賈春媛 張毓洪 徐 勇 楊 闊 魏 東 張耀光 王建業(yè)※ 楊 澤
前列腺癌(PCa)是美國男性常見的惡性腫瘤,僅2010 年就有200,000 新發(fā)病例和30,000 死亡病例[1]。在我國男性泌尿生殖系統(tǒng)惡性腫瘤發(fā)病率中,PCa 已排在惡性腫瘤的第三位,它的發(fā)病率可用來評價(jià)50 歲以上我國男性期望壽命的風(fēng)險(xiǎn)性指標(biāo)[2]。截止目前為止,普遍認(rèn)為前列腺癌的發(fā)生是由環(huán)境和遺傳因素,兩者共同作用的結(jié)果[1,3,4]。Takata R 等人[5]進(jìn)行了一項(xiàng)有關(guān)日本男性前列腺癌患者GWAS 和復(fù)制的研究,他們的研究提示了相同的結(jié)果。此外,他們還報(bào)道了五個新的前列腺癌易感基因位點(diǎn)5P15[P(GC)=3.9×10-18],GPRC6A/RFX6[P (GC)=1.6× 10-12],13q22[P(GC)=2.8×10-9],C2orf43[P(GC)=7.5×10-8]and FOXP4[P(GC)=7.6×10-8]。這些發(fā)現(xiàn)有助于我們對前列腺癌的遺傳基礎(chǔ)有更深的理解,也表明前列腺癌的易感性在不同種族人群的遺傳異質(zhì)性。
為了確定這些變異是否與中國北方人群的前列腺癌患病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān),我們選取北京市和天津市PCa 患者與正常對照者,采用病例-對照方法對6 個基因位點(diǎn)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,了解它們在PCa 患者的基因型與臨床特征之間的關(guān)系。
1.1 材料 自2000 年1 月~2010 年12 月,收集北京醫(yī)院泌尿外科和天津醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院泌尿外科研究所確診的266 例前列腺癌患者和288 例年齡匹配的健康對照者外周血標(biāo)本,同時還有他們的臨床資料,包括患者確診時的年齡,血清PSA,Gleason 分級和臨床分期。前列腺癌患者PSA超過20ng/ml,Gleason 評分≥8,和(或)病理分期≥Ⅲ期的被定義為侵入性前列腺癌。288 例對照者來自北京醫(yī)院和天津醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院的體檢人群。PSA <4.0ng/ml,均無PCa 家族史。所有研究對象對此研究均知情同意。受試者均是來自我國北方地區(qū)的無親緣關(guān)系的漢族人群。
1.2 SNP 的基因型位點(diǎn)選擇與試驗(yàn)方法 根據(jù)歐美人群以前的GWAS 前列腺癌的風(fēng)險(xiǎn)研究,隨機(jī)選取6 個SNPs。這些位點(diǎn)包括rs13385191,rs12653946,rs1983891,rs339331,rs9600079 和rs2735839。全血基因組DNA 提取試劑盒由北京Bio Chain 公司提供。采用PTC-225 擴(kuò)增儀進(jìn)行PCR 高分辨率擴(kuò)增熔解曲線,包括初始變性95℃3 分鐘,隨后45 個循環(huán)95℃30 秒,退火30 秒,72℃延伸4 秒,經(jīng)過94℃30 秒而后降至24℃2 分鐘,進(jìn)行2 個循環(huán)后結(jié)束。PCR 產(chǎn)物通過Light Scanner TMHR-I 96 進(jìn)行HRM 分析。隨機(jī)選取6 個樣本基因進(jìn)行PCR 擴(kuò)增和測序,以確認(rèn)基因分型結(jié)果。PCR 的檢測方法為,預(yù)變性95℃3 分鐘,隨后在95℃30 秒進(jìn)行35 個循環(huán),退火30 秒,72℃延伸30 秒,72℃2 分鐘完成。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 統(tǒng)計(jì)采用SPSS16.0 版本處理數(shù)據(jù)。用比值比(OR)值和95%可信區(qū)間(95%CI)來評價(jià)相對風(fēng)險(xiǎn)。組間基因型頻率及等位基因頻率比較采用χ2檢驗(yàn)或者Fisher 確切概率法。組間比較的差異設(shè)定P <0.05 為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。用Hardy-Weinberg 平衡對樣本群體基因型頻率的代表性進(jìn)行檢驗(yàn)。
2.1 臨床數(shù)據(jù) 此次研究,前列腺癌患者的平均年齡72.17 ±7.72 歲,平均PSA 值46.42 ±143.11ng/ml。對照組平均年齡70.47 ±7.60 歲,平均PSA 值1.20 ±1.01ng/ml。兩組間比較無顯著性差異(P=0.129)。在表1 中,列出了266例前列腺癌患者的Gleason 評分、腫瘤分期、危險(xiǎn)度分級等臨床特征。
表1 前列腺癌患者的臨床基本特征
2.2 6 個SNP 位點(diǎn)基因型與PCa 的關(guān)聯(lián)分析
2.2.1 前列腺癌與SNP 位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析:Hardy-Weinberg 平衡檢驗(yàn)對照組的基因型頻率,其分布具有群體代表性(P >0.05)。由遺傳學(xué)統(tǒng)計(jì)分析的6 個位點(diǎn),經(jīng)前列腺癌與對照組比較表明,只有一種等位基因頻率,RFX6 基因(rs339331,C)與前列腺癌有顯著性關(guān)聯(lián)(OR=0.73,95%CI=0.57~0.94,P=0.013)。
