莆田市公安局物證鑒定所 叢雪塵 方愛瓊 方 茜
Identifiler Plus試劑盒在產(chǎn)品定位上雖不屬于直擴(kuò)試劑盒,但因其具有抗抑制能力強(qiáng)等特點(diǎn),也具有直擴(kuò)的潛力。關(guān)于 Identifiler Plus應(yīng)用于不同類型的現(xiàn)場檢材直擴(kuò)檢驗(yàn)的可行性和有效性,已經(jīng)有文獻(xiàn)予以報(bào)道,用其對(duì)現(xiàn)場血樣進(jìn)行直擴(kuò)檢驗(yàn)的成功率和用 Identifiler-Direct進(jìn)行直擴(kuò)檢驗(yàn)的成功率無顯著差異,用其對(duì)現(xiàn)場煙蒂及擦拭物進(jìn)行直擴(kuò)檢驗(yàn)的成功率甚至遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于用 Identifiler-Direct進(jìn)行直擴(kuò)檢驗(yàn)的成功率[1],這進(jìn)一步表明Identifiler Plus應(yīng)用于直擴(kuò)時(shí)表現(xiàn)良好。對(duì)于煙蒂的 DNA檢驗(yàn),有研究指出,當(dāng)煙蒂放置時(shí)間超過一周時(shí),檢出率就將隨著放置時(shí)間的增長而大幅下降,且在用Chelex-100方法提取煙蒂DNA時(shí),提取煙紙上DNA的檢出率要大大高于提取海綿上DNA的檢出率[2],而在煙紙中加入海綿對(duì)檢出率沒有顯著影響[3]。筆者認(rèn)為,該結(jié)論是否同樣適用于直擴(kuò)法還需進(jìn)一步驗(yàn)證,且該驗(yàn)證非常有必要,因?yàn)檫@對(duì)日常檢案將帶來很大幫助。
50個(gè)煙蒂均來源于志愿者,為新鮮煙蒂。
采用ABI-9700型PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增,ABI-3130XL型遺傳分析儀進(jìn)行測序;擴(kuò)增試劑使用美國 ABI公司生產(chǎn)的Identifiler Plus 試劑盒。
分為直擴(kuò)組和對(duì)照組兩組。直擴(kuò)組分別剪取每枚煙蒂唾液斑痕處的外層煙紙約 2mm×1mm、海綿約 2mm×0.5mm、以及兩者混合物,剪碎后留待擴(kuò)增。擴(kuò)增試劑采用Idnetifiler Plus試劑盒,擴(kuò)增反應(yīng)體系為25μL,反應(yīng)體系配比與擴(kuò)增參數(shù)均參照操作說明書推薦參數(shù)設(shè)置。對(duì)照組按上述方法剪取相同檢材的煙紙海綿混合物,DNA提取采用行標(biāo)GA/T383-2014中的Chelex-100方法,擴(kuò)增試劑亦使用Idnetifiler Plus試劑盒,25μL反應(yīng)體系,反應(yīng)體系配比與擴(kuò)增參數(shù)設(shè)置同直擴(kuò)組。以上兩組電泳測序信息均由Data Collection 3.0數(shù)據(jù)收集軟件自動(dòng)收集,采用GeneMapperID v3.2軟件進(jìn)行基因分型。
從檢驗(yàn)結(jié)果看,煙紙的直擴(kuò)檢出成功率僅為12%,海綿的檢出成功率高達(dá)96%,與對(duì)照組的檢出率(98%)相比無顯著差異,在海綿中加入煙紙對(duì)檢驗(yàn)結(jié)果無顯著影響(見表1)。對(duì)海綿進(jìn)行直擴(kuò)檢驗(yàn)所獲得的STR分型與用對(duì)照組相比無顯著差異,但對(duì)照組圖譜的等位基因間均衡性要稍好,STR分型比較見圖1~圖3。
表1 三種檢驗(yàn)部位的STR分型結(jié)果比較
圖1 煙紙直擴(kuò)STR分型結(jié)果
圖2 海綿直擴(kuò)STR分型結(jié)果
圖3 對(duì)照組STR分型結(jié)果
從檢驗(yàn)結(jié)果看,對(duì)新鮮煙蒂進(jìn)行直擴(kuò)檢驗(yàn)時(shí),應(yīng)選取煙蒂的海綿部分,而非煙紙部分。用直擴(kuò)法檢驗(yàn)煙蒂海綿是可行的,結(jié)果是可信的,且省去 DNA提取步驟,既節(jié)省了檢驗(yàn)時(shí)間又減少了潛在的污染環(huán)節(jié)。一些學(xué)者認(rèn)為,海綿中的纖維上含有PCR抑制物,會(huì)導(dǎo)致PCR擴(kuò)增效率低[2],[4],但另一些實(shí)驗(yàn)[3]則表明,在煙紙中加入煙絲會(huì)導(dǎo)致檢驗(yàn)失敗,而加入海綿則不影響檢驗(yàn)結(jié)果。筆者認(rèn)為,海綿纖維本身對(duì)PCR的抑制作用并不顯著,而煙絲中則存在大量 PCR抑制物,只是由于吸煙者在吸煙過程中,過濾嘴海綿上可能吸附了大量煙絲燃燒殘留物,煙紙上吸附的則比較少,所以當(dāng)使用抗抑制能力不強(qiáng)的擴(kuò)增試劑盒來檢驗(yàn)海綿時(shí),很難得到滿意的結(jié)果。Identifiler Plus試劑盒的突出特點(diǎn)便是抗抑制能力強(qiáng),所以用其來做直擴(kuò)實(shí)驗(yàn)時(shí),反而可能由于吸附在海綿上的脫落細(xì)胞比吸附在煙紙上的脫落細(xì)胞更容易浸泡脫落,從而檢驗(yàn)海綿的成功率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于檢驗(yàn)煙紙的成功率。對(duì)于陳舊煙蒂,吸附在煙紙和海綿上的脫落細(xì)胞更難浸泡脫落,是否適用直擴(kuò)法檢驗(yàn)還需驗(yàn)證。在本次研究中,雖然檢驗(yàn)海綿的檢出成功率很高,但所獲得STR分型的峰高及等位基因間均衡性還不甚理想,改良擴(kuò)增反應(yīng)體系或許會(huì)獲得更好的結(jié)果。在對(duì)新鮮煙蒂進(jìn)行直擴(kuò)時(shí),還需注意,在剪取海綿時(shí),應(yīng)選取唾液斑痕較明顯處剪取,增加模板濃度可有效提高檢出成功率;由于海綿的延展性較好,在擴(kuò)增前應(yīng)注意將剪取的檢材完全浸沒在反應(yīng)液中,避免因檢材漂浮在液面導(dǎo)致檢驗(yàn)失敗。
[1]哈飛,孫紅兵,高海鵬,等.現(xiàn)場生物檢材Identifiler Plus直接擴(kuò)增方法的應(yīng)用研究[J].中國優(yōu)生與遺傳雜志,2013,21(12):33-34.
[2]張愛平,陳曉輝,劉長暉,等.放置時(shí)間對(duì)煙蒂上DNA含量及STR分型的影響[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2008,24(6):423-424.
[3]張慶霞,劉雅誠,唐暉,等.煙蒂DNA分型的研究[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2003,18(1):29-30.
[4]陳向紅,劉超,李越.熒光標(biāo)記STR分型進(jìn)行煙蒂的個(gè)人識(shí)別[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2002,17(5):301-302.