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豬瘟病毒簡介

2015-12-08 00:17冷冬
湖北畜牧獸醫(yī) 2015年10期

冷冬

摘要:豬瘟病毒(CSFV)對養(yǎng)殖業(yè)危害巨大,具有高發(fā)病率、高死亡率的特點(diǎn)。在分子層面對CSFV進(jìn)行介紹,對其分子結(jié)構(gòu)、組成及編碼產(chǎn)物的功能進(jìn)行簡要介紹,以期為該病的防控提供幫助。

關(guān)鍵詞:豬瘟病毒;分子結(jié)構(gòu);結(jié)構(gòu)蛋白;開放閱讀框

中圖分類號:S852.65+1 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:B 文章編號:1007-273X(2015)10-0005-02

豬瘟病毒(Classical swine fever virus, CSFV)屬黃病毒科(Flaviviridae),瘟病毒屬(Pestivirus),該病毒粒子大小約為40~60 nm,具有囊膜結(jié)構(gòu)的單股線狀正鏈RNA病毒,是引起豬瘟的病毒因子。在世界范圍內(nèi)廣泛流行,其特點(diǎn)為發(fā)病率與死亡率高。OIE將其列為A類法定傳染病[1]?,F(xiàn)將豬瘟病毒特征及分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行簡介,為全面了解該病毒奠定基礎(chǔ)。

1 發(fā)病特征

CSFV感染后,豬可見高熱、運(yùn)動失調(diào)、后肢無力、皮膚出現(xiàn)不同程度紅色或紫色的出血點(diǎn),也有報道感染后出現(xiàn)神經(jīng)癥狀。感染后死亡率高,在感染豬的多個器官中均能檢出該病毒,如腦、骨髓、舌、淋巴、腎臟、脾、扁桃體等。母豬感染該病毒,常見臨床癥狀為流產(chǎn)、死胎、木乃伊胎、畸形胎兒、淋巴細(xì)胞和血小板減少、慢性營養(yǎng)性消耗等[2]。

2 豬瘟病毒分子結(jié)構(gòu)

豬瘟病毒與瘟病毒屬中其他病毒具有類似結(jié)構(gòu),為正鏈單股RNA病毒,具感染能力。在病毒3′-端不存在多聚腺苷酸結(jié)構(gòu)(polyA),5′端無甲基化的“帽子”結(jié)構(gòu)??蓪⒄麄€病毒分為5′端非編碼區(qū)(5′-untrandslated region, 5′-UTR),3′端非編碼區(qū)(3′-untranslated region, 3′-UTR)以及一個較大的開放閱讀框(Open reading frame, ORF)[3]三個部分。

2.1 3′-UTR

豬瘟病毒的3′-UTR由223-239個氨基酸殘基組成,在ORF的終止密碼子(UGA)后無Poly(A)尾巴結(jié)構(gòu),但其中包含一段AT含量較高的區(qū)域。在3′-UTR中存在兩個較為穩(wěn)定的莖-環(huán)結(jié)構(gòu)(stem-loop motif,SL),分別命名為SL I及SL II[4]。在這兩個SL結(jié)構(gòu)之間存在一段單鏈間隔序列(Single-stranded intervening sequence, SS)。在豬瘟病毒的復(fù)制過程中,SL I及SS發(fā)揮著重要的作用。SL I缺失以及在SL I及SS序列中發(fā)生突變都會導(dǎo)致豬瘟病毒無法復(fù)制,而SL I 發(fā)生補(bǔ)償性堿基替換(Compensatory base exchange)時,病毒仍會保持一定的復(fù)制能力,當(dāng)該類替換發(fā)生在SS序列中時,則對病毒的復(fù)制能力沒有影響。該現(xiàn)象說明,豬瘟病毒的3′-UTR莖-環(huán)結(jié)構(gòu)是CSFV病毒RNA復(fù)制的順式作用元件[5]。研究表明,豬瘟病毒的3′-UTR參與病毒的轉(zhuǎn)錄、復(fù)制及翻譯過程,并與復(fù)制相關(guān)酶對病毒模板RNA的識別有關(guān)。其中在3′-UTR序列中包含有與病毒成熟、包裝相關(guān)的信號因子,能夠起始病毒粒子的包裝成熟過程[6]。

