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非同源末端連接修復相關(guān)因子對DNA損傷修復調(diào)控及腫瘤治療作用的研究進展

2015-07-24 19:02李蔚蔚孔金昕漆永梅黃德軍
中國藥理學與毒理學雜志 2015年4期
關(guān)鍵詞:同源激酶磷酸化

李蔚蔚,孔金昕,漆永梅,黃德軍

(蘭州大學生命科學學院,甘肅蘭州730000)

非同源末端連接修復相關(guān)因子對DNA損傷修復調(diào)控及腫瘤治療作用的研究進展

李蔚蔚,孔金昕,漆永梅,黃德軍

(蘭州大學生命科學學院,甘肅蘭州730000)

細胞在內(nèi)源性或外源性因子的脅迫作用下會產(chǎn)生各種損傷,包括遺傳物質(zhì)DNA的雙鏈斷裂(DSB)。非同源末端連接(NHEJ)是哺乳動物細胞中DSB損傷修復的一種主要機制。NHEJ過程中一些主要因子如DNA依賴性蛋白激酶、DNA交聯(lián)修復蛋白1C、X射線修復交叉互補蛋白4/DNA連接酶Ⅳ和X射線修復交叉互補蛋白4類似因子對DNA損傷修復(DDR)具有重要的調(diào)控作用,其中任何一種因子的改變都會影響DDR的效率。此外,NHEJ相關(guān)因子與腫瘤發(fā)生息息相關(guān)。本文針對NHEJ相關(guān)因子調(diào)控DSB修復方面的研究作一簡要綜述,并對NHEJ修復相關(guān)因子在腫瘤治療中的研究進行總結(jié)。

DNA依賴性蛋白激酶;DNA雙鏈斷裂;DNA斷端接合修復;DNA損傷修復

DNA是生物細胞儲存遺傳信息的重要物質(zhì),它的完整性和穩(wěn)定性對于細胞的存活具有重要意義。很多因素包括外源性的離子輻射、紫外線、化學物質(zhì)和內(nèi)源性的DNA復制及重組過程中的失誤,都能對DNA造成損傷[1-2]。其中,DNA雙鏈斷裂(DNA double-strand breaks,DSB)是最嚴重的一種損傷類型,能直接導致細胞的癌變或凋亡[1]。針對這些損傷,細胞也進化出一系列完整而精確的修復機制,以防止癌癥的發(fā)生或細胞死亡[2-3]。

哺乳動物細胞應對DSB損傷修復的機制主要包括兩方面:同源重組(homologous recombination,HR)和非同源末端連接(nonhomologous end-joining,NHEJ)[3]。NHEJ在細胞的各個周期都能被激活(HR主要在DNA復制的S期/G2期被激活)并維持基因組的穩(wěn)定性,因而它被認為是哺乳動物細胞中DSB修復的主要機制[4]。NHEJ修復機制主要包括DNA依賴性蛋白激酶(DNA-dependent protein kinase,DNA-PK)、DNA交聯(lián)修復蛋白1C(DNA cross-link repair IC,artemis)、X射線修復交叉互補蛋白4(X-ray repair cross-complementing 4,XRCC4)、DNA連接酶Ⅳ(DNA ligaseⅣ,LigⅣ)和XRCC4類似因子(XRCC4-like factor,XLF)等因子構(gòu)成的通路[5-6]。修復的基本過程包括三個步驟:首先,DNA-PK調(diào)節(jié)亞基Ku識別并結(jié)合到DNA斷裂末端,將DNA-PK催化亞基(DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNAPKcs)招募過來形成具有全酶活性的DNA-PK;然后,artemis被募集并與DNA-PKcs形成復合體,DNA-PK通過自身磷酸化及磷酸化artemis,使得artemis/DNA-PKcs復合體具有了核酸外切酶活性,與其他相關(guān)因子協(xié)調(diào)對DNA斷裂末端進行修飾和加工;最后,XRCC4/LigⅣ及XLF復合體對DNA末端進行處理和連接,完成整個修復通路[5-7]。

