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信號(hào)分子與葉銹菌誘導(dǎo)下小麥病程相關(guān)蛋白1基因的表達(dá)分析

2015-10-20 21:04栗小英等
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年9期
關(guān)鍵詞:表達(dá)分析原核表達(dá)

栗小英等

摘要:病程相關(guān)蛋白1(pathogenesis-related proteins1,PR1)是一類(lèi)以基因家族形式存在的重要病程相關(guān)蛋白,在前期研究中,在小麥抗葉銹病近等基因系材料TaLr35中成功獲得了1個(gè)小麥病程相關(guān)蛋白1基因TaLr35PR1,具有植物防御體系中的SCP保守結(jié)構(gòu)域。利用生物信息學(xué)方法進(jìn)一步明確,該基因含有信號(hào)肽,定位于細(xì)胞間隙,可能含有跨膜結(jié)構(gòu)域,相對(duì)分子量為17.3 ku,與多個(gè)植物病程相關(guān)蛋白1序列具有較高同源性;利用半定量RT-PCR方法結(jié)合genetools、SPSS軟件分析TaLr35PR1基因表達(dá)模式,結(jié)果表明,信號(hào)分子水楊酸(salicylic acid,SA)、脫落酸(abscisic acid,ABA)明顯誘導(dǎo)該基因表達(dá),且用信號(hào)分子預(yù)處理后接種葉銹菌,基因表達(dá)量明顯增加;構(gòu)建了TaLr35PR1基因的原核表達(dá)載體pEASY-PR1,在大腸桿菌中高效表達(dá)分子量約為17 ku的融合蛋白,明確其最佳誘導(dǎo)條件為在 0.8 mmol/L IPTG下于25 ℃誘導(dǎo)8 h。

關(guān)鍵詞:葉銹菌;信號(hào)分子;病程相關(guān)蛋白1;表達(dá)分析;原核表達(dá)

中圖分類(lèi)號(hào): Q756文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2015)09-0028-04

收稿日期:2014-08-27

基金項(xiàng)目:國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(編號(hào):2013CB127700);河北省自然科學(xué)基金(編號(hào):C2012204005)。

作者簡(jiǎn)介:栗小英(1988—),女,河北張家口人,碩士研究生,研究方向?yàn)榉肿又参锊±怼-mail:506112516@163.com。

通信作者:王海燕,副教授,主要從事分子植物病理學(xué)研究。E-mail:ndwanghaiyan@163.com。植物在長(zhǎng)期的進(jìn)化過(guò)程中,為了抵抗病害對(duì)自身生長(zhǎng)的不良影響,在一定程度上發(fā)展了感受生物脅迫信號(hào)的機(jī)制,通過(guò)體內(nèi)的信號(hào)傳導(dǎo)途徑,激發(fā)轉(zhuǎn)錄因子與相應(yīng)的順式作用元件的結(jié)合,進(jìn)而啟動(dòng)特定基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá),最后導(dǎo)致植物對(duì)脅迫作出反應(yīng)[1]。病程相關(guān)(pathogenesis-related,PR)蛋白質(zhì)在信號(hào)傳遞與脅迫應(yīng)答中起調(diào)節(jié)作用。PR 基因的最初發(fā)現(xiàn)主要是由于它們?cè)谥参锸艿讲≡锴秩緯r(shí)會(huì)大量表達(dá)。PR蛋白質(zhì)除了在抗病反應(yīng)中發(fā)揮重要作用外,在植物抗衰老、傷害、非生物逆境脅迫和激素處理,以及正常生長(zhǎng)中也發(fā)揮重要作用。在PR蛋白家族中,PR1是一類(lèi)重要的蛋白,但對(duì)其作用機(jī)制以及靶物質(zhì)還尚不了解[2]。水楊酸(salicylic acid,SA)或乙烯(ethylene) 可誘導(dǎo)PR1基因的表達(dá),常被作為系統(tǒng)獲得性抗性(systemic acquired resistance,SAR)的分子標(biāo)記[3],因此,PR1基因編碼的蛋白質(zhì)成為目前的研究熱點(diǎn)。