2.2.2 前列腺癌相關(guān)的基因型:我們發(fā)現(xiàn)受試者與攜帶(CC+CT)基因型患者相比,這些攜帶TT 基因型中的RFX6基因(rs339331,C)更能降低前列腺癌的風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.64,95%CI=0.45~0.90,P=0.008)(見表2)。
表2 6 個SNP 位點(diǎn)基因型與前列腺癌等位基因的頻率分布[n(%)]
續(xù)表2
2.2.3 前列腺癌相關(guān)的危險(xiǎn)因素分析:我們通過前列腺癌病例對照研究,比較了6 個SNP 與相關(guān)的臨床表型,包括PSA 水平、年齡診斷、Gleason 評分、腫瘤分期和亢進(jìn)型前列腺癌患者的分層分析。結(jié)果表明:僅有13q22(rs9600079,T)基因型與腫瘤分期可能存在關(guān)聯(lián)(P=0.044,OR=2.34,95%CI=0.94~5.87)。對于其他SNPs,我們沒有觀察到前列腺癌病例與相關(guān)的臨床表型有任何顯著性差異(P >0.05),見表3。
表3 rs9600079 位點(diǎn)基因型與前列腺癌患者臨床指征的關(guān)聯(lián)分析
激肽釋放酶相關(guān)肽3(KLK3)基因的產(chǎn)物是用來檢測人的前列腺特異性抗原(PSA),它是前列腺癌(PCa)臨床診斷的重要生物學(xué)標(biāo)志物。G 蛋白偶聯(lián)受體RFX6,C2orf43 和FOXP4 信號在前列腺癌發(fā)展中起到重要作用。我們研究了其中的6 個位點(diǎn),涉及位于KLK3 的rs2735839(G),C2orf43的rs13385191(G),F(xiàn)OXP4 的rs1983891(T),RFX6 基因的rs339331(C),5P15 的rs12653946(C),13q22 的rs9600079(T)。通過研究這些中國北方前列腺癌患者基因變異的情況,來判斷他們與中國北方男性前列腺癌的發(fā)生是否有關(guān)。
KLK3 在19 號染色體屬于15 激肽釋放酶家族,其蛋白質(zhì)產(chǎn)物是一種目前存在于精漿中的蛋白酶,在臨床上稱為PSA,這種蛋白的血清水平在診斷和監(jiān)測前列腺癌中發(fā)揮作用。Waters[6]公司生產(chǎn)的多種族序列發(fā)現(xiàn)關(guān)聯(lián)合并族群分析,KLK2/3(rs2735839)變異與前列腺癌風(fēng)險(xiǎn)可能關(guān)聯(lián)(OR=1.06;95%CI=0.97~1.16;P <0.05)。但我們的研究沒有發(fā)現(xiàn)KLK3 基因群與前列腺癌存在顯著相關(guān)的統(tǒng)計(jì)學(xué)風(fēng)險(xiǎn)。
叉頭蛋白4(ForkheadP4,F(xiàn)OXP4)的功能是轉(zhuǎn)錄抑制因子來抑制肺的外周血特異性基因的表達(dá),是轉(zhuǎn)錄內(nèi)分泌胰腺發(fā)育過程中直接分化胰島細(xì)胞所需的因子。它分化胰島細(xì)胞類型并且生產(chǎn)胰島素,同時不需要胰腺PP(多肽生產(chǎn))細(xì)胞分化。調(diào)控因子RFX6 遷移到NEUROG3 的下游,調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄參與β 細(xì)胞的成熟,從而限制了β 細(xì)胞中的分化。通過形成轉(zhuǎn)錄激活與RFX3 和有約束力的X-box 中的異源二聚體靶基因的啟動子。
在亞洲人口中與前列腺癌風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的四個SNPs,在歐洲人中也與前列腺癌風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)。Batra 等[7]對1,357 例前列腺癌患者和歐洲的1,403 例健康的澳大利亞男性進(jìn)行了相同的研究。在日本人群中發(fā)現(xiàn)5P15 (rs12653946)與前列腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)(OR=1.20,95% CI:1.07~1.34;P=0.002)。高田等人[8]發(fā)現(xiàn)其5 個位點(diǎn)對前列腺癌具有易感性,在5P15[P(GC)=3.9×10-18],GPRC6A/RFX6[P(GC)=1.6×10-12],13q22[P(GC)=2.8×10-9],C2orf43[P(GC)=7.5×10-8]和FOXP4[P(GC)=7.6×10-8]。后來Wang M等人[9]發(fā)現(xiàn),3/4 的遺傳變異與前列腺癌的風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)聯(lián)性(日本男性rs12653946 在5P15,P=4.33×10-8,rs339331 在6q22為4.43×10-5,rs9600079 在13q22 為8.42×10-4)。這些結(jié)果進(jìn)一步提供了證據(jù),即在日本男性中確定的PCa 風(fēng)險(xiǎn)基因也有可能有助于中國男性前列腺癌易感性基因的研究。
總之,我們的研究結(jié)果表明,RFX6 基因(rs339331,C)變體與前列腺癌風(fēng)險(xiǎn)有關(guān),13q22(rs9600079,T)的變異關(guān)系到我國北方男性前列腺癌腫瘤分期。然而,在本項(xiàng)研究中的其他位點(diǎn)均沒有得到同樣的復(fù)制,可能表明其與中國北方的男性前列腺癌相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)等位基因無關(guān)。
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