在NHEJ修復通路中,DNA-PK是關(guān)鍵的調(diào)控因子,盡管國內(nèi)已有學者對DNA-PK在DSB修復中的主要作用進行了介紹。但近10年來,對DNA-PK及其他NHEJ相關(guān)因子的研究又有很多新的認識和發(fā)現(xiàn),本文特作一綜述。

1 NHEJ相關(guān)因子對DNA損傷修復的調(diào)控

1.1 DNA-PK調(diào)控NHEJ介導的DNA損傷修復

DNA-PK是磷脂酰肌醇-3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinases,PI3K)家族的一員,由1個催化亞基DNA-PKcs、2個調(diào)節(jié)亞基Ku70和Ku80(也稱Ku86)組成,在接觸斷裂DNA后可以聚合成三聚體,發(fā)揮激酶活性對DSB進行修復[5]。

1.1.1 Ku70/80調(diào)控NHEJ介導的DNA損傷修復

以往的研究表明,在NHEJ修復過程中,Ku70/ 80作為DNA-PK的調(diào)節(jié)亞基,其功能主要是作為DSB的識別因子。最新研究表明,Ku70羧基端包含的一個SAP部位(Ku70-SAP)能與DNA雙鏈相連,而Ku80氨基端的環(huán)形結(jié)構(gòu)也可與DNA綁定進而被募集到DNA損傷位點[8-9]。Ku80羧基端的曲臂部(Ku-CTD)與DNA-PKcs連接,可將后者募集過來,最終形成完整的DNA-PK三聚體并激活全酶的激酶活性[8,10]。而Ku功能缺陷時,Ku70與DNA的連接、Ku80與DNA-PKcs的連接都會受到抑制(圖1)[11-13]。在功能方面,Ku不僅識別DSB,還可識別和調(diào)控NHEJ相關(guān)因子,促進NHEJ的修復效率。例如,①Ku70/80促進XLF與DNA的連接[14]。Ku70募集XLF到損傷位點,形成更穩(wěn)定的Ku70/80-XLF-DNA復合物,有利于DSB的損傷修復;而Ku70/80的不完整可能會干擾XLF的穩(wěn)定性,影響修復進程[15]。②Ku70/80可與LigⅣ的BRCT部位連接,促進LigⅣ的酶活性并增強末端連接的效率[16]。③Ku70還具有5′-dRP/AP裂解酶的作用,能切除斷裂端損傷的核苷酸,Ku70缺失會導致AP位點的減少,并使得NHEJ的連接效率降低[17]。④PAXX(XRCC4與XLF的間接同源物,又稱C9orf142)也可與Ku結(jié)合促進NHEJ介導的修復[18]。

1.1.2 DNA-PKcs調(diào)控NHEJ介導的DNA損傷修復

早期研究顯示,DNA-PKcs作為DNA-PK的催化亞基,主要通過磷酸化及自磷酸化調(diào)控著NHEJ通路中的多種因子。一方面,DNA-PKcs與DNA結(jié)合后改變自身構(gòu)象,經(jīng)磷酸化修飾后,激活DNA-PK全酶活性[19]。但是,早期針對DNA-PKcs構(gòu)象方面的研究并不深入。隨著先進技術(shù)的應用和方法的成熟,近些年針對DNA-PKcs結(jié)構(gòu)及磷酸化方面的研究也有了新的拓展。這些區(qū)域無定向特性并遠離激酶功能域,屬于DNA的結(jié)合域。

