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改良的差異裂解法提取混合斑中精子DNA

2015-11-19 09:13:56泉州市公安局刑偵支隊晉江市公安局刑事科學技術室
海峽科學 2015年10期
關鍵詞:沉淀物離心管磁力

.泉州市公安局刑偵支隊 .晉江市公安局刑事科學技術室 程 沖 王 芳

在強奸類案件中,含有精子的混合斑(陰道拭子、內褲等等)是一種常見的檢材,一般采用差異裂解法[1]提取精子DNA。在實際檢案中,混合斑第一步消化時間、精子沉淀物洗滌時間以及純化的時間都較長,特別是遇到大量混合斑檢材時,耗費時間更長,本文采用了改良的差異裂解法可以減少提取時間,并能保證提取結果。

1 材料與方法

1.1 樣本

本實驗室日常受理的混合斑檢材34份(PSA試紙條檢測均為陽性),其中陰道拭子18例,內褲13例,衛(wèi)生紙3例。

1.2 儀器和試劑

9700型擴增儀(AB公司);3130XL型測序儀(AB公司);DNA IQTM系統(tǒng)(Promega公司);Loopile First-hand PCR Kit試劑盒;Identifiler Plus試劑盒(AB公司);磁力架。

1.3 方法

1.3.1 常規(guī)差異裂解法

內褲襠部布片剪取約 1cm×1cm,衛(wèi)生紙剪取約1cm×1cm,陰道拭子剪取外層棉花一半,剪碎后放入 1.5ml離心管中,按文獻[1]中差異裂解法消化 34例混合斑檢材中女性成分,洗滌的沉淀物按照文獻[2]中磁珠法提取精子DNA,DNA溶液4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3.2 改良差異裂解法

(1)內褲襠部布片剪取約 1cm×1cm,衛(wèi)生紙剪取約1cm×1cm,陰道拭子剪取外層棉花一半,剪碎后放入 1.5mL離心管中,加入1mL TNE溶液,100μL 10% SDS溶液,10μL 10mg/mL PK溶液,混勻后56℃恒溫保存2小時。(2)套管離心后轉移液體至另一1.5mL離心管,13000r/min 離心3分鐘后,將離心管置于磁力架上,打開蓋子,迅速、平穩(wěn)翻轉磁力架傾倒上清液。(3)傾倒后,沉淀物中加入1mL TNE溶液,振蕩后13000r/min 離心3分鐘,再將離心管置于磁力架上,打開蓋子,迅速、平穩(wěn)翻轉磁力架傾倒上清液,重復步驟(3)兩次。(4)TNE洗滌3次后,沉淀物中加入Loopile First-hand PCR Kit試劑盒A-裂解液,95℃ 3分鐘,加B液后振蕩混勻,13000r/min 離心3分鐘,上清液4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3.3 DNA擴增及產物檢測

采用Identifiler Plus試劑盒在9700型擴增儀進行PCR擴增,擴增體系為 10μL,DNA 模板為 1μL,擴增參數參照Identifiler Plus試劑盒操作手冊。取上述 PCR擴增產物經3130XL型測序儀電泳,結果用GeneMapper ID v3.2軟件進行分析,獲得等位基因分型圖譜。

2 結果

本文中,34例混合斑檢材經不同提取方法檢驗的結果見表1。采用改良的差異裂解法提取混合斑中精子 DNA,34例檢材中有 31例獲得了單一男性分型,2例檢材獲得混合STR分型,剩余1例未獲得分型,未獲得分型的檢材經涂片鏡檢,未能發(fā)現精子細胞。比較不同提取方法的檢驗結果,改良的差異裂解法檢出率高于常規(guī)差異裂解法,究其原因,56℃恒溫有助于提高PK消化效率,能進一步去除女性成分。改良法在提取時間上較常規(guī)法將近減少一半,并且對不同混合斑檢材均有較好的適應性。同時,改良法與常規(guī)法檢驗結果在峰高、平衡性方面無顯著差異。

表1 不同提取方法檢驗結果(檢出單一男性分型)

3 討論

用傳統(tǒng)的差異裂解法處理混合斑檢材時,上皮細胞與精子細胞的分離并不都是完全的,特別是在含有大量女性上皮細胞且精子細胞含量少的混合斑檢材中,一些上皮細胞在第一步消化時沒有消化干凈,使得精子 DNA溶液中出現女性成分,表現為混合分型,不利于結果判斷。本文中,由于采用了改良的差異裂解法,在第一步消化時采用56℃孵育,能提高蛋白酶K裂解效率,精子在二硫基的保護下不受影響,而女性上皮細胞則能夠基本消化干凈,因此,改良法在檢出單一男性分型的數量要高于傳統(tǒng)法,同時,在第一步消化完畢后,改良法在精子沉淀物的洗滌時間上也具有較大優(yōu)勢,由于采用磁力架傾倒的方式一步去除洗滌液,減少了移液器的手工操作,降低勞動強度,在實際工作中具有重要意義。

綜上所述,改良的差異裂解法極大程度上減少了提取時間,提高了勞動效率,此改良方法無需特殊設備,適用于常見的混合斑檢材,在日常檢案中具有較高的應用價值。

[1]鄭秀芬.法醫(yī)DNA分析[M].北京∶中國人民大學出版社,2002.

[2]鄭秀芬,凌鳳俊,涂政.模板 DNA 磁珠提取法[J].中國法醫(yī)學雜志, 2003,18(2)∶107.

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