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楊樹(shù)胞外蛋白的提取分離及2-D電泳體系的建立

2015-07-04 09:21羅永亞汪南陽(yáng)林芳芝王俊霖
西北植物學(xué)報(bào) 2015年1期
關(guān)鍵詞:胞外膠條細(xì)胞壁

陳 穎,樂(lè) 利,羅永亞,楊 華,汪南陽(yáng),林芳芝,王俊霖

(南京林業(yè)大學(xué) 南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心,生物與環(huán)境學(xué)院,南京210037)

胞外蛋白(extracellular proteins,ECP)又被叫做細(xì)胞壁蛋白(cell wall proteins,CWPs),質(zhì)外體蛋白(apoplastic proteins,APPs)和分泌蛋白[1],是質(zhì)外體中對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)發(fā)育和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)起關(guān)鍵調(diào)控作用的物質(zhì),通常在高爾基體內(nèi)合成,被分泌到細(xì)胞壁及胞外的基質(zhì)中,只占質(zhì)外體所有成分的5%~10%。但胞外蛋白是胞外信號(hào)的感知者,是信號(hào)跨越細(xì)胞膜的傳遞者,又是細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)骨架的搭建者。越來(lái)越多的實(shí)驗(yàn)證據(jù)表明胞外蛋白與細(xì)胞骨架、胞外基質(zhì)、細(xì)胞膜及胞內(nèi)物質(zhì)之間不斷地進(jìn)行著“交流”[2-3]。

根據(jù)其與細(xì)胞壁成分的結(jié)合度可將胞外蛋白分為三類:一類是松散型結(jié)合蛋白,主要屬于調(diào)控細(xì)胞壁生長(zhǎng)分化的酶類;第二類胞外蛋白稱為弱結(jié)合型蛋白,是以弱的非共價(jià)鍵與細(xì)胞基質(zhì)結(jié)合的蛋白,在胞外可以進(jìn)行擴(kuò)散和遷移,因與細(xì)胞的生物脅迫和非生物脅迫應(yīng)答有關(guān),又稱為防御蛋白;第三類胞外蛋白與胞壁成分結(jié)合緊密,稱為緊密結(jié)合型蛋白,因與細(xì)胞壁的框架構(gòu)建有關(guān),又稱為壁結(jié)構(gòu)蛋白[4]。把胞外蛋白稱“質(zhì)外體蛋白”的學(xué)者偏于前兩類蛋白的研究,而把胞外蛋白稱“細(xì)胞壁蛋白”的學(xué)者大都偏向于二、三類蛋白的研究。本研究把葉片細(xì)胞壁提取的蛋白叫做細(xì)胞壁蛋白(CPWs),把從莖段液流中提取的蛋白叫做質(zhì)外體蛋白(APPs)。

隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,亞細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究成為當(dāng)今生命科學(xué)研究的熱點(diǎn)。亞細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)在細(xì)胞膜、細(xì)胞器(線粒體和葉綠體中)的研究相對(duì)較多,而由于人們對(duì)胞外蛋白作用的忽視及提取的困難使其研究落后于胞內(nèi)蛋白。目前對(duì)胞外蛋白組的研究主要集中在模式植物擬南芥上[4],另外在甘藍(lán)、紫花苜蓿、煙草、玉米、鷹嘴豆、葡萄、水稻、豌豆、黃瓜等農(nóng)作物和蔬菜上也有所涉及[5-11],但胞外蛋白組學(xué)在林木上的研究相對(duì)較少。