圖1 非同源末端連接NHEJ相關(guān)因子對DNA損傷修復過程的調(diào)控。當起始因子Ku70/80(黃色橢圓)缺失或被抑制(a),影響后期因子的募集,會導致NHEJ無法完成而激活同源重組通路;DNA依賴性蛋白激酶催化亞基(DNA-PKcs)(藍色橢圓)的缺失或抑制(b),嚴重影響NHEJ修復進程,導致NHEJ修復通路被抑制而激活同源重組通路;X射線交叉互補蛋白4(XRCC4)/DNA連接酶Ⅳ(LigⅣ)作為損傷修復最后連接的核心因子,兩者的缺失直接會造成NHEJ被抑制(c);artemis、XRCC類似因子(XLF)的缺失不會完全抑制NHEJ(d),但是會降低它的修復效率。然而當各個因子募集正常時(A、B、C、D),NHEJ完成損傷修復。

具有享廷頓蛋白延長因子3(Huntinotin,elong ation factor3 cEF3)、蛋白質(zhì)磷酸酶2A和酵母激酶TOR1(HAET)重復結(jié)構(gòu),該構(gòu)象包含蛋白激酶的活性域,以及磷酸化其他蛋白及DNA-PKcs自磷酸化的部位;而較小的HAET重復結(jié)構(gòu)域則屬于DNA的綁定部位[8,10]。當DNA或Ku缺失時,DNA-PKcs通過氨基端構(gòu)象改變激活其激酶活性,這顯然不同于早期研究[20]。

DNA-PKcs磷酸化的研究發(fā)現(xiàn),DNA-PKcs磷酸化的位點可以因不同外源因子誘導而各不相同:離子輻射主要引起T2609及S2056的磷酸化[21];外來化合物如硒(Se)主要誘導S2056與T2647位點的磷酸化[22]。T2609及S2056位點的磷酸化可調(diào)控修復通路的選擇:當T2609的磷酸化受阻時,NHEJ受到抑制,促使DNA損傷修復偏向HR通路,在此通路選擇中,DNA-PK酶活性的降低對NHEJ的抑制起關(guān)鍵作用(圖2)[23]。DNA-PKcs可磷酸化artemis并使后者獲得核酸內(nèi)切酶活性,它還可磷酸化末端連接因子Ku、XLF及XRCC4等,增強DSB損傷修復的連接效率[23-24]。

近年來,針對DNA-PKcs自磷酸化位點方面的研究,除了比較公認的ABCDE(ABCDE cluster T2609、S2612、T2620、S2624、T2638和T2647)和PQR位點(PQR cluster S2023,S2029、S2041、S2051、S2053、S2056)之外,還有N(N terminal cluster S56,S76)、JK(JK cluster T946,S1004),LZ(leucine zipper cluster S1470,S1546)和S3205等位點[21,23]。研究結(jié)果顯示,這些自磷酸化位點與DNA損傷后通路的選擇緊密相關(guān)[23]。例如,N位點自身磷酸化抑制HR通路,并以依賴激酶活性的方式選擇NHEJ通路;而JK位點的自磷酸化能顯著抑制NHEJ但促進HR參與的DNA損傷修復,且此時激酶活性不參與通路的選擇;S3205位點的自磷酸化只與HR通路相關(guān),不參與NHEJ通路的調(diào)控(圖2)[19,22-23]。DNA-PKcs自磷酸化可調(diào)控其他NHEJ因子,如促進artemis內(nèi)切酶活性等[23]。

此外,DNA-PKcs通過調(diào)控毛細血管擴張性共濟失調(diào)癥突變蛋白(ataxia telangiectasia mutated,ATM)及濟失調(diào)性毛細血管擴張和Rad3相關(guān)蛋白(ataxia-telangiectasia and Rad3-related,ATR)的磷酸化參與HR通路的調(diào)節(jié),而且DNA-PK激酶活性的降低導致大量異常的DNA-PKcs的自磷酸化,影響H2AX的磷酸化(gH2AX的形成),甚至降低HR的修復效率[9]。

