拷貝基因,表達(dá)也遠(yuǎn)低于PDX1。多個(gè)研究小組從擬南芥也鑒定出PDX1和PDX2同源序列,并開(kāi)展了更為深入的研究[13,19-23]。目前已經(jīng)明確植物通過(guò)DXP非依賴途徑從頭合成VB6。
圖1 DXP非依賴性維生素B6 合成途徑Fig.1 DXP independent vitamin B6synthetic pathway
擬南芥PDX2也是單拷貝基因,位于5號(hào)染色體上(At5g60540),基因長(zhǎng)度為2 180bp,含有7個(gè)外顯子,轉(zhuǎn)錄長(zhǎng)度為768bp,編碼255個(gè)氨基酸、理論分子量為27 303Da的蛋白。存在3個(gè)PDX1同系物,分別命名為AtPDX1.1、AtPDX1.2和AtPDX1.3。PDX1.1(At2g38230)、PDX1.2(At3g16050)和PDX1.3(At5g01410)分別位于2號(hào)、3號(hào)和5號(hào)染色體上。PDX1.1和PDX1.3具有89%的相似性,而與PDX1.2的相似性為60%。擬南芥還存在一個(gè)小的不完全拷貝(PDX1.4),其與PDX1.1基因上游序列33%相同,在細(xì)胞代謝中可能沒(méi)有作用。PDX1同系物都沒(méi)有基因內(nèi)含子,提示其原核起源。PDX1.1、PDX1.2和PDX1.3的轉(zhuǎn)錄長(zhǎng)度分別為1 053、1 380和1 297bp。PDX2對(duì)擬南芥的生長(zhǎng)發(fā)育至關(guān)重要,突變體胚胎致死[19,23]。因?yàn)殡y以獲得PDX2的純合突變體,所以大量的研究集中 在PDX1同系物上[13,19-22]。其 中PDX1.3 的 轉(zhuǎn)錄豐度最高,突變體表型和VB6水平的變化最大,研究也最為詳細(xì)。
PDX1.1基因沉默植物出現(xiàn)萎黃和根系生長(zhǎng)不良,而PDX1.1和PDX1.3基因都沉默植物葉片萎黃畸形,多數(shù)死亡,幸存植物的花朵小、未能結(jié)籽,提 示PDX1.1 和PDX1.3可能存在功能重疊[21]。Titiz等[20]對(duì)PDX1.1 和PDX1.3 基因進(jìn)行了TDNA 插入突變。pdx1.3突變體的表型與Wagner等的結(jié)果非常相似,但pdx1.1突變體的VB6水平?jīng)]有下降,也不呈現(xiàn)萎黃表型。Titiz等也進(jìn)行了PDX1.1和PDX1.3雙突變,惡化的表型和致命的雙突變也預(yù)示兩基因至少部分功能重疊。但是,2個(gè)基因的時(shí)空表達(dá)存在差異[13,20-21],提示兩者也可能具有相對(duì)獨(dú)立的功能,在擬南芥基因組中都有存在的意義。擬南芥PDX1.2的作用還不清楚,基因插入突變體的表型與野生型沒(méi)有差異[21]。但擬南芥遭遇紫外線和氧化脅迫時(shí)PDX1.2轉(zhuǎn)錄上調(diào)[22],提示PDX1.2可能在脅迫條件下發(fā)揮作用。
煙草感染假單胞桿菌后PDX1和PDX2的基因表達(dá)下調(diào),而水楊酸和茉莉酮酸甲酯處理可致基因短暫上調(diào)[18]。Chen等[13]在分離干旱和鹽脅迫響應(yīng)蛋白互作伴侶的酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)中,首先分離出PDX1.3。植物的根、莖、葉、花和長(zhǎng)角果都能檢測(cè)出PDX1.3的轉(zhuǎn)錄,基因的最強(qiáng)表達(dá)出現(xiàn)在脈管組織和保衛(wèi)細(xì)胞。pdx1.3突變體的葉綠體和根的生長(zhǎng)異常,幼苗的根對(duì)鹽和甘露醇敏感,提示PDX1.3蛋白涉及對(duì)滲透和離子脅迫的生物應(yīng)答。pdx1.3突變體根部缺乏色氨酸依賴性生長(zhǎng)素的合成,這可能是出現(xiàn)短根表型的原因[24]。2006年,Wagner等[21]獲得了PDX1.3基因EMS 突變體rsr4-1,突變體的蔗糖響應(yīng)下降,呈現(xiàn)根生長(zhǎng)退化、矮小和退綠葉。突變體的表型可以采用向生長(zhǎng)媒體中添加PL 的方法加以恢復(fù),添加PN、PM 或者PLP可部分恢復(fù)。
