鄢興華等
摘 要 建立了一種基于微流控滑移芯片的反應(yīng)微陣列體系,并應(yīng)用于雙濃度梯度研究。在此反應(yīng)微陣列芯片中,兩種試劑分別通過(guò)芯片進(jìn)樣形成多級(jí)濃度梯度,進(jìn)一步在正交方向上形成雙濃度梯度的微反應(yīng)陣列,經(jīng)過(guò)滑動(dòng)、接觸和混合,簡(jiǎn)便實(shí)現(xiàn)多路反應(yīng)。采用不同色素和熒光染料對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行了表征,確認(rèn)了方法的可靠性,在此基礎(chǔ)上, 考察了β-半乳糖苷酶(β-gal)的反應(yīng)條件。將45 nmol/L β-gal和45 μmol/L底物熒光素二半乳糖苷(FDG)分別注入芯片上下層,在芯片通道中各自形成濃度梯度,滑移后進(jìn)行不同酶濃度和不同底物濃度的反應(yīng)測(cè)定。結(jié)果表明,隨著底物濃度的提高,反應(yīng)產(chǎn)物逐漸增多;一定底物濃度下,產(chǎn)物隨酶濃度升高而逐漸增多,但很快到達(dá)平臺(tái)期。芯片上酶與底物的濃度對(duì)反應(yīng)的影響與芯片外基本一致。此芯片具有結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、操作簡(jiǎn)便和消耗低等特點(diǎn),適用于多因素和多水平的復(fù)雜反應(yīng)分析。
關(guān)鍵詞 微流控; 滑移芯片; 雙濃度梯度; β-半乳糖苷酶
1 引 言
生命科學(xué)的飛速發(fā)展對(duì)高通量分析技術(shù)提出了更迫切的要求。陣列技術(shù)以其規(guī)?;行蚣傻牟僮鞣绞匠蔀楫?dāng)前高通量技術(shù)代表。微流控芯片是近年發(fā)展起來(lái)的新概念分析技術(shù),以其微型化、集成化和自動(dòng)化等優(yōu)點(diǎn)備受矚目。將微流控芯片技術(shù)與陣列技術(shù)結(jié)合,即陣列微流控芯片或微流控陣列芯片已成為芯片分析的最重要方向之一,廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)分析。陣列式的微反應(yīng)器越來(lái)越被研究人員重視,各種陣列形成方式得到廣泛嘗試與驗(yàn)證,如液滴陣列[1,2]、微孔陣列[3~5]、電極陣列[6]、磁珠陣列[7]等,并實(shí)際應(yīng)用于基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué),甚至細(xì)胞、組織等分析,如RT PCR[8~10]、DNA甲基化分析[11]、單分子酶的測(cè)定[12]、細(xì)胞培養(yǎng)[13~15]、胚胎研究[16,17]、單細(xì)胞研究[18~20]、病毒檢測(cè)與基因分型[21,22]等。
滑移芯片是Ismagilov研究組提出的一種新微反應(yīng)陣列平臺(tái)。這種組合芯片通過(guò)兩塊芯片之間的相對(duì)滑動(dòng)實(shí)現(xiàn)指定通道和孔的接通與斷開(kāi),從而實(shí)現(xiàn)樣品和反應(yīng)物的進(jìn)樣、混合、洗脫及反應(yīng)等功能。該研究組采用滑移芯片實(shí)現(xiàn)了單種樣品和多種試劑的多路同時(shí)反應(yīng)[23,24],在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)了蛋白質(zhì)結(jié)晶條件篩選[23,25]、PCR[26,27]、免疫測(cè)定[28]、細(xì)菌培養(yǎng)[29]等高通量分析。
濃度梯度是實(shí)現(xiàn)多路高通量反應(yīng)的方式之一,可以減少多濃度試劑需求實(shí)驗(yàn)中的樣品準(zhǔn)備時(shí)間,并且更加精確和易于調(diào)整。微流控芯片可以形成精確的濃度梯度,且通過(guò)改變網(wǎng)絡(luò)通道的構(gòu)型設(shè)計(jì)及初始液流的濃度和組合順序,可獲得一系列復(fù)雜的濃度梯度。在芯片上形成雙濃度梯度的難點(diǎn)在于每種濃度梯度的形成需要一個(gè)獨(dú)立不受干擾的區(qū)域或平面,而兩種試劑的混合可能會(huì)造成流體的互相干擾和通道的互相影響。Hung等[30]在垂直交叉的芯片通道交叉處用閥的開(kāi)關(guān)控制流體方向,可使兩個(gè)方向的試劑分別形成濃度梯度,但同時(shí)形成兩種濃度梯度仍有困難?;菩酒瑸榻鉀Q同一平面的兩種濃度梯度互相干擾的情況提供了全新思路,即通過(guò)兩塊不同平面的芯片分別形成濃度梯度,再通過(guò)芯片滑移操作將兩種濃度梯度的試劑進(jìn)行接觸混合反應(yīng)。兩種濃度梯度同時(shí)形成, 且互不影響,形成后也能使不同濃度的兩種試劑以正交的形式交叉反應(yīng)。