圖2 DNA-PKcs磷酸化及自磷酸化調(diào)控修復通路的選擇。DNA-PKcs的磷酸化(紅色實線方框)及自磷酸化(紅色虛線方框)是非同源末端連接與同源重組通路選擇的開關(guān):ABCDE cluster自磷酸化可以促進非同源末端連接;PQR cluster的自磷酸化限制非同源末端連接的進展,促進同源重組;JK自磷酸化抑制非同源末端連接促進同源重組修復通路;T2609及S2056的磷酸化受到抑制時,非同源末端連接修復通路被抑制而啟動同源重組。

1.2 artemis調(diào)節(jié)NHEJ介導的DNA損傷修復

artemis于2001年被報道[25],盡管與其他NHEJ因子相比發(fā)現(xiàn)較晚,但近10年來,針對artemis的研究,無論在結(jié)構(gòu)還是功能方面,都比較深入。從結(jié)構(gòu)上來說,artemis是金屬β-內(nèi)酰胺酶蛋白家族的一員,該家族成員均有一個保守的由金屬β-內(nèi)酰胺酶折疊和β-CASP結(jié)構(gòu)域組成的SNM1結(jié)構(gòu)域,其中金屬β-內(nèi)酰胺酶具有核酸外切酶的活性,而β-CASP結(jié)構(gòu)域的凹槽可與DNA結(jié)合以便更好的進行損傷修復[25-26]。緊鄰β-CASP區(qū)域,在artemis的羧基端還有一個特殊的Art-Cter部位,artemis通過該結(jié)構(gòu)可與DNA-PKcs連接,形成的復合物被DNA-PKcs磷酸化后具有核酸內(nèi)切酶活性(因為artemis的羧基端區(qū)域?qū)ζ浜怂醿?nèi)切酶酶活性具有抑制作用,而當羧基端被磷酸化后發(fā)生構(gòu)象改變后,可以解除這種抑制作用),對DNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)和5′或3′突出端進行切割,這有助于后期高效的DNA損傷修復[10,26-29]。此外,artemis也可通過Art-Cter部位與LigⅣ連接,調(diào)控DNA損傷修復通路(NHEJ或HR)的選擇[10]。就功能而言,artemis主要是調(diào)控NHEJ的修復效率。artemis與LigⅣ及XRCC4形成不依賴于DNA或DNA-PKcs的復合物,進一步加強XRCC4/LigⅣ的活性,促進高效的NHEJ修復[4,28]。當artemis缺失時,盡管XRCC4/LigⅣ依舊可以發(fā)揮作用,但NHEJ修復被減弱,而機體為了維護自身穩(wěn)態(tài),會激活高效的HR通路以完成DNA損傷修復[4,26]。值得注意的是,artemis除了在NHEJ中發(fā)揮作用外,還參與其他因子介導的修復,如artemis作為ATM的底物因子,可以被ATM磷酸化,放大信號作用,在G2/M期與ATM共調(diào)節(jié)ATM介導的DNA損傷修復[28]。

1.3 XRCC4/LigIV和XLF相互作用調(diào)節(jié)NHEJ介導的DNA損傷修復

XRCC4與LigⅣ是NHEJ修復過程中連接斷裂DNA的重要因子。早期研究顯示,XRCC4與LigⅣ形成XRCC4/LigⅣ復合體后,在DNA-PKcs的協(xié)同作用下,連接DNA的兩斷裂端,完成NHEJ中雙鏈的連接過程[4,30]。近期的研究進一步從蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)方面解釋了它們的作用,并拓展了相關(guān)的功能。LigⅣ有2個BRCT部位(氨基端BRCT1/羧基端BRCT2),其中BRCT1與Ku具有較高的親和力,有利于LigⅣ被Ku募集[10];而BRCT2部位可與XRCC4的卷曲螺旋部位緊密連接。因此,LigⅣ與XRCC4之間的相互依賴性較強,當XRCC4(或LigⅣ)被敲低,表達量減少時,LigⅣ(或XRCC4)也會受到抑制,使整個NHEJ修復通路受到影響(圖1)[31]。LigⅣ可作用于XRCC4與XLF,LigⅣ缺失或減少會影響后者對斷裂DNA鏈的識別,從而延緩修復效率[10,32]。除了BRCT1和BRCT2兩個連接部位,LigⅣ還具有一個腺苷?;呋稽c,其腺苷酰化作用可以被XLF加強,從而促進末端連接的效率,有利于高效的DNA損傷修復[32-33]。LigⅣ作為連接因子還可調(diào)控NHEJ與HR通路的選擇:當LigⅣ功能正常時,其通過DNA綁定部位與DNA連接,有助于NHEJ的啟動和末端連接的進行[8,16];當LigⅣ完全缺失時,因末端連接無法完成,NHEJ受到抑制而啟動HR通路。與LigⅣ相似,XRCC4也具有調(diào)節(jié)通路選擇的作用,XRCC4缺陷的細胞經(jīng)輻射后,因NHEJ無法正常進行而啟動HR修復[31]。