楊屬植物(Populus)是林木基因組研究的模式植物,具有基因組小、童期短、生長(zhǎng)快、易轉(zhuǎn)化、易再生等特點(diǎn),是當(dāng)今世界中緯度地區(qū)栽培面積最廣、木材產(chǎn)量最多的樹(shù)種之一,中國(guó)種植面積就已超過(guò)7×106hm2[12]。目前楊樹(shù)基因組學(xué)的研究較為深入,在環(huán)境脅迫下胞外蛋白組的研究卻相對(duì)較少。通過(guò)對(duì)楊樹(shù)胞外蛋白組的變化研究,一方面可以揭示胞外蛋白在環(huán)境脅迫中的響應(yīng)機(jī)制,另一方面可以為其他林木胞外蛋白研究提供重要的理論和技術(shù)指導(dǎo)。本研究以美洲黑楊雜種優(yōu)良無(wú)性系‘NL895’(Populusdeltoides×Populuseuramericanacv.)組培苗的葉片和莖段為試材,對(duì)楊樹(shù)胞外蛋白的提取、分離、純化、單向和雙向電泳檢測(cè)等技術(shù)進(jìn)行了系統(tǒng)地研究。其中葉片胞外蛋白(細(xì)胞壁蛋白)的提取采用了LiCl和CaCl2法,莖段胞外蛋白(木質(zhì)部液流蛋白)的提取采用了真空滲入法,初步建立了楊樹(shù)胞外蛋白的雙向電泳研究體系。

1 材料和方法

1.1 材 料

美洲黑楊雜種優(yōu)良無(wú)性系NL895楊組培苗葉片和莖段來(lái)自于南京林業(yè)大學(xué)實(shí)驗(yàn)室。

1.2 苗木的擴(kuò)繁和培養(yǎng)

組培苗的擴(kuò)繁方法參照文獻(xiàn)[13],蛋白提取等試驗(yàn)材料取自組培苗的莖段和葉片(圖版Ⅰ,A、B)。

1.3 楊樹(shù)葉片胞外蛋白的提取與純化

楊樹(shù)葉片胞外蛋白提取參照Kong等[8]、朱畇昊等[11]、Feiz等[14]提取法加以改進(jìn),分兩步提取,具體流程如下。

細(xì)胞壁(CW)提?。海?)將NL895楊葉片用液氮研磨成粉末,加適量5mmol·L-1醋酸鈉(pH 4.6)溶解,然后轉(zhuǎn)移到50mL離心管中,在4℃、6 000×g(Beckman CoulterTM)離心15min,重復(fù)1次上述操作。(2)將沉淀轉(zhuǎn)入三角瓶中,加入含0.4mol·L-1蔗糖的醋酸鈉溶液(5 mmol·L-1,pH 4.6)中搖勻,用超聲波細(xì)胞破碎儀(XO-1000D)將細(xì)胞破碎,共3次,每次10min,并對(duì)破碎后的細(xì)胞粉碎程度進(jìn)行鏡檢。破碎后的細(xì)胞在4 ℃、4 000×g離心15min,棄上清。(3)上述沉淀中依次加入含0.4、0.6、1.0mol·L-1蔗糖的醋酸鈉溶液(1mol·L-1)各沖洗3次,每次在4 ℃、4 000×g離心15min,棄上清。(4)沉淀再用5mmol·L-1醋酸鈉溶液(pH 4.6)洗滌6次,洗滌后每次4 ℃、4 000×g離心15 min。(5)棄上清,沉淀再用超純水沖洗4 次,沖洗后每次在4℃、4 000×g離心15min,最后一次在4℃、12 000×g 離心30 min,棄上清,其沉淀放入-20 ℃冷凍干燥即得細(xì)胞壁組分。

酚-甲醇/醋酸銨沉淀法胞外蛋白(ECPs)的提取與純化:(1)弱鍵結(jié)合的CWPs提取。上述細(xì)胞壁沉淀中加入0.2mol·L-1CaCl2醋酸鈉溶液(pH 4.6)沖洗2次,每次在4 000×g離心15min。(2)緊密型結(jié)合型CWPs提取。提取的細(xì)胞壁沉淀加入含0.2mol·L-1LiCl的醋酸鈉溶液(pH 4.6)沖洗2次,每次在4 000×g離心15min,以下兩者提取的步驟相同。(3)合并2次上清液,加入1/3體積Tris-平衡酚混勻,吸取苯酚相,轉(zhuǎn)入離心管中,再加入5倍體積0.1 mol·L-1乙酸銨/甲醇溶液混勻,于-20 ℃條件下沉淀過(guò)夜。(4)次日將沉淀在4℃、12 000×g離心20min,棄上清加入2倍沉淀體積的甲醇,漩渦震蕩2min,12 000×g離心20min。(5)棄上清,加入2倍沉淀體積的丙酮,漩渦震蕩2 min,12 000×g離心20min。重復(fù)1次該操作,最后沉淀于-20 ℃冰箱中冷凍干燥,干粉即為細(xì)胞壁蛋白質(zhì)(CWPs),-70 ℃保存。