Denslow 等[22]報(bào)道了非生物脅迫下擬南芥PLP合酶基因的應(yīng)答調(diào)節(jié)。正常狀態(tài)下,擬南芥PDX1.1和PDX1.3高水平表達(dá),PDX1.2不表達(dá)或低水平表達(dá),PDX2中間水平表達(dá)。在植物遭遇強(qiáng)光、低溫、干旱、紫外線、百草枯和臭氧時(shí),PDX1和PDX2基因都上調(diào)。作者進(jìn)一步分析多種脅迫因子對(duì)煙草VB6存在形態(tài)的影響,發(fā)現(xiàn)PLP 水平不同程度地應(yīng)答上升,并引起PL 和PN 的相應(yīng)變化,隨后回歸對(duì)照水平[25]。
2007年Herrero 等[26]在煙草中表達(dá)尾孢菌PLP合成酶基因,嘗試提高煙草的VB6含量。結(jié)果僅有一個(gè)株系VB6水平的增加達(dá)到顯著水平,比野生型和轉(zhuǎn)化對(duì)照系高出約17%。然而,轉(zhuǎn)化系煙草內(nèi)源PDX1和PDX2 基因的表達(dá)下降,提示植物VB6的從頭合成受到嚴(yán)格調(diào)控。2011年,Raschke等[27]在擬南芥過(guò)量表達(dá)PDX 蛋白,獲得了VB6含量顯著增加的植株。他們還發(fā)現(xiàn)僅能提高PDX1的蛋白表達(dá)量,高VB6含量植株的生長(zhǎng)期延長(zhǎng),細(xì)胞體積增大,對(duì)氧化脅迫的抵抗性也增強(qiáng)。
PDX1和PDX2 復(fù)合體的細(xì)胞定位還存在爭(zhēng)議。Tambasco-Studart等報(bào)道所有PDX1和PDX2蛋白都定位于細(xì)胞溶質(zhì)[19]。然而,Chen 等[13]把PDX1.3定位于細(xì)胞器和膜系統(tǒng)。Denslow 等[21]也報(bào)道能夠從質(zhì)膜和細(xì)胞核觀察到PDX2 蛋白。從SUBA 擬南芥亞細(xì)胞定位數(shù)據(jù)庫(kù)匯總的亞細(xì)胞定位信息看,PDX1和PDX2定位于細(xì)胞溶質(zhì)和細(xì)胞器?;陬A(yù)測(cè)程序,PDX1.1、PDX1.3 和PDX2定位于細(xì)胞溶質(zhì)、線粒體和質(zhì)體,PDX1.2定位于細(xì)胞溶質(zhì)和線粒體。
除了VB6的從頭合成,細(xì)菌和真核生物細(xì)胞中還普遍存在一條相似的PLP補(bǔ)救途徑,補(bǔ)救途徑涉及一系列酶的作用,通過(guò)VB6各型的代謝轉(zhuǎn)換使得細(xì)胞能夠直接利用外源PN、PM 或PL來(lái)合成細(xì)胞代謝所需要的PLP。補(bǔ)救途徑在微生物和哺乳動(dòng)物有詳細(xì)研究。雖然PLP是占優(yōu)勢(shì)的輔酶型,其他形式的VB6在細(xì)胞中通過(guò)補(bǔ)救途徑也保持動(dòng)態(tài)平衡。
PL激酶(PL kinase,EC 2.7.1.35)在金屬陽(yáng)離子的存在下,利用ATP催化PL、PN 和PM 的5′位醇基磷酸化,生成相應(yīng)的磷酸酯型。從大腸桿菌發(fā)現(xiàn)兩種PL 激酶,pdxk 基因編碼普通PL 激酶,而pdxy 基因編碼的特殊PL 激酶僅以PL 為底物,且活性很低[28-29]。目前,真核生物中僅發(fā)現(xiàn)pdxk 基因,而多數(shù)原核生物同時(shí)具有pdxk和pdxy。
2002、2004和2008年,分別從擬南芥[30]、小麥[31]和油菜[32]克隆出PL 激酶基因。從擬南芥鑒定出的At5g37850與大腸桿菌pdxk 同源,與哺乳動(dòng)物PL 激酶氨基酸序列的相似性大于40%。At5g37850也稱SOS4,其突變體對(duì)鹽高度敏感。擬南芥SOS4基因在葉、莖、根和花均等表達(dá),根尖高度表達(dá),種子吸水60h后可檢測(cè)出PL 激酶基因的表達(dá)。小麥基因組至少有2個(gè)PL 激酶拷貝,在根、芽、穗和花藥均有轉(zhuǎn)錄。油菜也有2 個(gè)PL 激酶拷貝,基因的轉(zhuǎn)錄受發(fā)育和環(huán)境的調(diào)節(jié)。目前還缺乏采用實(shí)驗(yàn)的方法對(duì)PL 激酶進(jìn)行細(xì)胞定位,預(yù)測(cè)結(jié)果表示存在于質(zhì)體和線粒體。