XLF作為XRCC4類似因子,也是NHEJ修復通路中發(fā)現(xiàn)較晚的因子之一,于2006年在病變患者中發(fā)現(xiàn)并被命名為XLF[33]。在NHEJ修復中,XLF的羧基端是它與DNA連接的主要部位[10]。XLF作為支架蛋白可以與XRCC4形成緊密的螺旋復合物,通過增強XRCC4/LigⅣ的活性,提升末端連接的效率[34]。XLF與XRCC4/LigⅣ相互作用可調(diào)控DDR的進程:XLF表達下調(diào)可引起顯著的輻射敏感性,使細胞活力下降(這與XRCC4下調(diào)時造成的影響相似),同時也會導致DDR過程中的連接效率降低,所以XLF的正常表達是高效DDR所必需的[32-33]。

由此可見,在整個NHEJ修復過程中,XLF,XRCC4和LigⅣ保持正常功能,對DNA損傷修復過程是必不可少的,如果后階段的末端連接過程受到影響,也會顯著降低修復效率。

2 NHEJ相關(guān)因子與腫瘤

綜上所述,在NHEJ介導的DSB損傷修復通路中,各個因子之間的協(xié)調(diào)作用對細胞存活是必不可少的。若損傷修復無法完成,將導致細胞走向死亡或癌變。癌細胞由于脫離了正常細胞的周期制約,導致失控性的增殖與生長。同時,在增殖過程中,細胞內(nèi)DNA損傷程度明顯增加,為應對這些損傷,許多修復因子的表達發(fā)生改變,如Ku及DNA-PK蛋白在人宮頸癌細胞中均有異?,F(xiàn)象[35-37]。

目前,針對腫瘤的治療主要是通過藥物損傷腫瘤細胞的DNA,誘導細胞凋亡,達到清除癌變細胞的目的[38]。例如,順鉑和5-氟尿嘧啶等藥物主要通過破壞DNA的正常結(jié)構(gòu)和功能,促進細胞凋亡,從而殺死腫瘤細胞[39]。然而,這些藥物在損傷腫瘤細胞的同時也會影響正常細胞,因此,靶向藥物治療成為現(xiàn)階段腫瘤治療的熱點。DNA-PK作為腫瘤治療中一個潛在靶點,具有非常重要的意義,因為與正常細胞相比,DNA-PK在腫瘤細胞中通常會超表達,而對DNA-PK的抑制,可增強腫瘤細胞對抗癌藥物的敏感性,促進細胞衰老或死亡,增強療效[40-41]。此外,抑制DNA-PK激酶的活性,也可增加癌細胞對輻射的敏感性,加速其衰老或凋亡[42-43]。總之,特異性地抑制DNA-PK的表達或其酶活性,均可促進細胞衰老或死亡,使機體內(nèi)的腫瘤細胞得到有效的清除,為提升腫瘤或癌癥臨床治療的效果提供了理論支持。