TCA/丙酮沉淀法胞外蛋白(ECPs)的提取與純化:參照林梓浩等[6]和Komatsu等[15]法,在提取的細(xì)胞壁組分中加入含0.2 mol·L-1CaCl2的醋酸鈉緩沖液(25mmol·L-1,pH 4.6),渦旋5min,于4 ℃冰箱中浸提3h,4℃下15 000×g離心30min,留取上清液。該步驟重復(fù)1次后,再加入含3mol·L-1LiCl的醋酸鈉緩沖液(25mmol·L-1,pH 4.6)15mL,渦旋5min,4 ℃冰箱中浸提3h后,4 ℃下15 000×g離心30min。取上清液加入4倍體積預(yù)冷的10% TCA/丙酮溶液(內(nèi)含0.1% DTT,1 mmol·L-1PMSF),并在-20 ℃冰箱沉降過(guò)夜,4℃下15 000×g離心30min,棄上清,沉淀用丙酮清洗3次,每次4 ℃下15 000×g離心30 min,棄上清,沉淀于-20 ℃冰箱中冷凍干燥,干粉即為細(xì)胞壁粗蛋白(CWPs)。

1.4 楊樹(shù)莖段胞外蛋白提取

參照Dani等[16]與Zhu等[17]的真空滲入法,并加以改進(jìn)。(1)稱取適量楊樹(shù)莖段剪成2cm 長(zhǎng)小段,用超純水漂洗和分光光度計(jì)檢測(cè)蛋白的含量。(2)將漂洗好的莖段浸入20mmol·L-1醋酸鈉(含20mmol·L-1CaCl2)液體中,用70kPa真空抽氣泵抽氣20min,然后在5min內(nèi)慢慢放氣至室內(nèi)大氣壓,將莖段取出吸干表面水分,并剪除兩端褐化部分。(3)將材料放入底端帶孔的離心管中,將其套入另一個(gè)大的離心管內(nèi),4 ℃、3 000×g離心60min,收集離心管底部的胞外提取液。(4)向提取液中加入1.5倍體積預(yù)冷的甲醇(含1%冰乙酸),在-28℃下浸提過(guò)夜。(5)次日,4 ℃、3 500×g 離心30 min,收集沉淀,依次用100%、70%甲醇洗滌沉淀,去除甲醇后的胞外蛋白粉在-70 ℃保存(即質(zhì)外體蛋白,APPs)。

1.5 細(xì)胞壁顯微檢測(cè)與胞外蛋白質(zhì)含量測(cè)定

用1.0%碘-碘化鉀染色液、藍(lán)墨水染色液浸潤(rùn)超聲破碎的細(xì)胞,然后做徒手切片,并在顯微鏡下檢測(cè)細(xì)胞結(jié)構(gòu)的變化情況。胞外蛋白提取液中蛋白的含量測(cè)定參照Laemmli[18]法進(jìn)行,用牛血清白蛋白做標(biāo)準(zhǔn)曲線,計(jì)算樣品中蛋白質(zhì)的含量。

1.6 楊樹(shù)胞內(nèi)酶(蛋白)污染的檢測(cè)

為防止提取液中胞內(nèi)蛋白的污染,采用細(xì)胞內(nèi)6-P-葡萄糖(G-6-PDH)脫氫酶活性測(cè)定法(胞內(nèi)標(biāo)志酶)檢測(cè)胞質(zhì)蛋白的污染率。參照Komatsu等[15]與Zhou等[19]法,向100μL 莖 段 胞 外 蛋 白 質(zhì)提取液、葉片細(xì)胞壁蛋白提取液和葉片總蛋白提取液中分別加入2.9mL 含55mmol·L-1Tris-HCl(8.0)、3.3 mmol·L-1MgCl2、0.2 mmol·L-1NADP、3.3mmol·L-1G-6P(6-P-葡萄糖)的混合液,在340nm 處檢測(cè)G-6-PDH 脫氫酶的活性。用胞外蛋白提取液中G-6-PDH 脫氫酶活性占總蛋白提取液中G-6-PDH 脫氫酶活性的百分比來(lái)檢測(cè)提取的胞外蛋白是否有胞內(nèi)蛋白污染,重復(fù)3次。