擬南芥SOS4基因突變的研究證明PL 激酶是一個(gè)新的鹽耐受性決定因子,其突變體sos4 萎黃,與野生型相比植株重量減輕,根部對(duì)蔗糖和鹽高度敏感,存在NaCl時(shí)根的生長(zhǎng)嚴(yán)重受損;突變體出乎預(yù)料地出現(xiàn)了VB6積累,其中PLP 的增加量最為顯著,其次是PN 和PM[33]。PLP 的增加可能是因?yàn)閺念^合成途徑基因的上調(diào),因?yàn)閟os4 突變體PDX 基因的轉(zhuǎn)錄量比野生型的高。除了對(duì)鹽和蔗糖敏感,sos4突變體耐旱而不耐寒。最近發(fā)現(xiàn)葉綠體依靠PL激酶維持磷酸酯型VB6水平[34]。
補(bǔ)救途徑的另一個(gè)重要酶是FMN 依賴性PNP氧化酶(PNP oxidase,EC 1.4.3.5),氧化底物PNP和PMP上的4′位醇基或氨基為醛基,生成PLP。2007年克隆出擬南芥At5g49970基因,編碼蛋白由3個(gè)部分構(gòu)成,N 端為葉綠體轉(zhuǎn)運(yùn)肽,中部為未知功能的Yjef_N 區(qū)域,C 端為PNP氧化酶(PDX3)[35]。Sang等[35]在大腸桿菌中表達(dá)該基因,通過(guò)酶活性分析證明了其功能。擬南芥PNP氧化酶在不同組織中的表達(dá)存在差異,受光、熱、ABA 和乙烯處理的上調(diào),受干旱和NaCl的下調(diào)。生物信息學(xué)預(yù)測(cè)PNP 氧化酶定位于葉綠體,也獲得了GFT-AtPPOX 融合實(shí)驗(yàn)的支持。Gonzalez等[33]采用對(duì)大腸桿菌pdxh 突變體的互補(bǔ)實(shí)驗(yàn),也驗(yàn)證了擬南芥At5g49970的PNP氧化酶功能。他們還對(duì)該基因進(jìn)行了插入突變,2個(gè)獨(dú)立插入突變系氧化酶的活力均下降。pdx3 突變體的VB6總水平下降,而VB6各型與野生型相比較沒(méi)有顯著差異。生長(zhǎng)在標(biāo)準(zhǔn)室內(nèi)環(huán)境中的pdx3 突變體比野生型對(duì)照矮小。高光照條件下,pdx3 突變體對(duì)增強(qiáng)的光照反應(yīng)遲鈍,植株重量無(wú)變化,而野生型在強(qiáng)光照條件下生長(zhǎng)量增加。突變體對(duì)低溫、鹽與蔗糖引起的滲透壓響應(yīng)與野生型無(wú)區(qū)別。pdx3 突變體的SOS4以及從頭合成途徑基因,特別是PDX1.1基因的表達(dá)增強(qiáng)。雖然從頭合成途徑基因的表達(dá)增加,但pdx3突變體與野生型或者sos4突變體相比較,PDX1的酶活力下降。2011年Sang等[36]又報(bào)道PNP 氧化酶在細(xì)胞溶質(zhì)和葉綠體中將PNP 和PMP 氧化為PLP。
PL還原酶(PL reductase,EC 1.1.1.65)也稱為PN 脫氫酶,利用NADPH 將PL 還原成PN,反應(yīng)在體外是可逆的,但在體內(nèi)逆反應(yīng)幾乎不可能發(fā)生。2004年,Morita等[37]發(fā)現(xiàn)裂殖酵母PL 還原酶基因突變體能夠在缺乏VB6的合成培養(yǎng)基上生長(zhǎng),認(rèn)為該酶對(duì)酵母生存而言是非必要的,僅涉及PL轉(zhuǎn)變?yōu)镻N 后的細(xì)胞排出。
2011年,采用序列同源比對(duì)的方法從擬南芥鑒定出PL 還原酶(PLR1),在酵母PL 還原酶缺失突變體中表達(dá)AtPLR1 編碼區(qū)域,驗(yàn)證了該酶催化NADPH 依賴性PL 的 還 原 反 應(yīng)[38]。采 用T-DNA插入突變的研究發(fā)現(xiàn),plr1突變體VB6從頭合成途徑基因的表達(dá)水平變化不大,而補(bǔ)救途徑作用酶PDX3和SOS4 基因的表達(dá)發(fā)生顯著變化。并且,pdx3和sos4突變體AtPLR1 基因的表達(dá)也上調(diào)。高效液相色譜的分析結(jié)果顯示,2 個(gè)plr1 突變體VB6總水平下降,其中PL、PLP、PM 和PMP 水平顯著下降,而PN 和PNP 沒(méi)有顯著變化。突變體PL水平下降和PN 水平?jīng)]有變化是很意外的,提示AtPLR1基因的表達(dá)產(chǎn)物可能不是唯一的PL 還原反應(yīng)的作用酶。突變體的根系生長(zhǎng)正常,但植株明顯小于野生型;對(duì)低溫和高光照的抵抗性與野生型沒(méi)有差異,但明顯受NaCl和甘露醇的抑制,提示PL還原酶也可能涉及植物對(duì)滲透脅迫的抵抗性。