PR1蛋白最早從煙草中發(fā)現(xiàn),隨后從許多單子葉和雙子葉植物中鑒定出PR1基因。PR1是一類(lèi)可經(jīng)病原菌和SA大量誘導(dǎo)表達(dá)的PR蛋白,蛋白分子量為14~17 ku,有酸性和堿性,大多呈堿性。PR1 被證實(shí)具有抗病毒擴(kuò)散、限制真菌入侵和保護(hù)植物抵御逆境脅迫等功能[4-5]。Agrawal 等研究證明OsPR1a、OsPR1b基因受茉莉酸(jasmonic acid,JA)、SA、過(guò)氧化氫(H2O2)、蛋白酶抑制劑斑蝥素(cantharidin,CN)、草藻滅(endothall,EN)和稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)的誘導(dǎo),對(duì)光傷害及磷酸酶抑制劑等環(huán)境脅迫和化學(xué)處理作出反應(yīng)[6-8]。楊德翠等研究發(fā)現(xiàn),PR1基因表達(dá)量與水楊酸的積累密切相關(guān),表達(dá)量的升高增強(qiáng)了牡丹對(duì)柱枝孢葉斑?。–ylindrocladium canadense)的抗性,并且發(fā)現(xiàn)該病侵染牡丹 24 h 后,PR1基因的表達(dá)顯著提高[9]。

小麥(Triticum aestivum)是重要的糧食作物,是全世界一半以上人口的主糧。小麥生產(chǎn)經(jīng)常受到病蟲(chóng)害的威脅,尤其由小麥葉銹菌(Puccinia triticina)引起的小麥葉銹病是威脅全球小麥穩(wěn)產(chǎn)高產(chǎn)的主要病害之一。小麥抗葉銹病基因Lr35,其抗性從2葉期開(kāi)始表達(dá),6葉期完全表達(dá),是1個(gè)十分有效的成株抗葉銹病基因。筆者前期利用RT-PCR和cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技術(shù)從含有小麥抗葉銹病基因Lr35的近等基因系材料TcLr35中獲得1個(gè)PR1基因的cDNA全長(zhǎng),命名為T(mén)aLr35PR1[10]。本研究擬利用半定量RT-PCR明確TaLr35PR1基因在受葉銹菌和信號(hào)分子誘導(dǎo)后核酸水平的表達(dá)特征,為進(jìn)一步探究其在生物與非生物脅迫過(guò)程中的功能及了解生物脅迫應(yīng)答機(jī)理提供線索。

1材料與方法

1.1試驗(yàn)材料

供試植物材料為攜帶小麥抗葉銹病基因Lr35的回交6代近等基因系材料TcLr35,及與其遺傳背景相同的感病親本“Thatcher”;供試小麥葉銹菌菌株為07-10-426-1(PHNT),該菌株對(duì)TcLr35呈非親和反應(yīng)(反應(yīng)型為1型),對(duì)Thatcher呈親和反應(yīng)(反應(yīng)型為4型)。各種限制性內(nèi)切酶、質(zhì)粒、膠回收試劑盒、Taq DNA聚合酶購(gòu)自生工生物工程上海(股份)有限公司;原核表達(dá)載體pEASYTM-E1購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司。

1.2試驗(yàn)方法

化學(xué)試劑處理:參考Zambounis等的方法[11]配制50 μmol/L SA溶液、50 μmol/L ABA溶液,噴灑于六葉期的成株小麥葉片表面至溶液滴下,于18~25 ℃、光照時(shí)間10~14 h的溫室培養(yǎng),處理3 d后,開(kāi)始接種葉銹菌07-10-426-1(孢子萌發(fā)率為80%以上),以未接菌處理為對(duì)照,分別在接種后0、6、12、24、36、48、72、120 h取0.1 g葉片,液氮速凍后于-80 ℃儲(chǔ)藏備用。

1.3總RNA的提取和cDNA第1鏈的合成

采用Bio-Flux公司的BIOZOL試劑盒提取小麥各處理樣品總RNA,按照寶生物工程(大連)有限公司的反轉(zhuǎn)錄酶試劑盒說(shuō)明書(shū)合成cDNA第1鏈。反轉(zhuǎn)錄合成的模板直接用于PR1基因的半定量RT-PCR分析。

1.4小麥TaLr35PR1生物信息學(xué)分析

利用SignalP(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)、TMHMM(http://www.hsls.pitt.edu/obrc/index.)、ProtScale(http://expasy.org/tools/)和Spidey(http://www. nebi. nlm. nih. Gov/spidey)在線工具完成對(duì)基因結(jié)構(gòu)模式的分析。分別利用SOPMA程序和Phyre2在線工具完成對(duì)蛋白質(zhì)二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)。