1.7 楊樹(shù)胞外蛋白的1-D和2-D電泳分析

1.7.1 胞外蛋白樣品處理及1-D 電泳分析 樣品的處理:將提取的胞外蛋白加入樣品處理液混勻,在沸水浴中煮5min,冷卻后在4 ℃、12 000×g下離心15min,取上清液點(diǎn)樣,進(jìn)行SDS-PAGE 電泳分析。分離膠濃度12.9%,初始電壓80V,15min后改為200V 恒壓,至溴酚蘭遷移到距凝膠底部約1~2cm 時(shí)終止電泳。用PD Quest 1-DE 7.4.0圖像處理軟件進(jìn)行圖譜分析。

1.7.2 2-D 電泳體系優(yōu)化 2-D 電泳參照林梓浩等[6]的方法并加以改進(jìn)。(1)等電聚焦(IEF):按10 μL/mg胞外蛋白含量加入蛋白裂解液[含7 mol·L-1尿素,2 mol·L-1硫脲,4% Chaps,1% DTT,2% Ampholyte(pH 3~10),1mmol·L-1PMSF],充分搖勻后進(jìn)行超聲波處理20 min;37 ℃水浴45 min,12 000×g離心15min,取上清液150μL,加入300μL溶脹液[含6mol·L-1尿素,2mol·L-1硫脲,2%Chaps,0.4%DTT,1%Ampholyte(pH 3~10)]水化上樣液,渦旋混勻。將樣品液加入IPG strip聚焦盤中,再放入IPG 膠條(GE Healthcare),滴加2~3mL 礦物油水化12h 后,在等電聚焦儀(Bio-Rad)上進(jìn)行第一向等電聚焦電泳(IEF)。IEF聚焦參數(shù)為250V 慢速升壓45min,1 000V 快速升壓1h45min,10 000V 線性升壓5h,10 000V非線性快速升壓聚焦,使總聚焦伏特小時(shí)數(shù)達(dá)60 000Vh完成聚焦,最后為500V 保持任意時(shí)間,水化和聚焦溫度為20 ℃。(2)平衡:等電聚焦結(jié)束后,將膠條在平衡液Ⅰ[內(nèi)含50mmol/L Tris-HCl(pH 8.8),6 mol·L-1尿素,30%甘油,20g·L-1SDS,20g·L-1DTT]中振蕩平衡15 min,再在平衡液Ⅱ[內(nèi)含50mmol·L-1Tris-HCl(pH 8.8),6 mol·L-1尿素,30%甘油,20g·L-1SDS,25g·L-1碘乙酰胺]中振蕩平衡15 min。(3)第二向SDS-PAGE:同1-D 電泳操作步驟。(4)凝膠蛋白染色:SDS-PAGE結(jié)束后,取出凝膠,用去離子水漂洗2~3次,加入適量的R-250染色液,于搖床上輕輕染色3h,隨后用脫色液洗脫至背景清晰。

1.8 楊樹(shù)胞外蛋白電泳圖譜分析

顯色后的凝膠用ChemiDoc XRS 凝膠成像系統(tǒng)(Bio-Rad)掃描獲取圖像。單向電泳采用Quantity One 1-D 分析軟件進(jìn)行條帶的識(shí)別和分析。雙向電泳采用PDQuest 2-DE 7.4.0對(duì)圖譜進(jìn)行蛋白點(diǎn)的檢測(cè)。

2 結(jié)果與分析

2.1 楊樹(shù)葉片細(xì)胞壁破碎程度檢測(cè)及顯微檢測(cè)