植物的葉際是一個(gè)復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng),具有豐富的微生物多樣性。這些微生物改變植物體表微環(huán)境和參與物質(zhì)循環(huán)。VB6是水溶性維生素,其跨膜轉(zhuǎn)移已有廣泛的研究,很早就明確只有非磷酸酯型VB6能夠穿越細(xì)胞膜。植物即可以從環(huán)境中吸收VB6,過(guò)量VB6也向環(huán)境釋放[39]。我們發(fā)現(xiàn)葉際微生物在煙草葉面可以將來(lái)源于葉組織的PL 還原為PN,提示植物PL 的還原可能還存在葉際微生物的作用[40]。
作為重要經(jīng)濟(jì)作物和模式植物,煙草VB6從頭合成途徑最早被闡明。我們以組培煙草為材料構(gòu)建無(wú)菌實(shí)驗(yàn)?zāi)P停馕隽酥参矬w內(nèi)VB6的代謝轉(zhuǎn)換,獲得了代謝轉(zhuǎn)換的重要調(diào)控信息。采用底物(PL、PM 和PN)飼喂和應(yīng)答分析的研究發(fā)現(xiàn),煙草葉片組織中PLP保持穩(wěn)定、PL 水平受到控制,PL 還原為PN 以及PM 與PL的相互轉(zhuǎn)化是VB6代謝轉(zhuǎn)換的重要內(nèi)容[39]。在建立以HPLC 檢測(cè)為基礎(chǔ)的VB6代謝酶活性檢測(cè)方法的基礎(chǔ)上,從煙草葉片組織鑒定出PL激酶、PNP氧化酶、PL還原酶,以及酶促PM-PL轉(zhuǎn)換和PLP 水解脫磷酸反應(yīng),在體外最適反應(yīng)條件下,葉片組織粗提液中這些酶的催化活力分別為0.15、0.10、0.08、0.64和23.08nmol·min-1·mg-1,在代謝酶活力水平上探討了植物體內(nèi)VB6的代謝轉(zhuǎn)換[41]。我們的研究結(jié)果提示PLP→PL→PN 是植物(煙草)體內(nèi)VB6從頭合成后代謝轉(zhuǎn)換的主體流向,PL 激酶和PNP氧化酶構(gòu)成的PLP補(bǔ)救合成以及酶促PM 和PL 的相互轉(zhuǎn)換是VB6主體代謝的補(bǔ)充(圖2)。
PLP的水解在動(dòng)物和微生物有詳細(xì)研究,受特異和非特異性磷酸酶的作用。堿性磷酸酶涉及維持細(xì)胞外PLP濃度的穩(wěn)定,而酸性磷酸酶涉及細(xì)胞內(nèi)PLP濃度的穩(wěn)定。1992年從人紅細(xì)胞純化出特異性PLP磷酸酶[42],2003年從人腦克隆出PLP 磷酸酶基因[43],從老鼠組織cDNA中也克隆出PLP 磷酸酶基因。我們以PLP為底物,從煙草純化出水解PLP、PMP和PNP的磷酸酶。該酶為二聚體結(jié)構(gòu)、分子量約為50kD,是一個(gè)新的非特異性酸性磷酸酶[44]。植物體內(nèi)是否存在特異性PLP 磷酸酶還有待進(jìn)一步的研究。
很早就發(fā)現(xiàn)某些生物體內(nèi)存在PL 和PM 的相互轉(zhuǎn)換。從大腸桿菌和兔肝純化出PM-草酰乙酸轉(zhuǎn)氨酶,該酶可逆性地催化PM 和草酰乙酸、PL 和天冬氨酸之間的轉(zhuǎn)氨反應(yīng),但是最終被認(rèn)為是一個(gè)未知轉(zhuǎn)氨酶的脫輔基形式[45]。因?yàn)樵撐淖髡甙l(fā)現(xiàn)從豬心純化出的谷氨酸-草酰乙酸轉(zhuǎn)氨酶在脫去輔酶PLP或者PMP后,也能夠催化PM 和酮酸之間的轉(zhuǎn)氨反應(yīng)。PM-丙酮酸轉(zhuǎn)氨酶(PM-pyruvate aminotransferase,EC 2.6.1.30)和PMP-α-酮戊二酸轉(zhuǎn)氨酶(PMP-α-ketoglutarateaminotranferase,EC2.6.1.54)是目前已經(jīng)明確和僅有的PLP非依賴性轉(zhuǎn)氨酶,特異性地以VB6為底物而非輔酶,參與VB6代謝轉(zhuǎn)換[46-47]。我們?cè)诎l(fā)現(xiàn)煙草體內(nèi)存在PM 和PL相互轉(zhuǎn)換的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步純化出其作用酶。結(jié)果表示煙草體內(nèi)存在PM-丙酮酸轉(zhuǎn)氨酶,對(duì)PM 和PL的相互轉(zhuǎn)換發(fā)揮主導(dǎo)作用,同時(shí)也明確煙草的谷氨酸-草酰乙酸轉(zhuǎn)氨酶在脫去輔酶后,能夠催化PM 和草酰乙酸或者α-酮戊二酸之間的轉(zhuǎn)氨反應(yīng)[48]。