1.5小麥TaLr35PR1基因表達(dá)模式分析

根據(jù)TaLr35PR1基因開(kāi)放閱讀框(open reading frame,ORF)設(shè)計(jì)特異引物TaLr35PR1-F、TaLr35PR1-R(TaLr35PR1-F:5′- CCCAAGCTTTTAGTATGGTTTCTGTCCAATGAT-3′;TaLr35PR1-R:5′-CGCGGATCCAACTCGCCTCAGGACTAC-3′),以小麥中組成型表達(dá)的基因甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)基因(GenBank登錄號(hào):AF251217;GAPDH-F:5′-AACTGCCTTGCTCCTCTTGC-3′;GAPDH-R:5′-CTGTTGTCACCCTGGAAGTCA-3′)作為內(nèi)標(biāo)基因。以葉銹菌、ABA,SA處理后不同時(shí)間點(diǎn)的小麥葉片的cDNA為模板進(jìn)行半定量RT-PCR。PCR反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性1 min;94 ℃變性30 s,51 ℃退火1 min,72 ℃延伸2 min,35個(gè)循環(huán)。每個(gè)樣品設(shè)3個(gè)重復(fù)。試驗(yàn)數(shù)據(jù)通過(guò)genetools軟件得出表達(dá)量大小,利用SPSS軟件計(jì)算方差和顯著性,綜合進(jìn)行分析,獲得TaLr35PR1基因的相對(duì)表達(dá)量。

1.6小麥TaLr35PR1原核表達(dá)載體的構(gòu)建與誘導(dǎo)表達(dá)

設(shè)計(jì)原核表達(dá)特異引物YTaLr35PR1-F:5′-CGCGGATCCAACTCGCCTCAGGACTAC-3′、YTaLr35PR1-R:5′-CCCAAGCTTTTAGTATGGTTTCTGTCCAATGAT-3′;PCR產(chǎn)物與表達(dá)載體pEASY-E1進(jìn)行連接并轉(zhuǎn)化。首先使用PCR擴(kuò)增用引物驗(yàn)證目的片段與載體連接是否成功,再利用上游引物YTaLr35PR1-F和載體自帶T7終止子引物T7terminator(5′-TAGTTATTGCTCAGCGGTGG-3′)驗(yàn)證目的片段插入的方向性,然后轉(zhuǎn)入表達(dá)載體BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞后進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。

2結(jié)果與分析

2.1小麥TaLr35PR1基因特征分析

ProtScale軟件[12]預(yù)測(cè)TaLr35PR1編碼的蛋白總體表現(xiàn)為疏水性;SignalP 4.1[13]預(yù)測(cè)TaLr35PR1氨基酸序列具有信號(hào)肽,信號(hào)肽酶切位點(diǎn)在第1~24個(gè)氨基酸殘基之間。利用 SMART在線軟件對(duì)TaLr35PR1基因進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析,結(jié)果表明該基因具有保守的抗真菌結(jié)構(gòu)域SCP(圖1);利用Phyre2軟件分析,結(jié)果表明該基因由4條α螺旋、4條β折疊構(gòu)成,呈三明治般的ɑβɑ結(jié)構(gòu)。

2.2小麥TaLr35PR1基因表達(dá)模式

2.2.1SA誘導(dǎo)葉片中TaLr35PR1基因的表達(dá)譜分析50 μmol/L SA脅迫處理后,TaLr35PR1基因表達(dá)量在處理 12 h 明顯增加,并達(dá)到最大,約為對(duì)照組(0 h)表達(dá)量的7.6倍;之后隨著時(shí)間延長(zhǎng),表達(dá)量減少,到120 h又略有增加,約為對(duì)照組(0 h)表達(dá)量的2.6倍(圖2)。為了明確信號(hào)分子與葉銹菌的協(xié)調(diào)作用,50 μmol/L水楊酸脅迫處理3 d后,再接種葉銹菌,TaLr35PR1基因表達(dá)量在接種12 h極顯著增加并達(dá)到最大(P<0.01),約為對(duì)照組(0 h)的2.6倍;之后隨著接種時(shí)間延長(zhǎng),表達(dá)量顯著減少,到120 h又略有增加,約為未接種對(duì)照組(0 h)表達(dá)量的1.8倍。水楊酸預(yù)處理后再接種葉銹菌的表達(dá)趨勢(shì)與未接菌處理基本一致,但整體表達(dá)水平高于未接菌處理,接菌0 h后,TaLr35PR1基因表達(dá)量約為未接菌處理5.9倍。上述結(jié)果均扣除了Thatcher的表達(dá)量。