本研究發(fā)展了一種基于滑移芯片的雙濃度梯度反應(yīng)陣列平臺(tái),可通過(guò)簡(jiǎn)單的樣品注入,同時(shí)形成兩種試劑的多水平的濃度梯度,并將其以正交的方式相互接觸與混合,形成正交濃度的微反應(yīng)陣列,從而簡(jiǎn)單地同時(shí)實(shí)現(xiàn)多組反應(yīng)。在色素與熒光素對(duì)該平臺(tái)進(jìn)行表征的基礎(chǔ)上,成功實(shí)現(xiàn)了β-半乳糖苷酶與底物反應(yīng)優(yōu)化條件的測(cè)定。此系統(tǒng)有結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、操作方便、消耗小等特點(diǎn),廣泛適用于多因素、多指標(biāo)(水平)的生物及化學(xué)反應(yīng)研究與分析。
2 實(shí)驗(yàn)部分
2.1 材料與試劑
熒光素、NaCl、EDTA、Tris等(上海國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司);β-半乳糖苷酶及底物FDG(Fluorescein di-β-D-galactopyranoside)購(gòu)自北京博奧森生物有限公司;FC-40(3M公司)。除特殊說(shuō)明外,所有試劑均為分析純,實(shí)驗(yàn)用水均來(lái)自Direct-Q system (Millipore, Bedford, MA, USA)所產(chǎn)的超純水,在使用前所有溶液均用0.45 μm濾頭先行過(guò)濾。
2.2 芯片設(shè)計(jì)與制作
本實(shí)驗(yàn)的滑移芯片由兩塊相同的PDMS/玻璃芯片組成,并通過(guò)PMMA夾子使兩塊芯片的玻璃面相互接觸與固定(圖1c)。每塊PDMS/玻璃芯片都包括PDMS上的通道部分和玻璃上鑿空的孔陣列,其中PDMS通道包括濃度梯度形成部分及多路平行的非連續(xù)通道部分,玻璃基底上包括用作反應(yīng)孔的大孔陣列和用于連接另一塊芯片反應(yīng)孔的小孔陣列;將玻璃和對(duì)應(yīng)的PDMS芯片鍵合后,非連續(xù)通道的末端與小孔一一對(duì)應(yīng),再將芯片底面進(jìn)行疏水處理。PMMA夾子包括兩片有螺紋孔及滑道的PMMA板,通過(guò)四角的螺絲可以將兩塊芯片固定和壓緊,PMMA板上的斜向滑道可以準(zhǔn)確的限定芯片滑動(dòng)的方向和距離。芯片通道高50 μm,寬300 μm,連接孔與反應(yīng)孔直徑分別為1.0 和1.5 mm。
2.3 芯片實(shí)驗(yàn)操作
將兩塊疏水處理后的芯片玻璃底面用全氟化合物FC-40浸潤(rùn),再將兩底面對(duì)準(zhǔn),使得每塊芯片上的大孔均勻連接另一塊芯片上的小孔。將對(duì)準(zhǔn)后的芯片用PMMA夾子夾緊,兩片PMMA板正好與兩塊芯片的PDMS面相接觸。
用PMMA夾子將兩塊芯片組裝到一起后(圖1c),芯片上的大孔陣列可以將另一塊芯片上的小孔陣列連接起來(lái),進(jìn)而將芯片上的非連續(xù)通道接通,可以實(shí)現(xiàn)兩塊芯片的同時(shí)進(jìn)樣,并同時(shí)產(chǎn)生濃度梯度(如圖1a所示)。通過(guò)微泵將樣品和反應(yīng)物分別與緩沖液一起注入兩塊芯片中,控制流速,即可在兩塊芯片上分別形成樣品和反應(yīng)物的濃度梯度。由于兩種濃度梯度是在不同的芯片平面上產(chǎn)生的,因此互不干擾,并且使得每塊芯片上的大孔即反應(yīng)孔陣列都充滿(mǎn)了另一塊芯片上形成的濃度梯度溶液,為下一步混合做好準(zhǔn)備。
進(jìn)樣完成后,沿著PMMMA夾子上層四角預(yù)留的滑道進(jìn)行滑動(dòng),由于PMMA與PDMS之間的摩擦力遠(yuǎn)大于中間有FC-40潤(rùn)滑的玻璃與玻璃之間的摩擦力,因此上層PDMS芯片會(huì)隨著PMMA板一起,沿著滑道移動(dòng),從而斷開(kāi)兩塊芯片的通道,同時(shí)使得分別充滿(mǎn)兩類(lèi)濃度梯度溶液的反應(yīng)孔陣列一一對(duì)應(yīng),樣品和反應(yīng)物進(jìn)行混合并反應(yīng)(圖1b)。
2.4 芯片表征與β-半乳糖苷酶反應(yīng)