圖2 煙草體內(nèi)維生素B6 代謝轉(zhuǎn)換示意圖[39]Fig.2 Postulated interconversions of different vitamin B6forms in tobacco plants[39]Thick arrow shows the predominant VB6 metabolic flux
植物合成的VB6對(duì)植物自身的生長(zhǎng)發(fā)育和逆境適應(yīng),以及人和動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)具有重要意義。植物VB6從頭合成途徑已經(jīng)明確,研究積累也較豐富,而代謝轉(zhuǎn)換尚未明了,還有許多不明之處。PN 葡糖苷(PN glucoside)是植物體內(nèi)特有的VB6衍生物[49],可能受UDP-葡萄糖依賴性葡糖基轉(zhuǎn)移酶(UDP-glucose-dependentglucosyltransferase)的 作用由PN 生成。植物體內(nèi)水解PLP、PMP 和PNP的磷酸酶、PM-丙酮酸轉(zhuǎn)氨酶以及催化生成PN 葡糖苷的葡糖基轉(zhuǎn)移酶,都還需要在基因水平上加以明確。雖然從擬南芥鑒定出PL 還原酶基因,但T-DNA插入突變的研究結(jié)果顯示該基因的表達(dá)產(chǎn)物不是唯一的作用酶[37]。植物體內(nèi)PL 的還原和PN 的形成還需要更加深入的研究。
同時(shí),從植物檢出4-吡哆酸(4-pyridoxic acid)[50],盡管其起源和去向還是未解之謎,但提出了VB6的異化問(wèn)題。因?yàn)?-吡哆酸在哺乳動(dòng)物是排泄型VB6,在微生物是VB6降解途徑的一個(gè)中間產(chǎn)物。至今從細(xì)菌發(fā)現(xiàn)兩種VB6降解途徑,PM-丙酮酸轉(zhuǎn)氨酶是降解途徑Ⅰ的重要作用酶[51]。從煙草分離出PM-丙酮酸轉(zhuǎn)氨酶,暗示植物體內(nèi)可能存在VB6降解途徑Ⅰ。對(duì)植物VB6降解的研究具有重要意義,是VB6代謝平衡機(jī)制的重要內(nèi)容,還將為今后通過(guò)基因工程技術(shù)提高食源性植物的VB6含量提供靶標(biāo)基因。
另外,植物的質(zhì)體、線粒體和過(guò)氧化物酶體等都存在重要的PLP依賴酶,這些酶的活力受制于細(xì)胞器內(nèi)PLP 的平衡供給。PLP 不能通過(guò)質(zhì)膜,并且PLP的4′位醛基非常活潑,極易與伯胺和仲胺形成醛亞胺結(jié)構(gòu)。PLP與非VB6蛋白的非特異性結(jié)合將導(dǎo)致生理功能的紊亂。因此,植物VB6從頭合成與代謝轉(zhuǎn)換的調(diào)控機(jī)制也是亟待研究的重要科學(xué)問(wèn)題。
[1] RAVANEL S,DROUX M,DOUCE R.Methionine biosynthesis in higher plants.I.Purification and characterization of cystathionine gamma-synthase from spinach chloroplasts[J].Arch.Biochem.Biophys.,1995,316:572-584.
[2] ZHOU H,WANG HW,ZHU K,et al.The multiple roles of conserved arginine 286of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase.Coenzyme binding,substrate binding,and beyond[J].Plant Physiol.,1999,121:913-919.