2.2.2ABA誘導(dǎo)葉片中TaLr35PR1基因的表達(dá)譜分析50 μmol/L ABA脅迫處理后,TaLr35PR1基因表達(dá)量在處理 12 h 明顯增加,72 h達(dá)到表達(dá)高峰,約為對(duì)照組(0 h)表達(dá)量的3.6倍,至120 h表達(dá)量減少(圖3)。為了明確信號(hào)分子與葉銹菌的協(xié)調(diào)作用,在50 μmol/L脫落酸脅迫預(yù)處理后,再接種葉銹菌。結(jié)果表明,TaLr35PR1基因表達(dá)量在接種12 h后顯著增加,至72 h達(dá)到最大(P<0.05),約為未接種對(duì)照組(0 h)的1.8倍;之后隨著接種時(shí)間延長(zhǎng),表達(dá)量稍有減少,整體表達(dá)趨勢(shì)與未接菌處理一致,但表達(dá)量明顯高于未接菌處理;接菌0 h后,TaLr35PR1基因表達(dá)量約為脫落酸處理(0 h)的3.2倍。上述結(jié)果均扣除了Thatcher的表達(dá)量。

2.3TaLr35PR1基因原核表達(dá)載體的構(gòu)建

利用pEASY-E1表達(dá)試劑盒構(gòu)建表達(dá)載體TaLr35PR1-pEASY,為驗(yàn)證目的片段是否與載體成功連接,利用YTaLr35PR1-F、YTaLr35PR1-R引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,對(duì)重組子進(jìn)行初篩,獲得約420 bp左右的片段,與該引物對(duì)TcLr35總RNA的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物大小一致,說(shuō)明目的基因已經(jīng)整合到pEASY-E1載體上。為驗(yàn)證目的片段插入載體的方向是否正確,使用YTaLr35PR1-F、T7terminator重組引物對(duì)重組子進(jìn)行篩選,預(yù)期擴(kuò)增產(chǎn)物為目的片段與載體序列的重組片段,獲得約500 bp左右的片段(圖4),證明插入載體的方向正確。測(cè)序結(jié)果進(jìn)一步表明,目的片段插入表達(dá)載體的位置和讀碼框正確。

2.4TaLr35PR1基因的體外誘導(dǎo)表達(dá)

以不同溫度、不同IPTG濃度、不同時(shí)間誘導(dǎo)轉(zhuǎn)化了表達(dá)載體pEASY-PR1的大腸桿菌BL21(DE3)。經(jīng)SDS-PAGE

分析可見(jiàn),在25 ℃溫度下,誘導(dǎo)的pEASY-PR1在17 ku左右產(chǎn)生1條新的誘導(dǎo)條帶,大小與理論值推算相符,而在27 ℃溫度下未見(jiàn)明顯誘導(dǎo)條帶(圖5-A);以未經(jīng)誘導(dǎo)的pEASY-PR1為對(duì)照,0.01~0.80 mmol/L IPTG誘導(dǎo)菌體均產(chǎn)生1條約17 ku的新條帶,確定0.80 mmol/L IPTG為最佳的誘導(dǎo)濃度(圖5-B);隨著誘導(dǎo)時(shí)間的延長(zhǎng),誘導(dǎo)2 h蛋白表達(dá)量增加明顯,6 h至過(guò)夜趨于穩(wěn)定,最佳誘導(dǎo)時(shí)間為8 h(圖5-C)。結(jié)果表明,小麥TaLr35PR1基因在大腸桿菌中得到了高效表達(dá),獲得了分子量約為17 ku的融合蛋白,最佳誘導(dǎo)條件為在0.8 mmol/L IPTG下于25 ℃誘導(dǎo)8 h。