分別用色素和熒光素對(duì)此芯片形成雙濃度梯度的效果進(jìn)行評(píng)估。評(píng)估分別采用肉眼可見(jiàn)的色素溶液和肉眼不可見(jiàn)的熒光素溶液進(jìn)行定性和定量分析。首先測(cè)試了單層芯片的濃度梯度形成效果,用黃色和藍(lán)色色素溶液分別注入單塊芯片的兩個(gè)入口,觀察4條通道的色素顏色以判斷混合情況;對(duì)組合好的芯片,上層芯片兩個(gè)入口分別注入綠色色素溶液和水,下層芯片兩個(gè)入口分別注入紅色色素溶液和水。完成了色素對(duì)芯片的表征后,同樣用熒光素溶液進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)。芯片入口分別注入1.0×104 mol/L 的熒光素溶液和水,待形成穩(wěn)定濃度梯度后進(jìn)行熒光強(qiáng)度的測(cè)定。
此芯片還用于β-半乳糖苷酶與底物FDG的反應(yīng)測(cè)定。在確定了合適的反應(yīng)時(shí)間和反應(yīng)濃度范圍后,上層芯片注入45 nmol/L β-Gal溶液和水,下層芯片注入45 μmol/L FDG溶液和水,待形成穩(wěn)定濃度梯度后,將芯片進(jìn)行滑移,接觸反應(yīng)1 h后,對(duì)反應(yīng)孔的反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行光強(qiáng)測(cè)定。
3 結(jié)果與討論
3.1 有限元模擬
采用Fluent軟件對(duì)芯片通道進(jìn)行了有限元模擬,以驗(yàn)證此設(shè)計(jì)是否能形成符合要求的濃度梯度。以水為對(duì)象,采用與實(shí)際實(shí)驗(yàn)中相同的通道尺寸和立體結(jié)構(gòu),模擬流體在上下層通道間的流動(dòng)和混合情況。流體流速分別設(shè)置為0.1, 0.5, 1.0, 5.0和10.0 μL/min,模擬濃度場(chǎng)分布如圖2所示(流速為0.5 μL/min)。結(jié)果表明,流體在由不同平面的通道和孔連接而成的芯片通道中能夠很好地?cái)U(kuò)散混合,此通道設(shè)計(jì)理論上能很好地形成穩(wěn)定連續(xù)的濃度梯度。
3.2 芯片表征
芯片組裝完成后,首先對(duì)單層芯片的濃度梯度形成情況進(jìn)行了實(shí)驗(yàn),往上層芯片的兩個(gè)入口分別注入黃色色素溶液和藍(lán)色色素溶液,黃色和藍(lán)色色素混合會(huì)形成綠色。結(jié)果表明,單層芯片能較好的形成符合預(yù)期的濃度梯度(如圖3a)。此后,用色素對(duì)雙層芯片進(jìn)行了驗(yàn)證。上層芯片分別注入綠色色素溶液和水溶液,同時(shí),下層芯片分別注入紅色色素溶液和水溶液,經(jīng)過(guò)一段時(shí)間后,兩層芯片分別獨(dú)立的形成了基本符合要求的濃度梯度(如圖3b所示)。
在用色素溶液對(duì)芯片濃度梯度進(jìn)行定性表征后,采用熒光素溶液對(duì)芯片的濃度梯度情況進(jìn)行了定量表征。芯片中分別注入1.0×104 mol/L熒光素溶液和水,待穩(wěn)定后,在熒光場(chǎng)下用顯微鏡觀察和測(cè)量,并用Image Pro Plus和Origin Pro進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)圖和3D柱形圖(圖3c和3d)。結(jié)果表明,此芯片平臺(tái)能形成符合預(yù)期的濃度梯度。
3.3 β-半乳糖苷酶反應(yīng)
采用此芯片進(jìn)一步進(jìn)行了β-半乳糖苷酶和底物FDG的反應(yīng)測(cè)定。首先在多孔板上探索了酶反應(yīng)時(shí)間對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物的影響。實(shí)驗(yàn)中,選取了不同濃度的β-半乳糖苷酶(15, 30和45 nmol/L)和不同濃度的底物FDG(15, 30和45 μmol/L),分別進(jìn)行混合后,相隔不同時(shí)間(0, 0.25, 0.5, 0.75, 1.0, 1.5和2.0 h)后測(cè)量反應(yīng)產(chǎn)物光強(qiáng)(圖4)。隨著反應(yīng)時(shí)間延長(zhǎng),產(chǎn)物光強(qiáng)逐漸上升,約1 h后,產(chǎn)物光強(qiáng)到達(dá)平臺(tái)期。因此,選擇1 h作為反應(yīng)時(shí)間,既能保證反應(yīng)充分進(jìn)行,也給測(cè)量預(yù)留了足夠的時(shí)間,不會(huì)出現(xiàn)光強(qiáng)明顯衰減的情況。