[3] TAMUR K,NISHIURA H,MORI J,et al.Cloning and characterization of a cDNA encoding serine palmitoyl transferase in Arabidopsis thaliana[J].Biochem.Soc.Trans.,2000,28:745-747.
[4] THOMAZEAU K,CURIEN G,DUMAS R,et al.Crystal structure of threonine synthase from Arabidopsis thaliana[J].Protein Sci.,2001,10:638-648.
[5] BREITINGER U,CLAUSEN T,EHLERT S,et al.The three dimensional structure of cystathionine beta-lyase from Arabidopsis and its substrate specificity[J].Plant Physiol.,2001,126:631-642.
[6] TAO Y,F(xiàn)ERRER JL,LJUNG K,et al.Rapid synthesis of auxin via a new tryptophan-dependent pathway is required for shade avoidance in plants[J].Cell,2008,133:164-176.
[7] VAVILIN DV,VERMAAS WF.Regulation of the tetrapyrrole biosynthetic pathway leading to heme and chlorophyll in plants and cyanobacteria[J].Physiol.Plant,2002,115:9-24.
[8] MOONEY S,HELLMANN H.Vitamin B6:killing two birds with one stone?[J].Phytochem.,2010,71:495-501.
[9] PREISS J,BALL K,HUTNEY J,et al.Regulatory mechanisms involved in the biosynthesis of starch[J].Pure Appl.Chem.,1991,63:535-544.
[10] BILSKI P,LI MY,EHRENSHAFT M,et al.Vitamin B6(pyridoxine)and its derivatives are efficient singlet oxygen quenchers and potential fungal antioxidants[J].Photochem Photobiol.,2000,71:129-134.
[11] PALMIERI L,AGRIMI G,RUNSWICK MJ,et al.Identification in Saccharomyces cerevisiae of two isoforms of a novel mitochondrial transporter for 2-oxoadipate and 2-oxoglutarate[J].J.Biol.Chem.,2001,276:1 916-1 922.
[12] SHI H,XIONG L,STEVENSON B,et al.The Arabidopsis salt overly sensitive 4mutants uncover a critical role for vitamin B6in plant salt tolerance[J].Plant Cell,2002,14:575-588.
[13] CHEN H,XIONG L.Pyridoxine is required for postembryonic root development and tolerance to osmotic and oxidative stresses[J].Plant J.,2005,44:396-408.
[14] MITTENHUBER G.Phylogenetic analyses and comparative genomics of vitamin B6(pyridoxine)and pyridoxal phosphate biosynthesis pathways[J].J.Mol.Microb.Biotech.,2001,3:1-20.