除了DNA-PK,NHEJ中的其他相關(guān)因子與腫瘤的關(guān)系也受到廣泛關(guān)注。Ku70的異常表達與卵巢漿液性腫瘤惡變相關(guān)。在胃癌中,Ku70/80的過表達增加了細胞對博雷霉素的抗性,而抑制Ku70/80則可增加腫瘤細胞的放射敏感性。因此,在放療過程中,通過抑制Ku70/80表達的藥物,可提高腫瘤放療的效果[44-45]。XRCC4突變的增加與膀胱尿路上皮腫瘤、肝細胞癌等多種癌癥的發(fā)生緊密相關(guān)[46-47]。artemis,LigⅣ和XLF在腫瘤細胞中的缺失或低表達也會影響細胞對輻射的敏感性,如HeLa細胞中artemis(D37N-413aa)片段的突變增加了細胞的致敏性(因為突變的artemis片段與DNA-PK結(jié)合形成更為穩(wěn)定的復合物,破壞了DNA-PKcs對內(nèi)源性artemis的磷酸化進程,影響后者的內(nèi)切酶活性,從而抑制NHEJ修復,導致細胞凋亡)[48]。所以,在腫瘤或癌癥的治療過程中,可通過對DNA-PKcs,artemis,LigⅣ和XLF的抑制減緩DSB修復,促進細胞凋亡[49-50]。

總之,NHEJ相關(guān)因子可以作為腫瘤治療中的潛在靶點。然而,對于不同類型的腫瘤細胞,NHEJ相關(guān)因子的表達情況及作用機制依然有待深入研究,這些因子在腫瘤治療中的作用也需進一步驗證。

3 結(jié)語

目前針對NHEJ修復通路的報道很多,但研究結(jié)果各不相同,特別是在人體腫瘤治療過程中,DNA-PK與artemis,XRCC4,LigⅣ和XLF等相關(guān)因子之間的關(guān)系及應用效果尚無定論,仍需更多的體外或體內(nèi)實驗研究予以闡明。相信不久的將來,DNA-PK及相關(guān)的因子可作為腫瘤細胞的藥物靶點,廣泛應用于腫瘤和癌癥的臨床治療之中。

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Regulation of nonhomologous end-joining-related factors in DNA damage repair and tumor treatment

LI Wei-wei,KONG Jin-xin,QI Yong-mei,HUANG De-jun
(School of Life Sciences,Lanzhou University,Lanzhou 730000,China)

DNA double-strand break(DSB)is one of the various lesions induced by endogenous or exogenous stresses in cells.The nonhomologous end-joining(NHEJ)is a main mechanism in response to DSB in mammalian cells.The major factors(DNA-dependent protein kinase,artemis,X-ray repair cross-complementing 4/DNA ligaseⅣand XRCC4-like factor)in the progress of NHEJ play very important roles in mediating DNA damage repair(DDR),and the change of any factor will affect the DDR efficiency.In addition,NHEJ-related factors are associated with tumorigenesis.In this paper,we reviewed the actions of NHEJ-related factors in DSB repair and summarized the research progress in these factors in cancer therapy.

DNA-dependent protein kinase;DNA double-strand breaks;DNA end-joining repair;DNA damage repair

The project supported by National Natural Science Foundation of China(20907019);and Fundamental Research Funds for the Central Universities(lzujbky-2013-m03).

HUANG De-jun,E-mail:huangdj@lzu.edu.cn,Tel:(0931)8912893

R394.6

A

1000-3002-(2015)04-0607-07

10.3867/j.issn.1000-3002.2015.04.012

2014-10-11接受日期:2015-02-28)

(本文編輯:喬虹)

國家自然科學基金項目(20907019);中央高?;究蒲袠I(yè)務費專項資金項目(lzujbky-2013-m03)。

李蔚蔚,女,碩士研究生,主要從事遺傳毒理學研究;E-mail:bingningbj@126.com;黃德軍,男,博士,副教授,主要從事環(huán)境動物學和遺傳毒理學研究。

黃德軍,E-mail:huangdj@lzu.edu.cn,Tel:(0931)8912893

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