確定反應(yīng)時(shí)間后,在多孔板和芯片上分別進(jìn)行了酶反應(yīng)的測(cè)定。根據(jù)多次篩選,確定了合適的酶濃度(0, 15, 30和45 nmol/L)和底物濃度(0, 15, 30 和45 μmol/L)。在多孔板上,分別加入4個(gè)濃度的β-Gal和4個(gè)濃度的FDG,形成不同濃度組合,反應(yīng)1 h后測(cè)量光強(qiáng)。在芯片中,上層芯片注入45 nmol/L β-Gal和水,下層芯片注入45 μmol/L FDG和水,待形成穩(wěn)定濃度梯度后,滑動(dòng)芯片,使反應(yīng)孔接觸,反應(yīng)1 h后測(cè)量光強(qiáng)。用Image Pro Plus和Origin Pro對(duì)測(cè)量數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,并繪制了2D和3D柱形圖(圖5)。
由圖5可知,隨著底物濃度增大,反應(yīng)產(chǎn)物逐漸增多;隨著酶濃度增大,產(chǎn)物逐漸增多,但很快到達(dá)平臺(tái)期(當(dāng)酶濃度為30和45 nmol/L時(shí),產(chǎn)物光強(qiáng)基本一致)。芯片上的酶反應(yīng)與多孔板上的反應(yīng)趨勢(shì)基本一致,酶和底物濃度對(duì)反應(yīng)的影響也基本一致,這表明此芯片平臺(tái)對(duì)β-半乳糖苷酶反應(yīng)條件的測(cè)定是可靠的。
4 結(jié) 論
濃度梯度技術(shù)是科學(xué)研究中優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件的重要手段。在微流控芯片上研究濃度梯度具有自動(dòng)化、微型化、高通量的優(yōu)點(diǎn),因而在藥物篩選、免疫分析、細(xì)胞刺激等方面得到了廣泛應(yīng)用。但多數(shù)研究都限于單一條件的濃度梯度形成,而不能同時(shí)形成兩個(gè)或多個(gè)條件的濃度梯度,無(wú)法應(yīng)對(duì)多因素復(fù)雜反應(yīng)的需要。本研究建立了一種基于滑移芯片的反應(yīng)陣列平臺(tái),并應(yīng)用于雙濃度梯度研究。此芯片系統(tǒng)包含上下兩塊相同的PDMS/玻璃芯片,兩種試劑分別通過(guò)芯片進(jìn)樣,能同時(shí)各自形成不同平面上的濃度梯度,再經(jīng)過(guò)兩塊芯片的滑動(dòng),兩個(gè)平面上不同類(lèi)別的試劑接觸、混合并反應(yīng),從而實(shí)現(xiàn)多路不同濃度條件下的反應(yīng)。用色素和熒光素對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行了表征,確認(rèn)本方法的可靠性,并進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)了β-半乳糖苷酶反應(yīng)條件的優(yōu)化測(cè)定。該芯片具有結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、操作簡(jiǎn)便、消耗低、速度快等特點(diǎn),適用于多因素和多水平的復(fù)雜反應(yīng)分析。
References
1 Shen H, Fang Q. Talanta, 2008, 77(1): 269-272
2 Zhu Y, Zhang Y X, Liu W W, Ma Y, Fang Q, Yao B. Sci. Rep., 2015, 5: 9551
3 Park E S, Brown A C, DiFeo M A, Barker T H, Lu H. Lab Chip, 2010, 10(5): 571-580
4 Lindstrom S, Mori K, Ohashi T, Andersson-Svahn H. Electrophoresis, 2009, 30(24): 4166-4171
5 Park S, Bassat D B, Yossifon G. Biomicrofluidics, 2014, 8(2): 024117
6 Hirano Y, Yasukawa T, Sawayashiki Y, Shiku H, Mizutani F, Matsue T. Electrochemistry, 2010, 78(2): 175-177
7 Yang X H, Zhao X, Zuo X B, Wang K M, Wen J H, Zhang H. Talanta, 2009, 77(3): 1027-1031
8 Zhang Y X, Zhu Y, Yao B, Fang Q. Lab Chip, 2011, 11(8): 1545-1549