[15] EHRENSHAFT M,BILSKI P,LI MY,et al.A highly conserved sequence is a novel gene involved in de novo vitamin B6biosynthesis[J].Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1999,96:9 374-9 378.
[16] EHRESHAFT M,DAUB ME.Isolation of PDX2,a second novel gene in thepyridoxine biosynthesis pathway of eukaryotes,archaebacteria,and a subsetof eubacteria[J].J.Bacteriol.,2001,183:3 383-3 390.
[17] FITZPATRICK TB,MOCCAND C,ROUX C.Vitamin B6biosynthesis:charting the mechanistic landscape[J].Chem.Biochem.,2010,11:1 185-1 193.
[18] DENSLOW S,WALLS A,DAUB M.Regulation of biosynthetic genes andantioxidant properties of vitamin B6vitamers during plant defense responses[J].Physiol.Molec.Plant Pathol.,2005,66:244-255.
[19] TAMBASCO-Studart M,TITIZ O,RASCHLE T,et al.Vitamin B6biosynthesis in higher plants[J].Proc.Natl.Acad.Sci.USA,2005,102:13 687-13 692.
[20] TITIZ O,TAMBASCO-Studart M,WARZYCH E,et al.PDX1is essential for vitamin B6biosynthesis,development and stress tolerance in Arabidopsis[J].Plant J.,2006,48:933-946.
[21] WAGNER S,BERNHARDT A,LEUENDORF JE,et al.Analysis of the Arabidopsisrsr4-1/pdx1-3mutant reveals the critical functionof the PDX1protein family in metabolism,development,and vitamin B6biosynthesis[J].Plant Cell,2006,18:1 722-1 735.
[22] DENSLOW SA,RUESCHHOFF EE,DAUB ME.Regulation of the Arabidopsisthalianavitamin B6biosynthesis genes by abiotic stress[J].Plant PhysiolBiochem.,2007,45:152-161.
[23] TANBASCO-Studart M,TEWS I,AMRHEIN N,et al.Functionalanalysis of PDX2fromArabidopsis,aglutaminase involved in vitamin B6biosynthesis[J].Plant Physiol.,2007,144:915-925.
[24] CHEN H,XIONG L.The short-rooted vitamin B6-deficient mutant pdx1hasimpaired local auxin biosynthesis[J].Planta,2009,229:1 303-1 310.
[25] HUANG SH,ZHANG JY,WANG LH,et al.Effect of abiotic stress on the abundance of different vitamin B6vitamers in tobacco plants[J].Plant Physiol.Biochem.,2013,66:63-67.
[26] HERRERO S,DAUB M.Genetic manipulation of vitamin B6biosynthesis intobacco and fungi uncovers limitations to up-regulation of the pathway[J].Plant Sci.,2007,172:609-620.
[27] RASCHKE M,BOYCHEVA S,CREVECOEUR M,et al.Enhanced levelsof vitamin B6increase aerial organ size and positively affect stresstolerance in Arabidopsis[J].Plant J.,2011,66:414-432.
[28] YANG Y,ZHAO G,WINKIER ME.Identification of the pdxK gene that encodespyridoxine(vitamin B6)kinase in Escherichia coli K-12[J].FEMS Microbiol.Lett.,1996,141:89-95.
[29] YANG Y,TSUI HC,MAN TK,et al.Identification and function of the pdxYgene,which encodes a novel pyridoxal kinase involved in the salvage pathway of pyridoxal 5′-phosphate biosynthesis in Escherichia coli K-12[J].J.Bacteriol.,1998,180:1 814-1 821.
[30] LUM HK,KWOK F,LO S.Cloning and characterization of Arabidopsis thaliana pyridoxal kinase[J].Planta,2002,215:870-879.
[31] WANG H,LIU D,LIU C,et al.The pyridoxal kinase gene tapdxkfrom wheat complements vitamin B6synthesis-defective Escherichia coli[J].J.Plant Physiol.,2004,161:1 053-1 060.
[32] YU SW,LUO LJ.Expression analysis of a novel pyridoxal kinase messenger RNA splice variant,PLK,in oil rape suffering abiotic stress and phytohormones[J].Acta Biochim.Biophys.Sin.,2008,40:1 005-1 014.