有研究表明,在豬瘟病毒3′-UTR的21 nt位置的核苷酸對病毒的復(fù)制起決定作用,為病毒復(fù)制所必需,缺失該序列將不能起始RNA合成。而只存在該序列而無其他3′-UTR序列,病毒合成仍能夠進(jìn)行,但起始效率極低。說明3′-UTR結(jié)構(gòu)的完整性,是保證病毒RNA正常復(fù)制的必要條件[7]。報道稱,CSFV病毒3′-UTR能夠在病毒的復(fù)制過程中與RNA復(fù)制酶進(jìn)行結(jié)合,起始病毒RNA的復(fù)制過程,其末端序列CCCGG為結(jié)合所必須序列,該序列發(fā)生突變將導(dǎo)致結(jié)合能力喪失。

2.2 5′-UTR

CSFV的5′-UTR由大約370個氨基酸殘基組成,具體長度因種屬不盡相同。其結(jié)構(gòu)中無甲基化“帽子”構(gòu)造,具有穩(wěn)定的二級結(jié)構(gòu),序列的保守性較高。在5′-UTR中存在核糖體進(jìn)入位點(diǎn),能夠與核糖體中的18S rRNA中的保守區(qū)域結(jié)合,結(jié)合后病毒5′-UTR的起始密碼子通過堿基配對,與18S rRNA結(jié)合,并起始翻譯過程,合成病毒自身蛋白。CSFV的5′-UTR存在穩(wěn)定的莖-環(huán)序列,能夠形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),該發(fā)夾結(jié)構(gòu)式核糖體進(jìn)入位點(diǎn)的重要組成部分,對病毒RNA與核糖體結(jié)合起到?jīng)Q定性的作用。在病毒的5′-UTR區(qū)域內(nèi),存在一個GTATACGAG的連續(xù)序列,該序列為病毒基因復(fù)制的必須序列,推測該序列與病毒復(fù)制起始功能有關(guān)[8],缺失該序列或該序列發(fā)生部分突變時,病毒RNA復(fù)制的起始能力完全或部分喪失。同時,在CSFV的5′-UTR上游存在一個27 bp的高度保守區(qū)域,該區(qū)域與病毒RNA和核糖體中的Met tRNA結(jié)合有關(guān),是病毒雖然缺失“帽子”結(jié)構(gòu),但仍然能夠完成RNA翻譯過程的關(guān)鍵基團(tuán)[9]。由于該區(qū)域存在高度保守型,所以根據(jù)該部分序列設(shè)計的特異性檢測引物,能夠?qū)SFV進(jìn)行快速、準(zhǔn)確的檢測。

2.3 ORF

CSFV基因組包含一個很大的開放閱讀框(ORF),編碼的多聚蛋白由3 898個氨基酸殘基組成。在病毒自身合成的多種蛋白酶及宿主細(xì)胞內(nèi)的信號肽酶作用下,多聚蛋白被加工為10或11個成熟蛋白。根據(jù)編碼基因?qū)⒊墒斓鞍酌麨镹S2,NS3,NS4A,NS4B,NS5A,NS5B,E1,E2,P7,Npro,C及Erns。其中E1,E2,C,Erns為結(jié)構(gòu)蛋白,其他蛋白為非結(jié)構(gòu)蛋白[10]。