3結(jié)論與討論

有報(bào)道證明擬南芥在抵抗病原物后的茉莉酸(JA)、SA信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)協(xié)調(diào)擬南芥抗病性[14]。此外,在病原物侵染前用SA處理擬南芥,發(fā)現(xiàn)可以誘導(dǎo)SAR反應(yīng)以及PR蛋白的表達(dá),以增強(qiáng)抗病能力[15]。PR1基因能被病菌侵染和信號(hào)分子脅迫所誘導(dǎo)[16-17],PR1基因的表達(dá)增強(qiáng)了植物抵御病害和其他各種脅迫的能力。機(jī)械損傷、植物激素(JA、SA、ET)、蛋白磷酸酶抑制劑斑蝥素(CN)、草藻滅(EN)都能誘導(dǎo)水稻OsPR1a基因的表達(dá)[18]。SA介導(dǎo)的SAR反應(yīng)主要對(duì)活體營(yíng)養(yǎng)型病菌起作用,而JA/ET介導(dǎo)的抗病信號(hào)途徑對(duì)抵抗腐生型真菌侵染起到作用[19]。棉花的PR3、PR10、GST18基因在轉(zhuǎn)錄水平上不僅受JA、SA的誘導(dǎo),而且受棉花枯萎病菌(Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum)誘導(dǎo)后表達(dá)水平顯著上調(diào)[11]。小麥葉銹菌為典型的活體營(yíng)養(yǎng)型病菌。本研究旨在明確SA和葉銹菌誘導(dǎo)對(duì)TaLr35PR1基因表達(dá)的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)TaLr35PR1基因表達(dá)受SA單獨(dú)誘導(dǎo);同時(shí),在SA脅迫處理后再接種葉銹菌,TaLr35PR1基因表達(dá)趨勢(shì)與SA誘導(dǎo)表達(dá)趨勢(shì)一致,而且SA與葉銹菌協(xié)同作用顯著增加了TaLr35PR1表達(dá)量,且其表達(dá)量明顯高于葉銹菌單獨(dú)誘導(dǎo)。

ABA是調(diào)節(jié)植物生長(zhǎng)發(fā)育的一種激素。當(dāng)植物面臨不利的自然環(huán)境時(shí),植物體內(nèi)ABA的含量會(huì)增加,進(jìn)而促進(jìn)植物生長(zhǎng)。植物體內(nèi)存在ABA、非ABA 2種調(diào)節(jié)系統(tǒng)[20]。實(shí)現(xiàn)這種調(diào)節(jié)必須能夠順利完成從刺激到準(zhǔn)確反應(yīng)的一系列信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程,這主要包括以受體為中心的脫落酸信號(hào)的細(xì)胞識(shí)別、以第二信使為中心的胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)換,以及以蛋白磷酸化為中心的信號(hào)放大與傳導(dǎo)等過(guò)程[14]。在前期研究中證明ABA可以誘導(dǎo)病程相關(guān)蛋白的表達(dá)[21],在本研究中發(fā)現(xiàn)TaLr35PR1基因表達(dá)受ABA誘導(dǎo),而且脫落酸與葉銹菌協(xié)同作用明顯誘導(dǎo)TaLr35PR1基因的表達(dá),而且表達(dá)量顯著高于SA和葉銹菌單獨(dú)誘導(dǎo)?;?種信號(hào)分子對(duì)TaLr35PR1基因的誘導(dǎo)表達(dá)模式,推測(cè)小麥TaLr35PR1基因在參與小麥抗葉銹病防御反應(yīng)時(shí),可能通過(guò)SA、ABA 2種信號(hào)途徑,但具體作用機(jī)制還需進(jìn)一步探討。

水稻、小麥等作物中關(guān)于病程相關(guān)蛋白從蛋白水平驗(yàn)證抗病性的研究報(bào)道較多。李雪姣等研究發(fā)現(xiàn),在水稻與白葉枯病菌互作時(shí),病程相關(guān)蛋白1家族在接菌后不同時(shí)間點(diǎn)、不同生長(zhǎng)期都發(fā)揮作用[22];關(guān)明俐等的研究有力地證明了不同的病程相關(guān)蛋白在水稻與白葉枯病菌互作時(shí)發(fā)揮作用[23];此外,牛吉山等應(yīng)用RT-PCR和cDNA文庫(kù)篩選技術(shù),從抗白粉病小麥-簇毛麥6VS/6AL易位系中分離到1個(gè)小麥類(lèi)甜蛋白基因的全長(zhǎng)cDNA,Western分析表明其可能與小麥 6VS/6AL 易位系的抗白粉病性相關(guān)[24];余宇克隆得到了小麥類(lèi)甜蛋白基因的全長(zhǎng)序列,并利用原核表達(dá)得到純度較高的類(lèi)甜蛋白[25]。后續(xù)研究將進(jìn)一步制備單克隆抗體,從蛋白水平分析其表達(dá)模式,并分析其他信號(hào)分子對(duì)該基因的影響,探析信號(hào)傳遞途徑。

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