[33] GONZALEZ E,DANEHOWER D,DAUB ME.Vitamer levels,stress response,enzyme activity,and gene regulation of Arabidopsis lines mutant in the pyridoxine/pyridoxamine 5′-phosphate oxidase(PDX3)and the pyridoxal kinase(SOS4)genes involved in the vitamin B6salvage pathway[J].Plant Physiol.,2007,145:985-996.
[34] RUESCHHOFF EE,GILLIKIN JW,SEDEROFF HW,et al.The SOS4 pyridoxal kinase is required for maintenance of vitamin B6mediated processes in chloroplasts[J].Plant Physiol.Biochem.,2013,83:281-291.
[35] SANG Y,BARBOSA J M,WU H,et al.Identification of a pyridoxine(pyridoxamine)5′-phosphate oxidase from Arabidopsis thaliana[J].FEBS Letters,2007,581:344-348.
[36] SANG Y,Locy B,GOERTZEN,L R,et al.Expression,in vivolocalization and phylogenetic analysis of a pyridoxine 5′-phosphate oxidase in Arabidopsis thaliana[J].Plant Physiol.Biochem.,2011,49:88-95.
[37] MORITA T,TAKEGAWA K,YAGI T.Disruption of the plr1tgene encodingpyridoxal reductase of Schizosaccharomyces pombe[J].J.Biochem.,2004,135:225-230.
[38] HERREROS,GONZALEZE,GILLIKINJW,et al.Identification and characterization of a pyridoxal reductase involved in the vitamin B6salvage pathway in Arabidopsis[J].Plant Molecular Biology,2011,76:157-169.
[39] HUANG SH,ZENG HB,ZHANG JY,et al.Interconversions of different vitamin B6forms in tobacco plants[J].Phytochem.,2011,72:2 124-2 129.
[40] HUANG SH,ZHANG JY,TAO Z,et al.Enzymatic conversion from pyridoxal to pyridoxine caused by microorganisms within tobacco phyllosphere[J].Plant Physiol.Biochem.,2014,85:9-13.
[41] HUANG SH,ZENG HB,ZHANG JY,et al.Characterization of enzymes involved in the interconversions of different vitamin B6forms in tobacco plants[J].Plant Physiol.Biochem.,2011,49:1 299-1 305.
[42] FONDA ML.Purification and characterization of vitamin B6-phosphate phosphatase from human erythrocytes[J].J.Biol.Chem.,1992,267:15 978-15 983.
[43] JANG YM,KIM DW,KANG TC,et al.Human pyridoxal phosphatase.Molecular cloning,functionalexpression,and tissue distribution[J].J.Biol.Chem.,2003,278:50 040-50 046.
[44] HUANG S H,ZHANG J Y,MA YP,et al.Characterization of an acid phosphatase responsible for hydrolysis of pyridoxal 5′-phosphate in tobacco plants[J].Plant Physiol.Biochem.,2012,57:114-119.
[45] WADA H,SNELL EE.Enzymatic transamination of pyridoxamine:I.Withoxaloacetate and α-ketoglutarate[J].J.Biol.Chem.,1962,237:127-132.
[46] YOSHIKANE Y,YOKOCHI N,OHNISHI K,et al.Molecular cloning,expression and characterization of pyridoxamine-pyruvate transaminase[J].Biochem J.,2006,396:499-507.
[47] TANI Y,UKITA M,OGATA K.Studies on vitamin B6metabolism in microorganisms:part X.Further purification and characterization of pyridoxamine5′-phosphate-alpha-ketoglutarate transaminase from Clostridium kainantoi[J].Agric.Biol.Chem.,1972,36:181-188.
[48] HUANG SH,ZHANG JY.,WU M,et al.Enzymatic transamination of pyridoxamine in tobacco plants[J].Plant Sci.,2013,212:55-59.
[49] GREGORY JF,INK SL.Identification and quantification of pyridoxine-β-glucoside as a major form of vitamin B6in plant-derivedfoods[J].J.Agr.Food Chem.,1987,35:76-82.
[50] SAMPSON DA,EOFF LA,YAN XL,et al.Analysis of freeand glycosylated vitamin B6in wheat by high-performance liquidchromatography[J].Cereal Chemistry,1995,72:217-221.
[51] GE F,YOKOSHI N,YOSHIKANE Y,et al.Gene identification and characterization of the pyridoxine degradative enzyme 4-pyridoxic acid dehydrogenase fromthe nitrogen-fixing symbiotic bacterium Mesorhizobium Loti MAFF303099[J].J.Biochem.,2008,143:603-609.