細(xì)胞壁的提取與葉片的破碎程度有關(guān),葉片越破碎,細(xì)胞壁越易提取出來(lái)。在圖版Ⅰ,C~E 中,在用液氮研磨后的葉片進(jìn)行光鏡檢測(cè)時(shí),可以看到葉片組織塊較大,破碎程度小(圖版Ⅰ,C);經(jīng)超聲破處理5 min 后,葉片組織塊開(kāi)始變?。▓D版Ⅰ,D),當(dāng)超聲破處理10min后,葉片已成為非常小的碎片,這對(duì)后面的細(xì)胞壁蛋白的提取是有利的,因此在細(xì)胞壁的提取過(guò)程選擇超聲波處理10min效果較好(圖版Ⅰ,E)。

將5min 和10min超聲處理的細(xì)胞碎片懸浮液用碘化鉀和藍(lán)墨水染色后,可以看到胞內(nèi)結(jié)構(gòu)易著色,而細(xì)胞壁不易著色(圖版Ⅰ,F(xiàn)~G)。細(xì)胞破碎時(shí)間不同,細(xì)胞的結(jié)構(gòu)變化相差很大,超聲波處理5min后,可以看到大量細(xì)胞壁網(wǎng)絡(luò),但胞內(nèi)細(xì)胞質(zhì)保留較多(圖版Ⅰ,F(xiàn)),而10min超聲破碎處理,其葉片細(xì)胞中細(xì)胞質(zhì)大部分已經(jīng)去除,只看到細(xì)胞壁連接而成的網(wǎng)絡(luò),還可以觀察到大量氣孔存在,說(shuō)明10min超聲破碎清除胞內(nèi)物質(zhì)的效果較好(圖版Ⅰ,G)。

2.2 楊樹(shù)葉片胞內(nèi)蛋白污染檢測(cè)

G-6-PDH 脫氫酶是植物細(xì)胞內(nèi)呼吸過(guò)程中重要的糖代謝酶,代表植物細(xì)胞的活力程度,也是判斷細(xì)胞活力強(qiáng)弱的標(biāo)志酶,常被用來(lái)檢測(cè)細(xì)胞器提取液的純凈程度或污染程度[19]。從表1中可以看出,葉片細(xì)胞壁蛋白提取較純,該酶占總蛋白提取液的2.9%,而莖段質(zhì)外體蛋白提取液中該酶活性占總蛋白酶活性的14.1%,低于細(xì)胞壁提取液的純度,但仍在允許的范圍之內(nèi)。

2.3 楊樹(shù)胞外蛋白的電泳圖譜分析

2.3.1 楊樹(shù)葉片胞外蛋白SDS-PAGE分析 從圖1的C、D 泳道電泳膠中可以看出,分別用加CaCl2和LiCl提取的NL895楊葉片細(xì)胞壁蛋白條帶差異很大,CaCl2純化的蛋白較LiCl提取的蛋白條帶清晰、帶寬,而LiCl純化的胞外蛋白清晰度差,條帶數(shù)和條帶寬度都遠(yuǎn)小于CaCl2。在此提取方法中CaCl2提取的細(xì)胞壁蛋白主要是以弱鍵形式與細(xì)胞壁結(jié)合的蛋白,大多屬于酶類,說(shuō)明在細(xì)胞壁的提取液中與細(xì)胞壁和胞外基質(zhì)活動(dòng)相關(guān)的酶類含量豐富,細(xì)胞代謝活動(dòng)旺盛(圖1,C泳道)。

從圖1中還可以看出,提取樣品葉片的質(zhì)量與提取蛋白的含量關(guān)系密切,同樣用CaCl2提取胞外蛋白的方法中,用7g(圖1,C 泳道)葉片樣品電泳的多肽條帶清晰度差,條帶彌散不集中,但用15g(圖1,B泳道)葉片量提取的蛋白與前者比較,條帶數(shù)明顯增加,條帶清晰、帶寬,可以觀察到的條帶有12~14條,分子量主要分布在13~65kD 之間,其中豐度較高的亞基分布在4 3、3 0和25kD附近。在43kD 附近有較為豐富的蛋白存在,R-250染色深,亮度大。通過(guò)與總蛋白電泳膠(圖1,A 泳道)比較,1,5-2-P核酮糖羧化酶的大亞基(55kD)在B 泳道電泳膠中非常弱,說(shuō)明細(xì)胞壁蛋白提取的純度較高(圖1,B)。而總蛋白的SDS-PAGE 圖譜中可以看到 標(biāo) 志 酶1,5-2-P 核 酮 糖 羧 化 酶 的 大 亞 基(55 kD)存在,總蛋白圖譜中多肽的條帶多于胞外蛋白的條帶數(shù)(圖1,A 泳道)。經(jīng)真空滲入法提取的莖段胞外蛋白SDS-PAGE電泳見(jiàn)圖1,E泳道,可見(jiàn)在43kD 附近有較大的多肽帶存在,在40kD 以下有少量條帶存在,而在高分子量區(qū)域50~97kD 區(qū)域中多肽條帶稀少,說(shuō)明楊樹(shù)的莖段質(zhì)外體蛋白主要分布在小分子量蛋白區(qū)域。