9 Ramalingam N, Rui Z, Liu H B, Dai C C, Kaushik R, Ratnaharika B, Gong H Q. Sensor. Actuat. B-Chem., 2010, 145(1): 543-552
10 Wong W, Farr R, Joglekar M, Januszewski A, Hardikar A. J. Vis. Exp., 2015, (98): e52586
11 Zhang Y, Bailey V, Puleo C M, Easwaran H, Griffiths E, Herman J G, Baylin S B, Wang T H. Lab Chip, 2009, 9(8): 1059-1064
12 Sakakihara S, Araki S, Iino R, Noji H. Lab Chip, 2010, 10(24): 3355-3362
13 Liu M C, Tai Y C. Biomed. Microdevices, 2011, 13(1): 191-201
14 Frimat J P, Becker M, Chiang Y Y, Marggraf U, Janasek D, Hengstler J G, Franzke J, West J. Lab Chip, 2011, 11(2): 231-237
15 Wilson J L, Suri S, Singh A, Rivet C A, Lu H, McDevitt T C. Biomed. Microdevices, 2014, 16(1): 79-90
16 Kang E, Choi Y Y, Jun Y, Chung B G, Lee S H. Lab Chip, 2010, 10(20): 2651-2654
17 Chung K, Kim Y, Kanodia J S, Gong E, Shvartsman S Y, Lu H. Nat. Methods, 2011, 8(2): 171-176
18 Li Y W, Feng X J, Du W, Li Y, Liu B F. Anal. Chem., 2013, 85(8): 4066-4073
19 Wang Y, Tang X L, Feng X J, Liu C, Chen P, Chen D J, Liu B F. Anal. Bioanal. Chem., 2015, 407(4): 1139-1148
20 Kumar P T, Vriens K, Cornaglia M, Gijs M, Kokalj T, Thevissen K, Geeraerd A, Cammue B P A, Puers R, Lammertyn J. Lab Chip, 2015, 15(8): 1852-1860
21 Zhang H, Xu T, Li C W, Yang M S. Biosens. Bioelectron., 2010, 25(11): 2402-2407
22 Ahlford A, Kjeldsen B, Reimers J, Lundmark A, Romani M, Wolff A, Syvanen A C, Brivio M. Analyst, 2010, 135(9): 2377-2385
23 Du W B, Li L, Nichols K P, Ismagilov R F. Lab Chip, 2009, 9(16): 2286-2292
24 Li L, Du W B, Ismagilov R F. J. Am. Chem. Soc., 2010, 132(1): 106-111
25 Li L, Du W B, Ismagilov R F. J. Am. Chem. Soc., 2010, 132(1): 112-119
26 Shen F, Du W B, Davydova E K, Karymov M A, Pandey J, Ismagilov R F. Anal. Chem., 2010, 82(11): 4606-4612
27 Shen F, Du W B, Kreutz J E, Fok A, Ismagilov R F. Lab Chip, 2010, 10(20): 2666-2672
28 Liu W S, Chen D L, Du W B, Nichols K P, Ismagilov R F. Anal. Chem., 2010, 82(8): 3276-3282
29 Ma L, Datta S S, Karymov M A, Pan Q C, Begolo S, Ismagilov R F. Integr. Biol., 2014, 6(8): 796-805
30 Hung P J, Lee P J, Sabounchi P, Lin R, Lee L P. Biotechnol. Bioeng., 2005, 89(1): 1-8