2.3.1 結(jié)構(gòu)蛋白 結(jié)構(gòu)蛋白C由192 bp的基因編碼,編碼后的蛋白經(jīng)宿主的信號肽酶加工,具有較強(qiáng)的親水性,具有一定轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子功能。Erns由227個氨基酸殘基構(gòu)成,分子量約為44 kDa,具有一定的神經(jīng)毒性和免疫抑制功能,并能誘導(dǎo)某些種屬動物的淋巴細(xì)胞凋亡。同時,Erns能夠刺激機(jī)體產(chǎn)生特異中和抗體,使機(jī)體獲得對CSFV的免疫能力。E1及E2是病毒的囊膜蛋白,分子量分貝為21.8 kDa及41.5 kDa[7]。E1為包埋在囊膜內(nèi)的蛋白,不能夠刺激機(jī)體產(chǎn)生特異性抗體,E2則存在于病毒粒子及被感染的細(xì)胞表面,可以誘導(dǎo)產(chǎn)生特異性中和抗體。同時,E2蛋白也是病毒對宿主細(xì)胞進(jìn)行識別及吸附的主要蛋白,能夠決定CSFV對細(xì)胞的感染傾向性[11]。

2.3.2 非結(jié)構(gòu)蛋白 Npro由168個氨基酸殘基組成,是ORF編碼的第一個蛋白,是由結(jié)構(gòu)蛋白C剪切產(chǎn)生的。該蛋白自身具有酶活性,且能夠抑制宿主機(jī)體的天然免疫能力,與CSFV的致病力及毒力有關(guān)。P7為分子量6k~7 kDa的小蛋白,其功能與病毒RNA復(fù)制無關(guān),但與感染性病毒粒子的產(chǎn)生有關(guān),參與感染性病毒粒子的產(chǎn)生于釋放[9]。NS2及NS3蛋白,也成為P125蛋白,在不同的病毒株中存在于聚蛋白的不同位置。NS2蛋白功能尚不明確,推測可能具有病毒復(fù)制調(diào)控作用。NS2變異性較高,NS3的保守性較高。NS3在病毒的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄及蛋白加工過程中發(fā)揮重要作用。NS4A由64個氨基酸殘基構(gòu)成的小蛋白,為NS3的輔助因子。NS4B由347個氨基酸殘基構(gòu)成,NS5A由496個氨基酸殘基構(gòu)成,NS4B與NS5A為組成RNA復(fù)制酶的成分。NS5B由718個氨基酸殘基構(gòu)成,為病毒復(fù)制酶,序列具有較高保守性,是負(fù)責(zé)基因組復(fù)制的主要聚合酶[11],其能夠識別并啟動病毒的基因組復(fù)制過程。

CSFV的分子結(jié)構(gòu)雖然已經(jīng)清楚,但許多基因的功能,以及其與病毒毒力之間的關(guān)系仍不明確。有報道稱,CSFV的毒力與其多個基因相關(guān),包括編碼Erns,Npro及E2等蛋白的基因。如Npro基因可調(diào)節(jié)CSFV的基因表達(dá)起始,同時能夠抑制宿主的天然免疫機(jī)制[3],降低機(jī)體免疫防御機(jī)制對病毒的防御、識別能力,但Npro不能影響病毒毒力。E2及Erns蛋白各自對病毒的毒力無明顯影響,但其嵌合體則可對毒力產(chǎn)生一定影響,特備是E2蛋白,推測可能是CSFV毒力構(gòu)成的重要因素[5]。

目前,CSFV的具體致病機(jī)制上不清楚。病毒感染后的最主要病理變化為宿主免疫抑制及宿主血細(xì)胞減少。白細(xì)胞降低是免疫系統(tǒng)受到抑制的主要特征,組織中發(fā)生的細(xì)胞凋亡則可引起淋巴組織萎縮?,F(xiàn)階段致病機(jī)制的研究主要集中在病毒感染早期,病毒與靶細(xì)胞的作用特點(diǎn)上,以及病毒造成細(xì)胞凋亡的機(jī)制等。但對于病毒自身的基因調(diào)控表達(dá)、病毒對感染細(xì)胞的功能影響,以及蛋白相互作用方面的研究還鮮有報道。因此,對CSFV致病機(jī)理的研究仍需要大量細(xì)致的工作。

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