表1 胞外蛋白提取液中胞內(nèi)蛋白污染檢測(cè)Table1 Detection of intracellular contamination in ECPs

圖1 NL895楊胞外蛋白的1-D電泳圖譜Fig.1 SDS-PAGE image analysis of NL895poplar leaf CWPs(A-D)and stem(E)ECPs

2.3.2 楊樹(shù)葉片胞外蛋白的2-DE電泳分析

(1)不同pH 膠條和提取方法對(duì)楊樹(shù)葉片細(xì)胞壁蛋白2-DE圖譜的影響 為探究楊樹(shù)細(xì)胞壁蛋白最佳的pH 范圍,采用了pH 3~10和4~7、長(zhǎng)為17 cm IPG 膠條進(jìn)行研究。結(jié)果表明(圖2),從葉片提取的NL895楊細(xì)胞壁蛋白經(jīng)2-D 雙向電泳后,在不同pH 介質(zhì)中出現(xiàn)的蛋白質(zhì)多肽斑點(diǎn)差異較大。在pH 3~10介質(zhì)條件下(圖2,A),電泳圖譜中蛋白質(zhì)斑點(diǎn)較少,而且不清晰,統(tǒng)計(jì)斑點(diǎn)數(shù)在50個(gè)左右,大部分在43~20kD 之間。而在pH 4~7介質(zhì)條件下(圖2,C),電泳圖譜中蛋白質(zhì)斑點(diǎn)較pH 3~10介質(zhì)條件下增多且斑點(diǎn)清晰,且在66~45kD 之間出現(xiàn)了蛋白斑點(diǎn),45~35kD 之間是斑點(diǎn)最密集區(qū)域,25.0~18.0kD 之間斑點(diǎn)也比較密集,蛋白點(diǎn)最密集的條帶在31kD 左右,斑點(diǎn)數(shù)最多,最清晰,經(jīng)軟件統(tǒng)計(jì)的斑點(diǎn)數(shù)達(dá)150個(gè)左右,再次說(shuō)明楊樹(shù)細(xì)胞壁蛋白(CaCl2)提取部分,弱堿結(jié)合的細(xì)胞壁蛋白的分子量主要分布在低分子量、酸性區(qū)域,即小分子量蛋白居多。

從上樣量來(lái)看,500μg(圖2,B)上樣量蛋白點(diǎn)較少,清晰度較差,特別是低豐度的蛋白分辨率差;1 000μg(圖2,C)上樣量無(wú)論從蛋白點(diǎn)的斑點(diǎn)數(shù)、清晰度、低豐度蛋白的表達(dá)量來(lái)講都最好,蛋白質(zhì)點(diǎn)呈圓形,重復(fù)性好,斑點(diǎn)數(shù)達(dá)300多個(gè);而1 200μg(圖2,D)上樣量由于上樣量高,導(dǎo)致大多數(shù)蛋白質(zhì)點(diǎn)沒(méi)有完全分離,疊加在一起。

圖2 NL895楊葉片細(xì)胞壁蛋白2D 電泳圖譜(17cm IPG,pH 4~7)Fig.2 2-DE image analysis of NL895poplar CWPs extraction by andphenol-MeOH/NH4Ac(17cm IPG,pH 4~7)

盡管酚-甲醇/醋酸銨沉淀法在1 000μg上樣量、17cm 膠條、pH 4~7條件下獲得了較為滿意的蛋白質(zhì)圖譜,但由于膠條較窄,出現(xiàn)部分蛋白質(zhì)點(diǎn)的重疊和堆積,斑點(diǎn)仍然較少。在用TCA/丙酮沉淀法提取的細(xì)胞壁蛋白中,改進(jìn)了提取技術(shù),采用加大離心力到15 000×g、延長(zhǎng)離心至30min,并在提取液中添加DTT 和PMSF,使細(xì)胞壁蛋白的提取效果大大增加,采用500μg(圖3)上樣量、24cm 膠條、pH 4~7條件下獲得了滿意結(jié)果,蛋白質(zhì)電泳圖譜清晰度提高,特別是蛋白質(zhì)斑點(diǎn)數(shù)大大增加,斑點(diǎn)數(shù)達(dá)550多個(gè),比酚-甲醇/醋酸銨沉淀法多了200多個(gè)斑點(diǎn),是較為有效的一種純化方法。

圖3 NL895楊葉片丙酮沉淀法細(xì)胞壁蛋白的2D 電泳圖譜(500μg,24cm IPG,pH 4~7)Fig.3 2-DE image analysis of NL895poplar CWPs extraction by TCA/acetone precipitation(500μg,24cm IPG,pH 4~7)

(2)楊樹(shù)莖段胞外蛋白的2-D 電泳分析 NL895楊細(xì)胞壁蛋白經(jīng)2-D 電泳后,在不同pH 介質(zhì)膠條下電泳出現(xiàn)的蛋白質(zhì)斑點(diǎn)與在葉片中的pH范圍不同。在pH 3~10介質(zhì)條件下(圖4,A),電泳圖譜中蛋白質(zhì)斑點(diǎn)較多,而且清晰,在高分子量部分70~97kD 區(qū)域也有斑點(diǎn)存在,但較少,在31~66kD 區(qū)域蛋白主要分布在pH 5~7之間的中性區(qū)域;31~43kD 之間蛋白斑點(diǎn)最多,特別是在43kD左右,蛋白斑點(diǎn)最為集中,依然說(shuō)明莖段胞外蛋白主要分布在小分子量的區(qū)域。而在pH 4~7 介質(zhì)條件下,電泳圖譜中蛋白質(zhì)斑點(diǎn)并沒(méi)有表現(xiàn)出比pH 3~10之間多的現(xiàn)象,也是主要在31~66kD 之間蛋白斑點(diǎn)最多,但斑點(diǎn)堆積現(xiàn)象明顯(圖4,B)。

3 討 論

目前胞外蛋白的提取方法主要有兩種,一種是細(xì)胞毀壞型即通常采用先提取細(xì)胞壁,再?gòu)募?xì)胞壁中純化出蛋白[14-15],主要應(yīng)用于葉片;另一種是細(xì)胞非毀壞型即通過(guò)真空滲入法[17,19]將胞外蛋白提取出來(lái),主要應(yīng)用于莖段。不同植物胞外蛋白的提取技術(shù)相差很大,在本研究中葉片細(xì)胞壁蛋白采用了第一種方法,在細(xì)胞壁的超聲破碎過(guò)程中,10 min超聲波對(duì)細(xì)胞壁的破碎程度最好,超聲波處理后溶液明顯比處理前溶液均勻,且粉末更加細(xì)致,這樣大大增加了與提取液接觸面積,進(jìn)而提高了蛋白樣品質(zhì)量。通過(guò)染色鏡檢葉肉細(xì)胞中的胞內(nèi)物質(zhì),可看出該法已將其大部分去除,檢測(cè)到大部分結(jié)構(gòu)為去除胞內(nèi)成分的細(xì)胞壁,結(jié)果與朱畇昊等[11]的方法一致,證明該法對(duì)細(xì)胞壁的破碎是可行的。用真空滲入法提取葉片胞外蛋白時(shí),由于楊樹(shù)葉片汁液流動(dòng)不及農(nóng)作物,因而提取的胞外蛋白量非常少,需要大量的葉片材料(資料未給出),因此利用前一種方法提取葉片胞外蛋白較好。在莖段質(zhì)外體液流蛋白的提取過(guò)程中,采用了多年生實(shí)生苗楊樹(shù)(春季嫩梢)和組培苗的莖段提取作對(duì)比,發(fā)現(xiàn)實(shí)生苗由于枝條較粗且已木質(zhì)化,酚氧化酶活性強(qiáng),在提取過(guò)程中亦褐化,給提取質(zhì)外體液流蛋白帶來(lái)困難(資料未給出),而利用組培苗的幼嫩莖段提取質(zhì)外體液流蛋白,其效果較好。

圖4 NL895楊莖段胞外蛋白雙向電泳圖Fig.4 2-DE image analysis of NL895poplar apopalst proteins from stems

在樣品的用量方面,大部分文獻(xiàn)中通常介紹樣品量在5~10g之間,但在楊樹(shù)胞外蛋白提取過(guò)程中,發(fā)現(xiàn)低量(7g左右),只有用CaCl2純化的蛋白多肽條帶清晰,用LiCl提取的蛋白電泳后條帶不清晰,濃度低,不能用于分析。采用高質(zhì)量(10g 以上)樣品提取的胞外蛋白條帶清晰、帶寬、濃度高,說(shuō)明楊樹(shù)細(xì)胞壁蛋白的提取需要較高的樣品用量,這與林梓浩等[6]在黃瓜中細(xì)胞壁蛋白提取只用5g的量相差很大,說(shuō)明不同的植物細(xì)胞壁蛋白具有特異性,另外也可能與提取的方法有關(guān)。

在蛋白純化中,采用的方法主要有丙酮干粉法和飽和酚法。酚-甲醇/醋酸銨沉淀法主要是用于從富含次生代謝物的復(fù)雜樣品中提取蛋白質(zhì)的方法[20];在酚-甲醇/醋酸銨沉淀法中本實(shí)驗(yàn)獲得了300多個(gè)蛋白質(zhì)斑點(diǎn),提取效果較好,與黃雅芳等[21]結(jié)果相似;而采用丙酮/沉淀法純化的細(xì)胞壁蛋白效果要好于上述方法,且采用24cm 的大膠條更有利于楊樹(shù)細(xì)胞壁蛋白斑點(diǎn)的展現(xiàn),斑點(diǎn)達(dá)550個(gè),是較為理想的純化方法。在本研究中影響雙向電泳蛋白斑點(diǎn)數(shù)量和清晰度的因素主要有2 個(gè):一是膠條pH 范圍,pH4~7膠條對(duì)楊樹(shù)細(xì)胞壁蛋白的分辨率較有利,分離出的蛋白質(zhì)斑點(diǎn)多而密集、清晰度高,減少了蛋白斑點(diǎn)的堆積和重疊,而用pH 3~10 膠條蛋白質(zhì)斑點(diǎn)較少,低豐度蛋白不清晰,蛋白斑點(diǎn)堆積、重疊。相反,莖段質(zhì)外體蛋白采用pH 3~10的膠條效果更好,說(shuō)明不同器官之間蛋白質(zhì)分子量區(qū)域有差異,需要的pH 值也不同。二是膠條長(zhǎng)度,采用24cm 膠條比17cm 的膠條得到的蛋白斑點(diǎn)多。

楊樹(shù)是林木研究的模式樹(shù)種,而胞外蛋白在應(yīng)答環(huán)境脅迫和環(huán)境適應(yīng)性中具有非常重要的作用[3]。本研究利用NL895楊組培苗的葉片和莖段初步建立了楊樹(shù)胞外蛋白的雙向電泳技術(shù)體系,為開(kāi)展楊樹(shù)細(xì)胞壁蛋白的研究提供了前提條件,為差異蛋白的分析奠定了基礎(chǔ)。莖段質(zhì)外體蛋白的提取、純化的方法還需進(jìn)一步完善和探索。

圖版Ⅰ NL895楊組培苗(A、B)、葉片細(xì)胞碎片超聲波處理(C~E)及超聲波葉碎片顯微檢測(cè)(F、G)PlateⅠ Plantlets of NL895poplar(A,B);detection of the cell breaking status by microscopic(C-G)

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